MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis str. Erdman = ATCC 35801 DNA

Total Repeats: 3074

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020559	TCATC	2	10	902	911	20 %	40 %	0 %	40 %	471335785
2	NC_020559	CGTTT	2	10	2092	2101	0 %	60 %	20 %	20 %	471335786
3	NC_020559	CGGTT	2	10	3241	3250	0 %	40 %	40 %	20 %	471335786
4	NC_020559	GTCGG	2	10	4589	4598	0 %	20 %	60 %	20 %	471335788
5	NC_020559	GCAGC	2	10	7373	7382	20 %	0 %	40 %	40 %	471335790
6	NC_020559	CGGTG	2	10	9281	9290	0 %	20 %	60 %	20 %	471335790
7	NC_020559	CAGAC	2	10	9799	9808	40 %	0 %	20 %	40 %	471335790
8	NC_020559	CGCAA	2	10	10323	10332	40 %	0 %	20 %	40 %	471335792
9	NC_020559	CGGCG	2	10	10449	10458	0 %	0 %	60 %	40 %	471335792
10	NC_020559	GGCGT	2	10	14154	14163	0 %	20 %	60 %	20 %	471335799
11	NC_020559	GGGCC	2	10	14437	14446	0 %	0 %	60 %	40 %	471335799
12	NC_020559	GCGTT	2	10	15182	15191	0 %	40 %	40 %	20 %	471335800
13	NC_020559	CCAGC	2	10	15722	15731	20 %	0 %	20 %	60 %	471335801
14	NC_020559	ACCGA	2	10	16485	16494	40 %	0 %	20 %	40 %	471335801
15	NC_020559	ATCGG	2	10	16877	16886	20 %	20 %	40 %	20 %	471335801
16	NC_020559	CGGCC	2	10	17886	17895	0 %	0 %	40 %	60 %	471335802
17	NC_020559	TTAGC	2	10	19037	19046	20 %	40 %	20 %	20 %	471335803
18	NC_020559	GGTCC	2	10	19109	19118	0 %	20 %	40 %	40 %	471335803
19	NC_020559	GTCGT	2	10	21628	21637	0 %	40 %	40 %	20 %	471335804
20	NC_020559	ATCAC	2	10	23901	23910	40 %	20 %	0 %	40 %	471335807
21	NC_020559	GCCGG	2	10	24588	24597	0 %	0 %	60 %	40 %	471335807
22	NC_020559	GGCAA	2	10	29283	29292	40 %	0 %	40 %	20 %	471335813
23	NC_020559	CGATC	2	10	30108	30117	20 %	20 %	20 %	40 %	471335814
24	NC_020559	CGACG	2	10	32291	32300	20 %	0 %	40 %	40 %	471335818
25	NC_020559	GCGTC	2	10	32346	32355	0 %	20 %	40 %	40 %	471335818
26	NC_020559	GACAC	2	10	32443	32452	40 %	0 %	20 %	40 %	471335818
27	NC_020559	TCCTG	2	10	37447	37456	0 %	40 %	20 %	40 %	471335824
28	NC_020559	CTCGG	2	10	37540	37549	0 %	20 %	40 %	40 %	471335824
29	NC_020559	GGCGC	2	10	38083	38092	0 %	0 %	60 %	40 %	471335824
30	NC_020559	TGGCC	2	10	38231	38240	0 %	20 %	40 %	40 %	471335824
31	NC_020559	CGGCG	2	10	38763	38772	0 %	0 %	60 %	40 %	471335824
32	NC_020559	GTCCA	2	10	39375	39384	20 %	20 %	20 %	40 %	471335825
33	NC_020559	GCCAA	2	10	41509	41518	40 %	0 %	20 %	40 %	471335827
34	NC_020559	GCACA	2	10	42308	42317	40 %	0 %	20 %	40 %	471335828
35	NC_020559	GGTAC	2	10	44842	44851	20 %	20 %	40 %	20 %	471335830
36	NC_020559	TCGAA	2	10	45074	45083	40 %	20 %	20 %	20 %	471335830
37	NC_020559	GCACC	2	10	46004	46013	20 %	0 %	20 %	60 %	471335830
38	NC_020559	CGGTG	2	10	47038	47047	0 %	20 %	60 %	20 %	471335831
39	NC_020559	TCATG	2	10	47184	47193	20 %	40 %	20 %	20 %	471335832
40	NC_020559	GCAGC	2	10	48578	48587	20 %	0 %	40 %	40 %	471335834
41	NC_020559	CCCGA	2	10	48661	48670	20 %	0 %	20 %	60 %	471335834
42	NC_020559	CAGCG	2	10	49786	49795	20 %	0 %	40 %	40 %	471335835
43	NC_020559	CTCCC	2	10	56220	56229	0 %	20 %	0 %	80 %	471335841
44	NC_020559	CGGCG	2	10	56669	56678	0 %	0 %	60 %	40 %	471335841
45	NC_020559	CGACC	2	10	58201	58210	20 %	0 %	20 %	60 %	471335843
46	NC_020559	CTTCG	2	10	58888	58897	0 %	40 %	20 %	40 %	471335844
47	NC_020559	TCAGG	2	10	62430	62439	20 %	20 %	40 %	20 %	471335848
48	NC_020559	TGCCG	2	10	65461	65470	0 %	20 %	40 %	40 %	471335852
49	NC_020559	GGCGA	2	10	66393	66402	20 %	0 %	60 %	20 %	471335853
50	NC_020559	GGTGT	2	10	68969	68978	0 %	40 %	60 %	0 %	471335856
51	NC_020559	ATCGG	2	10	69606	69615	20 %	20 %	40 %	20 %	471335856
52	NC_020559	CGACC	2	10	69879	69888	20 %	0 %	20 %	60 %	471335856
53	NC_020559	CGGGT	2	10	70333	70342	0 %	20 %	60 %	20 %	471335857
54	NC_020559	GGTCG	2	10	70393	70402	0 %	20 %	60 %	20 %	471335857
55	NC_020559	TGCCT	2	10	71134	71143	0 %	40 %	20 %	40 %	471335859
56	NC_020559	GTCCA	2	10	72005	72014	20 %	20 %	20 %	40 %	471335860
57	NC_020559	TGACC	2	10	74629	74638	20 %	20 %	20 %	40 %	471335862
58	NC_020559	GCCAA	2	10	74943	74952	40 %	0 %	20 %	40 %	471335862
59	NC_020559	GTCGC	2	10	75020	75029	0 %	20 %	40 %	40 %	471335862
60	NC_020559	GCGCG	2	10	76108	76117	0 %	0 %	60 %	40 %	471335863
61	NC_020559	CACGA	2	10	78983	78992	40 %	0 %	20 %	40 %	471335866
62	NC_020559	CCACC	2	10	79616	79625	20 %	0 %	0 %	80 %	471335867
63	NC_020559	GAGCA	2	10	81521	81530	40 %	0 %	40 %	20 %	471335869
64	NC_020559	GCCGG	2	10	81620	81629	0 %	0 %	60 %	40 %	471335869
65	NC_020559	GCGAC	2	10	81696	81705	20 %	0 %	40 %	40 %	471335869
66	NC_020559	ATCCG	2	10	82466	82475	20 %	20 %	20 %	40 %	471335870
67	NC_020559	CACCG	2	10	83246	83255	20 %	0 %	20 %	60 %	471335871
68	NC_020559	TGGTC	2	10	85381	85390	0 %	40 %	40 %	20 %	471335873
69	NC_020559	GCTGG	2	10	86018	86027	0 %	20 %	60 %	20 %	471335874
70	NC_020559	TGGGT	2	10	89056	89065	0 %	40 %	60 %	0 %	471335879
71	NC_020559	TCGCC	2	10	89263	89272	0 %	20 %	20 %	60 %	471335879
72	NC_020559	GGGCC	2	10	90236	90245	0 %	0 %	60 %	40 %	471335880
73	NC_020559	GGCCG	2	10	91555	91564	0 %	0 %	60 %	40 %	471335881
74	NC_020559	GCGCC	2	10	92207	92216	0 %	0 %	40 %	60 %	471335881
75	NC_020559	GCTTG	2	10	94239	94248	0 %	40 %	40 %	20 %	471335883
76	NC_020559	CGTGT	2	10	94671	94680	0 %	40 %	40 %	20 %	471335884
77	NC_020559	AGATC	2	10	94750	94759	40 %	20 %	20 %	20 %	471335884
78	NC_020559	CGGCG	2	10	98331	98340	0 %	0 %	60 %	40 %	471335888
79	NC_020559	GCGGT	2	10	99407	99416	0 %	20 %	60 %	20 %	471335889
80	NC_020559	GGTGG	2	10	102927	102936	0 %	20 %	80 %	0 %	471335891
81	NC_020559	GGCTT	2	10	103940	103949	0 %	40 %	40 %	20 %	471335893
82	NC_020559	CTGGC	2	10	104662	104671	0 %	20 %	40 %	40 %	471335894
83	NC_020559	GCACA	2	10	105783	105792	40 %	0 %	20 %	40 %	471335894
84	NC_020559	CTGAA	2	10	108113	108122	40 %	20 %	20 %	20 %	471335897
85	NC_020559	ATCGC	2	10	108608	108617	20 %	20 %	20 %	40 %	471335897
86	NC_020559	TCTGA	2	10	109942	109951	20 %	40 %	20 %	20 %	471335899
87	NC_020559	CGGTC	2	10	110217	110226	0 %	20 %	40 %	40 %	471335899
88	NC_020559	GACCA	2	10	111355	111364	40 %	0 %	20 %	40 %	471335899
89	NC_020559	GGCTG	2	10	113919	113928	0 %	20 %	60 %	20 %	471335899
90	NC_020559	CCGCG	2	10	117839	117848	0 %	0 %	40 %	60 %	471335900
91	NC_020559	TCGTG	2	10	121792	121801	0 %	40 %	40 %	20 %	471335902
92	NC_020559	CCGGA	2	10	123573	123582	20 %	0 %	40 %	40 %	471335904
93	NC_020559	TGCGC	2	10	126046	126055	0 %	20 %	40 %	40 %	471335905
94	NC_020559	GCGAG	2	10	126557	126566	20 %	0 %	60 %	20 %	471335905
95	NC_020559	GGGGT	2	10	127566	127575	0 %	20 %	80 %	0 %	471335905
96	NC_020559	CCCAC	2	10	128128	128137	20 %	0 %	0 %	80 %	471335905
97	NC_020559	CCGGC	2	10	128638	128647	0 %	0 %	40 %	60 %	471335905
98	NC_020559	TGCGG	2	10	129048	129057	0 %	20 %	60 %	20 %	471335905
99	NC_020559	ATCAC	2	10	130527	130536	40 %	20 %	0 %	40 %	471335907
100	NC_020559	ATCGG	2	10	130575	130584	20 %	20 %	40 %	20 %	471335907
101	NC_020559	CGGGC	2	10	131666	131675	0 %	0 %	60 %	40 %	471335907
102	NC_020559	GCGAT	2	10	133471	133480	20 %	20 %	40 %	20 %	471335910
103	NC_020559	GTTCG	2	10	133692	133701	0 %	40 %	40 %	20 %	471335910
104	NC_020559	CCTGG	2	10	134084	134093	0 %	20 %	40 %	40 %	471335910
105	NC_020559	GGCCC	2	10	134190	134199	0 %	0 %	40 %	60 %	471335910
106	NC_020559	CGTTG	2	10	134702	134711	0 %	40 %	40 %	20 %	471335910
107	NC_020559	CGACC	2	10	134774	134783	20 %	0 %	20 %	60 %	471335910
108	NC_020559	GAGAT	2	10	137794	137803	40 %	20 %	40 %	0 %	471335914
109	NC_020559	CGGCG	2	10	139948	139957	0 %	0 %	60 %	40 %	471335916
110	NC_020559	TGCGG	2	10	140581	140590	0 %	20 %	60 %	20 %	471335917
111	NC_020559	CGCTG	2	10	141288	141297	0 %	20 %	40 %	40 %	471335918
112	NC_020559	GTTGC	2	10	141834	141843	0 %	40 %	40 %	20 %	471335918
113	NC_020559	CCGAT	2	10	142582	142591	20 %	20 %	20 %	40 %	471335918
114	NC_020559	ATCGC	2	10	143273	143282	20 %	20 %	20 %	40 %	471335919
115	NC_020559	AACCG	2	10	144012	144021	40 %	0 %	20 %	40 %	471335919
116	NC_020559	CCGCC	2	10	144599	144608	0 %	0 %	20 %	80 %	471335919
117	NC_020559	CCGCC	2	10	145242	145251	0 %	0 %	20 %	80 %	471335920
118	NC_020559	ATCGG	2	10	148726	148735	20 %	20 %	40 %	20 %	471335925
119	NC_020559	TCGTC	2	10	153864	153873	0 %	40 %	20 %	40 %	471335928
120	NC_020559	CACGC	2	10	154328	154337	20 %	0 %	20 %	60 %	471335928
121	NC_020559	ATTCT	2	10	155172	155181	20 %	60 %	0 %	20 %	471335929
122	NC_020559	AGGCG	2	10	155700	155709	20 %	0 %	60 %	20 %	471335929
123	NC_020559	TGACC	2	10	158704	158713	20 %	20 %	20 %	40 %	471335934
124	NC_020559	CGGCG	2	10	158950	158959	0 %	0 %	60 %	40 %	471335934
125	NC_020559	GCACC	2	10	159120	159129	20 %	0 %	20 %	60 %	471335935
126	NC_020559	CCGCA	2	10	160298	160307	20 %	0 %	20 %	60 %	471335936
127	NC_020559	CGCGG	2	10	160377	160386	0 %	0 %	60 %	40 %	471335936
128	NC_020559	CGGTT	2	10	160704	160713	0 %	40 %	40 %	20 %	471335936
129	NC_020559	GCCGG	2	10	161165	161174	0 %	0 %	60 %	40 %	471335937
130	NC_020559	GCGCG	2	10	161287	161296	0 %	0 %	60 %	40 %	471335937
131	NC_020559	CTGGG	2	10	163501	163510	0 %	20 %	60 %	20 %	471335939
132	NC_020559	GCCGG	2	10	164094	164103	0 %	0 %	60 %	40 %	471335940
133	NC_020559	GTTGG	2	10	166063	166072	0 %	40 %	60 %	0 %	471335942
134	NC_020559	GCGTG	2	10	167229	167238	0 %	20 %	60 %	20 %	471335945
135	NC_020559	GCCGC	2	10	167902	167911	0 %	0 %	40 %	60 %	471335945
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152	NC_020559	GGCTG	2	10	190276	190285	0 %	20 %	60 %	20 %	471335967
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245	NC_020559	CTCGA	2	10	335493	335502	20 %	20 %	20 %	40 %	471336091
246	NC_020559	CTCGA	2	10	339383	339392	20 %	20 %	20 %	40 %	471336094
247	NC_020559	CGCGG	2	10	341065	341074	0 %	0 %	60 %	40 %	471336095
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251	NC_020559	GCCCG	2	10	345913	345922	0 %	0 %	40 %	60 %	471336098
252	NC_020559	GCCCG	2	10	346844	346853	0 %	0 %	40 %	60 %	471336099
253	NC_020559	CGGTT	2	10	349187	349196	0 %	40 %	40 %	20 %	471336099
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256	NC_020559	GGGCT	2	10	351164	351173	0 %	20 %	60 %	20 %	471336101
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258	NC_020559	TGACG	2	10	358205	358214	20 %	20 %	40 %	20 %	471336108
259	NC_020559	CGCGC	2	10	363867	363876	0 %	0 %	40 %	60 %	471336115
260	NC_020559	CCGGG	2	10	363970	363979	0 %	0 %	60 %	40 %	471336115
261	NC_020559	GCTCT	2	10	364135	364144	0 %	40 %	20 %	40 %	471336115
262	NC_020559	GCGCG	2	10	365175	365184	0 %	0 %	60 %	40 %	471336118
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381	NC_020559	CGTCA	2	10	524862	524871	20 %	20 %	20 %	40 %	471336258
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