MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Sphingomonas sp. MM-1

Total Repeats: 4352

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020561	GCCGC	2	10	1799	1808	0 %	0 %	40 %	60 %	470211966
2	NC_020561	GGCCA	2	10	2040	2049	20 %	0 %	40 %	40 %	470211966
3	NC_020561	GCGCC	2	10	2129	2138	0 %	0 %	40 %	60 %	470211967
4	NC_020561	GGCGA	2	10	3075	3084	20 %	0 %	60 %	20 %	470211967
5	NC_020561	CCGCG	2	10	3628	3637	0 %	0 %	40 %	60 %	470211967
6	NC_020561	GCGAT	2	10	4284	4293	20 %	20 %	40 %	20 %	470211967
7	NC_020561	AGCGC	2	10	4426	4435	20 %	0 %	40 %	40 %	470211967
8	NC_020561	GGCTG	2	10	4585	4594	0 %	20 %	60 %	20 %	470211967
9	NC_020561	GCCGC	2	10	6117	6126	0 %	0 %	40 %	60 %	470211968
10	NC_020561	GCTGC	2	10	9251	9260	0 %	20 %	40 %	40 %	470211970
11	NC_020561	AGAGA	2	10	12789	12798	60 %	0 %	40 %	0 %	470211975
12	NC_020561	CGGCG	2	10	12942	12951	0 %	0 %	60 %	40 %	470211975
13	NC_020561	CGGCG	2	10	13106	13115	0 %	0 %	60 %	40 %	470211975
14	NC_020561	TGCGA	2	10	14298	14307	20 %	20 %	40 %	20 %	470211978
15	NC_020561	GAAGC	2	10	15081	15090	40 %	0 %	40 %	20 %	470211979
16	NC_020561	GATCG	2	10	15809	15818	20 %	20 %	40 %	20 %	470211980
17	NC_020561	CCGAA	2	10	17834	17843	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
18	NC_020561	TGGCG	2	10	19338	19347	0 %	20 %	60 %	20 %	470211981
19	NC_020561	GAGCG	2	10	20305	20314	20 %	0 %	60 %	20 %	470211983
20	NC_020561	TCGGT	2	10	20537	20546	0 %	40 %	40 %	20 %	470211983
21	NC_020561	GATCA	2	10	21550	21559	40 %	20 %	20 %	20 %	470211985
22	NC_020561	GCGCG	2	10	24439	24448	0 %	0 %	60 %	40 %	470211987
23	NC_020561	CCGCG	2	10	24849	24858	0 %	0 %	40 %	60 %	470211988
24	NC_020561	AGGCG	2	10	25806	25815	20 %	0 %	60 %	20 %	470211989
25	NC_020561	GCCCG	2	10	25973	25982	0 %	0 %	40 %	60 %	470211989
26	NC_020561	CGGCG	2	10	25992	26001	0 %	0 %	60 %	40 %	470211989
27	NC_020561	GCGAT	2	10	26333	26342	20 %	20 %	40 %	20 %	470211989
28	NC_020561	CATCC	2	10	28386	28395	20 %	20 %	0 %	60 %	470211991
29	NC_020561	GGCCG	2	10	28583	28592	0 %	0 %	60 %	40 %	470211991
30	NC_020561	GCCGG	2	10	29916	29925	0 %	0 %	60 %	40 %	470211992
31	NC_020561	CGGCG	2	10	31905	31914	0 %	0 %	60 %	40 %	470211994
32	NC_020561	CGGCG	2	10	32032	32041	0 %	0 %	60 %	40 %	470211994
33	NC_020561	GGAGC	2	10	32188	32197	20 %	0 %	60 %	20 %	470211994
34	NC_020561	GGCGA	2	10	32433	32442	20 %	0 %	60 %	20 %	470211995
35	NC_020561	GCATC	2	10	32639	32648	20 %	20 %	20 %	40 %	470211995
36	NC_020561	CGGGG	2	10	32924	32933	0 %	0 %	80 %	20 %	470211995
37	NC_020561	GCGCC	2	10	34286	34295	0 %	0 %	40 %	60 %	470211997
38	NC_020561	TGGCC	2	10	34754	34763	0 %	20 %	40 %	40 %	470211998
39	NC_020561	GACCT	2	10	37341	37350	20 %	20 %	20 %	40 %	470212001
40	NC_020561	ATGCG	2	10	37866	37875	20 %	20 %	40 %	20 %	470212002
41	NC_020561	GGCGC	2	10	38193	38202	0 %	0 %	60 %	40 %	470212002
42	NC_020561	CGCGG	2	10	40405	40414	0 %	0 %	60 %	40 %	470212003
43	NC_020561	GGCTG	2	10	41779	41788	0 %	20 %	60 %	20 %	470212004
44	NC_020561	TGCGC	2	10	42022	42031	0 %	20 %	40 %	40 %	470212005
45	NC_020561	CTCCC	2	10	43416	43425	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
46	NC_020561	CCATG	2	10	44518	44527	20 %	20 %	20 %	40 %	470212008
47	NC_020561	GGCCT	2	10	44714	44723	0 %	20 %	40 %	40 %	470212008
48	NC_020561	GCCGT	2	10	47708	47717	0 %	20 %	40 %	40 %	470212010
49	NC_020561	TGGAT	2	10	49245	49254	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020561	CGCGG	2	10	49966	49975	0 %	0 %	60 %	40 %	470212012
51	NC_020561	GGATC	2	10	50041	50050	20 %	20 %	40 %	20 %	470212012
52	NC_020561	TGGCC	2	10	52088	52097	0 %	20 %	40 %	40 %	470212015
53	NC_020561	CGGGG	2	10	52369	52378	0 %	0 %	80 %	20 %	470212015
54	NC_020561	TCCGC	2	10	52665	52674	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
55	NC_020561	GATCG	2	10	53682	53691	20 %	20 %	40 %	20 %	470212017
56	NC_020561	GGCCG	2	10	54877	54886	0 %	0 %	60 %	40 %	470212019
57	NC_020561	CGGCT	2	10	55293	55302	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
58	NC_020561	TGGCC	2	10	55329	55338	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
59	NC_020561	CGCGC	2	10	57480	57489	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
60	NC_020561	GAACC	2	10	59605	59614	40 %	0 %	20 %	40 %	470212020
61	NC_020561	GCCGA	2	10	60102	60111	20 %	0 %	40 %	40 %	470212020
62	NC_020561	GACTG	2	10	60823	60832	20 %	20 %	40 %	20 %	470212021
63	NC_020561	GCGCT	2	10	60958	60967	0 %	20 %	40 %	40 %	470212021
64	NC_020561	GCCGC	2	10	61096	61105	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
65	NC_020561	CGATC	2	10	61163	61172	20 %	20 %	20 %	40 %	470212022
66	NC_020561	GCGCT	2	10	61257	61266	0 %	20 %	40 %	40 %	470212022
67	NC_020561	TCTCG	2	10	62906	62915	0 %	40 %	20 %	40 %	470212024
68	NC_020561	GCCGG	2	10	63200	63209	0 %	0 %	60 %	40 %	470212024
69	NC_020561	GCCGG	2	10	63549	63558	0 %	0 %	60 %	40 %	470212024
70	NC_020561	TTGCG	2	10	63595	63604	0 %	40 %	40 %	20 %	470212024
71	NC_020561	GCGCC	2	10	63871	63880	0 %	0 %	40 %	60 %	470212024
72	NC_020561	GAAGC	2	10	64422	64431	40 %	0 %	40 %	20 %	470212024
73	NC_020561	GCCGG	2	10	64605	64614	0 %	0 %	60 %	40 %	470212024
74	NC_020561	CCGCG	2	10	68637	68646	0 %	0 %	40 %	60 %	470212028
75	NC_020561	CGGCC	2	10	71365	71374	0 %	0 %	40 %	60 %	470212032
76	NC_020561	TGACG	2	10	73004	73013	20 %	20 %	40 %	20 %	470212034
77	NC_020561	GCCGC	2	10	73469	73478	0 %	0 %	40 %	60 %	470212035
78	NC_020561	GCCGC	2	10	75109	75118	0 %	0 %	40 %	60 %	470212036
79	NC_020561	GCGCG	2	10	76024	76033	0 %	0 %	60 %	40 %	470212037
80	NC_020561	CGTCG	2	10	78272	78281	0 %	20 %	40 %	40 %	470212038
81	NC_020561	GCGGA	2	10	78954	78963	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
82	NC_020561	CGGGC	2	10	80024	80033	0 %	0 %	60 %	40 %	470212040
83	NC_020561	AGCCC	2	10	80651	80660	20 %	0 %	20 %	60 %	470212040
84	NC_020561	GGGCA	2	10	81032	81041	20 %	0 %	60 %	20 %	470212041
85	NC_020561	TCGCT	2	10	81418	81427	0 %	40 %	20 %	40 %	470212041
86	NC_020561	ACCGC	2	10	82094	82103	20 %	0 %	20 %	60 %	470212042
87	NC_020561	CACGG	2	10	82207	82216	20 %	0 %	40 %	40 %	470212042
88	NC_020561	GGCCG	2	10	83669	83678	0 %	0 %	60 %	40 %	470212043
89	NC_020561	CGGTG	2	10	84729	84738	0 %	20 %	60 %	20 %	470212045
90	NC_020561	GCAGG	2	10	85122	85131	20 %	0 %	60 %	20 %	470212045
91	NC_020561	GCCAG	2	10	85487	85496	20 %	0 %	40 %	40 %	470212045
92	NC_020561	ACGCC	2	10	86380	86389	20 %	0 %	20 %	60 %	470212046
93	NC_020561	ATCGC	2	10	88413	88422	20 %	20 %	20 %	40 %	470212048
94	NC_020561	GTCGC	2	10	88597	88606	0 %	20 %	40 %	40 %	470212049
95	NC_020561	CGGCG	2	10	92122	92131	0 %	0 %	60 %	40 %	470212053
96	NC_020561	AGCGC	2	10	93467	93476	20 %	0 %	40 %	40 %	470212054
97	NC_020561	GCCGA	2	10	95616	95625	20 %	0 %	40 %	40 %	470212056
98	NC_020561	CGAAT	2	10	99723	99732	40 %	20 %	20 %	20 %	470212058
99	NC_020561	CGGGC	2	10	100344	100353	0 %	0 %	60 %	40 %	470212059
100	NC_020561	CGATC	2	10	100778	100787	20 %	20 %	20 %	40 %	470212059
101	NC_020561	CTGGG	2	10	101242	101251	0 %	20 %	60 %	20 %	470212060
102	NC_020561	GCGTG	2	10	102233	102242	0 %	20 %	60 %	20 %	470212061
103	NC_020561	GGGCA	2	10	103217	103226	20 %	0 %	60 %	20 %	470212062
104	NC_020561	ATCCG	2	10	103695	103704	20 %	20 %	20 %	40 %	470212062
105	NC_020561	CGGCG	2	10	104461	104470	0 %	0 %	60 %	40 %	470212063
106	NC_020561	GTGGC	2	10	105983	105992	0 %	20 %	60 %	20 %	470212065
107	NC_020561	CGGCG	2	10	106150	106159	0 %	0 %	60 %	40 %	470212065
108	NC_020561	CGGCG	2	10	107317	107326	0 %	0 %	60 %	40 %	470212066
109	NC_020561	ATCGG	2	10	107443	107452	20 %	20 %	40 %	20 %	470212066
110	NC_020561	CCACA	2	10	108632	108641	40 %	0 %	0 %	60 %	470212067
111	NC_020561	GGGGC	2	10	109048	109057	0 %	0 %	80 %	20 %	470212067
112	NC_020561	TGGAA	2	10	109914	109923	40 %	20 %	40 %	0 %	470212068
113	NC_020561	GCTTC	2	10	110602	110611	0 %	40 %	20 %	40 %	470212068
114	NC_020561	CTGAT	2	10	110963	110972	20 %	40 %	20 %	20 %	470212068
115	NC_020561	GCATC	2	10	113509	113518	20 %	20 %	20 %	40 %	470212072
116	NC_020561	GGCTG	2	10	114022	114031	0 %	20 %	60 %	20 %	470212073
117	NC_020561	TGCGG	2	10	117690	117699	0 %	20 %	60 %	20 %	470212078
118	NC_020561	GCTTT	2	10	117950	117959	0 %	60 %	20 %	20 %	470212078
119	NC_020561	GACCG	2	10	118994	119003	20 %	0 %	40 %	40 %	470212079
120	NC_020561	CCGCC	2	10	119959	119968	0 %	0 %	20 %	80 %	470212080
121	NC_020561	GCGAT	2	10	120457	120466	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
122	NC_020561	ATGAC	2	10	120505	120514	40 %	20 %	20 %	20 %	470212081
123	NC_020561	GCCTC	2	10	123652	123661	0 %	20 %	20 %	60 %	470212084
124	NC_020561	GCGCC	2	10	123938	123947	0 %	0 %	40 %	60 %	470212084
125	NC_020561	CAGCG	2	10	123960	123969	20 %	0 %	40 %	40 %	470212084
126	NC_020561	TTCCC	2	10	124030	124039	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
127	NC_020561	CCTCG	2	10	124092	124101	0 %	20 %	20 %	60 %	470212085
128	NC_020561	CGGCC	2	10	124344	124353	0 %	0 %	40 %	60 %	470212085
129	NC_020561	CGATC	2	10	125398	125407	20 %	20 %	20 %	40 %	470212086
130	NC_020561	GGGCG	2	10	125570	125579	0 %	0 %	80 %	20 %	470212086
131	NC_020561	GGCGA	2	10	126683	126692	20 %	0 %	60 %	20 %	470212087
132	NC_020561	TTACC	2	10	127645	127654	20 %	40 %	0 %	40 %	470212088
133	NC_020561	GCGCC	2	10	130837	130846	0 %	0 %	40 %	60 %	470212092
134	NC_020561	CGAAA	2	10	131382	131391	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
135	NC_020561	TGCTC	2	10	132835	132844	0 %	40 %	20 %	40 %	470212093
136	NC_020561	ACATC	2	10	133285	133294	40 %	20 %	0 %	40 %	470212093
137	NC_020561	GCATC	2	10	133844	133853	20 %	20 %	20 %	40 %	470212094
138	NC_020561	CCGCC	2	10	134071	134080	0 %	0 %	20 %	80 %	470212094
139	NC_020561	TGCCG	2	10	137185	137194	0 %	20 %	40 %	40 %	470212097
140	NC_020561	GGGCA	2	10	139740	139749	20 %	0 %	60 %	20 %	470212100
141	NC_020561	CTGCA	2	10	141196	141205	20 %	20 %	20 %	40 %	470212100
142	NC_020561	GCCTC	2	10	142375	142384	0 %	20 %	20 %	60 %	470212102
143	NC_020561	AGCGG	2	10	142504	142513	20 %	0 %	60 %	20 %	470212103
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145	NC_020561	GCCGG	2	10	144783	144792	0 %	0 %	60 %	40 %	470212105
146	NC_020561	GATCG	2	10	144944	144953	20 %	20 %	40 %	20 %	470212105
147	NC_020561	GCTCC	2	10	145304	145313	0 %	20 %	20 %	60 %	470212105
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149	NC_020561	GCCGC	2	10	148453	148462	0 %	0 %	40 %	60 %	470212106
150	NC_020561	GCGCG	2	10	150251	150260	0 %	0 %	60 %	40 %	470212108
151	NC_020561	AGGGC	2	10	150801	150810	20 %	0 %	60 %	20 %	470212109
152	NC_020561	GGCGA	2	10	151048	151057	20 %	0 %	60 %	20 %	470212109
153	NC_020561	GCGCG	2	10	156800	156809	0 %	0 %	60 %	40 %	470212114
154	NC_020561	CGGCG	2	10	158776	158785	0 %	0 %	60 %	40 %	470212116
155	NC_020561	CGCGC	2	10	159284	159293	0 %	0 %	40 %	60 %	470212116
156	NC_020561	GGCAG	2	10	159354	159363	20 %	0 %	60 %	20 %	470212116
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158	NC_020561	GGTGG	2	10	161271	161280	0 %	20 %	80 %	0 %	470212118
159	NC_020561	GGGCG	2	10	161764	161773	0 %	0 %	80 %	20 %	470212119
160	NC_020561	GCCCG	2	10	162440	162449	0 %	0 %	40 %	60 %	470212120
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165	NC_020561	TGGCT	2	10	166160	166169	0 %	40 %	40 %	20 %	470212124
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169	NC_020561	TGGGC	2	10	170259	170268	0 %	20 %	60 %	20 %	470212129
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171	NC_020561	CGATG	2	10	172709	172718	20 %	20 %	40 %	20 %	470212131
172	NC_020561	GCCGC	2	10	175067	175076	0 %	0 %	40 %	60 %	470212133
173	NC_020561	TGCCG	2	10	175077	175086	0 %	20 %	40 %	40 %	470212133
174	NC_020561	CGGCG	2	10	176285	176294	0 %	0 %	60 %	40 %	470212134
175	NC_020561	CAATC	2	10	178780	178789	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
176	NC_020561	CCTGC	2	10	179600	179609	0 %	20 %	20 %	60 %	470212137
177	NC_020561	GATCC	2	10	183428	183437	20 %	20 %	20 %	40 %	470212142
178	NC_020561	GCATG	2	10	183754	183763	20 %	20 %	40 %	20 %	470212142
179	NC_020561	AGGGG	2	10	183949	183958	20 %	0 %	80 %	0 %	470212142
180	NC_020561	GATCG	2	10	184212	184221	20 %	20 %	40 %	20 %	470212143
181	NC_020561	GCGCC	2	10	184389	184398	0 %	0 %	40 %	60 %	470212143
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189	NC_020561	GCGAT	2	10	193787	193796	20 %	20 %	40 %	20 %	470212152
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194	NC_020561	GTCCA	2	10	199471	199480	20 %	20 %	20 %	40 %	470212152
195	NC_020561	TATGA	2	10	199765	199774	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
196	NC_020561	CCGCC	2	10	200031	200040	0 %	0 %	20 %	80 %	470212153
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199	NC_020561	GCAAA	2	10	202680	202689	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
200	NC_020561	TGGTC	2	10	202834	202843	0 %	40 %	40 %	20 %	470212157
201	NC_020561	GCTCG	2	10	203156	203165	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
202	NC_020561	GCTCG	2	10	203815	203824	0 %	20 %	40 %	40 %	470212159
203	NC_020561	CGATC	2	10	203998	204007	20 %	20 %	20 %	40 %	470212159
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205	NC_020561	CCGGC	2	10	206214	206223	0 %	0 %	40 %	60 %	470212162
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215	NC_020561	GACGA	2	10	217951	217960	40 %	0 %	40 %	20 %	470212171
216	NC_020561	GGGGA	2	10	218148	218157	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
217	NC_020561	GCCGC	2	10	218391	218400	0 %	0 %	40 %	60 %	470212172
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222	NC_020561	GCCGG	2	10	220999	221008	0 %	0 %	60 %	40 %	470212174
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227	NC_020561	TCGCC	2	10	226048	226057	0 %	20 %	20 %	60 %	470212177
228	NC_020561	GGGAC	2	10	226979	226988	20 %	0 %	60 %	20 %	470212177
229	NC_020561	CCGCG	2	10	228170	228179	0 %	0 %	40 %	60 %	470212180
230	NC_020561	GCGCG	2	10	229824	229833	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
231	NC_020561	ATCCG	2	10	230443	230452	20 %	20 %	20 %	40 %	470212183
232	NC_020561	GCGCT	2	10	232437	232446	0 %	20 %	40 %	40 %	470212184
233	NC_020561	ACGCG	2	10	233171	233180	20 %	0 %	40 %	40 %	470212184
234	NC_020561	GCCGG	2	10	237103	237112	0 %	0 %	60 %	40 %	470212190
235	NC_020561	GGGAT	2	10	237302	237311	20 %	20 %	60 %	0 %	470212190
236	NC_020561	GCATC	2	10	237682	237691	20 %	20 %	20 %	40 %	470212191
237	NC_020561	CGCTC	2	10	238298	238307	0 %	20 %	20 %	60 %	470212191
238	NC_020561	CGGCT	2	10	239494	239503	0 %	20 %	40 %	40 %	470212192
239	NC_020561	CGGCG	2	10	240018	240027	0 %	0 %	60 %	40 %	470212193
240	NC_020561	GGGGA	2	10	240452	240461	20 %	0 %	80 %	0 %	470212193
241	NC_020561	CTGGC	2	10	242815	242824	0 %	20 %	40 %	40 %	470212195
242	NC_020561	GGACG	2	10	242874	242883	20 %	0 %	60 %	20 %	470212195
243	NC_020561	CGGCA	2	10	243269	243278	20 %	0 %	40 %	40 %	470212195
244	NC_020561	CTCGC	2	10	244411	244420	0 %	20 %	20 %	60 %	470212195
245	NC_020561	ACCCG	2	10	248093	248102	20 %	0 %	20 %	60 %	470212199
246	NC_020561	TGTCC	2	10	248748	248757	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
247	NC_020561	GCGCC	2	10	250300	250309	0 %	0 %	40 %	60 %	470212201
248	NC_020561	CGCCA	2	10	250577	250586	20 %	0 %	20 %	60 %	470212201
249	NC_020561	CGATC	2	10	251363	251372	20 %	20 %	20 %	40 %	470212202
250	NC_020561	GGTCA	2	10	252381	252390	20 %	20 %	40 %	20 %	470212202
251	NC_020561	GCCGG	2	10	252816	252825	0 %	0 %	60 %	40 %	470212202
252	NC_020561	ACGGC	2	10	253086	253095	20 %	0 %	40 %	40 %	470212203
253	NC_020561	GGCCC	2	10	253329	253338	0 %	0 %	40 %	60 %	470212203
254	NC_020561	GCGCC	2	10	253981	253990	0 %	0 %	40 %	60 %	470212203
255	NC_020561	TTCCC	2	10	254110	254119	0 %	40 %	0 %	60 %	470212204
256	NC_020561	GCTGG	2	10	255716	255725	0 %	20 %	60 %	20 %	470212205
257	NC_020561	GGCGA	2	10	255819	255828	20 %	0 %	60 %	20 %	470212205
258	NC_020561	GTGCG	2	10	256329	256338	0 %	20 %	60 %	20 %	470212205
259	NC_020561	GATGC	2	10	256389	256398	20 %	20 %	40 %	20 %	470212205
260	NC_020561	CGGCG	2	10	259623	259632	0 %	0 %	60 %	40 %	470212207
261	NC_020561	CGATC	2	10	259972	259981	20 %	20 %	20 %	40 %	470212207
262	NC_020561	CCGCG	2	10	260972	260981	0 %	0 %	40 %	60 %	470212208
263	NC_020561	GGGAT	2	10	261067	261076	20 %	20 %	60 %	0 %	470212208
264	NC_020561	GCCGC	2	10	263184	263193	0 %	0 %	40 %	60 %	470212209
265	NC_020561	GCCGC	2	10	263368	263377	0 %	0 %	40 %	60 %	470212209
266	NC_020561	CGAAG	2	10	265990	265999	40 %	0 %	40 %	20 %	470212211
267	NC_020561	CGGCG	2	10	266459	266468	0 %	0 %	60 %	40 %	470212213
268	NC_020561	CGCCC	2	10	266532	266541	0 %	0 %	20 %	80 %	470212213
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