MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 1195

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020564	GTTGAA	2	12	3191	3202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470217948
2	NC_020564	GTTATC	2	12	7297	7308	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470217951
3	NC_020564	CAGATA	2	12	8206	8217	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470217951
4	NC_020564	CAAGCT	2	12	8265	8276	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470217951
5	NC_020564	GTAATG	2	12	9253	9264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470217951
6	NC_020564	AGATGA	2	12	9656	9667	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	470217951
7	NC_020564	ACAATT	2	12	11259	11270	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	470217953
8	NC_020564	TAGCAT	2	12	11354	11365	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470217953
9	NC_020564	GCTTTA	2	12	17450	17461	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470217957
10	NC_020564	TTTGAA	2	12	18271	18282	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470217957
11	NC_020564	TTGGTG	2	12	19115	19126	0 %	50 %	50 %	0 %	470217958
12	NC_020564	TGATTG	2	12	21719	21730	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	470217959
13	NC_020564	TGAAAT	2	12	22050	22061	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470217959
14	NC_020564	AAGGAA	2	12	22488	22499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470217960
15	NC_020564	TGAATT	2	12	25416	25427	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470217961
16	NC_020564	ATTTCA	2	12	27900	27911	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	470217963
17	NC_020564	ATCAGC	2	12	31215	31226	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470217966
18	NC_020564	AAAAGA	2	12	33856	33867	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	470217967
19	NC_020564	ACATCT	2	12	35510	35521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470217969
20	NC_020564	ACAACT	2	12	40613	40624	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	470217971
21	NC_020564	TAGTTT	2	12	47301	47312	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	470217977
22	NC_020564	ATAACC	2	12	47797	47808	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	470217977
23	NC_020564	TTTGTA	2	12	52952	52963	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	470217980
24	NC_020564	TTTTTC	2	12	53969	53980	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	470217981
25	NC_020564	TATTTT	2	12	54273	54284	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	470217981
26	NC_020564	ATAAAA	2	12	55465	55476	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	470217982
27	NC_020564	TTGTGA	2	12	59570	59581	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	470217984
28	NC_020564	TTTATA	2	12	59910	59921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470217984
29	NC_020564	TTTATC	2	12	60212	60223	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	470217985
30	NC_020564	ACAAAT	2	12	63545	63556	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	470217987
31	NC_020564	AATTAA	2	12	63636	63647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470217987
32	NC_020564	TTAATG	2	12	66579	66590	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470217988
33	NC_020564	AAGTCA	2	12	67784	67795	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470217989
34	NC_020564	AAAAAG	2	12	67898	67909	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	470217989
35	NC_020564	GAAAAA	2	12	68211	68222	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	470217989
36	NC_020564	AATTAT	2	12	70450	70461	50 %	50 %	0 %	0 %	470217991
37	NC_020564	ACCCTT	2	12	72289	72300	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	470217992
38	NC_020564	TTTAGC	2	12	74198	74209	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470217993
39	NC_020564	AAATAA	2	12	74249	74260	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	470217993
40	NC_020564	GTTAGA	2	12	76372	76383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470217994
41	NC_020564	AAAAGA	2	12	76426	76437	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	470217994
42	NC_020564	GCTAAA	2	12	79214	79225	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470217996
43	NC_020564	TAAAGA	2	12	83362	83373	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	470218001
44	NC_020564	AACCAC	2	12	87233	87244	50 %	0 %	0 %	50 %	470218003
45	NC_020564	AACCGA	2	12	90544	90555	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	470218005
46	NC_020564	ATAGAT	2	12	95444	95455	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470218008
47	NC_020564	TATCAT	2	12	96211	96222	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	470218009
48	NC_020564	TTTATT	2	12	96619	96630	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	470218010
49	NC_020564	TATTTG	2	12	96705	96716	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	470218010
50	NC_020564	TAAATA	2	12	98138	98149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218010
51	NC_020564	TTTTTC	2	12	99832	99843	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	470218011
52	NC_020564	TAAGCC	2	12	101693	101704	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470218013
53	NC_020564	ATCGCA	2	12	102908	102919	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470218014
54	NC_020564	TTTGAA	2	12	103939	103950	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470218015
55	NC_020564	CAATGG	2	12	112897	112908	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	470218021
56	NC_020564	TGAAGA	2	12	113731	113742	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	470218022
57	NC_020564	TTTCAT	2	12	114412	114423	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	470218023
58	NC_020564	TGTATA	2	12	118632	118643	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470218027
59	NC_020564	TCGAAA	2	12	120133	120144	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470218029
60	NC_020564	CTATTG	2	12	122719	122730	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470218031
61	NC_020564	CATATG	2	12	123922	123933	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470218032
62	NC_020564	GGTATG	2	12	126965	126976	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	470218035
63	NC_020564	CAGATT	2	12	129563	129574	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470218037
64	NC_020564	AGATAT	2	12	136941	136952	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470218044
65	NC_020564	ATGCCT	2	12	138080	138091	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	470218045
66	NC_020564	TGAAAG	2	12	138720	138731	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	470218045
67	NC_020564	GATATG	2	12	146220	146231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218051
68	NC_020564	ATTTGA	2	12	150126	150137	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470218054
69	NC_020564	GATTTT	2	12	154637	154648	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	470218059
70	NC_020564	ACAAAG	2	12	159157	159168	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	470218063
71	NC_020564	AAAGAT	2	12	161170	161181	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	470218064
72	NC_020564	ATTAAT	2	12	163076	163087	50 %	50 %	0 %	0 %	470218065
73	NC_020564	CAATAT	2	12	163642	163653	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	470218065
74	NC_020564	TTGGTA	2	12	167727	167738	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	470218069
75	NC_020564	GCGATT	2	12	167747	167758	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	470218069
76	NC_020564	AAATTT	2	12	167845	167856	50 %	50 %	0 %	0 %	470218069
77	NC_020564	ACCTGC	2	12	170748	170759	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	470218071
78	NC_020564	AAGATA	2	12	170894	170905	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	470218071
79	NC_020564	CGTTAA	2	12	173828	173839	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470218073
80	NC_020564	CTATTA	2	12	175679	175690	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	470218073
81	NC_020564	TATGAT	2	12	177213	177224	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470218073
82	NC_020564	TTGAAA	2	12	177665	177676	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470218073
83	NC_020564	AACATT	2	12	180105	180116	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	470218073
84	NC_020564	AGCAAC	2	12	183594	183605	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	470218077
85	NC_020564	TGTTTG	2	12	183642	183653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218077
86	NC_020564	CACCTT	2	12	185646	185657	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	470218079
87	NC_020564	ACCTTT	2	12	186151	186162	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	470218079
88	NC_020564	GTAAAT	2	12	189890	189901	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470218082
89	NC_020564	ATTTTA	2	12	191485	191496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218083
90	NC_020564	TATCTT	2	12	196099	196110	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	470218086
91	NC_020564	ATTTGG	2	12	197112	197123	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	470218087
92	NC_020564	GAGTTT	2	12	200455	200466	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	470218088
93	NC_020564	TATACA	2	12	204456	204467	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	470218092
94	NC_020564	TTATTT	2	12	206488	206499	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	470218093
95	NC_020564	ATTTAT	2	12	207067	207078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218093
96	NC_020564	CCCTGA	2	12	209825	209836	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	470218096
97	NC_020564	TCCTGA	2	12	210644	210655	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	470218096
98	NC_020564	TCAATT	2	12	212795	212806	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	470218098
99	NC_020564	AATATG	2	12	214095	214106	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470218099
100	NC_020564	AAAAAT	2	12	217602	217613	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	470218101
101	NC_020564	AGGACA	2	12	219462	219473	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	470218103
102	NC_020564	ACATTT	2	12	219798	219809	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	470218103
103	NC_020564	TTCTTG	2	12	224727	224738	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	470218107
104	NC_020564	GGACGT	2	12	235229	235240	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	470218116
105	NC_020564	TATAGA	2	12	267761	267772	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470218135
106	NC_020564	ACGATG	2	12	274390	274401	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	470218140
107	NC_020564	AGAATC	2	12	281948	281959	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470218145
108	NC_020564	AAGTAA	2	12	285371	285382	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	470218149
109	NC_020564	ATAAAG	2	12	286352	286363	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	470218150
110	NC_020564	GACATT	2	12	288043	288054	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470218151
111	NC_020564	GATTTC	2	12	289862	289873	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470218153
112	NC_020564	TTCATA	2	12	290432	290443	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	470218154
113	NC_020564	GATTAT	2	12	294839	294850	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470218157
114	NC_020564	ATGGTG	2	12	294972	294983	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	470218157
115	NC_020564	CAGCAA	2	12	295359	295370	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	470218157
116	NC_020564	TCTTCA	2	12	300938	300949	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	470218162
117	NC_020564	TTATCT	2	12	301034	301045	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	470218162
118	NC_020564	GAAAAA	2	12	303296	303307	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	470218164
119	NC_020564	GATACA	2	12	304461	304472	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470218164
120	NC_020564	ACAAGA	2	12	307628	307639	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	470218165
121	NC_020564	AGGACA	2	12	308006	308017	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	470218165
122	NC_020564	TAAATT	2	12	310856	310867	50 %	50 %	0 %	0 %	470218166
123	NC_020564	TGAAGA	2	12	311117	311128	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	470218166
124	NC_020564	TAAAAC	2	12	317566	317577	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	470218170
125	NC_020564	CTGAAT	2	12	324051	324062	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470218176
126	NC_020564	GAAAAA	2	12	328246	328257	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	470218179
127	NC_020564	TTTATT	2	12	328831	328842	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	470218180
128	NC_020564	ACGAAT	2	12	329309	329320	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470218180
129	NC_020564	GAAACA	2	12	330914	330925	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	470218181
130	NC_020564	AAAATT	2	12	331479	331490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218182
131	NC_020564	AATGCA	2	12	343853	343864	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470218191
132	NC_020564	AATGAC	2	12	346907	346918	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470218194
133	NC_020564	AAAATG	2	12	348388	348399	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	470218195
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137	NC_020564	GATGCT	2	12	367073	367084	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	470218210
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140	NC_020564	ATTAAA	2	12	370856	370867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218212
141	NC_020564	AGGACA	2	12	374596	374607	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	470218216
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147	NC_020564	CCAAAC	2	12	401952	401963	50 %	0 %	0 %	50 %	470218235
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218	NC_020564	AAGTTG	2	12	562128	562139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218344
219	NC_020564	CTGGTA	2	12	562911	562922	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	470218344
220	NC_020564	ACGACT	2	12	564635	564646	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470218346
221	NC_020564	AACGTG	2	12	565608	565619	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	470218346
222	NC_020564	TTCGAA	2	12	566129	566140	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470218346
223	NC_020564	TACAGC	2	12	568375	568386	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470218348
224	NC_020564	TTGCTA	2	12	568656	568667	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470218348
225	NC_020564	AAATCA	2	12	569779	569790	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	470218349
226	NC_020564	TTATGA	2	12	575423	575434	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470218353
227	NC_020564	TTTCTT	2	12	578617	578628	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	470218356
228	NC_020564	AAGCAC	2	12	579545	579556	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	470218357
229	NC_020564	ACTGCA	2	12	581551	581562	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470218359
230	NC_020564	TTAAAA	2	12	581947	581958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218359
231	NC_020564	TCAGAT	2	12	583489	583500	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470218359
232	NC_020564	GACTCA	2	12	583504	583515	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470218359
233	NC_020564	GACTCA	2	12	583522	583533	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470218359
234	NC_020564	GACTCA	2	12	583552	583563	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470218359
235	NC_020564	GACTCA	2	12	583624	583635	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470218359
236	NC_020564	GACTCA	2	12	583672	583683	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470218359
237	NC_020564	TCAGAT	2	12	583729	583740	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470218359
238	NC_020564	GATTCA	2	12	583834	583845	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470218359
239	NC_020564	GATTCA	2	12	583852	583863	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470218359
240	NC_020564	TCAGAT	2	12	583873	583884	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470218359
241	NC_020564	GACTCA	2	12	583888	583899	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470218359
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248	NC_020564	GATTCA	2	12	587949	587960	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470218361
249	NC_020564	GATTCA	2	12	587967	587978	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470218361
250	NC_020564	GATTCA	2	12	587985	587996	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470218361
251	NC_020564	GACTCA	2	12	588003	588014	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470218361
252	NC_020564	GACTCA	2	12	588021	588032	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470218361
253	NC_020564	GATTCA	2	12	588039	588050	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470218361
254	NC_020564	TCAGAC	2	12	588060	588071	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470218361
255	NC_020564	GATTCA	2	12	588075	588086	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470218361
256	NC_020564	GACTCA	2	12	588093	588104	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470218361
257	NC_020564	GACTCA	2	12	588147	588158	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470218361
258	NC_020564	GACTCA	2	12	588183	588194	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470218361
259	NC_020564	GATTCA	2	12	588201	588212	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470218361
260	NC_020564	GATTCA	2	12	588219	588230	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470218361
261	NC_020564	GATTCA	2	12	588237	588248	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470218361
262	NC_020564	TCAGAT	2	12	588258	588269	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470218361
263	NC_020564	TCAGAC	2	12	588276	588287	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470218361
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282	NC_020564	GCAATT	2	12	612513	612524	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470218379
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328	NC_020564	TAATAT	2	12	733070	733081	50 %	50 %	0 %	0 %	470218475
329	NC_020564	ATCAGA	2	12	741735	741746	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470218484
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332	NC_020564	AAAAGA	2	12	747212	747223	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	470218487
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337	NC_020564	AATTTA	2	12	752009	752020	50 %	50 %	0 %	0 %	470218490
338	NC_020564	TCAATA	2	12	755463	755474	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	470218493
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340	NC_020564	ATGCTG	2	12	759353	759364	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	470218496
341	NC_020564	CTGGTG	2	12	761731	761742	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	470218497
342	NC_020564	GAAAAA	2	12	761999	762010	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	470218497
343	NC_020564	TATATG	2	12	763009	763020	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470218497
344	NC_020564	ATTCTT	2	12	763706	763717	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	470218498
345	NC_020564	AATGAT	2	12	764524	764535	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470218499
346	NC_020564	CAACTA	2	12	768334	768345	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	470218502
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349	NC_020564	ATCGAT	2	12	776906	776917	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470218510
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443	NC_020564	TTCCAG	2	12	961702	961713	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	470218640
444	NC_020564	AAGTAG	2	12	963320	963331	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	470218641
445	NC_020564	TGACGA	2	12	968170	968181	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	470218645
446	NC_020564	AAAGTA	2	12	971134	971145	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	470218648
447	NC_020564	ATGTTG	2	12	974192	974203	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	470218649
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449	NC_020564	TTTAAC	2	12	983199	983210	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	470218655
450	NC_020564	TGACAA	2	12	987083	987094	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470218657
451	NC_020564	AAAATA	2	12	987283	987294	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	470218657
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453	NC_020564	TGCATT	2	12	991039	991050	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470218659
454	NC_020564	AAAATA	2	12	991423	991434	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	470218659
455	NC_020564	TAGAGG	2	12	992415	992426	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	470218660
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