MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti 2011 plasmid pSymB

Total Repeats: 39

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020560	GTTTCG	2	12	29520	29531	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_020560	TGCCGC	2	12	96409	96420	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3	NC_020560	AGGGTG	2	12	130483	130494	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020560	ATAAGC	2	12	172221	172232	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_020560	TGGCAC	2	12	221909	221920	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_020560	TCGCCT	2	12	225161	225172	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
7	NC_020560	GGAGCG	2	12	357422	357433	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_020560	CCTTTC	2	12	534570	534581	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_020560	TTCCGC	2	12	544903	544914	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
10	NC_020560	GGCTCT	2	12	575791	575802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_020560	TTTGGC	2	12	595586	595597	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_020560	TTGAAC	2	12	601783	601794	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_020560	CAGTTC	2	12	612971	612982	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_020560	GGGCGC	2	12	632274	632285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_020560	CCCGCG	2	12	648168	648179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_020560	CGCCTG	2	12	667776	667787	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
17	NC_020560	ATGCGA	2	12	717250	717261	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_020560	AATGAA	2	12	892504	892515	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020560	GAGGGG	2	12	893778	893789	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020560	GAAGGC	2	12	1044171	1044182	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_020560	TCGTGT	2	12	1141774	1141785	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_020560	ACGGCA	2	12	1228642	1228653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_020560	ACAGGC	2	12	1230208	1230219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_020560	TCAGTT	2	12	1268170	1268181	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_020560	CCGGCG	2	12	1279680	1279691	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_020560	TTAGCG	2	12	1311417	1311428	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_020560	GATTCC	2	12	1315218	1315229	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_020560	AGGCCC	2	12	1332573	1332584	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
29	NC_020560	CGAGAC	2	12	1334299	1334310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_020560	GCGGCT	2	12	1370816	1370827	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_020560	CTTCCG	2	12	1381797	1381808	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
32	NC_020560	GGATTT	2	12	1404240	1404251	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020560	TGCGGA	2	12	1448639	1448650	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_020560	ACCGGC	2	12	1450498	1450509	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
35	NC_020560	CCCAAA	2	12	1493828	1493839	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_020560	GCGCCG	2	12	1507028	1507039	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_020560	GTGCAA	2	12	1536507	1536518	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_020560	ACAGGC	2	12	1543582	1543593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_020560	TTCAGC	2	12	1665087	1665098	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.