MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Sphingomonas sp. MM-1 plasmid pISP1

Total Repeats: 31

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020562	GCCGT	2	10	1573	1582	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
2	NC_020562	TCCTT	2	10	14326	14335	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
3	NC_020562	AATGC	2	10	18029	18038	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_020562	GACAT	2	10	27785	27794	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_020562	GGGTT	2	10	28582	28591	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020562	CGTTC	2	10	30251	30260	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
7	NC_020562	GGCGT	2	10	30400	30409	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
8	NC_020562	CGGCG	2	10	35546	35555	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
9	NC_020562	GCCCC	2	10	36103	36112	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
10	NC_020562	GGCGG	2	10	39256	39265	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
11	NC_020562	TGCGC	2	10	58914	58923	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
12	NC_020562	GCGCA	2	10	58959	58968	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
13	NC_020562	CCCCG	2	10	60738	60747	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
14	NC_020562	AGGCA	2	10	66984	66993	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_020562	GGCGC	2	10	81885	81894	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
16	NC_020562	GGCCA	2	10	84037	84046	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
17	NC_020562	AGCCG	2	10	84073	84082	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
18	NC_020562	GCCGG	2	10	94527	94536	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
19	NC_020562	TCCCC	2	10	113533	113542	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
20	NC_020562	TTCCC	2	10	114292	114301	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
21	NC_020562	GGGGT	2	10	126623	126632	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020562	GCGCT	2	10	130128	130137	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
23	NC_020562	AAGGG	2	10	131864	131873	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020562	GCTCC	2	10	133190	133199	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
25	NC_020562	AGCAA	2	10	139560	139569	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_020562	CGGAA	2	10	139591	139600	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_020562	CGGTC	2	10	142818	142827	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
28	NC_020562	CAGGC	2	10	143804	143813	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
29	NC_020562	GGACG	2	10	150740	150749	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
30	NC_020562	GCGCG	2	10	151768	151777	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
31	NC_020562	GGGGA	2	10	159448	159457	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.