MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 plasmid pI3T3 complete sequence

Total Repeats: 119

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020565	ACAT	2	8	272	279	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_020565	AAGA	2	8	506	513	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020565	CTTA	2	8	1095	1102	25 %	50 %	0 %	25 %	469823628
4	NC_020565	AGTA	2	8	1583	1590	50 %	25 %	25 %	0 %	469823628
5	NC_020565	TAGA	2	8	1866	1873	50 %	25 %	25 %	0 %	469823628
6	NC_020565	CCAT	2	8	2320	2327	25 %	25 %	0 %	50 %	469823628
7	NC_020565	CGTA	2	8	3199	3206	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_020565	GTAA	2	8	3289	3296	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020565	TCTT	2	8	3422	3429	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_020565	TTCA	2	8	3450	3457	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_020565	ATTT	2	8	3461	3468	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020565	GCAA	2	8	3500	3507	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_020565	TGAA	2	8	3513	3520	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020565	AAGT	2	8	3529	3536	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020565	AACG	2	8	3561	3568	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_020565	TAAA	2	8	3680	3687	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020565	AAAT	2	8	3873	3880	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020565	TATT	2	8	3976	3983	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020565	TTAA	2	8	4206	4213	50 %	50 %	0 %	0 %	469823629
20	NC_020565	TTTA	2	8	4295	4302	25 %	75 %	0 %	0 %	469823629
21	NC_020565	AAGT	2	8	5162	5169	50 %	25 %	25 %	0 %	469823630
22	NC_020565	AAAG	2	8	5650	5657	75 %	0 %	25 %	0 %	469823630
23	NC_020565	CATT	2	8	5793	5800	25 %	50 %	0 %	25 %	469823630
24	NC_020565	TTAA	2	8	5832	5839	50 %	50 %	0 %	0 %	469823630
25	NC_020565	AATT	2	8	5872	5879	50 %	50 %	0 %	0 %	469823630
26	NC_020565	AAAG	2	8	6084	6091	75 %	0 %	25 %	0 %	469823630
27	NC_020565	ATTT	2	8	6126	6133	25 %	75 %	0 %	0 %	469823630
28	NC_020565	TGGA	2	8	6372	6379	25 %	25 %	50 %	0 %	469823630
29	NC_020565	ATTT	2	8	6892	6899	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020565	TAGA	2	8	7528	7535	50 %	25 %	25 %	0 %	469823631
31	NC_020565	TAAA	2	8	7774	7781	75 %	25 %	0 %	0 %	469823631
32	NC_020565	ATAA	2	8	7912	7919	75 %	25 %	0 %	0 %	469823631
33	NC_020565	AAGA	2	8	7934	7941	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020565	TATT	2	8	8022	8029	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020565	ATGA	2	8	8041	8048	50 %	25 %	25 %	0 %	469823632
36	NC_020565	TTAT	2	8	8532	8539	25 %	75 %	0 %	0 %	469823632
37	NC_020565	ATTG	2	8	8657	8664	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020565	TAAC	2	8	8954	8961	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_020565	AATA	2	8	9347	9354	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020565	CATT	2	8	9429	9436	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_020565	AACG	2	8	9506	9513	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_020565	ATAA	2	8	10080	10087	75 %	25 %	0 %	0 %	469823633
43	NC_020565	GTTT	2	8	10383	10390	0 %	75 %	25 %	0 %	469823634
44	NC_020565	ATTA	2	8	10414	10421	50 %	50 %	0 %	0 %	469823634
45	NC_020565	AAAG	2	8	10721	10728	75 %	0 %	25 %	0 %	469823634
46	NC_020565	TAAT	2	8	10836	10843	50 %	50 %	0 %	0 %	469823634
47	NC_020565	TATG	2	8	11527	11534	25 %	50 %	25 %	0 %	469823634
48	NC_020565	GAAC	2	8	12235	12242	50 %	0 %	25 %	25 %	469823635
49	NC_020565	ATGT	2	8	12409	12416	25 %	50 %	25 %	0 %	469823635
50	NC_020565	CTTA	2	8	12566	12573	25 %	50 %	0 %	25 %	469823635
51	NC_020565	GATT	2	8	12968	12975	25 %	50 %	25 %	0 %	469823635
52	NC_020565	AATT	2	8	13499	13506	50 %	50 %	0 %	0 %	469823636
53	NC_020565	AAAC	2	8	13995	14002	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_020565	TAAT	2	8	14248	14255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020565	CAAA	2	8	14268	14275	75 %	0 %	0 %	25 %	469823637
56	NC_020565	TCTT	2	8	14551	14558	0 %	75 %	0 %	25 %	469823637
57	NC_020565	TTTA	2	8	14632	14639	25 %	75 %	0 %	0 %	469823637
58	NC_020565	TCTT	2	8	14830	14837	0 %	75 %	0 %	25 %	469823637
59	NC_020565	CTTT	2	8	14867	14874	0 %	75 %	0 %	25 %	469823637
60	NC_020565	TAAT	2	8	14921	14928	50 %	50 %	0 %	0 %	469823637
61	NC_020565	GTTT	2	8	14981	14988	0 %	75 %	25 %	0 %	469823637
62	NC_020565	TATG	2	8	15590	15597	25 %	50 %	25 %	0 %	469823638
63	NC_020565	ATCC	2	8	15623	15630	25 %	25 %	0 %	50 %	469823638
64	NC_020565	TAGA	2	8	15643	15650	50 %	25 %	25 %	0 %	469823638
65	NC_020565	TATT	2	8	15801	15808	25 %	75 %	0 %	0 %	469823638
66	NC_020565	TTTA	2	8	17267	17274	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020565	TAGA	2	8	17345	17352	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020565	TATT	2	8	17609	17616	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020565	GTAT	2	8	18032	18039	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020565	TTAG	2	8	18191	18198	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020565	TGAA	2	8	18335	18342	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020565	TTAC	2	8	18457	18464	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_020565	TTTA	2	8	18597	18604	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020565	CTAG	2	8	19390	19397	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_020565	TAAA	2	8	19761	19768	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020565	ATAA	2	8	19803	19810	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020565	AAAT	2	8	19979	19986	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020565	CAAA	2	8	20001	20008	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_020565	TACA	2	8	20295	20302	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_020565	ATTA	2	8	20468	20475	50 %	50 %	0 %	0 %	469823639
81	NC_020565	TTAG	2	8	20943	20950	25 %	50 %	25 %	0 %	469823639
82	NC_020565	CAAC	2	8	21014	21021	50 %	0 %	0 %	50 %	469823639
83	NC_020565	TCGG	2	8	21162	21169	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_020565	AAGC	2	8	21515	21522	50 %	0 %	25 %	25 %	469823640
85	NC_020565	GCTA	2	8	21979	21986	25 %	25 %	25 %	25 %	469823640
86	NC_020565	GTGG	2	8	22212	22219	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020565	ATTT	2	8	22232	22239	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020565	ATTT	2	8	22247	22254	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020565	AGGT	2	8	22538	22545	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020565	TGTA	2	8	22864	22871	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020565	TAAA	2	8	23137	23144	75 %	25 %	0 %	0 %	469823641
92	NC_020565	AAAT	2	8	23329	23336	75 %	25 %	0 %	0 %	469823641
93	NC_020565	AAGA	2	8	24130	24137	75 %	0 %	25 %	0 %	469823642
94	NC_020565	TATT	2	8	24527	24534	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020565	ACAT	2	8	25362	25369	50 %	25 %	0 %	25 %	469823643
96	NC_020565	AAGA	2	8	25596	25603	75 %	0 %	25 %	0 %	469823643
97	NC_020565	AGTA	2	8	25937	25944	50 %	25 %	25 %	0 %	469823644
98	NC_020565	TATT	2	8	26475	26482	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020565	TAGA	2	8	26508	26515	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020565	CCGA	2	8	26748	26755	25 %	0 %	25 %	50 %	469823645
101	NC_020565	CGGA	2	8	26843	26850	25 %	0 %	50 %	25 %	469823645
102	NC_020565	ACGG	2	8	27138	27145	25 %	0 %	50 %	25 %	469823645
103	NC_020565	TCAC	2	8	27476	27483	25 %	25 %	0 %	50 %	469823646
104	NC_020565	CGAT	2	8	27651	27658	25 %	25 %	25 %	25 %	469823646
105	NC_020565	CGCT	2	8	28100	28107	0 %	25 %	25 %	50 %	469823646
106	NC_020565	TCAT	2	8	28250	28257	25 %	50 %	0 %	25 %	469823646
107	NC_020565	TGAC	2	8	28430	28437	25 %	25 %	25 %	25 %	469823646
108	NC_020565	GGCT	2	8	28733	28740	0 %	25 %	50 %	25 %	469823646
109	NC_020565	CATC	2	8	29337	29344	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_020565	TACA	2	8	29390	29397	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_020565	ATAG	2	8	29794	29801	50 %	25 %	25 %	0 %	469823647
112	NC_020565	CTTT	2	8	30361	30368	0 %	75 %	0 %	25 %	469823648
113	NC_020565	AACT	2	8	30389	30396	50 %	25 %	0 %	25 %	469823648
114	NC_020565	TAGG	2	8	30512	30519	25 %	25 %	50 %	0 %	469823648
115	NC_020565	ATTC	2	8	30554	30561	25 %	50 %	0 %	25 %	469823648
116	NC_020565	ATTT	2	8	30659	30666	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020565	TTAT	2	8	31178	31185	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020565	TACC	2	8	31655	31662	25 %	25 %	0 %	50 %	469823649
119	NC_020565	TTAC	2	8	31834	31841	25 %	50 %	0 %	25 %	469823649

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.