MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Sphingomonas sp. MM-1 plasmid pISP4

Total Repeats: 45

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020563	TCCCC	2	10	32	41	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
2	NC_020563	TCGGC	2	10	1248	1257	0 %	20 %	40 %	40 %	470211926
3	NC_020563	GCCCT	2	10	1452	1461	0 %	20 %	20 %	60 %	470211927
4	NC_020563	GCGCG	2	10	1717	1726	0 %	0 %	60 %	40 %	470211927
5	NC_020563	GCGCC	2	10	1807	1816	0 %	0 %	40 %	60 %	470211927
6	NC_020563	CGACA	2	10	4123	4132	40 %	0 %	20 %	40 %	470211930
7	NC_020563	GCGAC	2	10	5548	5557	20 %	0 %	40 %	40 %	470211931
8	NC_020563	GCTCG	2	10	5957	5966	0 %	20 %	40 %	40 %	470211931
9	NC_020563	GTGAT	2	10	6070	6079	20 %	40 %	40 %	0 %	470211932
10	NC_020563	ATCCG	2	10	7355	7364	20 %	20 %	20 %	40 %	470211934
11	NC_020563	CGGAC	2	10	8069	8078	20 %	0 %	40 %	40 %	470211935
12	NC_020563	GCCCT	2	10	8328	8337	0 %	20 %	20 %	60 %	470211935
13	NC_020563	CGTCC	2	10	8740	8749	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
14	NC_020563	GTGAT	2	10	9469	9478	20 %	40 %	40 %	0 %	470211937
15	NC_020563	ATCAC	2	10	13128	13137	40 %	20 %	0 %	40 %	470211942
16	NC_020563	ATACG	2	10	13588	13597	40 %	20 %	20 %	20 %	470211943
17	NC_020563	GCCGG	2	10	16721	16730	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
18	NC_020563	CTTTC	2	10	17116	17125	0 %	60 %	0 %	40 %	470211948
19	NC_020563	CGATC	2	10	17267	17276	20 %	20 %	20 %	40 %	470211948
20	NC_020563	GCCGA	2	10	17806	17815	20 %	0 %	40 %	40 %	470211949
21	NC_020563	GTGAT	2	10	18064	18073	20 %	40 %	40 %	0 %	470211950
22	NC_020563	CGCTT	2	10	19293	19302	0 %	40 %	20 %	40 %	470211951
23	NC_020563	GGATC	2	10	19751	19760	20 %	20 %	40 %	20 %	470211951
24	NC_020563	GTGAT	2	10	20247	20256	20 %	40 %	40 %	0 %	470211953
25	NC_020563	TCCCA	2	10	20652	20661	20 %	20 %	0 %	60 %	470211954
26	NC_020563	CAGCG	2	10	20931	20940	20 %	0 %	40 %	40 %	470211954
27	NC_020563	TCGCC	2	10	21331	21340	0 %	20 %	20 %	60 %	470211954
28	NC_020563	AACCA	2	10	21508	21517	60 %	0 %	0 %	40 %	470211954
29	NC_020563	GCGCG	2	10	21562	21571	0 %	0 %	60 %	40 %	470211954
30	NC_020563	CATCG	2	10	22262	22271	20 %	20 %	20 %	40 %	470211954
31	NC_020563	CCGGC	2	10	22287	22296	0 %	0 %	40 %	60 %	470211954
32	NC_020563	CGGTG	2	10	22383	22392	0 %	20 %	60 %	20 %	470211954
33	NC_020563	CGGGC	2	10	22689	22698	0 %	0 %	60 %	40 %	470211954
34	NC_020563	AAGCG	2	10	22838	22847	40 %	0 %	40 %	20 %	470211954
35	NC_020563	GCGCC	2	10	23706	23715	0 %	0 %	40 %	60 %	470211955
36	NC_020563	GATCG	2	10	24660	24669	20 %	20 %	40 %	20 %	470211956
37	NC_020563	GCCGC	2	10	26801	26810	0 %	0 %	40 %	60 %	470211958
38	NC_020563	CGGCG	2	10	28934	28943	0 %	0 %	60 %	40 %	470211959
39	NC_020563	CCATG	2	10	29011	29020	20 %	20 %	20 %	40 %	470211959
40	NC_020563	TCGCC	2	10	29038	29047	0 %	20 %	20 %	60 %	470211959
41	NC_020563	GCCCG	2	10	29049	29058	0 %	0 %	40 %	60 %	470211959
42	NC_020563	GTCGC	2	10	29073	29082	0 %	20 %	40 %	40 %	470211959
43	NC_020563	CGCGA	2	10	29355	29364	20 %	0 %	40 %	40 %	470211959
44	NC_020563	GCCGC	2	10	29409	29418	0 %	0 %	40 %	60 %	470211959
45	NC_020563	TCCCG	2	10	29713	29722	0 %	20 %	20 %	60 %	470211959

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.