MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis str. Erdman = ATCC 35801 DNA

Total Repeats: 1217

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020559	CCGA	2	8	1725	1732	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_020559	GCCC	2	8	12453	12460	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3	NC_020559	ATTC	2	8	13691	13698	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_020559	ACCC	2	8	14098	14105	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5	NC_020559	TCAA	2	8	25496	25503	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_020559	GAGC	2	8	25524	25531	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_020559	GGCC	2	8	25538	25545	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_020559	ACCA	2	8	31105	31112	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_020559	GCTA	2	8	33836	33843	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_020559	CTGG	2	8	52696	52703	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_020559	CGGT	2	8	78283	78290	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_020559	CGGT	2	8	78468	78475	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_020559	CTTC	2	8	84653	84660	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_020559	CTGG	2	8	86331	86338	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_020559	CGCA	2	8	88632	88639	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_020559	ACCG	2	8	98576	98583	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_020559	TGCG	2	8	99791	99798	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_020559	CGGG	2	8	102483	102490	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
19	NC_020559	CTGG	2	8	102519	102526	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_020559	ATCC	2	8	124711	124718	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_020559	GCGA	2	8	129799	129806	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_020559	CGGG	2	8	129842	129849	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
23	NC_020559	GCTC	2	8	130354	130361	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_020559	CGGG	2	8	133066	133073	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
25	NC_020559	TACG	2	8	137155	137162	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_020559	TTCT	2	8	138982	138989	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_020559	ACGC	2	8	139054	139061	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_020559	AGCA	2	8	140226	140233	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_020559	GCCG	2	8	143032	143039	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_020559	GCGT	2	8	147576	147583	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_020559	GCGG	2	8	148642	148649	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
32	NC_020559	GCCG	2	8	151549	151556	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_020559	CCGG	2	8	154915	154922	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_020559	GCGT	3	12	154943	154954	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_020559	TCGT	2	8	160806	160813	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_020559	CCGG	2	8	160814	160821	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_020559	CCCG	2	8	161026	161033	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
38	NC_020559	GGTA	2	8	169761	169768	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020559	ACTT	2	8	170503	170510	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_020559	CGGA	2	8	172582	172589	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_020559	ACCC	2	8	178540	178547	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
42	NC_020559	TTGA	2	8	186035	186042	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020559	CTGG	2	8	196020	196027	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_020559	CTGT	2	8	211572	211579	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_020559	GGCC	2	8	217660	217667	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_020559	CGGT	2	8	217996	218003	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_020559	GATG	2	8	218743	218750	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020559	AACT	2	8	229938	229945	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_020559	GGAA	2	8	230113	230120	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020559	ACGT	2	8	230865	230872	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_020559	ACAT	2	8	230932	230939	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_020559	GTGC	2	8	240645	240652	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_020559	GCGG	2	8	242506	242513	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
54	NC_020559	GCAT	2	8	248196	248203	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_020559	GAAC	2	8	248331	248338	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_020559	CGCA	2	8	252940	252947	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_020559	GACG	2	8	255349	255356	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_020559	GCGG	2	8	272230	272237	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
59	NC_020559	CGGC	2	8	273596	273603	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_020559	TGGG	2	8	280309	280316	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020559	TAGA	2	8	287705	287712	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020559	ACTT	2	8	291410	291417	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_020559	TCGT	2	8	293038	293045	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_020559	AACT	2	8	295088	295095	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_020559	AACC	2	8	295096	295103	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_020559	ATGC	2	8	296086	296093	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_020559	GACG	2	8	301404	301411	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_020559	TTGC	2	8	309044	309051	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_020559	GGTC	2	8	309216	309223	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_020559	TCGG	2	8	309441	309448	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_020559	GGTA	2	8	335690	335697	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020559	GCCG	2	8	335777	335784	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_020559	TGGC	2	8	335789	335796	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_020559	GGCG	2	8	342512	342519	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
75	NC_020559	CTGT	2	8	364888	364895	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_020559	AATC	2	8	376127	376134	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_020559	GGCC	2	8	386487	386494	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_020559	AAGG	2	8	387503	387510	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020559	AGCA	2	8	391576	391583	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_020559	TGAC	2	8	396472	396479	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_020559	GTCA	2	8	396483	396490	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_020559	CGGC	2	8	400317	400324	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_020559	CGAG	2	8	411251	411258	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_020559	ATCG	2	8	417452	417459	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_020559	GCCA	2	8	417543	417550	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_020559	GTCC	2	8	417569	417576	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_020559	GAGC	2	8	424437	424444	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_020559	GAGC	2	8	424488	424495	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_020559	TGCG	2	8	455856	455863	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_020559	GCTC	2	8	456236	456243	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
91	NC_020559	GGAT	2	8	468529	468536	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020559	GCAC	2	8	476752	476759	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
93	NC_020559	CAAC	2	8	480621	480628	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_020559	CCGC	2	8	484907	484914	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
95	NC_020559	GTCC	2	8	488220	488227	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_020559	GGGT	2	8	488356	488363	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020559	ATGC	2	8	488598	488605	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_020559	ACCT	2	8	492081	492088	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_020559	CGAG	2	8	492316	492323	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_020559	GAGC	2	8	492374	492381	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_020559	AGAA	2	8	492486	492493	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020559	ACCG	2	8	506742	506749	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
103	NC_020559	CGGG	2	8	506779	506786	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
104	NC_020559	GAGG	2	8	508735	508742	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020559	GCGT	2	8	508821	508828	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_020559	ACGG	2	8	512071	512078	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_020559	GATG	2	8	517045	517052	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020559	CTGA	2	8	517669	517676	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_020559	GCAA	2	8	520305	520312	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_020559	GCTG	2	8	523178	523185	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_020559	CCGT	2	8	530223	530230	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
112	NC_020559	CGGC	2	8	535550	535557	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_020559	CGGC	2	8	540293	540300	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_020559	GACG	2	8	540303	540310	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_020559	GTCT	2	8	547608	547615	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_020559	CGCT	2	8	548884	548891	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
117	NC_020559	GGCC	2	8	553802	553809	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_020559	CGGC	2	8	561612	561619	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_020559	CCGG	2	8	562547	562554	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_020559	CAGC	2	8	563807	563814	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
121	NC_020559	GTAG	2	8	563834	563841	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020559	AGCA	2	8	566691	566698	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_020559	CGAC	2	8	567361	567368	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
124	NC_020559	CGCC	2	8	579137	579144	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
125	NC_020559	GCAT	2	8	579220	579227	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_020559	GCTG	2	8	586259	586266	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
127	NC_020559	CGGC	2	8	587866	587873	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_020559	GTTT	2	8	587930	587937	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020559	GCCG	2	8	592944	592951	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_020559	GGCG	2	8	594396	594403	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
131	NC_020559	TGCC	2	8	598000	598007	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
132	NC_020559	GCTA	2	8	598246	598253	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_020559	GCGT	2	8	606132	606139	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_020559	CCGA	2	8	606157	606164	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
135	NC_020559	CCGA	2	8	610160	610167	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
136	NC_020559	GTCC	2	8	612715	612722	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
137	NC_020559	CCGA	2	8	626442	626449	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
138	NC_020559	CGGC	2	8	626858	626865	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_020559	GCCC	2	8	627215	627222	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
140	NC_020559	AGCC	2	8	631696	631703	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
141	NC_020559	CCGG	2	8	637220	637227	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_020559	TGCC	2	8	641657	641664	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
143	NC_020559	GCCG	2	8	653199	653206	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_020559	TGGC	2	8	656489	656496	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NC_020559	CCAG	2	8	659199	659206	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
146	NC_020559	CGGT	2	8	659943	659950	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
147	NC_020559	GTGC	2	8	662643	662650	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
148	NC_020559	AAGG	2	8	662666	662673	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_020559	CGGC	2	8	665150	665157	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150	NC_020559	GTCG	2	8	667315	667322	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
151	NC_020559	CGGC	2	8	670144	670151	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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439	NC_020559	CCGG	2	8	1737796	1737803	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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451	NC_020559	CGGC	2	8	1802169	1802176	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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454	NC_020559	CATT	2	8	1802430	1802437	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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463	NC_020559	CGAG	2	8	1835470	1835477	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
464	NC_020559	TCGG	2	8	1835786	1835793	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
465	NC_020559	CCGG	2	8	1835857	1835864	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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471	NC_020559	CCAG	2	8	1879356	1879363	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
472	NC_020559	GACT	2	8	1879374	1879381	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
473	NC_020559	GCCG	2	8	1879477	1879484	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
474	NC_020559	CTGA	2	8	1879553	1879560	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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477	NC_020559	TCGA	2	8	1884610	1884617	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
478	NC_020559	GCCG	2	8	1889790	1889797	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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480	NC_020559	GCCG	2	8	1912134	1912141	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
481	NC_020559	TCGA	2	8	1912554	1912561	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
482	NC_020559	TGGG	2	8	1917433	1917440	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
483	NC_020559	CCCG	2	8	1931341	1931348	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
484	NC_020559	GTCG	2	8	1934328	1934335	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
485	NC_020559	AGGA	2	8	1938152	1938159	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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487	NC_020559	CTGG	2	8	1942443	1942450	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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489	NC_020559	GCTT	2	8	1956958	1956965	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
490	NC_020559	TCAC	2	8	1961227	1961234	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
491	NC_020559	ACGC	2	8	1961309	1961316	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
492	NC_020559	CGGG	2	8	1961357	1961364	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
493	NC_020559	CGCA	2	8	1962825	1962832	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
494	NC_020559	GCCG	2	8	1962883	1962890	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
495	NC_020559	GCTG	2	8	1966087	1966094	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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497	NC_020559	CCTG	2	8	1975913	1975920	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
498	NC_020559	GACA	2	8	1975936	1975943	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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500	NC_020559	TCCT	2	8	1987455	1987462	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

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