MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti 2011 plasmid pSymB

Total Repeats: 154

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020560	GTGGA	2	10	26196	26205	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020560	CGACC	2	10	30135	30144	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3	NC_020560	CCCTC	2	10	35934	35943	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
4	NC_020560	GCAAC	2	10	40369	40378	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_020560	CGGCA	2	10	77801	77810	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6	NC_020560	ATTGA	2	10	88013	88022	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020560	CTTTT	2	10	91507	91516	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_020560	TGGCG	2	10	96516	96525	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
9	NC_020560	GCGCC	2	10	99728	99737	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
10	NC_020560	GGCGC	2	10	113094	113103	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
11	NC_020560	CAGGA	2	10	116805	116814	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_020560	GGAAA	2	10	120270	120279	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020560	GCCCG	2	10	124691	124700	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
14	NC_020560	TCCTC	2	10	140003	140012	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
15	NC_020560	CAGTG	2	10	141488	141497	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_020560	ATTTC	2	10	141626	141635	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_020560	AATCT	2	10	141783	141792	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_020560	CCGGA	2	10	147436	147445	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
19	NC_020560	ACCGC	2	10	147486	147495	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
20	NC_020560	AATTT	2	10	165495	165504	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020560	GCCCT	2	10	202135	202144	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
22	NC_020560	CTTCT	2	10	205736	205745	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
23	NC_020560	GGCTT	2	10	225220	225229	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_020560	CAGGC	2	10	241650	241659	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
25	NC_020560	AGCGC	2	10	260202	260211	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
26	NC_020560	CCGGA	2	10	261944	261953	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
27	NC_020560	AAATA	2	10	263971	263980	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020560	TTGAT	2	10	277305	277314	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020560	ATGTT	2	10	278867	278876	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020560	CCCGG	2	10	279049	279058	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
31	NC_020560	GATCG	2	10	279069	279078	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_020560	TTTTC	2	10	290789	290798	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_020560	TTTGT	2	10	294222	294231	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020560	GCAAA	2	10	310335	310344	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_020560	CCCGG	2	10	332421	332430	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
36	NC_020560	ATCGA	2	10	335977	335986	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_020560	CCTTT	2	10	336700	336709	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
38	NC_020560	TGGCG	2	10	339363	339372	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
39	NC_020560	GGAGT	2	10	340562	340571	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020560	TATTT	2	10	343396	343405	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020560	GGGGA	2	10	346011	346020	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020560	CTGTC	2	10	357546	357555	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
43	NC_020560	TAACA	2	10	380318	380327	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_020560	CGACC	2	10	402208	402217	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
45	NC_020560	TTGAC	2	10	429393	429402	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_020560	CTCTA	2	10	429479	429488	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
47	NC_020560	GGCAG	2	10	435980	435989	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
48	NC_020560	CTTTC	2	10	438515	438524	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
49	NC_020560	TGGCG	2	10	450690	450699	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
50	NC_020560	CGTTT	2	10	454299	454308	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_020560	ACGGA	2	10	458842	458851	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
52	NC_020560	GAATC	2	10	470157	470166	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_020560	TCTTA	2	10	483861	483870	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_020560	GGAGT	2	10	509315	509324	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020560	CGTCG	2	10	512632	512641	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
56	NC_020560	GGCTA	2	10	541883	541892	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
57	NC_020560	CAGCT	2	10	552111	552120	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
58	NC_020560	CTTCG	2	10	554762	554771	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
59	NC_020560	AGGCT	2	10	563808	563817	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
60	NC_020560	GCACC	2	10	573408	573417	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
61	NC_020560	CCTTT	2	10	574862	574871	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
62	NC_020560	GCCGG	2	10	576898	576907	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
63	NC_020560	GCGCG	2	10	582350	582359	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
64	NC_020560	CGGCG	2	10	584646	584655	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
65	NC_020560	CCAGA	2	10	585011	585020	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
66	NC_020560	TTGAT	2	10	594435	594444	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020560	GGGAC	2	10	599841	599850	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
68	NC_020560	GGCGG	2	10	610972	610981	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
69	NC_020560	GGTTA	2	10	653486	653495	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020560	CCGGC	2	10	663044	663053	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
71	NC_020560	CAAAA	2	10	666917	666926	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_020560	GGGAC	2	10	678292	678301	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
73	NC_020560	AGTTG	2	10	685390	685399	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020560	GTTTC	2	10	687848	687857	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_020560	CATCC	2	10	687869	687878	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
76	NC_020560	CTCGG	2	10	689348	689357	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
77	NC_020560	ACGGT	2	10	707722	707731	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
78	NC_020560	TTGTT	2	10	723241	723250	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020560	GGGCG	2	10	733633	733642	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
80	NC_020560	GGCCG	2	10	740546	740555	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
81	NC_020560	GACCC	2	10	783728	783737	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
82	NC_020560	AGCGC	3	15	793023	793037	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
83	NC_020560	CGCTG	2	10	793049	793058	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
84	NC_020560	CGCAA	2	10	800765	800774	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
85	NC_020560	ATTAG	2	10	802107	802116	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020560	AACGG	2	10	802190	802199	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
87	NC_020560	GCCGG	2	10	810675	810684	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
88	NC_020560	ATGAA	2	10	818767	818776	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020560	CGGGA	2	10	822553	822562	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
90	NC_020560	GAGAA	2	10	825382	825391	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020560	CGAAG	2	10	825402	825411	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
92	NC_020560	GCGCG	2	10	828119	828128	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
93	NC_020560	ATTTT	2	10	831040	831049	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020560	GCTCT	2	10	841578	841587	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
95	NC_020560	CCGCC	2	10	860374	860383	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
96	NC_020560	CGCCC	2	10	870876	870885	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
97	NC_020560	GATGC	2	10	892452	892461	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
98	NC_020560	TCGGC	2	10	896809	896818	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
99	NC_020560	CCGCA	2	10	908075	908084	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
100	NC_020560	GGTCG	2	10	919522	919531	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
101	NC_020560	CAAAT	2	10	936709	936718	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_020560	CCCGA	2	10	950509	950518	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
103	NC_020560	GCTCT	2	10	963906	963915	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
104	NC_020560	TGAAG	2	10	966328	966337	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020560	ATAAA	2	10	980348	980357	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020560	CCGCC	2	10	998328	998337	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
107	NC_020560	ACGTC	2	10	998427	998436	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
108	NC_020560	TCGCA	2	10	1023194	1023203	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
109	NC_020560	CGACC	2	10	1025635	1025644	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
110	NC_020560	CCGGA	2	10	1042454	1042463	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
111	NC_020560	TGCCC	2	10	1100251	1100260	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
112	NC_020560	CCGGA	2	10	1106643	1106652	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
113	NC_020560	CAAGG	2	10	1111983	1111992	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
114	NC_020560	CGCAC	2	10	1126771	1126780	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
115	NC_020560	GCACT	2	10	1141958	1141967	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
116	NC_020560	TCCGA	2	10	1143047	1143056	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
117	NC_020560	GTTTT	2	10	1148954	1148963	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020560	CTGAT	2	10	1167849	1167858	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
119	NC_020560	CCGCG	2	10	1168030	1168039	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
120	NC_020560	CTCCC	2	10	1203319	1203328	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
121	NC_020560	GGTCG	2	10	1222829	1222838	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
122	NC_020560	TGCGG	2	10	1230151	1230160	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
123	NC_020560	ACGCG	2	10	1232553	1232562	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
124	NC_020560	GTCCC	2	10	1233304	1233313	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
125	NC_020560	CCGGC	2	10	1241306	1241315	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
126	NC_020560	AAAAC	2	10	1243960	1243969	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_020560	CGACC	2	10	1268065	1268074	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
128	NC_020560	TTTGT	2	10	1272303	1272312	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020560	GGTCG	2	10	1287796	1287805	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
130	NC_020560	ATTGA	2	10	1288532	1288541	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020560	GCCGC	2	10	1291367	1291376	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
132	NC_020560	TAGCG	2	10	1319028	1319037	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
133	NC_020560	CCGAT	2	10	1341688	1341697	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
134	NC_020560	CGCAA	2	10	1369282	1369291	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
135	NC_020560	CGGCC	2	10	1387332	1387341	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
136	NC_020560	TGCAA	2	10	1391134	1391143	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
137	NC_020560	CCTCC	2	10	1397034	1397043	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
138	NC_020560	CTTCA	2	10	1402568	1402577	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
139	NC_020560	CGGGA	2	10	1406616	1406625	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
140	NC_020560	TGCTC	2	10	1427696	1427705	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
141	NC_020560	TCGAC	2	10	1441311	1441320	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
142	NC_020560	TTCAA	2	10	1511032	1511041	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_020560	CTGCC	2	10	1525566	1525575	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
144	NC_020560	GGCAG	2	10	1525726	1525735	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
145	NC_020560	GGCTG	2	10	1532366	1532375	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
146	NC_020560	TGCCC	2	10	1532992	1533001	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
147	NC_020560	CTTCG	2	10	1586046	1586055	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
148	NC_020560	CTTTG	2	10	1586760	1586769	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
149	NC_020560	AGGAA	2	10	1606850	1606859	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
150	NC_020560	CTGCA	2	10	1620469	1620478	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
151	NC_020560	GACCG	2	10	1633680	1633689	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
152	NC_020560	CGGCC	2	10	1638365	1638374	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
153	NC_020560	TCGGC	2	10	1665100	1665109	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
154	NC_020560	CGGCA	2	10	1681392	1681401	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.