MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 plasmid pI3T3 complete sequence

Total Repeats: 68

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020565	CTTA	2	8	1095	1102	25 %	50 %	0 %	25 %	469823628
2	NC_020565	AGTA	2	8	1583	1590	50 %	25 %	25 %	0 %	469823628
3	NC_020565	TAGA	2	8	1866	1873	50 %	25 %	25 %	0 %	469823628
4	NC_020565	CCAT	2	8	2320	2327	25 %	25 %	0 %	50 %	469823628
5	NC_020565	TTAA	2	8	4206	4213	50 %	50 %	0 %	0 %	469823629
6	NC_020565	TTTA	2	8	4295	4302	25 %	75 %	0 %	0 %	469823629
7	NC_020565	AAGT	2	8	5162	5169	50 %	25 %	25 %	0 %	469823630
8	NC_020565	AAAG	2	8	5650	5657	75 %	0 %	25 %	0 %	469823630
9	NC_020565	CATT	2	8	5793	5800	25 %	50 %	0 %	25 %	469823630
10	NC_020565	TTAA	2	8	5832	5839	50 %	50 %	0 %	0 %	469823630
11	NC_020565	AATT	2	8	5872	5879	50 %	50 %	0 %	0 %	469823630
12	NC_020565	AAAG	2	8	6084	6091	75 %	0 %	25 %	0 %	469823630
13	NC_020565	ATTT	2	8	6126	6133	25 %	75 %	0 %	0 %	469823630
14	NC_020565	TGGA	2	8	6372	6379	25 %	25 %	50 %	0 %	469823630
15	NC_020565	TAGA	2	8	7528	7535	50 %	25 %	25 %	0 %	469823631
16	NC_020565	TAAA	2	8	7774	7781	75 %	25 %	0 %	0 %	469823631
17	NC_020565	ATAA	2	8	7912	7919	75 %	25 %	0 %	0 %	469823631
18	NC_020565	ATGA	2	8	8041	8048	50 %	25 %	25 %	0 %	469823632
19	NC_020565	TTAT	2	8	8532	8539	25 %	75 %	0 %	0 %	469823632
20	NC_020565	ATAA	2	8	10080	10087	75 %	25 %	0 %	0 %	469823633
21	NC_020565	GTTT	2	8	10383	10390	0 %	75 %	25 %	0 %	469823634
22	NC_020565	ATTA	2	8	10414	10421	50 %	50 %	0 %	0 %	469823634
23	NC_020565	AAAG	2	8	10721	10728	75 %	0 %	25 %	0 %	469823634
24	NC_020565	TAAT	2	8	10836	10843	50 %	50 %	0 %	0 %	469823634
25	NC_020565	TATG	2	8	11527	11534	25 %	50 %	25 %	0 %	469823634
26	NC_020565	GAAC	2	8	12235	12242	50 %	0 %	25 %	25 %	469823635
27	NC_020565	ATGT	2	8	12409	12416	25 %	50 %	25 %	0 %	469823635
28	NC_020565	CTTA	2	8	12566	12573	25 %	50 %	0 %	25 %	469823635
29	NC_020565	GATT	2	8	12968	12975	25 %	50 %	25 %	0 %	469823635
30	NC_020565	AATT	2	8	13499	13506	50 %	50 %	0 %	0 %	469823636
31	NC_020565	CAAA	2	8	14268	14275	75 %	0 %	0 %	25 %	469823637
32	NC_020565	TCTT	2	8	14551	14558	0 %	75 %	0 %	25 %	469823637
33	NC_020565	TTTA	2	8	14632	14639	25 %	75 %	0 %	0 %	469823637
34	NC_020565	TCTT	2	8	14830	14837	0 %	75 %	0 %	25 %	469823637
35	NC_020565	CTTT	2	8	14867	14874	0 %	75 %	0 %	25 %	469823637
36	NC_020565	TAAT	2	8	14921	14928	50 %	50 %	0 %	0 %	469823637
37	NC_020565	GTTT	2	8	14981	14988	0 %	75 %	25 %	0 %	469823637
38	NC_020565	TATG	2	8	15590	15597	25 %	50 %	25 %	0 %	469823638
39	NC_020565	ATCC	2	8	15623	15630	25 %	25 %	0 %	50 %	469823638
40	NC_020565	TAGA	2	8	15643	15650	50 %	25 %	25 %	0 %	469823638
41	NC_020565	TATT	2	8	15801	15808	25 %	75 %	0 %	0 %	469823638
42	NC_020565	ATTA	2	8	20468	20475	50 %	50 %	0 %	0 %	469823639
43	NC_020565	TTAG	2	8	20943	20950	25 %	50 %	25 %	0 %	469823639
44	NC_020565	CAAC	2	8	21014	21021	50 %	0 %	0 %	50 %	469823639
45	NC_020565	AAGC	2	8	21515	21522	50 %	0 %	25 %	25 %	469823640
46	NC_020565	GCTA	2	8	21979	21986	25 %	25 %	25 %	25 %	469823640
47	NC_020565	TAAA	2	8	23137	23144	75 %	25 %	0 %	0 %	469823641
48	NC_020565	AAAT	2	8	23329	23336	75 %	25 %	0 %	0 %	469823641
49	NC_020565	AAGA	2	8	24130	24137	75 %	0 %	25 %	0 %	469823642
50	NC_020565	ACAT	2	8	25362	25369	50 %	25 %	0 %	25 %	469823643
51	NC_020565	AAGA	2	8	25596	25603	75 %	0 %	25 %	0 %	469823643
52	NC_020565	AGTA	2	8	25937	25944	50 %	25 %	25 %	0 %	469823644
53	NC_020565	CCGA	2	8	26748	26755	25 %	0 %	25 %	50 %	469823645
54	NC_020565	CGGA	2	8	26843	26850	25 %	0 %	50 %	25 %	469823645
55	NC_020565	ACGG	2	8	27138	27145	25 %	0 %	50 %	25 %	469823645
56	NC_020565	TCAC	2	8	27476	27483	25 %	25 %	0 %	50 %	469823646
57	NC_020565	CGAT	2	8	27651	27658	25 %	25 %	25 %	25 %	469823646
58	NC_020565	CGCT	2	8	28100	28107	0 %	25 %	25 %	50 %	469823646
59	NC_020565	TCAT	2	8	28250	28257	25 %	50 %	0 %	25 %	469823646
60	NC_020565	TGAC	2	8	28430	28437	25 %	25 %	25 %	25 %	469823646
61	NC_020565	GGCT	2	8	28733	28740	0 %	25 %	50 %	25 %	469823646
62	NC_020565	ATAG	2	8	29794	29801	50 %	25 %	25 %	0 %	469823647
63	NC_020565	CTTT	2	8	30361	30368	0 %	75 %	0 %	25 %	469823648
64	NC_020565	AACT	2	8	30389	30396	50 %	25 %	0 %	25 %	469823648
65	NC_020565	TAGG	2	8	30512	30519	25 %	25 %	50 %	0 %	469823648
66	NC_020565	ATTC	2	8	30554	30561	25 %	50 %	0 %	25 %	469823648
67	NC_020565	TACC	2	8	31655	31662	25 %	25 %	0 %	50 %	469823649
68	NC_020565	TTAC	2	8	31834	31841	25 %	50 %	0 %	25 %	469823649

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.