MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Sphingomonas sp. MM-1

Total Repeats: 12002

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020561	CTCG	2	8	479	486	0 %	25 %	25 %	50 %	470211965
2	NC_020561	CAGG	2	8	581	588	25 %	0 %	50 %	25 %	470211965
3	NC_020561	CCCG	2	8	1116	1123	0 %	0 %	25 %	75 %	470211966
4	NC_020561	TGGC	2	8	1564	1571	0 %	25 %	50 %	25 %	470211966
5	NC_020561	GATC	2	8	1673	1680	25 %	25 %	25 %	25 %	470211966
6	NC_020561	GACC	2	8	1730	1737	25 %	0 %	25 %	50 %	470211966
7	NC_020561	CGAT	2	8	2078	2085	25 %	25 %	25 %	25 %	470211966
8	NC_020561	GCCC	2	8	2261	2268	0 %	0 %	25 %	75 %	470211967
9	NC_020561	CAGC	2	8	3710	3717	25 %	0 %	25 %	50 %	470211967
10	NC_020561	CGAT	2	8	4054	4061	25 %	25 %	25 %	25 %	470211967
11	NC_020561	GAAG	2	8	4183	4190	50 %	0 %	50 %	0 %	470211967
12	NC_020561	TCGC	2	8	4653	4660	0 %	25 %	25 %	50 %	470211967
13	NC_020561	TGGC	2	8	5532	5539	0 %	25 %	50 %	25 %	470211968
14	NC_020561	AGCG	2	8	5747	5754	25 %	0 %	50 %	25 %	470211968
15	NC_020561	GACC	2	8	5874	5881	25 %	0 %	25 %	50 %	470211968
16	NC_020561	CGGC	2	8	5882	5889	0 %	0 %	50 %	50 %	470211968
17	NC_020561	GCCC	2	8	6354	6361	0 %	0 %	25 %	75 %	470211968
18	NC_020561	GCGG	2	8	6875	6882	0 %	0 %	75 %	25 %	470211969
19	NC_020561	GCGG	2	8	6980	6987	0 %	0 %	75 %	25 %	470211969
20	NC_020561	CGGC	2	8	7194	7201	0 %	0 %	50 %	50 %	470211969
21	NC_020561	TCGA	2	8	7397	7404	25 %	25 %	25 %	25 %	470211969
22	NC_020561	TCCG	2	8	8705	8712	0 %	25 %	25 %	50 %	470211970
23	NC_020561	GGCG	2	8	8840	8847	0 %	0 %	75 %	25 %	470211970
24	NC_020561	GCGA	2	8	9354	9361	25 %	0 %	50 %	25 %	470211970
25	NC_020561	AGGA	2	8	9414	9421	50 %	0 %	50 %	0 %	470211970
26	NC_020561	CGTT	2	8	9435	9442	0 %	50 %	25 %	25 %	470211970
27	NC_020561	TCGA	2	8	10156	10163	25 %	25 %	25 %	25 %	470211971
28	NC_020561	GTCG	2	8	10398	10405	0 %	25 %	50 %	25 %	470211971
29	NC_020561	CCGG	2	8	10711	10718	0 %	0 %	50 %	50 %	470211972
30	NC_020561	GACC	2	8	10845	10852	25 %	0 %	25 %	50 %	470211972
31	NC_020561	GCCA	2	8	11193	11200	25 %	0 %	25 %	50 %	470211973
32	NC_020561	GCCG	2	8	12258	12265	0 %	0 %	50 %	50 %	470211975
33	NC_020561	CCGC	2	8	12901	12908	0 %	0 %	25 %	75 %	470211975
34	NC_020561	CTGC	2	8	13728	13735	0 %	25 %	25 %	50 %	470211976
35	NC_020561	GCCA	2	8	14083	14090	25 %	0 %	25 %	50 %	470211977
36	NC_020561	CGGC	2	8	14204	14211	0 %	0 %	50 %	50 %	470211977
37	NC_020561	GCGG	2	8	14773	14780	0 %	0 %	75 %	25 %	470211979
38	NC_020561	CCGG	2	8	15265	15272	0 %	0 %	50 %	50 %	470211980
39	NC_020561	CGAG	2	8	17002	17009	25 %	0 %	50 %	25 %	470211980
40	NC_020561	CAGC	2	8	17108	17115	25 %	0 %	25 %	50 %	470211980
41	NC_020561	CGGT	2	8	18701	18708	0 %	25 %	50 %	25 %	470211981
42	NC_020561	CGAT	2	8	18868	18875	25 %	25 %	25 %	25 %	470211981
43	NC_020561	CGCC	2	8	19266	19273	0 %	0 %	25 %	75 %	470211981
44	NC_020561	CCCG	2	8	19826	19833	0 %	0 %	25 %	75 %	470211982
45	NC_020561	CCGA	2	8	20002	20009	25 %	0 %	25 %	50 %	470211982
46	NC_020561	TCCG	2	8	20446	20453	0 %	25 %	25 %	50 %	470211983
47	NC_020561	AAGG	2	8	21122	21129	50 %	0 %	50 %	0 %	470211984
48	NC_020561	CGCC	2	8	22208	22215	0 %	0 %	25 %	75 %	470211985
49	NC_020561	GCTG	2	8	23777	23784	0 %	25 %	50 %	25 %	470211986
50	NC_020561	ATCG	2	8	23880	23887	25 %	25 %	25 %	25 %	470211986
51	NC_020561	CGGC	2	8	24130	24137	0 %	0 %	50 %	50 %	470211987
52	NC_020561	GCGG	2	8	24488	24495	0 %	0 %	75 %	25 %	470211987
53	NC_020561	GTCG	2	8	24638	24645	0 %	25 %	50 %	25 %	470211987
54	NC_020561	CGGC	2	8	24821	24828	0 %	0 %	50 %	50 %	470211988
55	NC_020561	CGAG	2	8	25197	25204	25 %	0 %	50 %	25 %	470211988
56	NC_020561	CGGC	2	8	25341	25348	0 %	0 %	50 %	50 %	470211988
57	NC_020561	CGAG	2	8	25383	25390	25 %	0 %	50 %	25 %	470211988
58	NC_020561	CCCG	2	8	25453	25460	0 %	0 %	25 %	75 %	470211988
59	NC_020561	TCCG	2	8	25509	25516	0 %	25 %	25 %	50 %	470211988
60	NC_020561	CAGG	2	8	25775	25782	25 %	0 %	50 %	25 %	470211989
61	NC_020561	TGCG	2	8	25854	25861	0 %	25 %	50 %	25 %	470211989
62	NC_020561	GGCT	2	8	26045	26052	0 %	25 %	50 %	25 %	470211989
63	NC_020561	CCAG	2	8	26055	26062	25 %	0 %	25 %	50 %	470211989
64	NC_020561	TGCC	2	8	26164	26171	0 %	25 %	25 %	50 %	470211989
65	NC_020561	TGGG	2	8	26573	26580	0 %	25 %	75 %	0 %	470211990
66	NC_020561	GGGC	3	12	26631	26642	0 %	0 %	75 %	25 %	470211990
67	NC_020561	GGGC	3	12	27284	27295	0 %	0 %	75 %	25 %	470211991
68	NC_020561	TCGA	2	8	27989	27996	25 %	25 %	25 %	25 %	470211991
69	NC_020561	CCGG	2	8	28003	28010	0 %	0 %	50 %	50 %	470211991
70	NC_020561	CGTC	2	8	28317	28324	0 %	25 %	25 %	50 %	470211991
71	NC_020561	GGCG	2	8	28335	28342	0 %	0 %	75 %	25 %	470211991
72	NC_020561	CGAG	2	8	29372	29379	25 %	0 %	50 %	25 %	470211992
73	NC_020561	CGAC	2	8	29507	29514	25 %	0 %	25 %	50 %	470211992
74	NC_020561	GATC	2	8	29832	29839	25 %	25 %	25 %	25 %	470211992
75	NC_020561	GGGC	2	8	30378	30385	0 %	0 %	75 %	25 %	470211992
76	NC_020561	GCCG	2	8	31255	31262	0 %	0 %	50 %	50 %	470211993
77	NC_020561	GGCC	2	8	31501	31508	0 %	0 %	50 %	50 %	470211994
78	NC_020561	CGGG	2	8	31791	31798	0 %	0 %	75 %	25 %	470211994
79	NC_020561	GACG	2	8	31837	31844	25 %	0 %	50 %	25 %	470211994
80	NC_020561	GGCG	2	8	32143	32150	0 %	0 %	75 %	25 %	470211994
81	NC_020561	GCCG	2	8	32630	32637	0 %	0 %	50 %	50 %	470211995
82	NC_020561	CGGC	2	8	32708	32715	0 %	0 %	50 %	50 %	470211995
83	NC_020561	GATC	2	8	33250	33257	25 %	25 %	25 %	25 %	470211995
84	NC_020561	GGCT	2	8	33965	33972	0 %	25 %	50 %	25 %	470211996
85	NC_020561	GGCT	2	8	34932	34939	0 %	25 %	50 %	25 %	470211998
86	NC_020561	CTGG	2	8	35824	35831	0 %	25 %	50 %	25 %	470211999
87	NC_020561	AGCC	2	8	36002	36009	25 %	0 %	25 %	50 %	470211999
88	NC_020561	GCGT	2	8	36644	36651	0 %	25 %	50 %	25 %	470212000
89	NC_020561	GCTG	2	8	37033	37040	0 %	25 %	50 %	25 %	470212001
90	NC_020561	GGCC	2	8	37403	37410	0 %	0 %	50 %	50 %	470212001
91	NC_020561	ATCG	2	8	38164	38171	25 %	25 %	25 %	25 %	470212002
92	NC_020561	CGGG	2	8	38221	38228	0 %	0 %	75 %	25 %	470212002
93	NC_020561	CGTG	2	8	38280	38287	0 %	25 %	50 %	25 %	470212002
94	NC_020561	GCCG	2	8	38407	38414	0 %	0 %	50 %	50 %	470212002
95	NC_020561	GCCG	2	8	39018	39025	0 %	0 %	50 %	50 %	470212003
96	NC_020561	GCGG	2	8	39207	39214	0 %	0 %	75 %	25 %	470212003
97	NC_020561	GTGC	2	8	39279	39286	0 %	25 %	50 %	25 %	470212003
98	NC_020561	TCGA	2	8	39484	39491	25 %	25 %	25 %	25 %	470212003
99	NC_020561	GGCG	2	8	39723	39730	0 %	0 %	75 %	25 %	470212003
100	NC_020561	CTGG	2	8	40044	40051	0 %	25 %	50 %	25 %	470212003
101	NC_020561	GGGC	2	8	40254	40261	0 %	0 %	75 %	25 %	470212003
102	NC_020561	GCCG	2	8	40434	40441	0 %	0 %	50 %	50 %	470212003
103	NC_020561	ATCG	2	8	41312	41319	25 %	25 %	25 %	25 %	470212004
104	NC_020561	CAGA	2	8	41538	41545	50 %	0 %	25 %	25 %	470212004
105	NC_020561	CTGG	2	8	41573	41580	0 %	25 %	50 %	25 %	470212004
106	NC_020561	CCCG	2	8	42999	43006	0 %	0 %	25 %	75 %	470212006
107	NC_020561	CAGC	2	8	43771	43778	25 %	0 %	25 %	50 %	470212008
108	NC_020561	CTGC	2	8	44113	44120	0 %	25 %	25 %	50 %	470212008
109	NC_020561	CGGC	2	8	44238	44245	0 %	0 %	50 %	50 %	470212008
110	NC_020561	CCAG	2	8	44283	44290	25 %	0 %	25 %	50 %	470212008
111	NC_020561	CACG	2	8	44467	44474	25 %	0 %	25 %	50 %	470212008
112	NC_020561	ATGC	2	8	45113	45120	25 %	25 %	25 %	25 %	470212008
113	NC_020561	CTTC	2	8	45259	45266	0 %	50 %	0 %	50 %	470212008
114	NC_020561	CGTC	2	8	45307	45314	0 %	25 %	25 %	50 %	470212008
115	NC_020561	GCCT	2	8	45579	45586	0 %	25 %	25 %	50 %	470212009
116	NC_020561	CTGG	2	8	46328	46335	0 %	25 %	50 %	25 %	470212009
117	NC_020561	CTCG	2	8	46370	46377	0 %	25 %	25 %	50 %	470212009
118	NC_020561	TCGG	2	8	46650	46657	0 %	25 %	50 %	25 %	470212009
119	NC_020561	GCTC	2	8	47109	47116	0 %	25 %	25 %	50 %	470212010
120	NC_020561	CGAC	2	8	47421	47428	25 %	0 %	25 %	50 %	470212010
121	NC_020561	CGGC	2	8	48146	48153	0 %	0 %	50 %	50 %	470212010
122	NC_020561	AAGC	2	8	48376	48383	50 %	0 %	25 %	25 %	470212010
123	NC_020561	CCTC	2	8	48770	48777	0 %	25 %	0 %	75 %	470212011
124	NC_020561	GCTG	2	8	48986	48993	0 %	25 %	50 %	25 %	470212011
125	NC_020561	TGGC	2	8	49036	49043	0 %	25 %	50 %	25 %	470212011
126	NC_020561	GATC	2	8	49624	49631	25 %	25 %	25 %	25 %	470212012
127	NC_020561	GGCC	2	8	50026	50033	0 %	0 %	50 %	50 %	470212012
128	NC_020561	ACCG	2	8	50327	50334	25 %	0 %	25 %	50 %	470212012
129	NC_020561	GCCG	2	8	50596	50603	0 %	0 %	50 %	50 %	470212012
130	NC_020561	GACG	2	8	50785	50792	25 %	0 %	50 %	25 %	470212012
131	NC_020561	TGGC	2	8	51138	51145	0 %	25 %	50 %	25 %	470212013
132	NC_020561	CGGC	2	8	51758	51765	0 %	0 %	50 %	50 %	470212015
133	NC_020561	TCAG	2	8	52264	52271	25 %	25 %	25 %	25 %	470212015
134	NC_020561	GCGG	2	8	52742	52749	0 %	0 %	75 %	25 %	470212016
135	NC_020561	TTGC	2	8	53816	53823	0 %	50 %	25 %	25 %	470212017
136	NC_020561	CTCG	2	8	54610	54617	0 %	25 %	25 %	50 %	470212019
137	NC_020561	CCCG	2	8	54707	54714	0 %	0 %	25 %	75 %	470212019
138	NC_020561	GAGC	2	8	54740	54747	25 %	0 %	50 %	25 %	470212019
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