MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Sphingomonas sp. MM-1 plasmid pISP1

Total Repeats: 389

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020562	GT	3	6	680	685	0 %	50 %	50 %	0 %	472433975
2	NC_020562	GC	3	6	899	904	0 %	0 %	50 %	50 %	472433975
3	NC_020562	GT	3	6	1328	1333	0 %	50 %	50 %	0 %	472433975
4	NC_020562	AT	3	6	1799	1804	50 %	50 %	0 %	0 %	472433976
5	NC_020562	TG	3	6	1869	1874	0 %	50 %	50 %	0 %	472433976
6	NC_020562	GT	3	6	2233	2238	0 %	50 %	50 %	0 %	472433976
7	NC_020562	GC	3	6	2304	2309	0 %	0 %	50 %	50 %	472433976
8	NC_020562	CT	3	6	4080	4085	0 %	50 %	0 %	50 %	472433977
9	NC_020562	CG	3	6	5578	5583	0 %	0 %	50 %	50 %	472433978
10	NC_020562	GC	3	6	5919	5924	0 %	0 %	50 %	50 %	472433978
11	NC_020562	CT	3	6	6153	6158	0 %	50 %	0 %	50 %	472433978
12	NC_020562	CG	3	6	6695	6700	0 %	0 %	50 %	50 %	472433979
13	NC_020562	GC	3	6	7086	7091	0 %	0 %	50 %	50 %	472433979
14	NC_020562	GA	3	6	8329	8334	50 %	0 %	50 %	0 %	472433980
15	NC_020562	GC	3	6	8678	8683	0 %	0 %	50 %	50 %	472433981
16	NC_020562	GC	3	6	8707	8712	0 %	0 %	50 %	50 %	472433981
17	NC_020562	GC	4	8	9779	9786	0 %	0 %	50 %	50 %	472433981
18	NC_020562	CG	3	6	10142	10147	0 %	0 %	50 %	50 %	472433982
19	NC_020562	GC	4	8	10203	10210	0 %	0 %	50 %	50 %	472433982
20	NC_020562	CG	3	6	11183	11188	0 %	0 %	50 %	50 %	472433982
21	NC_020562	GC	3	6	12379	12384	0 %	0 %	50 %	50 %	472433983
22	NC_020562	AT	3	6	12410	12415	50 %	50 %	0 %	0 %	472433983
23	NC_020562	CG	3	6	13223	13228	0 %	0 %	50 %	50 %	472433984
24	NC_020562	GC	3	6	15097	15102	0 %	0 %	50 %	50 %	472433986
25	NC_020562	GC	4	8	15221	15228	0 %	0 %	50 %	50 %	472433986
26	NC_020562	GC	3	6	15396	15401	0 %	0 %	50 %	50 %	472433986
27	NC_020562	GC	3	6	15538	15543	0 %	0 %	50 %	50 %	472433986
28	NC_020562	CT	3	6	15696	15701	0 %	50 %	0 %	50 %	472433987
29	NC_020562	GC	3	6	18654	18659	0 %	0 %	50 %	50 %	472433989
30	NC_020562	GC	3	6	18796	18801	0 %	0 %	50 %	50 %	472433989
31	NC_020562	GC	3	6	18862	18867	0 %	0 %	50 %	50 %	472433989
32	NC_020562	GC	3	6	19081	19086	0 %	0 %	50 %	50 %	472433989
33	NC_020562	AC	3	6	19390	19395	50 %	0 %	0 %	50 %	472433990
34	NC_020562	GC	3	6	19502	19507	0 %	0 %	50 %	50 %	472433990
35	NC_020562	CG	3	6	19854	19859	0 %	0 %	50 %	50 %	472433990
36	NC_020562	GC	3	6	20382	20387	0 %	0 %	50 %	50 %	472433991
37	NC_020562	CG	3	6	21224	21229	0 %	0 %	50 %	50 %	472433991
38	NC_020562	GC	3	6	21348	21353	0 %	0 %	50 %	50 %	472433991
39	NC_020562	GC	3	6	21546	21551	0 %	0 %	50 %	50 %	472433992
40	NC_020562	GC	3	6	22008	22013	0 %	0 %	50 %	50 %	472433993
41	NC_020562	GC	3	6	22016	22021	0 %	0 %	50 %	50 %	472433993
42	NC_020562	GC	3	6	22078	22083	0 %	0 %	50 %	50 %	472433993
43	NC_020562	GC	4	8	22247	22254	0 %	0 %	50 %	50 %	472433993
44	NC_020562	GC	3	6	22604	22609	0 %	0 %	50 %	50 %	472433993
45	NC_020562	CG	3	6	22661	22666	0 %	0 %	50 %	50 %	472433993
46	NC_020562	CG	3	6	22866	22871	0 %	0 %	50 %	50 %	472433993
47	NC_020562	GC	3	6	22992	22997	0 %	0 %	50 %	50 %	472433993
48	NC_020562	CG	3	6	23243	23248	0 %	0 %	50 %	50 %	472433993
49	NC_020562	CG	3	6	23801	23806	0 %	0 %	50 %	50 %	472433994
50	NC_020562	CG	3	6	23854	23859	0 %	0 %	50 %	50 %	472433994
51	NC_020562	GC	3	6	24165	24170	0 %	0 %	50 %	50 %	472433994
52	NC_020562	TC	3	6	24443	24448	0 %	50 %	0 %	50 %	472433994
53	NC_020562	GA	3	6	24449	24454	50 %	0 %	50 %	0 %	472433994
54	NC_020562	CG	3	6	24507	24512	0 %	0 %	50 %	50 %	472433994
55	NC_020562	GC	3	6	25525	25530	0 %	0 %	50 %	50 %	472433995
56	NC_020562	GC	3	6	26014	26019	0 %	0 %	50 %	50 %	472433996
57	NC_020562	GC	3	6	26881	26886	0 %	0 %	50 %	50 %	472433996
58	NC_020562	CG	3	6	27405	27410	0 %	0 %	50 %	50 %	472433996
59	NC_020562	GC	3	6	30918	30923	0 %	0 %	50 %	50 %	472433999
60	NC_020562	GC	3	6	30974	30979	0 %	0 %	50 %	50 %	472433999
61	NC_020562	GC	3	6	31454	31459	0 %	0 %	50 %	50 %	472434001
62	NC_020562	TC	3	6	32182	32187	0 %	50 %	0 %	50 %	472434002
63	NC_020562	GC	3	6	33417	33422	0 %	0 %	50 %	50 %	472434003
64	NC_020562	GC	3	6	34176	34181	0 %	0 %	50 %	50 %	472434003
65	NC_020562	CG	3	6	34256	34261	0 %	0 %	50 %	50 %	472434003
66	NC_020562	GA	3	6	34450	34455	50 %	0 %	50 %	0 %	472434003
67	NC_020562	CT	3	6	36665	36670	0 %	50 %	0 %	50 %	472434004
68	NC_020562	TG	3	6	37622	37627	0 %	50 %	50 %	0 %	472434006
69	NC_020562	GC	3	6	37713	37718	0 %	0 %	50 %	50 %	472434006
70	NC_020562	CG	3	6	37773	37778	0 %	0 %	50 %	50 %	472434006
71	NC_020562	GC	3	6	38706	38711	0 %	0 %	50 %	50 %	472434007
72	NC_020562	GC	3	6	38772	38777	0 %	0 %	50 %	50 %	472434007
73	NC_020562	CG	3	6	39382	39387	0 %	0 %	50 %	50 %	472434008
74	NC_020562	GA	3	6	39430	39435	50 %	0 %	50 %	0 %	472434008
75	NC_020562	GC	3	6	39441	39446	0 %	0 %	50 %	50 %	472434008
76	NC_020562	CG	3	6	39830	39835	0 %	0 %	50 %	50 %	472434008
77	NC_020562	AT	3	6	39988	39993	50 %	50 %	0 %	0 %	472434008
78	NC_020562	CG	4	8	40824	40831	0 %	0 %	50 %	50 %	472434008
79	NC_020562	GC	3	6	41082	41087	0 %	0 %	50 %	50 %	472434008
80	NC_020562	CG	4	8	41212	41219	0 %	0 %	50 %	50 %	472434009
81	NC_020562	AT	3	6	41352	41357	50 %	50 %	0 %	0 %	472434009
82	NC_020562	GC	3	6	42873	42878	0 %	0 %	50 %	50 %	472434010
83	NC_020562	GC	3	6	42915	42920	0 %	0 %	50 %	50 %	472434010
84	NC_020562	GC	3	6	42938	42943	0 %	0 %	50 %	50 %	472434010
85	NC_020562	GC	3	6	42997	43002	0 %	0 %	50 %	50 %	472434011
86	NC_020562	GT	3	6	43288	43293	0 %	50 %	50 %	0 %	472434012
87	NC_020562	CG	3	6	43593	43598	0 %	0 %	50 %	50 %	472434012
88	NC_020562	GC	3	6	44160	44165	0 %	0 %	50 %	50 %	472434013
89	NC_020562	GC	3	6	44840	44845	0 %	0 %	50 %	50 %	472434014
90	NC_020562	CG	3	6	44966	44971	0 %	0 %	50 %	50 %	472434014
91	NC_020562	CG	3	6	44975	44980	0 %	0 %	50 %	50 %	472434014
92	NC_020562	CG	3	6	45924	45929	0 %	0 %	50 %	50 %	472434016
93	NC_020562	GT	3	6	47230	47235	0 %	50 %	50 %	0 %	472434016
94	NC_020562	CG	3	6	47684	47689	0 %	0 %	50 %	50 %	472434016
95	NC_020562	CG	4	8	48084	48091	0 %	0 %	50 %	50 %	472434017
96	NC_020562	CG	3	6	48648	48653	0 %	0 %	50 %	50 %	472434017
97	NC_020562	CG	3	6	48726	48731	0 %	0 %	50 %	50 %	472434017
98	NC_020562	GC	3	6	48789	48794	0 %	0 %	50 %	50 %	472434017
99	NC_020562	GC	3	6	48997	49002	0 %	0 %	50 %	50 %	472434018
100	NC_020562	GC	3	6	49439	49444	0 %	0 %	50 %	50 %	472434018
101	NC_020562	CG	4	8	49476	49483	0 %	0 %	50 %	50 %	472434018
102	NC_020562	AC	3	6	49833	49838	50 %	0 %	0 %	50 %	472434019
103	NC_020562	GC	3	6	49904	49909	0 %	0 %	50 %	50 %	472434019
104	NC_020562	AC	3	6	50034	50039	50 %	0 %	0 %	50 %	472434019
105	NC_020562	AG	3	6	50713	50718	50 %	0 %	50 %	0 %	472434019
106	NC_020562	GC	3	6	51387	51392	0 %	0 %	50 %	50 %	472434020
107	NC_020562	CG	3	6	51901	51906	0 %	0 %	50 %	50 %	472434020
108	NC_020562	CG	3	6	52329	52334	0 %	0 %	50 %	50 %	472434021
109	NC_020562	GC	3	6	52434	52439	0 %	0 %	50 %	50 %	472434021
110	NC_020562	GC	3	6	54550	54555	0 %	0 %	50 %	50 %	472434024
111	NC_020562	GC	3	6	55923	55928	0 %	0 %	50 %	50 %	472434026
112	NC_020562	GC	3	6	56459	56464	0 %	0 %	50 %	50 %	472434026
113	NC_020562	CG	3	6	56482	56487	0 %	0 %	50 %	50 %	472434026
114	NC_020562	CG	3	6	56723	56728	0 %	0 %	50 %	50 %	472434027
115	NC_020562	GC	3	6	57201	57206	0 %	0 %	50 %	50 %	472434027
116	NC_020562	TC	3	6	57665	57670	0 %	50 %	0 %	50 %	472434027
117	NC_020562	CG	3	6	58288	58293	0 %	0 %	50 %	50 %	472434028
118	NC_020562	GC	3	6	58607	58612	0 %	0 %	50 %	50 %	472434028
119	NC_020562	GA	4	8	59317	59324	50 %	0 %	50 %	0 %	472434029
120	NC_020562	CG	3	6	60880	60885	0 %	0 %	50 %	50 %	472434033
121	NC_020562	GC	3	6	62586	62591	0 %	0 %	50 %	50 %	472434035
122	NC_020562	GC	3	6	62843	62848	0 %	0 %	50 %	50 %	472434035
123	NC_020562	AG	3	6	63258	63263	50 %	0 %	50 %	0 %	472434035
124	NC_020562	CG	3	6	63480	63485	0 %	0 %	50 %	50 %	472434036
125	NC_020562	GC	3	6	65741	65746	0 %	0 %	50 %	50 %	472434037
126	NC_020562	GC	3	6	65856	65861	0 %	0 %	50 %	50 %	472434037
127	NC_020562	CG	3	6	66041	66046	0 %	0 %	50 %	50 %	472434038
128	NC_020562	CG	3	6	66296	66301	0 %	0 %	50 %	50 %	472434038
129	NC_020562	GC	4	8	66312	66319	0 %	0 %	50 %	50 %	472434038
130	NC_020562	CG	3	6	67512	67517	0 %	0 %	50 %	50 %	472434040
131	NC_020562	CG	3	6	67719	67724	0 %	0 %	50 %	50 %	472434040
132	NC_020562	CG	3	6	68358	68363	0 %	0 %	50 %	50 %	472434040
133	NC_020562	CG	3	6	68635	68640	0 %	0 %	50 %	50 %	472434040
134	NC_020562	GC	3	6	68761	68766	0 %	0 %	50 %	50 %	472434040
135	NC_020562	CG	3	6	69439	69444	0 %	0 %	50 %	50 %	472434040
136	NC_020562	CG	3	6	69457	69462	0 %	0 %	50 %	50 %	472434040
137	NC_020562	GC	3	6	69535	69540	0 %	0 %	50 %	50 %	472434040
138	NC_020562	GA	3	6	70535	70540	50 %	0 %	50 %	0 %	472434041
139	NC_020562	CG	3	6	70542	70547	0 %	0 %	50 %	50 %	472434041
140	NC_020562	TG	3	6	70979	70984	0 %	50 %	50 %	0 %	472434042
141	NC_020562	GC	3	6	72131	72136	0 %	0 %	50 %	50 %	472434043
142	NC_020562	GC	3	6	72549	72554	0 %	0 %	50 %	50 %	472434043
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.