MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Sphingomonas sp. MM-1 plasmid pISP1

Total Repeats: 90

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020562	CCCT	2	8	1403	1410	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
2	NC_020562	CTAA	2	8	1475	1482	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_020562	CCGG	2	8	2697	2704	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_020562	GGAT	2	8	2716	2723	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020562	TCGC	2	8	2989	2996	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_020562	AAGA	2	8	3025	3032	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020562	GCGA	2	8	3521	3528	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_020562	GTTT	2	8	3756	3763	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020562	ACGG	2	8	3917	3924	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_020562	TTGG	2	8	8608	8615	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020562	ATGG	2	8	14084	14091	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020562	CGCC	2	8	14197	14204	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13	NC_020562	AGCC	2	8	16614	16621	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_020562	CAGG	2	8	16907	16914	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_020562	TCAT	2	8	16998	17005	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_020562	GGGC	2	8	19169	19176	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
17	NC_020562	CCGA	2	8	23406	23413	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_020562	GATC	2	8	25051	25058	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_020562	TGGA	2	8	25155	25162	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020562	ATTA	2	8	28444	28451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020562	CGAG	2	8	30060	30067	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_020562	ACCT	2	8	30113	30120	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_020562	GCTC	2	8	30238	30245	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_020562	CCCA	2	8	30313	30320	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
25	NC_020562	CGTC	2	8	30321	30328	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_020562	GAAG	2	8	30332	30339	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020562	CACC	2	8	30572	30579	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
28	NC_020562	ATCG	2	8	30839	30846	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_020562	GGGC	2	8	53363	53370	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
30	NC_020562	TTTG	2	8	53894	53901	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020562	CCCT	2	8	58944	58951	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
32	NC_020562	GAGC	2	8	60693	60700	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_020562	GCGG	2	8	61112	61119	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
34	NC_020562	TCCG	2	8	70169	70176	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_020562	CAGA	2	8	70241	70248	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_020562	TGCT	2	8	71637	71644	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_020562	GGCA	2	8	71772	71779	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_020562	CCTT	2	8	73942	73949	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_020562	GCAA	2	8	81821	81828	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_020562	CCCG	2	8	81943	81950	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
41	NC_020562	GGCG	2	8	82528	82535	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
42	NC_020562	GCGG	2	8	82889	82896	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
43	NC_020562	GCGG	2	8	84006	84013	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
44	NC_020562	GCCC	2	8	85057	85064	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
45	NC_020562	AAGG	2	8	85079	85086	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020562	GCAA	2	8	85552	85559	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_020562	CGGT	2	8	85618	85625	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_020562	CGGT	2	8	86702	86709	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_020562	GACA	2	8	89461	89468	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_020562	AGGA	2	8	105100	105107	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020562	ATCG	2	8	108444	108451	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_020562	CGAG	2	8	108925	108932	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_020562	GAGG	2	8	109027	109034	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020562	CGAT	2	8	109239	109246	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_020562	GCCT	2	8	110884	110891	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_020562	CGCC	2	8	111793	111800	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
57	NC_020562	CCAG	2	8	112920	112927	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_020562	TGAT	2	8	113406	113413	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020562	GGCG	2	8	113419	113426	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
60	NC_020562	AAAG	2	8	113556	113563	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020562	TTCC	2	8	118501	118508	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_020562	CATT	2	8	118620	118627	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_020562	CGCA	2	8	118697	118704	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_020562	CGCA	2	8	125344	125351	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_020562	GATC	2	8	126665	126672	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_020562	AGGA	2	8	126768	126775	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020562	GGAC	2	8	128252	128259	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_020562	CAAG	2	8	129355	129362	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_020562	GCCA	2	8	130007	130014	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_020562	ATGG	2	8	130179	130186	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020562	ACCA	2	8	132997	133004	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_020562	TTTC	2	8	133869	133876	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_020562	GCTC	2	8	133898	133905	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_020562	CGCA	2	8	133930	133937	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_020562	AATC	2	8	137185	137192	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_020562	AGCC	2	8	137849	137856	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_020562	CACC	2	8	139244	139251	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
78	NC_020562	CAAT	2	8	142144	142151	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_020562	ATGA	2	8	142708	142715	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020562	GCCG	2	8	142868	142875	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_020562	AACC	2	8	144169	144176	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_020562	ACGG	2	8	145003	145010	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_020562	GCCG	2	8	150667	150674	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_020562	CGCT	2	8	151817	151824	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_020562	GGCA	2	8	151913	151920	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_020562	CCTG	2	8	159708	159715	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_020562	TTTG	2	8	159881	159888	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020562	AGGG	2	8	160262	160269	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020562	CGGC	2	8	166927	166934	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_020562	CGGA	2	8	169171	169178	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.