MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 plasmid pI3T3 complete sequence

Total Repeats: 25

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020565	TAATT	2	10	4359	4368	40 %	60 %	0 %	0 %	469823629
2	NC_020565	CATAA	2	10	5184	5193	60 %	20 %	0 %	20 %	469823630
3	NC_020565	GATAC	2	10	5388	5397	40 %	20 %	20 %	20 %	469823630
4	NC_020565	ACTCA	2	10	6315	6324	40 %	20 %	0 %	40 %	469823630
5	NC_020565	AATTA	2	10	6328	6337	60 %	40 %	0 %	0 %	469823630
6	NC_020565	AATAT	2	10	6745	6754	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020565	CTTTA	2	10	8490	8499	20 %	60 %	0 %	20 %	469823632
8	NC_020565	TACTA	2	10	9199	9208	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_020565	ATTTG	2	10	9913	9922	20 %	60 %	20 %	0 %	469823633
10	NC_020565	AAAAG	2	10	10906	10915	80 %	0 %	20 %	0 %	469823634
11	NC_020565	AACGA	2	10	12371	12380	60 %	0 %	20 %	20 %	469823635
12	NC_020565	AACAG	2	10	12501	12510	60 %	0 %	20 %	20 %	469823635
13	NC_020565	TTATT	2	10	13568	13577	20 %	80 %	0 %	0 %	469823636
14	NC_020565	ATTCA	2	10	14995	15004	40 %	40 %	0 %	20 %	469823637
15	NC_020565	TATGA	2	10	15990	15999	40 %	40 %	20 %	0 %	469823638
16	NC_020565	AATAT	2	10	16396	16405	60 %	40 %	0 %	0 %	469823638
17	NC_020565	TATTT	2	10	16852	16861	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020565	TGTGA	2	10	18691	18700	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020565	AAAAT	2	10	19132	19141	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020565	TCTAA	2	10	19178	19187	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_020565	CTTGA	2	10	29815	29824	20 %	40 %	20 %	20 %	469823647
22	NC_020565	ATAAA	2	10	30484	30493	80 %	20 %	0 %	0 %	469823648
23	NC_020565	CTTTT	2	10	30730	30739	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_020565	TCACA	2	10	31026	31035	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
25	NC_020565	CTTTA	2	10	31608	31617	20 %	60 %	0 %	20 %	469823649

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.