MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Listeria monocytogenes N53-1 complete genome

Total Repeats: 2050

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020558	TACAT	2	10	291	300	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_020558	ACCAA	2	10	2171	2180	60 %	0 %	0 %	40 %	470208775
3	NC_020558	TTAAA	2	10	2564	2573	60 %	40 %	0 %	0 %	470208775
4	NC_020558	TTTAT	2	10	4206	4215	20 %	80 %	0 %	0 %	470208776
5	NC_020558	TTTGT	2	10	4327	4336	0 %	80 %	20 %	0 %	470208776
6	NC_020558	CAAAA	2	10	7073	7082	80 %	0 %	0 %	20 %	470208779
7	NC_020558	TTGAT	2	10	11615	11624	20 %	60 %	20 %	0 %	470208782
8	NC_020558	TTTTA	2	10	12288	12297	20 %	80 %	0 %	0 %	470208783
9	NC_020558	GTATG	2	10	13231	13240	20 %	40 %	40 %	0 %	470208784
10	NC_020558	AAAGA	2	10	14246	14255	80 %	0 %	20 %	0 %	470208785
11	NC_020558	ATGAA	2	10	17087	17096	60 %	20 %	20 %	0 %	470208788
12	NC_020558	GAATG	2	10	18829	18838	40 %	20 %	40 %	0 %	470208789
13	NC_020558	TAATT	2	10	20207	20216	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020558	ATTAA	2	10	21715	21724	60 %	40 %	0 %	0 %	470208794
15	NC_020558	AAATC	2	10	22176	22185	60 %	20 %	0 %	20 %	470208794
16	NC_020558	AACAT	2	10	22337	22346	60 %	20 %	0 %	20 %	470208794
17	NC_020558	TTTTA	2	10	22954	22963	20 %	80 %	0 %	0 %	470208795
18	NC_020558	GACCA	2	10	23038	23047	40 %	0 %	20 %	40 %	470208795
19	NC_020558	TGGAT	2	10	23297	23306	20 %	40 %	40 %	0 %	470208795
20	NC_020558	CAAAA	2	10	24298	24307	80 %	0 %	0 %	20 %	470208796
21	NC_020558	ATTAT	2	10	24783	24792	40 %	60 %	0 %	0 %	470208797
22	NC_020558	TCAGG	2	10	25952	25961	20 %	20 %	40 %	20 %	470208799
23	NC_020558	TTTAC	2	10	26952	26961	20 %	60 %	0 %	20 %	470208800
24	NC_020558	GAAAA	2	10	32883	32892	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020558	TGAAA	2	10	34038	34047	60 %	20 %	20 %	0 %	470208806
26	NC_020558	GAATG	2	10	35909	35918	40 %	20 %	40 %	0 %	470208808
27	NC_020558	AAATT	2	10	36036	36045	60 %	40 %	0 %	0 %	470208808
28	NC_020558	ATGGA	2	10	38157	38166	40 %	20 %	40 %	0 %	470208809
29	NC_020558	AAAAC	2	10	40263	40272	80 %	0 %	0 %	20 %	470208810
30	NC_020558	TTATT	2	10	41752	41761	20 %	80 %	0 %	0 %	470208812
31	NC_020558	AAAAG	2	10	42966	42975	80 %	0 %	20 %	0 %	470208812
32	NC_020558	ATAAA	2	10	43790	43799	80 %	20 %	0 %	0 %	470208813
33	NC_020558	ATTTT	2	10	45595	45604	20 %	80 %	0 %	0 %	470208815
34	NC_020558	GAAAC	2	10	46853	46862	60 %	0 %	20 %	20 %	470208816
35	NC_020558	GACTT	2	10	47092	47101	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_020558	ATTTT	2	10	47179	47188	20 %	80 %	0 %	0 %	470208817
37	NC_020558	AAATG	2	10	48309	48318	60 %	20 %	20 %	0 %	470208818
38	NC_020558	ATGGT	2	10	49344	49353	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020558	GTAGA	2	10	49393	49402	40 %	20 %	40 %	0 %	470208819
40	NC_020558	TTACT	2	10	50375	50384	20 %	60 %	0 %	20 %	470208821
41	NC_020558	GAAAT	2	10	51033	51042	60 %	20 %	20 %	0 %	470208822
42	NC_020558	CTTAG	2	10	51132	51141	20 %	40 %	20 %	20 %	470208822
43	NC_020558	TAAAA	2	10	52383	52392	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020558	TGCTA	2	10	52557	52566	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_020558	TTTTA	2	10	52725	52734	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020558	AGTTA	2	10	54031	54040	40 %	40 %	20 %	0 %	470208826
47	NC_020558	TTATG	2	10	54580	54589	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020558	CGCAA	2	10	57544	57553	40 %	0 %	20 %	40 %	470208829
49	NC_020558	TTTTA	2	10	58492	58501	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020558	AAACG	2	10	62852	62861	60 %	0 %	20 %	20 %	470208835
51	NC_020558	CGAAA	2	10	64338	64347	60 %	0 %	20 %	20 %	470208836
52	NC_020558	AAAAC	2	10	64348	64357	80 %	0 %	0 %	20 %	470208836
53	NC_020558	AACAA	2	10	65732	65741	80 %	0 %	0 %	20 %	470208838
54	NC_020558	GAGAG	2	10	70781	70790	40 %	0 %	60 %	0 %	470208841
55	NC_020558	GCAAA	2	10	71963	71972	60 %	0 %	20 %	20 %	470208844
56	NC_020558	CAATA	2	10	72028	72037	60 %	20 %	0 %	20 %	470208844
57	NC_020558	GCCTT	2	10	72828	72837	0 %	40 %	20 %	40 %	470208845
58	NC_020558	CAAAA	2	10	73205	73214	80 %	0 %	0 %	20 %	470208845
59	NC_020558	GCTTG	2	10	75227	75236	0 %	40 %	40 %	20 %	470208849
60	NC_020558	AAACT	2	10	75237	75246	60 %	20 %	0 %	20 %	470208849
61	NC_020558	TCAAG	2	10	75902	75911	40 %	20 %	20 %	20 %	470208850
62	NC_020558	GCGCT	2	10	77266	77275	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
63	NC_020558	TCATT	2	10	80366	80375	20 %	60 %	0 %	20 %	470208855
64	NC_020558	ATTTT	2	10	80618	80627	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020558	CTAAA	2	10	82731	82740	60 %	20 %	0 %	20 %	470208857
66	NC_020558	AAGTT	2	10	83147	83156	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020558	GAAAA	2	10	84064	84073	80 %	0 %	20 %	0 %	470208858
68	NC_020558	TGAAA	2	10	84306	84315	60 %	20 %	20 %	0 %	470208858
69	NC_020558	AAATT	2	10	84650	84659	60 %	40 %	0 %	0 %	470208858
70	NC_020558	AGCGG	2	10	85234	85243	20 %	0 %	60 %	20 %	470208858
71	NC_020558	AGTTA	2	10	86643	86652	40 %	40 %	20 %	0 %	470208858
72	NC_020558	GAAAT	2	10	87730	87739	60 %	20 %	20 %	0 %	470208859
73	NC_020558	AAAAG	2	10	88042	88051	80 %	0 %	20 %	0 %	470208859
74	NC_020558	TGAAA	2	10	89039	89048	60 %	20 %	20 %	0 %	470208859
75	NC_020558	TGCAT	2	10	91699	91708	20 %	40 %	20 %	20 %	470208862
76	NC_020558	TTACT	2	10	91945	91954	20 %	60 %	0 %	20 %	470208862
77	NC_020558	GTTTT	2	10	93543	93552	0 %	80 %	20 %	0 %	470208864
78	NC_020558	GAAGT	2	10	93824	93833	40 %	20 %	40 %	0 %	470208864
79	NC_020558	AGCGG	2	10	95143	95152	20 %	0 %	60 %	20 %	470208865
80	NC_020558	ATATC	2	10	100947	100956	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_020558	TTCCA	2	10	101725	101734	20 %	40 %	0 %	40 %	470208875
82	NC_020558	AAAAG	2	10	103627	103636	80 %	0 %	20 %	0 %	470208877
83	NC_020558	ACGGT	2	10	105171	105180	20 %	20 %	40 %	20 %	470208878
84	NC_020558	GAAAT	2	10	106410	106419	60 %	20 %	20 %	0 %	470208879
85	NC_020558	GAATT	2	10	107050	107059	40 %	40 %	20 %	0 %	470208880
86	NC_020558	AACCA	2	10	110926	110935	60 %	0 %	0 %	40 %	470208883
87	NC_020558	CTCGA	2	10	112606	112615	20 %	20 %	20 %	40 %	470208885
88	NC_020558	TTCCA	2	10	112940	112949	20 %	40 %	0 %	40 %	470208885
89	NC_020558	TACTG	2	10	113205	113214	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
90	NC_020558	TCTCT	2	10	113778	113787	0 %	60 %	0 %	40 %	470208886
91	NC_020558	TTTTA	2	10	114138	114147	20 %	80 %	0 %	0 %	470208887
92	NC_020558	AAAAG	2	10	114403	114412	80 %	0 %	20 %	0 %	470208888
93	NC_020558	AAAGT	2	10	115430	115439	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020558	TTAGT	2	10	116551	116560	20 %	60 %	20 %	0 %	470208892
95	NC_020558	TTTAT	2	10	119487	119496	20 %	80 %	0 %	0 %	470208897
96	NC_020558	AAGTG	2	10	121509	121518	40 %	20 %	40 %	0 %	470208900
97	NC_020558	GTCAG	2	10	121954	121963	20 %	20 %	40 %	20 %	470208901
98	NC_020558	TTGTT	2	10	125087	125096	0 %	80 %	20 %	0 %	470208905
99	NC_020558	ATTTT	2	10	126823	126832	20 %	80 %	0 %	0 %	470208908
100	NC_020558	GCCGT	2	10	127876	127885	0 %	20 %	40 %	40 %	470208910
101	NC_020558	AAAAT	2	10	128277	128286	80 %	20 %	0 %	0 %	470208910
102	NC_020558	AACTT	2	10	129427	129436	40 %	40 %	0 %	20 %	470208912
103	NC_020558	ACAAA	2	10	129529	129538	80 %	0 %	0 %	20 %	470208912
104	NC_020558	CTTGA	2	10	130324	130333	20 %	40 %	20 %	20 %	470208912
105	NC_020558	TTGGT	2	10	131119	131128	0 %	60 %	40 %	0 %	470208913
106	NC_020558	GAAAG	2	10	131476	131485	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020558	TATGA	2	10	134015	134024	40 %	40 %	20 %	0 %	470208919
108	NC_020558	ACGGC	2	10	136728	136737	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
109	NC_020558	TTTAA	2	10	136800	136809	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020558	AATTT	2	10	136986	136995	40 %	60 %	0 %	0 %	470208924
111	NC_020558	GATAA	2	10	137149	137158	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020558	AATAA	2	10	138255	138264	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020558	GAATA	2	10	140159	140168	60 %	20 %	20 %	0 %	470208929
114	NC_020558	TTTAC	2	10	141358	141367	20 %	60 %	0 %	20 %	470208930
115	NC_020558	AGATG	2	10	141407	141416	40 %	20 %	40 %	0 %	470208930
116	NC_020558	ATATG	2	10	144074	144083	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020558	TCTAA	2	10	146704	146713	40 %	40 %	0 %	20 %	470208933
118	NC_020558	AAATC	2	10	147219	147228	60 %	20 %	0 %	20 %	470208933
119	NC_020558	GGCTG	2	10	147256	147265	0 %	20 %	60 %	20 %	470208933
120	NC_020558	CGAAA	2	10	147834	147843	60 %	0 %	20 %	20 %	470208933
121	NC_020558	AAGAT	2	10	150223	150232	60 %	20 %	20 %	0 %	470208935
122	NC_020558	TGCGC	2	10	150344	150353	0 %	20 %	40 %	40 %	470208935
123	NC_020558	GAATT	2	10	150594	150603	40 %	40 %	20 %	0 %	470208936
124	NC_020558	AAATA	2	10	153649	153658	80 %	20 %	0 %	0 %	470208940
125	NC_020558	TTCTT	2	10	154854	154863	0 %	80 %	0 %	20 %	470208942
126	NC_020558	CTAAA	2	10	155002	155011	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_020558	TTCCA	2	10	155405	155414	20 %	40 %	0 %	40 %	470208943
128	NC_020558	AACCT	2	10	157176	157185	40 %	20 %	0 %	40 %	470208944
129	NC_020558	ACAAA	2	10	159897	159906	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_020558	ACTTT	2	10	161167	161176	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_020558	AAAAG	2	10	162596	162605	80 %	0 %	20 %	0 %	470208949
132	NC_020558	ATGAA	2	10	164370	164379	60 %	20 %	20 %	0 %	470208950
133	NC_020558	TACTT	2	10	167370	167379	20 %	60 %	0 %	20 %	470208954
134	NC_020558	AGTGA	2	10	169944	169953	40 %	20 %	40 %	0 %	470208956
135	NC_020558	CCGTA	2	10	171354	171363	20 %	20 %	20 %	40 %	470208956
136	NC_020558	TGGAA	2	10	172175	172184	40 %	20 %	40 %	0 %	470208957
137	NC_020558	ATGTA	2	10	172270	172279	40 %	40 %	20 %	0 %	470208957
138	NC_020558	GCGTT	2	10	174032	174041	0 %	40 %	40 %	20 %	470208958
139	NC_020558	AAGCG	2	10	174398	174407	40 %	0 %	40 %	20 %	470208958
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145	NC_020558	AATTT	2	10	181140	181149	40 %	60 %	0 %	0 %	470208965
146	NC_020558	ATTTG	2	10	181967	181976	20 %	60 %	20 %	0 %	470208966
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151	NC_020558	CATTT	2	10	189252	189261	20 %	60 %	0 %	20 %	470208974
152	NC_020558	ATTTA	2	10	190587	190596	40 %	60 %	0 %	0 %	470208976
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174	NC_020558	AGCCG	2	10	210698	210707	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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181	NC_020558	GAAAA	2	10	219025	219034	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
182	NC_020558	GAAAA	2	10	219228	219237	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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184	NC_020558	TGATA	2	10	219798	219807	40 %	40 %	20 %	0 %	470209003
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191	NC_020558	TCGTG	2	10	231331	231340	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
192	NC_020558	AAGGT	2	10	232799	232808	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
193	NC_020558	ATTTT	2	10	236476	236485	20 %	80 %	0 %	0 %	470209010
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200	NC_020558	GGCAT	2	10	249773	249782	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
201	NC_020558	CAAAG	2	10	250876	250885	60 %	0 %	20 %	20 %	470209028
202	NC_020558	TCGTA	2	10	254698	254707	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
203	NC_020558	GAAAA	2	10	256069	256078	80 %	0 %	20 %	0 %	470209035
204	NC_020558	TATTT	2	10	257125	257134	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
205	NC_020558	ATTTG	2	10	257842	257851	20 %	60 %	20 %	0 %	470209037
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234	NC_020558	ATTCG	2	10	301019	301028	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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236	NC_020558	ATTTG	2	10	303636	303645	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
237	NC_020558	TAGAT	2	10	303676	303685	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
238	NC_020558	TTTGA	2	10	304785	304794	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
239	NC_020558	GTTTT	2	10	304796	304805	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
240	NC_020558	TTGGG	2	10	305500	305509	0 %	40 %	60 %	0 %	470209089
241	NC_020558	ACTTT	2	10	308423	308432	20 %	60 %	0 %	20 %	470209092
242	NC_020558	TTTCG	2	10	308689	308698	0 %	60 %	20 %	20 %	470209092
243	NC_020558	TATTT	2	10	310846	310855	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
244	NC_020558	ACGGG	2	10	313975	313984	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
245	NC_020558	AAGTG	2	10	315631	315640	40 %	20 %	40 %	0 %	470209103
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251	NC_020558	TTTTG	2	10	327379	327388	0 %	80 %	20 %	0 %	470209117
252	NC_020558	AAAAT	2	10	329146	329155	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
253	NC_020558	TAGTT	2	10	329781	329790	20 %	60 %	20 %	0 %	470209119
254	NC_020558	ATAGA	2	10	330781	330790	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
255	NC_020558	TCCAA	2	10	331436	331445	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
256	NC_020558	AACTT	2	10	331667	331676	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
257	NC_020558	TACAG	2	10	335701	335710	40 %	20 %	20 %	20 %	470209122
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260	NC_020558	AAATT	2	10	339947	339956	60 %	40 %	0 %	0 %	470209128
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262	NC_020558	GGTTG	2	10	343131	343140	0 %	40 %	60 %	0 %	470209132
263	NC_020558	CCATT	2	10	343498	343507	20 %	40 %	0 %	40 %	470209133
264	NC_020558	AGTTC	2	10	343674	343683	20 %	40 %	20 %	20 %	470209133
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266	NC_020558	TTCAC	2	10	345770	345779	20 %	40 %	0 %	40 %	470209136
267	NC_020558	ATTTC	2	10	346203	346212	20 %	60 %	0 %	20 %	470209137
268	NC_020558	ACAAA	2	10	348416	348425	80 %	0 %	0 %	20 %	470209140
269	NC_020558	ATTAA	2	10	351930	351939	60 %	40 %	0 %	0 %	470209144
270	NC_020558	GTGAT	2	10	352981	352990	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
271	NC_020558	GAAAC	2	10	358077	358086	60 %	0 %	20 %	20 %	470209151
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273	NC_020558	ATGAT	2	10	359965	359974	40 %	40 %	20 %	0 %	470209154
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392	NC_020558	CGATG	2	10	515533	515542	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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402	NC_020558	CCAAA	2	10	529151	529160	60 %	0 %	0 %	40 %	470209360
403	NC_020558	AAGAA	2	10	529769	529778	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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406	NC_020558	ATGGT	2	10	534616	534625	20 %	40 %	40 %	0 %	470209366
407	NC_020558	AAAGA	2	10	536616	536625	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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409	NC_020558	CCATT	2	10	540756	540765	20 %	40 %	0 %	40 %	470209372
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