MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 8958

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020564	ATT	2	6	125	130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020564	GTC	2	6	318	323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_020564	TAA	2	6	384	389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020564	TTA	2	6	415	420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020564	ATT	2	6	432	437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020564	TAA	3	9	1920	1928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020564	CCA	2	6	2071	2076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_020564	CTA	3	9	2088	2096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_020564	AAT	2	6	3352	3357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020564	TAA	2	6	3447	3452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020564	ATT	2	6	3673	3678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020564	AAG	2	6	3686	3691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020564	GTA	2	6	3694	3699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020564	ATT	2	6	3742	3747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020564	TGG	2	6	3753	3758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020564	AGG	2	6	6991	6996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020564	TAT	2	6	10653	10658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020564	ATT	3	9	10673	10681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020564	ATT	2	6	10739	10744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020564	ACA	2	6	10755	10760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_020564	ATA	2	6	10798	10803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020564	AAG	2	6	10858	10863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020564	TAA	2	6	12484	12489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020564	ATA	2	6	12755	12760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020564	ATT	2	6	12768	12773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020564	ATA	2	6	14149	14154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020564	GTG	2	6	14164	14169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020564	AAC	2	6	14228	14233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_020564	CAA	2	6	14281	14286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_020564	ATG	2	6	14299	14304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020564	TAT	2	6	14344	14349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020564	GTA	2	6	14385	14390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020564	GAT	3	9	14425	14433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020564	TCA	2	6	14469	14474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_020564	AAC	2	6	14509	14514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_020564	GAT	2	6	14590	14595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020564	TAT	2	6	14678	14683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020564	AGG	2	6	14716	14721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020564	TGT	2	6	15529	15534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020564	ATT	2	6	15593	15598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020564	ATT	2	6	15704	15709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020564	TCA	2	6	15917	15922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_020564	CTT	2	6	16061	16066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_020564	AGG	2	6	16100	16105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020564	CTA	2	6	17110	17115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_020564	AAT	2	6	17211	17216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020564	TTA	2	6	17285	17290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020564	ATA	2	6	17354	17359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020564	AAG	2	6	20347	20352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020564	CTT	2	6	20375	20380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_020564	CAA	2	6	20466	20471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_020564	GGT	2	6	20547	20552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020564	AAG	2	6	20695	20700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020564	AAT	2	6	22187	22192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020564	GAT	2	6	22199	22204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020564	AGG	2	6	23791	23796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020564	GAT	2	6	23890	23895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020564	AAG	2	6	23909	23914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020564	TAA	2	6	23928	23933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020564	ATT	2	6	24021	24026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020564	ATA	2	6	24027	24032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020564	TTC	2	6	24072	24077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_020564	CGG	2	6	24197	24202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_020564	TTA	2	6	24492	24497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020564	TTC	2	6	24529	24534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_020564	CCA	2	6	24546	24551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_020564	TCC	2	6	24553	24558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_020564	AAT	2	6	24590	24595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020564	TAT	2	6	24651	24656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020564	TCA	2	6	24670	24675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_020564	CCG	2	6	24701	24706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_020564	TAA	2	6	24715	24720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020564	ATA	2	6	24898	24903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020564	TAA	2	6	29600	29605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020564	TCA	2	6	29621	29626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_020564	TAA	2	6	29787	29792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020564	ATA	2	6	29861	29866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020564	CTG	2	6	30807	30812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_020564	GAC	2	6	30816	30821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_020564	TGG	2	6	30847	30852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020564	TGT	2	6	30861	30866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020564	AAT	2	6	30925	30930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020564	TAC	2	6	33341	33346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_020564	TAA	2	6	33437	33442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020564	AAG	2	6	34254	34259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020564	ATA	2	6	34328	34333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020564	GAA	2	6	34447	34452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020564	TAA	2	6	35784	35789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020564	TAA	2	6	35939	35944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020564	ATT	2	6	35979	35984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020564	TAA	2	6	36011	36016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020564	GTT	2	6	36018	36023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020564	AAT	2	6	36035	36040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020564	ATG	2	6	36118	36123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020564	ATT	2	6	36181	36186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020564	TAT	2	6	36215	36220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020564	TTA	2	6	36277	36282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020564	AGA	2	6	36303	36308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020564	GAA	2	6	36445	36450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020564	AGA	2	6	36546	36551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020564	TGA	2	6	36602	36607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020564	TAA	2	6	36837	36842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020564	CTT	2	6	37233	37238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_020564	ATA	2	6	37290	37295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020564	GAT	2	6	38188	38193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020564	TAG	2	6	38198	38203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020564	AGA	3	9	38238	38246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020564	CAA	2	6	38261	38266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_020564	AGA	2	6	38379	38384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020564	GAA	2	6	38398	38403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020564	TTA	2	6	38438	38443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020564	TTA	2	6	38591	38596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020564	ATA	2	6	38604	38609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020564	TCC	2	6	40665	40670	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_020564	GTA	2	6	40689	40694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020564	GTA	2	6	40705	40710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020564	AAT	2	6	40721	40726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020564	ATC	2	6	40764	40769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_020564	AAG	2	6	41754	41759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020564	CCA	2	6	41906	41911	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_020564	CAC	2	6	43512	43517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_020564	TCG	2	6	43532	43537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_020564	CAA	2	6	43560	43565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_020564	TTC	2	6	44154	44159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_020564	ATA	2	6	44175	44180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020564	CAT	2	6	44192	44197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_020564	GTT	2	6	44282	44287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020564	TCT	2	6	44320	44325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_020564	TCC	2	6	44467	44472	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_020564	ATG	2	6	44489	44494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020564	ATT	2	6	44545	44550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020564	CTT	2	6	44566	44571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_020564	TAG	2	6	44573	44578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020564	TGA	2	6	44659	44664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020564	TCA	2	6	44715	44720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_020564	TAG	2	6	44724	44729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020564	CTG	2	6	44797	44802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_020564	CTT	2	6	44803	44808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_020564	GTT	2	6	44886	44891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020564	CCT	2	6	44904	44909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_020564	ATA	2	6	44948	44953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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