MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mycobacterium tuberculosis str. Erdman = ATCC 35801 DNA

Total Repeats: 82576

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020559	CAC	2	6	27	32	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471335785
2	NC_020559	GTC	2	6	46	51	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471335785
3	NC_020559	GAC	2	6	79	84	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471335785
4	NC_020559	CAG	2	6	90	95	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471335785
5	NC_020559	TCG	2	6	167	172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471335785
6	NC_020559	AGC	2	6	199	204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471335785
7	NC_020559	GCC	2	6	260	265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471335785
8	NC_020559	CCG	2	6	304	309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471335785
9	NC_020559	CGA	2	6	324	329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471335785
10	NC_020559	GCC	2	6	339	344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471335785
11	NC_020559	ACG	2	6	389	394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471335785
12	NC_020559	TGA	2	6	399	404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471335785
13	NC_020559	CGC	3	9	561	569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471335785
14	NC_020559	GTT	2	6	681	686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471335785
15	NC_020559	CGA	2	6	810	815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471335785
16	NC_020559	TTC	2	6	856	861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471335785
17	NC_020559	CAA	2	6	888	893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471335785
18	NC_020559	AGC	2	6	926	931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471335785
19	NC_020559	ACC	2	6	993	998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471335785
20	NC_020559	CGA	2	6	1062	1067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471335785
21	NC_020559	CAG	2	6	1086	1091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471335785
22	NC_020559	GCG	2	6	1237	1242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471335785
23	NC_020559	CCG	2	6	1259	1264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471335785
24	NC_020559	CAC	2	6	1491	1496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471335785
25	NC_020559	TTC	2	6	1534	1539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_020559	CGG	2	6	1643	1648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_020559	TCG	2	6	1801	1806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_020559	ACC	2	6	1848	1853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_020559	TCG	2	6	1866	1871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_020559	ATG	2	6	1889	1894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020559	GTT	3	9	1925	1933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020559	CTG	2	6	1937	1942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_020559	CGT	2	6	1950	1955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_020559	TCG	2	6	1979	1984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_020559	GTT	2	6	2186	2191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471335786
36	NC_020559	CCG	2	6	2242	2247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471335786
37	NC_020559	TTG	2	6	2304	2309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471335786
38	NC_020559	CGA	2	6	2407	2412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471335786
39	NC_020559	TTG	2	6	2463	2468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471335786
40	NC_020559	ATT	2	6	2477	2482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471335786
41	NC_020559	CGC	2	6	2510	2515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471335786
42	NC_020559	GAC	2	6	2523	2528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471335786
43	NC_020559	GGT	2	6	2576	2581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471335786
44	NC_020559	CGT	2	6	2635	2640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471335786
45	NC_020559	GCC	2	6	2691	2696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471335786
46	NC_020559	CGG	2	6	2708	2713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471335786
47	NC_020559	GCA	2	6	2794	2799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471335786
48	NC_020559	CTT	2	6	2808	2813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471335786
49	NC_020559	CCA	2	6	2869	2874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471335786
50	NC_020559	GAT	2	6	2988	2993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471335786
51	NC_020559	TTG	3	9	3016	3024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471335786
52	NC_020559	CGG	2	6	3205	3210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471335786
53	NC_020559	TTG	2	6	3362	3367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471335787
54	NC_020559	CGA	2	6	3416	3421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471335787
55	NC_020559	GTG	2	6	3499	3504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471335787
56	NC_020559	ACG	2	6	3506	3511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471335787
57	NC_020559	CAA	2	6	3555	3560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471335787
58	NC_020559	ATC	2	6	3576	3581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471335787
59	NC_020559	TGT	2	6	3623	3628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471335787
60	NC_020559	CGG	2	6	3673	3678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471335787
61	NC_020559	GAT	2	6	3688	3693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471335787
62	NC_020559	TGG	2	6	3869	3874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471335787
63	NC_020559	GAA	2	6	3915	3920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471335787
64	NC_020559	AGC	2	6	4029	4034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471335787
65	NC_020559	GGC	2	6	4044	4049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471335787
66	NC_020559	GGC	2	6	4053	4058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471335787
67	NC_020559	GAC	2	6	4111	4116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471335787
68	NC_020559	GGC	2	6	4200	4205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471335787
69	NC_020559	TGG	2	6	4227	4232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471335787
70	NC_020559	GTT	2	6	4242	4247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471335787
71	NC_020559	CGA	2	6	4251	4256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471335787
72	NC_020559	CGG	2	6	4301	4306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471335787
73	NC_020559	CCG	2	6	4313	4318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471335787
74	NC_020559	CCG	2	6	4358	4363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471335787
75	NC_020559	GGT	2	6	4422	4427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471335787
76	NC_020559	TGC	3	9	4532	4540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471335788
77	NC_020559	CGA	2	6	4611	4616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471335788
78	NC_020559	GGT	2	6	4745	4750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471335788
79	NC_020559	CCA	2	6	4754	4759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471335788
80	NC_020559	ACG	2	6	4792	4797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471335788
81	NC_020559	CGC	2	6	4877	4882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471335788
82	NC_020559	CGG	2	6	4927	4932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471335788
83	NC_020559	GAA	2	6	5091	5096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020559	AGA	2	6	5141	5146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020559	GTG	2	6	5174	5179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471335789
86	NC_020559	GCG	2	6	5191	5196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471335789
87	NC_020559	GAG	2	6	5222	5227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	471335789
88	NC_020559	AAG	2	6	5255	5260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471335789
89	NC_020559	GGT	2	6	5383	5388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471335789
90	NC_020559	CGA	2	6	5401	5406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471335789
91	NC_020559	TGC	2	6	5442	5447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471335789
92	NC_020559	CGA	2	6	5473	5478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471335789
93	NC_020559	GTG	2	6	5531	5536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471335789
94	NC_020559	CGG	2	6	5554	5559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471335789
95	NC_020559	TGG	2	6	5590	5595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471335789
96	NC_020559	GGT	2	6	5617	5622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471335789
97	NC_020559	AAG	2	6	5732	5737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471335789
98	NC_020559	CAA	2	6	5839	5844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471335789
99	NC_020559	CGA	2	6	5866	5871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471335789
100	NC_020559	GTC	2	6	5891	5896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471335789
101	NC_020559	TGG	2	6	6009	6014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471335789
102	NC_020559	AGC	2	6	6056	6061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471335789
103	NC_020559	GGC	2	6	6176	6181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471335789
104	NC_020559	GGT	2	6	6217	6222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471335789
105	NC_020559	GCG	2	6	6520	6525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471335789
106	NC_020559	ATC	2	6	6692	6697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471335789
107	NC_020559	ATC	2	6	6752	6757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471335789
108	NC_020559	ACG	2	6	6780	6785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471335789
109	NC_020559	TGT	2	6	6867	6872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471335789
110	NC_020559	GTT	3	9	6877	6885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471335789
111	NC_020559	CCG	2	6	6935	6940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471335789
112	NC_020559	CTG	2	6	7007	7012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471335789
113	NC_020559	GAA	2	6	7033	7038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471335789
114	NC_020559	CAA	2	6	7042	7047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471335789
115	NC_020559	ACC	2	6	7109	7114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471335789
116	NC_020559	GAC	2	6	7154	7159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471335789
117	NC_020559	GCC	4	12	7160	7171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471335789
118	NC_020559	GTT	2	6	7177	7182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471335789
119	NC_020559	GCC	2	6	7319	7324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471335790
120	NC_020559	GAC	2	6	7326	7331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471335790
121	NC_020559	CAG	2	6	7362	7367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471335790
122	NC_020559	TCG	2	6	7408	7413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471335790
123	NC_020559	ACC	2	6	7552	7557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471335790
124	NC_020559	TGG	2	6	7627	7632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471335790
125	NC_020559	CGG	2	6	7672	7677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471335790
126	NC_020559	CGA	2	6	7736	7741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471335790
127	NC_020559	ACG	2	6	7768	7773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471335790
128	NC_020559	CTG	2	6	7818	7823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471335790
129	NC_020559	GGC	2	6	7836	7841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471335790
130	NC_020559	CGC	2	6	7870	7875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471335790
131	NC_020559	ACG	2	6	7924	7929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471335790
132	NC_020559	CGA	2	6	7931	7936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471335790
133	NC_020559	CCG	2	6	7990	7995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471335790
134	NC_020559	TCG	2	6	8002	8007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471335790
135	NC_020559	GTT	2	6	8067	8072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471335790
136	NC_020559	AGA	2	6	8078	8083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471335790
137	NC_020559	TCA	2	6	8149	8154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471335790
138	NC_020559	GGT	2	6	8276	8281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471335790
139	NC_020559	TCG	2	6	8344	8349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471335790
140	NC_020559	ACC	2	6	8401	8406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471335790
141	NC_020559	GCG	2	6	8423	8428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471335790
142	NC_020559	CAC	2	6	8429	8434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471335790
143	NC_020559	GCT	2	6	8570	8575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471335790
144	NC_020559	CGA	2	6	8582	8587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471335790
145	NC_020559	GCG	2	6	8621	8626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471335790
146	NC_020559	CAT	2	6	8651	8656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471335790
147	NC_020559	CGA	2	6	8657	8662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471335790
148	NC_020559	CGA	2	6	8741	8746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471335790
149	NC_020559	CGA	2	6	8774	8779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471335790
150	NC_020559	ATC	2	6	8793	8798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471335790
151	NC_020559	CGA	2	6	8819	8824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471335790
152	NC_020559	CGT	2	6	8846	8851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471335790
153	NC_020559	CGG	2	6	8918	8923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471335790
154	NC_020559	GAC	2	6	8955	8960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471335790
155	NC_020559	TCG	2	6	8962	8967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471335790
156	NC_020559	CTT	2	6	8972	8977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471335790
157	NC_020559	TTC	2	6	9006	9011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471335790
158	NC_020559	ACC	2	6	9012	9017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471335790
159	NC_020559	GCA	2	6	9080	9085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471335790
160	NC_020559	ACG	2	6	9268	9273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471335790
161	NC_020559	CGA	3	9	9302	9310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471335790
162	NC_020559	CTG	3	9	9312	9320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471335790
163	NC_020559	CGA	2	6	9422	9427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471335790
164	NC_020559	GCT	2	6	9431	9436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471335790
165	NC_020559	CGT	2	6	9446	9451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471335790
166	NC_020559	CTG	2	6	9468	9473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471335790
167	NC_020559	CGG	2	6	9536	9541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471335790
168	NC_020559	CCG	2	6	9569	9574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471335790
169	NC_020559	CGA	3	9	9605	9613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471335790
170	NC_020559	CGG	2	6	9638	9643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471335790
171	NC_020559	TGA	2	6	9709	9714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471335790
172	NC_020559	GAA	2	6	9759	9764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471335790
173	NC_020559	CGA	2	6	9770	9775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471335790
174	NC_020559	CGA	3	9	9830	9838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
175	NC_020559	GAG	2	6	9859	9864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
176	NC_020559	CGC	2	6	10041	10046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471335791
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181	NC_020559	CCG	2	6	10266	10271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471335792
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198	NC_020559	TCG	2	6	11030	11035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
199	NC_020559	CCT	2	6	11083	11088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
200	NC_020559	CGG	2	6	11320	11325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
201	NC_020559	ACG	2	6	11382	11387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
202	NC_020559	ACC	2	6	11425	11430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
203	NC_020559	ACC	3	9	11495	11503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
204	NC_020559	GCC	2	6	11532	11537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
205	NC_020559	CCG	2	6	11637	11642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471335793
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207	NC_020559	ACT	2	6	11741	11746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
208	NC_020559	CAT	2	6	11802	11807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
209	NC_020559	GAC	2	6	11863	11868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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212	NC_020559	CCG	2	6	11962	11967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471335794
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220	NC_020559	GCC	2	6	12315	12320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
221	NC_020559	CGG	2	6	12395	12400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
222	NC_020559	ACG	2	6	12664	12669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471335795
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233	NC_020559	CAC	2	6	13577	13582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
234	NC_020559	CGG	2	6	13702	13707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
235	NC_020559	CAA	2	6	13735	13740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471335798
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243	NC_020559	ACC	2	6	14329	14334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471335799
244	NC_020559	GGC	2	6	14376	14381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471335799
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246	NC_020559	GGC	2	6	14415	14420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471335799
247	NC_020559	TGG	2	6	14447	14452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471335799
248	NC_020559	CAT	2	6	14604	14609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471335799
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250	NC_020559	CGC	2	6	14685	14690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471335799
251	NC_020559	CGC	3	9	14700	14708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471335799
252	NC_020559	GCT	2	6	14716	14721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471335799
253	NC_020559	GAA	2	6	14788	14793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471335799
254	NC_020559	ACT	2	6	14870	14875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471335799
255	NC_020559	ACG	2	6	15008	15013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471335800
256	NC_020559	ACC	2	6	15014	15019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471335800
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258	NC_020559	GCA	2	6	15133	15138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471335800
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382	NC_020559	GTA	2	6	22198	22203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471335805
383	NC_020559	TGC	2	6	22206	22211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471335805
384	NC_020559	GAT	2	6	22213	22218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471335805
385	NC_020559	TCA	2	6	22245	22250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471335805
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400	NC_020559	GTC	2	6	23337	23342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471335806
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500	NC_020559	GGC	2	6	28763	28768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471335812

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