MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Sphingomonas sp. MM-1

Total Repeats: 5573

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020561	ATG	2	6	33	38	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020561	CGA	2	6	71	76	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_020561	GAA	2	6	110	115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020561	CCG	3	9	6576	6584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_020561	GGA	2	6	8204	8209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020561	ATG	2	6	8282	8287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020561	GAC	2	6	8357	8362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_020561	CCA	2	6	8504	8509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_020561	CGA	2	6	8515	8520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_020561	GTG	3	9	9494	9502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020561	CGG	2	6	9568	9573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_020561	CGG	2	6	9595	9600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_020561	CTA	2	6	9649	9654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_020561	ATT	2	6	10974	10979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020561	GCC	2	6	11569	11574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_020561	TGC	2	6	11841	11846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_020561	CGC	2	6	12015	12020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_020561	CGC	2	6	12026	12031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_020561	TTG	2	6	12050	12055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020561	GCG	2	6	14540	14545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_020561	GAG	2	6	14548	14553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020561	CCT	2	6	14578	14583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_020561	GCC	2	6	14591	14596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_020561	GAT	2	6	14659	14664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020561	TTC	2	6	17775	17780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_020561	GCG	2	6	17902	17907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_020561	GCC	2	6	17910	17915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_020561	GAC	2	6	17983	17988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_020561	GCG	2	6	17990	17995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_020561	GCC	2	6	18156	18161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_020561	GAA	2	6	18419	18424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020561	TCG	2	6	20932	20937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_020561	CGC	2	6	22359	22364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_020561	GAC	2	6	22384	22389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_020561	CGG	2	6	22442	22447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_020561	AAG	2	6	22546	22551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020561	GCC	2	6	22596	22601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_020561	GCG	2	6	22614	22619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_020561	TGA	2	6	22643	22648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020561	GCC	2	6	22656	22661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_020561	CCG	2	6	22698	22703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_020561	TCG	2	6	22723	22728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_020561	GCC	2	6	22745	22750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_020561	ACC	2	6	22773	22778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_020561	CCG	2	6	22845	22850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_020561	AAT	2	6	22871	22876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020561	CGA	2	6	22987	22992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_020561	TCG	2	6	22995	23000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_020561	CGC	2	6	23104	23109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_020561	ATT	2	6	23130	23135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020561	TGG	2	6	23151	23156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020561	TGC	2	6	23161	23166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_020561	GTG	2	6	23183	23188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020561	GCG	2	6	23297	23302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_020561	GTG	2	6	23382	23387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020561	TTC	2	6	23462	23467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_020561	GCC	2	6	23636	23641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_020561	GCC	2	6	25628	25633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_020561	CGC	2	6	25665	25670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_020561	GGT	2	6	25709	25714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020561	CAG	2	6	25766	25771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_020561	CGC	2	6	26815	26820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_020561	TCG	2	6	28848	28853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_020561	TCG	2	6	28858	28863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_020561	CAG	2	6	28931	28936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_020561	GCT	2	6	28954	28959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_020561	ACG	2	6	29016	29021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_020561	TTG	2	6	29054	29059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020561	GGC	2	6	29061	29066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_020561	GTG	2	6	29131	29136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020561	GCC	2	6	29178	29183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_020561	GCC	2	6	29193	29198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_020561	TGA	2	6	29258	29263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020561	GCG	2	6	30718	30723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_020561	GCT	2	6	30767	30772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_020561	GCC	2	6	31371	31376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_020561	GCC	2	6	33502	33507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_020561	TTG	2	6	33600	33605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020561	GCC	2	6	33624	33629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_020561	ACG	3	9	48533	48541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_020561	CGC	2	6	48543	48548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_020561	CGC	2	6	48638	48643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_020561	TTC	2	6	51554	51559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_020561	GCC	3	9	52614	52622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_020561	GCC	2	6	52641	52646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_020561	GCC	2	6	53245	53250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_020561	GCC	2	6	53261	53266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_020561	CAT	2	6	53901	53906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_020561	GCT	2	6	53912	53917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_020561	ACG	2	6	54262	54267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_020561	GAC	2	6	54300	54305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_020561	GAC	2	6	54322	54327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_020561	CGC	2	6	54345	54350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_020561	CTG	2	6	55098	55103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_020561	GCC	2	6	55104	55109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_020561	GAT	2	6	55144	55149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020561	CGA	2	6	55250	55255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_020561	GCC	2	6	55270	55275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_020561	GCA	2	6	55391	55396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_020561	TCG	2	6	55462	55467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_020561	CGA	2	6	55473	55478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_020561	CAT	2	6	55553	55558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_020561	TCG	2	6	55585	55590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_020561	TCC	2	6	55612	55617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_020561	TGC	2	6	55645	55650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_020561	CTG	2	6	55704	55709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_020561	CGA	2	6	55746	55751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_020561	GCC	2	6	55969	55974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_020561	GGC	2	6	55985	55990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_020561	GCA	2	6	56056	56061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_020561	GCC	2	6	56168	56173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_020561	GCA	2	6	56235	56240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_020561	CCG	2	6	56300	56305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_020561	CAT	2	6	56412	56417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_020561	GCC	2	6	56478	56483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_020561	CCG	2	6	56635	56640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_020561	GCG	2	6	56650	56655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_020561	TCA	2	6	56810	56815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_020561	CGC	2	6	56819	56824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_020561	GGC	2	6	56829	56834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_020561	CGC	2	6	56865	56870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_020561	TCT	2	6	56904	56909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_020561	CGA	2	6	56976	56981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_020561	GCT	2	6	56991	56996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_020561	GCC	2	6	57109	57114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_020561	CGC	2	6	57165	57170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_020561	CAC	2	6	57186	57191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_020561	TCG	2	6	57193	57198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_020561	GAG	2	6	57406	57411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020561	CTT	2	6	57462	57467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_020561	CGT	2	6	57508	57513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_020561	CCT	2	6	57519	57524	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_020561	CTG	2	6	57610	57615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_020561	TGC	2	6	57662	57667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_020561	GCC	2	6	57725	57730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_020561	CAA	2	6	57801	57806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_020561	CTT	2	6	57840	57845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_020561	TCG	2	6	57870	57875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_020561	TCG	2	6	57917	57922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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274	NC_020561	CCG	2	6	190775	190780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
275	NC_020561	CGA	2	6	192127	192132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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277	NC_020561	AGC	2	6	192180	192185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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306	NC_020561	GGC	2	6	215862	215867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
307	NC_020561	GCC	2	6	215879	215884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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