MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Sphingomonas sp. MM-1 plasmid pISP4

Total Repeats: 96

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020563	GC	3	6	990	995	0 %	0 %	50 %	50 %	470211925
2	NC_020563	CG	3	6	1037	1042	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_020563	CG	3	6	1171	1176	0 %	0 %	50 %	50 %	470211926
4	NC_020563	CG	3	6	1621	1626	0 %	0 %	50 %	50 %	470211927
5	NC_020563	GC	3	6	1860	1865	0 %	0 %	50 %	50 %	470211927
6	NC_020563	GC	5	10	1933	1942	0 %	0 %	50 %	50 %	470211927
7	NC_020563	GC	3	6	2202	2207	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_020563	GC	4	8	3101	3108	0 %	0 %	50 %	50 %	470211929
9	NC_020563	GC	3	6	3457	3462	0 %	0 %	50 %	50 %	470211929
10	NC_020563	GC	4	8	3948	3955	0 %	0 %	50 %	50 %	470211930
11	NC_020563	GC	3	6	3974	3979	0 %	0 %	50 %	50 %	470211930
12	NC_020563	GC	3	6	3997	4002	0 %	0 %	50 %	50 %	470211930
13	NC_020563	GC	3	6	4229	4234	0 %	0 %	50 %	50 %	470211930
14	NC_020563	CG	3	6	5188	5193	0 %	0 %	50 %	50 %	470211931
15	NC_020563	CG	3	6	5435	5440	0 %	0 %	50 %	50 %	470211931
16	NC_020563	CG	3	6	5692	5697	0 %	0 %	50 %	50 %	470211931
17	NC_020563	CG	3	6	5796	5801	0 %	0 %	50 %	50 %	470211931
18	NC_020563	GC	3	6	5922	5927	0 %	0 %	50 %	50 %	470211931
19	NC_020563	GA	3	6	6723	6728	50 %	0 %	50 %	0 %	470211932
20	NC_020563	CG	3	6	8247	8252	0 %	0 %	50 %	50 %	470211935
21	NC_020563	TC	3	6	8621	8626	0 %	50 %	0 %	50 %	470211935
22	NC_020563	CG	3	6	8639	8644	0 %	0 %	50 %	50 %	470211935
23	NC_020563	CG	3	6	8877	8882	0 %	0 %	50 %	50 %	470211936
24	NC_020563	GA	3	6	10122	10127	50 %	0 %	50 %	0 %	470211937
25	NC_020563	GC	4	8	10359	10366	0 %	0 %	50 %	50 %	470211938
26	NC_020563	CG	4	8	10540	10547	0 %	0 %	50 %	50 %	470211938
27	NC_020563	CG	4	8	10790	10797	0 %	0 %	50 %	50 %	470211939
28	NC_020563	GA	3	6	11198	11203	50 %	0 %	50 %	0 %	470211939
29	NC_020563	CG	3	6	11538	11543	0 %	0 %	50 %	50 %	485191030
30	NC_020563	GC	3	6	12061	12066	0 %	0 %	50 %	50 %	485191030
31	NC_020563	CG	3	6	12328	12333	0 %	0 %	50 %	50 %	470211941
32	NC_020563	CT	3	6	12478	12483	0 %	50 %	0 %	50 %	470211942
33	NC_020563	CG	3	6	13893	13898	0 %	0 %	50 %	50 %	470211944
34	NC_020563	CG	4	8	16049	16056	0 %	0 %	50 %	50 %	470211946
35	NC_020563	AT	3	6	16448	16453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020563	CG	3	6	16710	16715	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_020563	GC	3	6	17676	17681	0 %	0 %	50 %	50 %	470211949
38	NC_020563	CG	3	6	17889	17894	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_020563	GA	3	6	18717	18722	50 %	0 %	50 %	0 %	470211950
40	NC_020563	TC	3	6	18875	18880	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_020563	CG	3	6	20147	20152	0 %	0 %	50 %	50 %	470211952
42	NC_020563	CG	3	6	20789	20794	0 %	0 %	50 %	50 %	470211954
43	NC_020563	CG	3	6	21153	21158	0 %	0 %	50 %	50 %	470211954
44	NC_020563	GC	3	6	22054	22059	0 %	0 %	50 %	50 %	470211954
45	NC_020563	CG	4	8	22066	22073	0 %	0 %	50 %	50 %	470211954
46	NC_020563	GC	3	6	22114	22119	0 %	0 %	50 %	50 %	470211954
47	NC_020563	GC	3	6	22311	22316	0 %	0 %	50 %	50 %	470211954
48	NC_020563	GC	3	6	22584	22589	0 %	0 %	50 %	50 %	470211954
49	NC_020563	CG	4	8	23052	23059	0 %	0 %	50 %	50 %	470211954
50	NC_020563	GC	3	6	23086	23091	0 %	0 %	50 %	50 %	470211954
51	NC_020563	GC	3	6	23378	23383	0 %	0 %	50 %	50 %	470211954
52	NC_020563	GC	3	6	23469	23474	0 %	0 %	50 %	50 %	470211954
53	NC_020563	GC	3	6	23997	24002	0 %	0 %	50 %	50 %	470211955
54	NC_020563	GC	4	8	24515	24522	0 %	0 %	50 %	50 %	470211956
55	NC_020563	CG	3	6	24584	24589	0 %	0 %	50 %	50 %	470211956
56	NC_020563	CG	4	8	24790	24797	0 %	0 %	50 %	50 %	470211956
57	NC_020563	GT	3	6	25099	25104	0 %	50 %	50 %	0 %	470211956
58	NC_020563	TG	3	6	25761	25766	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020563	GA	3	6	26244	26249	50 %	0 %	50 %	0 %	470211957
60	NC_020563	AG	3	6	26509	26514	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020563	CG	4	8	26722	26729	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_020563	GC	3	6	26885	26890	0 %	0 %	50 %	50 %	470211958
63	NC_020563	GC	4	8	26981	26988	0 %	0 %	50 %	50 %	470211958
64	NC_020563	GC	5	10	27076	27085	0 %	0 %	50 %	50 %	470211958
65	NC_020563	CG	5	10	27330	27339	0 %	0 %	50 %	50 %	470211958
66	NC_020563	GC	3	6	27744	27749	0 %	0 %	50 %	50 %	470211959
67	NC_020563	CG	3	6	27769	27774	0 %	0 %	50 %	50 %	470211959
68	NC_020563	CG	3	6	28004	28009	0 %	0 %	50 %	50 %	470211959
69	NC_020563	GC	4	8	28048	28055	0 %	0 %	50 %	50 %	470211959
70	NC_020563	CG	4	8	28298	28305	0 %	0 %	50 %	50 %	470211959
71	NC_020563	CG	3	6	28444	28449	0 %	0 %	50 %	50 %	470211959
72	NC_020563	GC	3	6	28579	28584	0 %	0 %	50 %	50 %	470211959
73	NC_020563	CG	3	6	28803	28808	0 %	0 %	50 %	50 %	470211959
74	NC_020563	CG	4	8	28867	28874	0 %	0 %	50 %	50 %	470211959
75	NC_020563	CG	3	6	29296	29301	0 %	0 %	50 %	50 %	470211959
76	NC_020563	CG	4	8	29449	29456	0 %	0 %	50 %	50 %	470211959
77	NC_020563	GC	3	6	29590	29595	0 %	0 %	50 %	50 %	470211959
78	NC_020563	CG	3	6	29651	29656	0 %	0 %	50 %	50 %	470211959
79	NC_020563	CG	3	6	29686	29691	0 %	0 %	50 %	50 %	470211959
80	NC_020563	CG	4	8	29902	29909	0 %	0 %	50 %	50 %	470211959
81	NC_020563	CG	3	6	30316	30321	0 %	0 %	50 %	50 %	470211959
82	NC_020563	CG	3	6	30340	30345	0 %	0 %	50 %	50 %	470211959
83	NC_020563	CG	3	6	30398	30403	0 %	0 %	50 %	50 %	470211959
84	NC_020563	GC	3	6	30648	30653	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_020563	CT	3	6	30661	30666	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_020563	CG	4	8	30716	30723	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_020563	GA	3	6	30763	30768	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020563	GC	3	6	31084	31089	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_020563	GC	3	6	31217	31222	0 %	0 %	50 %	50 %	470211961
90	NC_020563	GC	3	6	31237	31242	0 %	0 %	50 %	50 %	470211961
91	NC_020563	GC	3	6	31296	31301	0 %	0 %	50 %	50 %	470211961
92	NC_020563	CG	3	6	31894	31899	0 %	0 %	50 %	50 %	470211962
93	NC_020563	CG	3	6	31983	31988	0 %	0 %	50 %	50 %	470211962
94	NC_020563	CG	3	6	31999	32004	0 %	0 %	50 %	50 %	470211962
95	NC_020563	CG	4	8	32048	32055	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_020563	CG	3	6	32129	32134	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.