MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Sphingomonas sp. MM-1 plasmid pISP1

Total Repeats: 2124

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020562	CGG	2	6	518	523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433975
2	NC_020562	CAT	2	6	525	530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433975
3	NC_020562	ACC	2	6	664	669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472433975
4	NC_020562	TGA	2	6	686	691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472433975
5	NC_020562	CAA	2	6	698	703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472433975
6	NC_020562	GCG	2	6	767	772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433975
7	NC_020562	TGG	2	6	851	856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472433975
8	NC_020562	ATC	2	6	906	911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433975
9	NC_020562	ACG	2	6	957	962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433975
10	NC_020562	TGA	2	6	998	1003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472433975
11	NC_020562	TCG	2	6	1018	1023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433975
12	NC_020562	GAT	2	6	1035	1040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472433975
13	NC_020562	GCC	2	6	1047	1052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433975
14	NC_020562	CGC	2	6	1175	1180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433975
15	NC_020562	GAT	2	6	1206	1211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472433975
16	NC_020562	GCC	2	6	1284	1289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433975
17	NC_020562	TCG	2	6	1321	1326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433975
18	NC_020562	GAG	2	6	1699	1704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472433976
19	NC_020562	CCA	2	6	1705	1710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472433976
20	NC_020562	GAC	2	6	1727	1732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433976
21	NC_020562	AAT	2	6	1748	1753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472433976
22	NC_020562	CAC	2	6	2239	2244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472433976
23	NC_020562	GAA	2	6	2261	2266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472433976
24	NC_020562	GTC	2	6	2349	2354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433976
25	NC_020562	CTT	2	6	2365	2370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472433976
26	NC_020562	GGC	2	6	4009	4014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433977
27	NC_020562	TGC	2	6	4015	4020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433977
28	NC_020562	TGG	2	6	4025	4030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472433977
29	NC_020562	CGC	2	6	4568	4573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433977
30	NC_020562	TCG	2	6	4632	4637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433977
31	NC_020562	GAG	2	6	5390	5395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472433978
32	NC_020562	GAG	2	6	5405	5410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472433978
33	NC_020562	CTT	2	6	5446	5451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472433978
34	NC_020562	CGG	2	6	5518	5523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433978
35	NC_020562	GGA	2	6	5539	5544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472433978
36	NC_020562	CGG	2	6	5548	5553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433978
37	NC_020562	GCT	2	6	5590	5595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433978
38	NC_020562	GCC	2	6	5597	5602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433978
39	NC_020562	AGC	2	6	5925	5930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433978
40	NC_020562	GAG	2	6	6077	6082	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472433978
41	NC_020562	CAG	2	6	6083	6088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433978
42	NC_020562	CGG	2	6	6091	6096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433978
43	NC_020562	TGC	2	6	6108	6113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433978
44	NC_020562	TTG	2	6	6129	6134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472433978
45	NC_020562	TGC	2	6	6141	6146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433978
46	NC_020562	TGA	2	6	6234	6239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472433978
47	NC_020562	CCG	2	6	6249	6254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433978
48	NC_020562	CAT	2	6	6274	6279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433978
49	NC_020562	ATC	2	6	6284	6289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433978
50	NC_020562	GCC	2	6	6296	6301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433978
51	NC_020562	TCG	2	6	6318	6323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433978
52	NC_020562	AAG	2	6	6339	6344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472433978
53	NC_020562	CGG	2	6	6505	6510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433978
54	NC_020562	TTC	2	6	6539	6544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472433978
55	NC_020562	CGC	2	6	6569	6574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433978
56	NC_020562	AAG	2	6	6584	6589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472433978
57	NC_020562	CTG	2	6	6594	6599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433978
58	NC_020562	CCT	2	6	6733	6738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472433979
59	NC_020562	TTC	2	6	6792	6797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472433979
60	NC_020562	AGG	2	6	6877	6882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472433979
61	NC_020562	CGA	2	6	7184	7189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433979
62	NC_020562	GCC	2	6	7455	7460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433979
63	NC_020562	GGC	2	6	7502	7507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433979
64	NC_020562	AGA	2	6	7508	7513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472433979
65	NC_020562	TGC	2	6	7544	7549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433979
66	NC_020562	CTT	2	6	7559	7564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472433979
67	NC_020562	ACG	2	6	7777	7782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433980
68	NC_020562	GGC	2	6	7841	7846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433980
69	NC_020562	ACC	2	6	8384	8389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472433980
70	NC_020562	GCA	2	6	8395	8400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433980
71	NC_020562	GCC	2	6	8401	8406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433980
72	NC_020562	GAG	2	6	8727	8732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472433981
73	NC_020562	GGC	2	6	8742	8747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433981
74	NC_020562	AAG	2	6	8775	8780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472433981
75	NC_020562	CAA	2	6	8936	8941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472433981
76	NC_020562	ATC	2	6	8952	8957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433981
77	NC_020562	TGC	2	6	8992	8997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433981
78	NC_020562	CCG	2	6	9019	9024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433981
79	NC_020562	GTG	2	6	9135	9140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472433981
80	NC_020562	CCA	2	6	9185	9190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472433981
81	NC_020562	GCT	2	6	9266	9271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433981
82	NC_020562	GCT	2	6	9350	9355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433981
83	NC_020562	TGC	2	6	9394	9399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433981
84	NC_020562	GAC	3	9	9489	9497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433981
85	NC_020562	AAT	2	6	9609	9614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472433981
86	NC_020562	CCG	2	6	9617	9622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433981
87	NC_020562	CCG	2	6	9646	9651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433981
88	NC_020562	CCG	2	6	9663	9668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433981
89	NC_020562	CAA	2	6	9704	9709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472433981
90	NC_020562	GAA	2	6	9752	9757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472433981
91	NC_020562	GTC	2	6	9798	9803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433981
92	NC_020562	GTG	2	6	9819	9824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472433981
93	NC_020562	GCC	2	6	9870	9875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433981
94	NC_020562	CGA	2	6	9914	9919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433981
95	NC_020562	GCG	2	6	10118	10123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433982
96	NC_020562	CCA	2	6	10171	10176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472433982
97	NC_020562	GTC	2	6	10220	10225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433982
98	NC_020562	CGC	2	6	10237	10242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433982
99	NC_020562	TCG	2	6	10260	10265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433982
100	NC_020562	ATC	2	6	10302	10307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433982
101	NC_020562	TGC	2	6	10322	10327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433982
102	NC_020562	CGG	2	6	10354	10359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433982
103	NC_020562	AGG	2	6	10371	10376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472433982
104	NC_020562	GCT	2	6	10414	10419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433982
105	NC_020562	CCA	2	6	10477	10482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472433982
106	NC_020562	TTC	2	6	10485	10490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472433982
107	NC_020562	AGC	2	6	10587	10592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433982
108	NC_020562	AGG	2	6	10713	10718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472433982
109	NC_020562	CTG	2	6	10727	10732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433982
110	NC_020562	ACC	2	6	10810	10815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472433982
111	NC_020562	TGG	2	6	10873	10878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472433982
112	NC_020562	TCA	2	6	10906	10911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433982
113	NC_020562	AGG	2	6	11071	11076	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472433982
114	NC_020562	CGA	2	6	11104	11109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433982
115	NC_020562	GCT	2	6	11117	11122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433982
116	NC_020562	GCG	2	6	11146	11151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433982
117	NC_020562	CTG	2	6	11240	11245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433982
118	NC_020562	TCA	2	6	11259	11264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433982
119	NC_020562	GAA	2	6	11707	11712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472433983
120	NC_020562	TCA	2	6	11743	11748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433983
121	NC_020562	GAA	2	6	11796	11801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472433983
122	NC_020562	CGT	2	6	11849	11854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433983
123	NC_020562	GCT	2	6	11868	11873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433983
124	NC_020562	GCG	2	6	11913	11918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433983
125	NC_020562	AAT	2	6	11925	11930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472433983
126	NC_020562	GGC	2	6	12003	12008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433983
127	NC_020562	GAG	3	9	12012	12020	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472433983
128	NC_020562	TGG	2	6	12043	12048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472433983
129	NC_020562	GGC	2	6	12083	12088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433983
130	NC_020562	ATC	2	6	12123	12128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433983
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135	NC_020562	CGG	2	6	12269	12274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433983
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150	NC_020562	GAT	2	6	13658	13663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472433985
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162	NC_020562	TGC	2	6	15631	15636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433987
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250	NC_020562	GGC	2	6	22645	22650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433993
251	NC_020562	GCT	2	6	22651	22656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433993
252	NC_020562	GAC	2	6	22733	22738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433993
253	NC_020562	ATC	2	6	22881	22886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433993
254	NC_020562	CGG	3	9	22944	22952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433993
255	NC_020562	CCG	2	6	23013	23018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433993
256	NC_020562	CGG	2	6	23026	23031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433993
257	NC_020562	CTT	2	6	23032	23037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472433993
258	NC_020562	CCG	2	6	23055	23060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433993
259	NC_020562	CGC	2	6	23174	23179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433993
260	NC_020562	GAC	2	6	23234	23239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433993
261	NC_020562	CGC	2	6	23272	23277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433993
262	NC_020562	TCG	2	6	23310	23315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433993
263	NC_020562	TCG	2	6	23358	23363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433993
264	NC_020562	GAG	2	6	23488	23493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472433994
265	NC_020562	TCG	2	6	23528	23533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433994
266	NC_020562	TCG	2	6	23666	23671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433994
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269	NC_020562	GAA	2	6	23761	23766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472433994
270	NC_020562	CGA	2	6	23781	23786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433994
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272	NC_020562	GCG	2	6	23930	23935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433994
273	NC_020562	TCA	2	6	23936	23941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433994
274	NC_020562	TCA	2	6	24029	24034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433994
275	NC_020562	GCG	2	6	24035	24040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433994
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277	NC_020562	AGG	2	6	24092	24097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472433994
278	NC_020562	TCG	3	9	24128	24136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433994
279	NC_020562	CCG	2	6	24140	24145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433994
280	NC_020562	TCG	2	6	24173	24178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433994
281	NC_020562	GGC	2	6	24259	24264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433994
282	NC_020562	CGA	2	6	24296	24301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433994
283	NC_020562	GCG	2	6	24350	24355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433994
284	NC_020562	CGA	2	6	24462	24467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433994
285	NC_020562	GAA	2	6	24492	24497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472433994
286	NC_020562	GTT	2	6	25397	25402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472433995
287	NC_020562	CGA	2	6	25517	25522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433995
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289	NC_020562	CAT	2	6	25576	25581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433996
290	NC_020562	TCA	2	6	25623	25628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433996
291	NC_020562	GAC	2	6	25683	25688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433996
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293	NC_020562	CGG	2	6	25736	25741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433996
294	NC_020562	CGC	2	6	25812	25817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433996
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300	NC_020562	TCG	2	6	26045	26050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433996
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330	NC_020562	ATG	2	6	29040	29045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472433997
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332	NC_020562	CGG	2	6	29236	29241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433997
333	NC_020562	ACG	2	6	29320	29325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433997
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335	NC_020562	GCC	2	6	29941	29946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433998
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338	NC_020562	CTC	2	6	31003	31008	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472433999
339	NC_020562	GAT	2	6	31151	31156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472434000
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343	NC_020562	CGA	2	6	31372	31377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434001
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346	NC_020562	GCT	2	6	31847	31852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434002
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349	NC_020562	TCG	2	6	31890	31895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434002
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352	NC_020562	CGG	2	6	31952	31957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434002
353	NC_020562	ACC	2	6	31959	31964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472434002
354	NC_020562	ACC	2	6	32007	32012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472434002
355	NC_020562	GAT	2	6	32018	32023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472434002
356	NC_020562	GCG	2	6	32071	32076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434002
357	NC_020562	CGA	2	6	32167	32172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434002
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359	NC_020562	CAA	2	6	32291	32296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472434002
360	NC_020562	CAT	2	6	32309	32314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472434002
361	NC_020562	CGG	2	6	32426	32431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434002
362	NC_020562	CAA	3	9	32474	32482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472434002
363	NC_020562	TCG	2	6	32539	32544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434002
364	NC_020562	ACA	2	6	32611	32616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472434002
365	NC_020562	TCA	2	6	32635	32640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472434002
366	NC_020562	GCG	2	6	32641	32646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434002
367	NC_020562	CAC	2	6	32684	32689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472434002
368	NC_020562	GAT	2	6	32721	32726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472434002
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370	NC_020562	GCG	2	6	32817	32822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434002
371	NC_020562	ATA	2	6	33323	33328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472434003
372	NC_020562	GTC	2	6	33395	33400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434003
373	NC_020562	GAT	2	6	33470	33475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472434003
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375	NC_020562	CGC	2	6	33625	33630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434003
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498	NC_020562	GGC	2	6	41550	41555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434009
499	NC_020562	GCG	2	6	41584	41589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434009
500	NC_020562	CGG	2	6	41602	41607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434009

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