MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Sphingomonas sp. MM-1

Total Repeats: 79826

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020561	ATG	2	6	33	38	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020561	CGA	2	6	71	76	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_020561	GAA	2	6	110	115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020561	GCG	2	6	225	230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470211965
5	NC_020561	GCT	2	6	241	246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211965
6	NC_020561	GCA	2	6	334	339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211965
7	NC_020561	CGG	2	6	346	351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470211965
8	NC_020561	CGC	2	6	380	385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470211965
9	NC_020561	TCG	2	6	409	414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211965
10	NC_020561	TCC	2	6	425	430	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470211965
11	NC_020561	ATC	2	6	459	464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211965
12	NC_020561	GCC	2	6	501	506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470211965
13	NC_020561	TCG	2	6	568	573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211965
14	NC_020561	GCC	3	9	705	713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470211966
15	NC_020561	ACC	2	6	733	738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470211966
16	NC_020561	CGA	2	6	764	769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211966
17	NC_020561	CGC	2	6	861	866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470211966
18	NC_020561	CTG	2	6	885	890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211966
19	NC_020561	GTC	2	6	928	933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211966
20	NC_020561	GGT	2	6	974	979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470211966
21	NC_020561	GCC	2	6	1071	1076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470211966
22	NC_020561	CCG	2	6	1093	1098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470211966
23	NC_020561	CGC	2	6	1181	1186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470211966
24	NC_020561	GGC	3	9	1197	1205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470211966
25	NC_020561	CGG	3	9	1217	1225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470211966
26	NC_020561	GCC	3	9	1235	1243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470211966
27	NC_020561	CGG	2	6	1253	1258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470211966
28	NC_020561	GTC	2	6	1300	1305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211966
29	NC_020561	GCG	2	6	1306	1311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470211966
30	NC_020561	CGG	2	6	1409	1414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470211966
31	NC_020561	CGC	2	6	1495	1500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470211966
32	NC_020561	CCG	2	6	1577	1582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470211966
33	NC_020561	CCG	2	6	1586	1591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470211966
34	NC_020561	GCA	2	6	1604	1609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211966
35	NC_020561	CGG	2	6	1637	1642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470211966
36	NC_020561	CGG	2	6	1654	1659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470211966
37	NC_020561	CGG	2	6	1759	1764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470211966
38	NC_020561	AGG	2	6	1772	1777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470211966
39	NC_020561	CCG	2	6	1786	1791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470211966
40	NC_020561	CTC	2	6	1836	1841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470211966
41	NC_020561	CCA	2	6	1929	1934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470211966
42	NC_020561	GCA	2	6	1975	1980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211966
43	NC_020561	CGG	2	6	2060	2065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470211966
44	NC_020561	CGC	2	6	2142	2147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470211967
45	NC_020561	ACG	2	6	2166	2171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211967
46	NC_020561	AGA	2	6	2173	2178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470211967
47	NC_020561	TCA	2	6	2317	2322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211967
48	NC_020561	TCC	2	6	2385	2390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470211967
49	NC_020561	CGA	2	6	2407	2412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211967
50	NC_020561	CCA	2	6	2440	2445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470211967
51	NC_020561	CGC	2	6	2482	2487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470211967
52	NC_020561	CGA	2	6	2503	2508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211967
53	NC_020561	GAG	2	6	2597	2602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470211967
54	NC_020561	GGC	2	6	2627	2632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470211967
55	NC_020561	CGC	2	6	2720	2725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470211967
56	NC_020561	CCG	2	6	2760	2765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470211967
57	NC_020561	GAT	2	6	2798	2803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470211967
58	NC_020561	GCC	2	6	2884	2889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470211967
59	NC_020561	GCC	3	9	3036	3044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470211967
60	NC_020561	TCA	2	6	3097	3102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211967
61	NC_020561	GCA	2	6	3126	3131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211967
62	NC_020561	GCC	2	6	3132	3137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470211967
63	NC_020561	GCA	2	6	3153	3158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211967
64	NC_020561	CCG	2	6	3210	3215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470211967
65	NC_020561	GGA	2	6	3237	3242	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470211967
66	NC_020561	CGA	2	6	3256	3261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211967
67	NC_020561	GTC	2	6	3295	3300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211967
68	NC_020561	CGC	2	6	3314	3319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470211967
69	NC_020561	CGG	2	6	3370	3375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470211967
70	NC_020561	CGA	2	6	3421	3426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211967
71	NC_020561	CGA	2	6	3526	3531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211967
72	NC_020561	ATA	2	6	3533	3538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211967
73	NC_020561	CGG	2	6	3562	3567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470211967
74	NC_020561	GAC	2	6	3641	3646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211967
75	NC_020561	CGC	2	6	3655	3660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470211967
76	NC_020561	AGC	2	6	3774	3779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211967
77	NC_020561	CCG	2	6	3817	3822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470211967
78	NC_020561	GAT	2	6	3935	3940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470211967
79	NC_020561	CGA	3	9	4021	4029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211967
80	NC_020561	CGA	3	9	4042	4050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211967
81	NC_020561	CGA	2	6	4150	4155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211967
82	NC_020561	ACG	2	6	4206	4211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211967
83	NC_020561	AGC	2	6	4227	4232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211967
84	NC_020561	CGA	2	6	4261	4266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211967
85	NC_020561	TCG	2	6	4270	4275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211967
86	NC_020561	TCG	2	6	4333	4338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211967
87	NC_020561	GCC	2	6	4350	4355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470211967
88	NC_020561	AGC	2	6	4419	4424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211967
89	NC_020561	GAC	2	6	4508	4513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211967
90	NC_020561	CTC	3	9	4526	4534	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470211967
91	NC_020561	GGC	2	6	4543	4548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470211967
92	NC_020561	CTG	2	6	4568	4573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211967
93	NC_020561	CGG	3	9	4576	4584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470211967
94	NC_020561	CGA	2	6	4645	4650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211967
95	NC_020561	GAC	2	6	4730	4735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211967
96	NC_020561	TCG	2	6	4767	4772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211967
97	NC_020561	AGC	2	6	4782	4787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211967
98	NC_020561	GGC	2	6	5117	5122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470211967
99	NC_020561	CCG	2	6	5149	5154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470211967
100	NC_020561	GGA	2	6	5176	5181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470211967
101	NC_020561	CAG	3	9	5201	5209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211967
102	NC_020561	GAA	2	6	5246	5251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470211967
103	NC_020561	CGC	2	6	5269	5274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470211968
104	NC_020561	TTC	2	6	5462	5467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211968
105	NC_020561	GCC	2	6	5593	5598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470211968
106	NC_020561	TGC	2	6	5685	5690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211968
107	NC_020561	TCG	2	6	5768	5773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211968
108	NC_020561	CCG	2	6	5837	5842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470211968
109	NC_020561	GCC	2	6	5927	5932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470211968
110	NC_020561	CCG	2	6	5940	5945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470211968
111	NC_020561	GGT	2	6	5989	5994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470211968
112	NC_020561	CGA	2	6	6030	6035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211968
113	NC_020561	CGG	2	6	6038	6043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470211968
114	NC_020561	GCC	2	6	6059	6064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470211968
115	NC_020561	CGC	2	6	6097	6102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470211968
116	NC_020561	TGC	2	6	6106	6111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211968
117	NC_020561	CGG	2	6	6164	6169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470211968
118	NC_020561	CCG	2	6	6243	6248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470211968
119	NC_020561	ACC	2	6	6293	6298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470211968
120	NC_020561	TGC	2	6	6301	6306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211968
121	NC_020561	CGG	2	6	6316	6321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470211968
122	NC_020561	GCG	2	6	6329	6334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470211968
123	NC_020561	ACC	2	6	6371	6376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470211968
124	NC_020561	CCG	3	9	6576	6584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_020561	GCT	2	6	6784	6789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211969
126	NC_020561	GCC	2	6	6794	6799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470211969
127	NC_020561	ATC	2	6	6827	6832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211969
128	NC_020561	GGC	2	6	6920	6925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470211969
129	NC_020561	TGC	2	6	6927	6932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211969
130	NC_020561	CGG	2	6	6937	6942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470211969
131	NC_020561	CGC	2	6	6968	6973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470211969
132	NC_020561	GCT	2	6	7012	7017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211969
133	NC_020561	TGC	2	6	7044	7049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211969
134	NC_020561	ATG	2	6	7131	7136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470211969
135	NC_020561	CGG	2	6	7182	7187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470211969
136	NC_020561	GCG	2	6	7212	7217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470211969
137	NC_020561	GCA	2	6	7320	7325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211969
138	NC_020561	GCG	2	6	7326	7331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470211969
139	NC_020561	TGG	2	6	7443	7448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470211969
140	NC_020561	CTT	2	6	7505	7510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211969
141	NC_020561	CGG	2	6	7542	7547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470211969
142	NC_020561	GCC	2	6	7574	7579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470211969
143	NC_020561	TTC	2	6	7595	7600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211969
144	NC_020561	CAG	2	6	7616	7621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211969
145	NC_020561	GCT	3	9	7753	7761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211969
146	NC_020561	GCG	2	6	7767	7772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470211969
147	NC_020561	GCC	2	6	7795	7800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470211969
148	NC_020561	CGC	2	6	7843	7848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470211969
149	NC_020561	CGA	3	9	7875	7883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211969
150	NC_020561	GAG	2	6	7910	7915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470211969
151	NC_020561	CAT	2	6	7978	7983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211969
152	NC_020561	CCG	2	6	8028	8033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470211969
153	NC_020561	CGC	2	6	8080	8085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470211969
154	NC_020561	GCT	2	6	8107	8112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211969
155	NC_020561	GGA	2	6	8204	8209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
156	NC_020561	ATG	2	6	8282	8287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
157	NC_020561	GAC	2	6	8357	8362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_020561	CCA	2	6	8504	8509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
159	NC_020561	CGA	2	6	8515	8520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_020561	GCC	2	6	8568	8573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470211970
161	NC_020561	CTG	2	6	8829	8834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211970
162	NC_020561	CAG	2	6	8906	8911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211970
163	NC_020561	GCA	2	6	9019	9024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211970
164	NC_020561	CGC	2	6	9055	9060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470211970
165	NC_020561	GGC	2	6	9290	9295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470211970
166	NC_020561	CCG	2	6	9375	9380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470211970
167	NC_020561	CGA	2	6	9388	9393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211970
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170	NC_020561	ACC	2	6	9453	9458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470211970
171	NC_020561	GTG	3	9	9494	9502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
172	NC_020561	CGG	2	6	9568	9573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
173	NC_020561	CGG	2	6	9595	9600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
174	NC_020561	CTA	2	6	9649	9654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
175	NC_020561	CGG	2	6	9798	9803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470211971
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207	NC_020561	CGC	2	6	12026	12031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
208	NC_020561	TTG	2	6	12050	12055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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258	NC_020561	GCC	2	6	14240	14245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470211977
259	NC_020561	CGA	2	6	14281	14286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211978
260	NC_020561	CAA	2	6	14332	14337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470211978
261	NC_020561	GCG	2	6	14540	14545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
262	NC_020561	GAG	2	6	14548	14553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
263	NC_020561	CCT	2	6	14578	14583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
264	NC_020561	GCC	2	6	14591	14596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
265	NC_020561	GAT	2	6	14659	14664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
266	NC_020561	GCC	2	6	14765	14770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470211979
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357	NC_020561	CTG	2	6	21000	21005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211984
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369	NC_020561	CGA	2	6	21822	21827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211985
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377	NC_020561	ATC	2	6	22243	22248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211985
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380	NC_020561	CGC	2	6	22359	22364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
381	NC_020561	GAC	2	6	22384	22389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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383	NC_020561	AAG	2	6	22546	22551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_020561	TCG	2	6	28858	28863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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