MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 1683

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020566	CAAAT	2	10	1445	1454	60 %	20 %	0 %	20 %	470221771
2	NC_020566	AATTT	2	10	2493	2502	40 %	60 %	0 %	0 %	470221772
3	NC_020566	CAATT	2	10	2559	2568	40 %	40 %	0 %	20 %	470221772
4	NC_020566	AAATT	2	10	2937	2946	60 %	40 %	0 %	0 %	470221772
5	NC_020566	TGAAT	2	10	6734	6743	40 %	40 %	20 %	0 %	470221774
6	NC_020566	TTCAA	2	10	7721	7730	40 %	40 %	0 %	20 %	470221775
7	NC_020566	ATCGC	2	10	10192	10201	20 %	20 %	20 %	40 %	470221776
8	NC_020566	CGTTG	2	10	11735	11744	0 %	40 %	40 %	20 %	470221777
9	NC_020566	GCAAG	2	10	16624	16633	40 %	0 %	40 %	20 %	470221780
10	NC_020566	TTTGA	2	10	16783	16792	20 %	60 %	20 %	0 %	470221780
11	NC_020566	TCAAT	2	10	18920	18929	40 %	40 %	0 %	20 %	470221782
12	NC_020566	AGTTA	2	10	22098	22107	40 %	40 %	20 %	0 %	470221783
13	NC_020566	ATGTA	2	10	23656	23665	40 %	40 %	20 %	0 %	470221784
14	NC_020566	ACCAA	2	10	26266	26275	60 %	0 %	0 %	40 %	470221786
15	NC_020566	ATCAA	2	10	26978	26987	60 %	20 %	0 %	20 %	470221786
16	NC_020566	GAAAC	2	10	27599	27608	60 %	0 %	20 %	20 %	470221787
17	NC_020566	GAAGT	2	10	27749	27758	40 %	20 %	40 %	0 %	470221787
18	NC_020566	ATTAT	2	10	29392	29401	40 %	60 %	0 %	0 %	470221788
19	NC_020566	AACGA	2	10	29465	29474	60 %	0 %	20 %	20 %	470221788
20	NC_020566	AAACG	2	10	31311	31320	60 %	0 %	20 %	20 %	470221790
21	NC_020566	AAGGT	2	10	32483	32492	40 %	20 %	40 %	0 %	470221790
22	NC_020566	TATGA	2	10	32680	32689	40 %	40 %	20 %	0 %	470221790
23	NC_020566	CATTA	2	10	33910	33919	40 %	40 %	0 %	20 %	470221791
24	NC_020566	AAATG	2	10	35554	35563	60 %	20 %	20 %	0 %	470221793
25	NC_020566	ATTTT	2	10	35635	35644	20 %	80 %	0 %	0 %	470221793
26	NC_020566	TGAAT	2	10	37533	37542	40 %	40 %	20 %	0 %	470221794
27	NC_020566	TTGGT	2	10	37575	37584	0 %	60 %	40 %	0 %	470221794
28	NC_020566	AATAT	2	10	37643	37652	60 %	40 %	0 %	0 %	470221794
29	NC_020566	TTCGT	2	10	37854	37863	0 %	60 %	20 %	20 %	470221794
30	NC_020566	AAATT	2	10	40313	40322	60 %	40 %	0 %	0 %	470221795
31	NC_020566	TTGAA	2	10	42342	42351	40 %	40 %	20 %	0 %	470221797
32	NC_020566	TTGAA	2	10	42688	42697	40 %	40 %	20 %	0 %	470221797
33	NC_020566	ATATT	2	10	45359	45368	40 %	60 %	0 %	0 %	470221799
34	NC_020566	GAATT	2	10	46276	46285	40 %	40 %	20 %	0 %	470221800
35	NC_020566	TCAGT	2	10	48177	48186	20 %	40 %	20 %	20 %	470221801
36	NC_020566	GGCCA	2	10	53184	53193	20 %	0 %	40 %	40 %	470221804
37	NC_020566	TAAAT	2	10	58894	58903	60 %	40 %	0 %	0 %	470221808
38	NC_020566	ATATT	2	10	60764	60773	40 %	60 %	0 %	0 %	470221809
39	NC_020566	AATGT	2	10	61489	61498	40 %	40 %	20 %	0 %	470221810
40	NC_020566	TAGTA	2	10	65037	65046	40 %	40 %	20 %	0 %	470221811
41	NC_020566	TACTA	2	10	66396	66405	40 %	40 %	0 %	20 %	470221812
42	NC_020566	ATCAA	2	10	69146	69155	60 %	20 %	0 %	20 %	470221814
43	NC_020566	TAATA	2	10	70978	70987	60 %	40 %	0 %	0 %	470221815
44	NC_020566	TATAT	2	10	73913	73922	40 %	60 %	0 %	0 %	470221817
45	NC_020566	CTAAA	2	10	75553	75562	60 %	20 %	0 %	20 %	470221818
46	NC_020566	CAAAA	2	10	75584	75593	80 %	0 %	0 %	20 %	470221818
47	NC_020566	GATAT	2	10	80276	80285	40 %	40 %	20 %	0 %	470221821
48	NC_020566	ATATA	2	10	81099	81108	60 %	40 %	0 %	0 %	470221822
49	NC_020566	GATAT	2	10	81933	81942	40 %	40 %	20 %	0 %	470221823
50	NC_020566	AATAA	2	10	82563	82572	80 %	20 %	0 %	0 %	470221824
51	NC_020566	ATTGC	2	10	84543	84552	20 %	40 %	20 %	20 %	470221826
52	NC_020566	TCATT	2	10	84731	84740	20 %	60 %	0 %	20 %	470221826
53	NC_020566	CATGG	2	10	85947	85956	20 %	20 %	40 %	20 %	470221826
54	NC_020566	TGAAA	2	10	86615	86624	60 %	20 %	20 %	0 %	470221827
55	NC_020566	TCAAT	2	10	86987	86996	40 %	40 %	0 %	20 %	470221827
56	NC_020566	GTATT	2	10	87476	87485	20 %	60 %	20 %	0 %	470221828
57	NC_020566	ATTAA	2	10	90218	90227	60 %	40 %	0 %	0 %	470221829
58	NC_020566	AGATA	2	10	93337	93346	60 %	20 %	20 %	0 %	470221831
59	NC_020566	TAAAA	2	10	93897	93906	80 %	20 %	0 %	0 %	470221831
60	NC_020566	ATACA	2	10	94327	94336	60 %	20 %	0 %	20 %	470221832
61	NC_020566	AAAGA	2	10	95530	95539	80 %	0 %	20 %	0 %	470221832
62	NC_020566	ATGTT	2	10	97015	97024	20 %	60 %	20 %	0 %	470221834
63	NC_020566	TTGCG	2	10	97586	97595	0 %	40 %	40 %	20 %	470221834
64	NC_020566	AGTTA	2	10	99146	99155	40 %	40 %	20 %	0 %	470221835
65	NC_020566	GGTGA	2	10	102941	102950	20 %	20 %	60 %	0 %	470221838
66	NC_020566	GAAAA	2	10	106378	106387	80 %	0 %	20 %	0 %	470221841
67	NC_020566	TTATT	2	10	106545	106554	20 %	80 %	0 %	0 %	470221841
68	NC_020566	AATCA	2	10	109567	109576	60 %	20 %	0 %	20 %	470221843
69	NC_020566	ATTTT	2	10	110265	110274	20 %	80 %	0 %	0 %	470221844
70	NC_020566	ATCAA	2	10	110292	110301	60 %	20 %	0 %	20 %	470221844
71	NC_020566	ATCAC	2	10	111525	111534	40 %	20 %	0 %	40 %	470221845
72	NC_020566	AACGA	2	10	112202	112211	60 %	0 %	20 %	20 %	470221845
73	NC_020566	ACACA	2	10	114258	114267	60 %	0 %	0 %	40 %	470221847
74	NC_020566	GACAA	2	10	115409	115418	60 %	0 %	20 %	20 %	470221848
75	NC_020566	ATTAC	2	10	117593	117602	40 %	40 %	0 %	20 %	470221850
76	NC_020566	TATCT	2	10	118253	118262	20 %	60 %	0 %	20 %	470221851
77	NC_020566	ATACG	2	10	120686	120695	40 %	20 %	20 %	20 %	470221853
78	NC_020566	TTATA	2	10	121344	121353	40 %	60 %	0 %	0 %	470221854
79	NC_020566	TTTTA	2	10	122142	122151	20 %	80 %	0 %	0 %	470221854
80	NC_020566	GTATT	2	10	122655	122664	20 %	60 %	20 %	0 %	470221855
81	NC_020566	AATAA	2	10	123248	123257	80 %	20 %	0 %	0 %	470221855
82	NC_020566	TACGC	2	10	123515	123524	20 %	20 %	20 %	40 %	470221855
83	NC_020566	TCCCT	2	10	126321	126330	0 %	40 %	0 %	60 %	470221858
84	NC_020566	GCTTT	2	10	128555	128564	0 %	60 %	20 %	20 %	470221860
85	NC_020566	TAATT	2	10	128640	128649	40 %	60 %	0 %	0 %	470221860
86	NC_020566	ATACT	2	10	129818	129827	40 %	40 %	0 %	20 %	470221861
87	NC_020566	TAATA	2	10	130982	130991	60 %	40 %	0 %	0 %	470221862
88	NC_020566	ATTTT	2	10	131973	131982	20 %	80 %	0 %	0 %	470221863
89	NC_020566	TTGTA	2	10	134178	134187	20 %	60 %	20 %	0 %	470221865
90	NC_020566	TGCAA	2	10	135183	135192	40 %	20 %	20 %	20 %	470221866
91	NC_020566	ATATG	2	10	137201	137210	40 %	40 %	20 %	0 %	470221867
92	NC_020566	TATGA	2	10	138881	138890	40 %	40 %	20 %	0 %	470221869
93	NC_020566	AATAT	2	10	139887	139896	60 %	40 %	0 %	0 %	470221869
94	NC_020566	TGGTA	2	10	141784	141793	20 %	40 %	40 %	0 %	470221870
95	NC_020566	CGAAC	2	10	141874	141883	40 %	0 %	20 %	40 %	470221870
96	NC_020566	TTCAA	2	10	143899	143908	40 %	40 %	0 %	20 %	470221871
97	NC_020566	ACATC	2	10	144742	144751	40 %	20 %	0 %	40 %	470221873
98	NC_020566	TAATT	2	10	146965	146974	40 %	60 %	0 %	0 %	470221874
99	NC_020566	AGAGA	2	10	149991	150000	60 %	0 %	40 %	0 %	470221877
100	NC_020566	AATCC	2	10	150347	150356	40 %	20 %	0 %	40 %	470221877
101	NC_020566	TGAAT	2	10	159103	159112	40 %	40 %	20 %	0 %	470221886
102	NC_020566	TTCAT	2	10	163341	163350	20 %	60 %	0 %	20 %	470221888
103	NC_020566	TTTAC	2	10	163724	163733	20 %	60 %	0 %	20 %	470221888
104	NC_020566	TTATT	2	10	164938	164947	20 %	80 %	0 %	0 %	470221889
105	NC_020566	GGATT	2	10	165926	165935	20 %	40 %	40 %	0 %	470221890
106	NC_020566	TAACT	2	10	168963	168972	40 %	40 %	0 %	20 %	470221893
107	NC_020566	TTTAT	2	10	171871	171880	20 %	80 %	0 %	0 %	470221895
108	NC_020566	ATGCA	2	10	173474	173483	40 %	20 %	20 %	20 %	470221896
109	NC_020566	TATGA	2	10	180720	180729	40 %	40 %	20 %	0 %	470221897
110	NC_020566	GTGAA	2	10	180754	180763	40 %	20 %	40 %	0 %	470221897
111	NC_020566	TTAAT	2	10	181197	181206	40 %	60 %	0 %	0 %	470221898
112	NC_020566	ATATA	2	10	184027	184036	60 %	40 %	0 %	0 %	470221901
113	NC_020566	AAGAT	2	10	187756	187765	60 %	20 %	20 %	0 %	470221903
114	NC_020566	CGTTT	2	10	188204	188213	0 %	60 %	20 %	20 %	470221904
115	NC_020566	AAATG	2	10	190684	190693	60 %	20 %	20 %	0 %	470221906
116	NC_020566	GTAAA	2	10	190848	190857	60 %	20 %	20 %	0 %	470221906
117	NC_020566	TTTAA	2	10	190868	190877	40 %	60 %	0 %	0 %	470221906
118	NC_020566	TTTGC	2	10	191384	191393	0 %	60 %	20 %	20 %	470221906
119	NC_020566	TTGTT	2	10	192390	192399	0 %	80 %	20 %	0 %	470221906
120	NC_020566	CAAAA	2	10	195602	195611	80 %	0 %	0 %	20 %	470221909
121	NC_020566	AGTTT	2	10	196138	196147	20 %	60 %	20 %	0 %	470221909
122	NC_020566	CAACA	2	10	196368	196377	60 %	0 %	0 %	40 %	470221909
123	NC_020566	AAAAT	2	10	196996	197005	80 %	20 %	0 %	0 %	470221910
124	NC_020566	AAATG	2	10	197405	197414	60 %	20 %	20 %	0 %	470221910
125	NC_020566	TTGAA	2	10	198679	198688	40 %	40 %	20 %	0 %	470221911
126	NC_020566	ATTAT	2	10	200635	200644	40 %	60 %	0 %	0 %	470221911
127	NC_020566	AATAG	2	10	201401	201410	60 %	20 %	20 %	0 %	470221912
128	NC_020566	ATACA	2	10	202038	202047	60 %	20 %	0 %	20 %	470221913
129	NC_020566	GTGTT	2	10	204723	204732	0 %	60 %	40 %	0 %	470221915
130	NC_020566	TAATT	2	10	207227	207236	40 %	60 %	0 %	0 %	470221917
131	NC_020566	TCTAT	2	10	207360	207369	20 %	60 %	0 %	20 %	470221917
132	NC_020566	ATAAA	2	10	207475	207484	80 %	20 %	0 %	0 %	470221917
133	NC_020566	AAAGA	2	10	208130	208139	80 %	0 %	20 %	0 %	470221918
134	NC_020566	CATGT	2	10	209335	209344	20 %	40 %	20 %	20 %	470221919
135	NC_020566	TTGAA	2	10	209410	209419	40 %	40 %	20 %	0 %	470221919
136	NC_020566	AATTG	2	10	210735	210744	40 %	40 %	20 %	0 %	470221919
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260	NC_020566	ATTCA	2	10	407748	407757	40 %	40 %	0 %	20 %	470222063
261	NC_020566	TTAAA	2	10	408348	408357	60 %	40 %	0 %	0 %	470222064
262	NC_020566	AATCA	2	10	410746	410755	60 %	20 %	0 %	20 %	470222065
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