MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 plasmid pI3T3 complete sequence

Total Repeats: 135

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020565	A	6	6	181	186	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020565	C	6	6	844	849	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3	NC_020565	T	7	7	1253	1259	0 %	100 %	0 %	0 %	469823628
4	NC_020565	T	6	6	1460	1465	0 %	100 %	0 %	0 %	469823628
5	NC_020565	T	6	6	1896	1901	0 %	100 %	0 %	0 %	469823628
6	NC_020565	T	6	6	2763	2768	0 %	100 %	0 %	0 %	469823628
7	NC_020565	A	6	6	3405	3410	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020565	A	6	6	3628	3633	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020565	A	6	6	3743	3748	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020565	T	6	6	3828	3833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020565	T	6	6	4256	4261	0 %	100 %	0 %	0 %	469823629
12	NC_020565	T	6	6	4337	4342	0 %	100 %	0 %	0 %	469823629
13	NC_020565	T	6	6	4430	4435	0 %	100 %	0 %	0 %	469823629
14	NC_020565	T	6	6	4589	4594	0 %	100 %	0 %	0 %	469823629
15	NC_020565	T	8	8	4745	4752	0 %	100 %	0 %	0 %	469823629
16	NC_020565	T	6	6	5010	5015	0 %	100 %	0 %	0 %	469823630
17	NC_020565	A	7	7	5374	5380	100 %	0 %	0 %	0 %	469823630
18	NC_020565	A	8	8	5415	5422	100 %	0 %	0 %	0 %	469823630
19	NC_020565	T	6	6	5769	5774	0 %	100 %	0 %	0 %	469823630
20	NC_020565	A	6	6	5859	5864	100 %	0 %	0 %	0 %	469823630
21	NC_020565	T	6	6	5903	5908	0 %	100 %	0 %	0 %	469823630
22	NC_020565	A	6	6	6456	6461	100 %	0 %	0 %	0 %	469823630
23	NC_020565	A	6	6	6667	6672	100 %	0 %	0 %	0 %	469823630
24	NC_020565	A	6	6	6760	6765	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020565	A	6	6	6856	6861	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020565	A	6	6	8744	8749	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020565	T	6	6	8930	8935	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020565	A	6	6	8989	8994	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020565	A	6	6	9214	9219	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020565	A	7	7	9579	9585	100 %	0 %	0 %	0 %	469823633
31	NC_020565	T	6	6	9781	9786	0 %	100 %	0 %	0 %	469823633
32	NC_020565	T	6	6	10074	10079	0 %	100 %	0 %	0 %	469823633
33	NC_020565	A	6	6	10167	10172	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020565	T	6	6	10222	10227	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020565	A	7	7	10240	10246	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020565	T	6	6	10313	10318	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020565	A	8	8	10345	10352	100 %	0 %	0 %	0 %	469823634
38	NC_020565	A	7	7	10552	10558	100 %	0 %	0 %	0 %	469823634
39	NC_020565	T	6	6	11942	11947	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020565	A	7	7	12554	12560	100 %	0 %	0 %	0 %	469823635
41	NC_020565	T	6	6	12724	12729	0 %	100 %	0 %	0 %	469823635
42	NC_020565	A	8	8	12883	12890	100 %	0 %	0 %	0 %	469823635
43	NC_020565	A	6	6	13583	13588	100 %	0 %	0 %	0 %	469823636
44	NC_020565	A	6	6	13590	13595	100 %	0 %	0 %	0 %	469823636
45	NC_020565	A	6	6	13693	13698	100 %	0 %	0 %	0 %	469823636
46	NC_020565	A	6	6	13914	13919	100 %	0 %	0 %	0 %	469823636
47	NC_020565	T	7	7	14836	14842	0 %	100 %	0 %	0 %	469823637
48	NC_020565	T	6	6	14938	14943	0 %	100 %	0 %	0 %	469823637
49	NC_020565	T	6	6	15086	15091	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020565	T	6	6	15358	15363	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020565	A	6	6	15715	15720	100 %	0 %	0 %	0 %	469823638
52	NC_020565	A	6	6	15732	15737	100 %	0 %	0 %	0 %	469823638
53	NC_020565	A	6	6	16060	16065	100 %	0 %	0 %	0 %	469823638
54	NC_020565	A	7	7	16496	16502	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020565	A	6	6	16718	16723	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020565	T	7	7	16922	16928	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020565	T	7	7	16933	16939	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020565	A	6	6	16942	16947	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020565	A	6	6	17131	17136	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020565	A	6	6	17157	17162	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020565	A	7	7	17249	17255	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020565	T	6	6	17443	17448	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020565	T	6	6	17702	17707	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020565	A	7	7	17798	17804	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020565	T	6	6	18113	18118	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020565	A	6	6	18134	18139	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020565	A	6	6	18325	18330	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020565	T	6	6	18738	18743	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020565	A	6	6	18782	18787	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020565	A	7	7	19149	19155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020565	A	6	6	19343	19348	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020565	T	7	7	19663	19669	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020565	A	7	7	19693	19699	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020565	A	6	6	19703	19708	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020565	A	6	6	19766	19771	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020565	A	7	7	19776	19782	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020565	A	6	6	19821	19826	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020565	A	6	6	19838	19843	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020565	T	6	6	20033	20038	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020565	T	6	6	20330	20335	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020565	A	6	6	20338	20343	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020565	A	6	6	20349	20354	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020565	T	7	7	20595	20601	0 %	100 %	0 %	0 %	469823639
84	NC_020565	A	6	6	20616	20621	100 %	0 %	0 %	0 %	469823639
85	NC_020565	T	7	7	20789	20795	0 %	100 %	0 %	0 %	469823639
86	NC_020565	T	6	6	20991	20996	0 %	100 %	0 %	0 %	469823639
87	NC_020565	T	6	6	21213	21218	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020565	A	6	6	21298	21303	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020565	A	8	8	21506	21513	100 %	0 %	0 %	0 %	469823640
90	NC_020565	T	6	6	22029	22034	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020565	A	7	7	22154	22160	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020565	A	6	6	22281	22286	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020565	T	7	7	22314	22320	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020565	A	6	6	22484	22489	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020565	A	6	6	22497	22502	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020565	T	6	6	22530	22535	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020565	T	6	6	22603	22608	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020565	T	7	7	22693	22699	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020565	A	8	8	22758	22765	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020565	A	7	7	22792	22798	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020565	A	6	6	22905	22910	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020565	T	7	7	22921	22927	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020565	T	7	7	23074	23080	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020565	T	7	7	23082	23088	0 %	100 %	0 %	0 %	469823641
105	NC_020565	T	6	6	23090	23095	0 %	100 %	0 %	0 %	469823641
106	NC_020565	A	6	6	23468	23473	100 %	0 %	0 %	0 %	469823641
107	NC_020565	T	6	6	23567	23572	0 %	100 %	0 %	0 %	469823641
108	NC_020565	A	6	6	23615	23620	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020565	T	7	7	23671	23677	0 %	100 %	0 %	0 %	469823642
110	NC_020565	A	7	7	24118	24124	100 %	0 %	0 %	0 %	469823642
111	NC_020565	T	7	7	24309	24315	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020565	T	6	6	24317	24322	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020565	T	6	6	24541	24546	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020565	A	6	6	24610	24615	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020565	A	6	6	24854	24859	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020565	A	6	6	25270	25275	100 %	0 %	0 %	0 %	469823643
117	NC_020565	T	7	7	25783	25789	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020565	T	6	6	26194	26199	0 %	100 %	0 %	0 %	469823644
119	NC_020565	G	6	6	26970	26975	0 %	0 %	100 %	0 %	469823645
120	NC_020565	T	6	6	27850	27855	0 %	100 %	0 %	0 %	469823646
121	NC_020565	C	6	6	28588	28593	0 %	0 %	0 %	100 %	469823646
122	NC_020565	T	6	6	29066	29071	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020565	A	8	8	29363	29370	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020565	T	6	6	29434	29439	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020565	T	6	6	29454	29459	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020565	T	6	6	29565	29570	0 %	100 %	0 %	0 %	469823647
127	NC_020565	T	6	6	30636	30641	0 %	100 %	0 %	0 %	469823648
128	NC_020565	T	6	6	30801	30806	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020565	T	6	6	31130	31135	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020565	A	6	6	31170	31175	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020565	T	6	6	31203	31208	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020565	A	6	6	31282	31287	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020565	T	7	7	31715	31721	0 %	100 %	0 %	0 %	469823649
134	NC_020565	T	6	6	31875	31880	0 %	100 %	0 %	0 %	469823649
135	NC_020565	T	7	7	31977	31983	0 %	100 %	0 %	0 %	469823649

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.