MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Listeria monocytogenes N53-1 complete genome

Total Repeats: 1567

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020558	ACCAA	2	10	2171	2180	60 %	0 %	0 %	40 %	470208775
2	NC_020558	TTAAA	2	10	2564	2573	60 %	40 %	0 %	0 %	470208775
3	NC_020558	TTTAT	2	10	4206	4215	20 %	80 %	0 %	0 %	470208776
4	NC_020558	TTTGT	2	10	4327	4336	0 %	80 %	20 %	0 %	470208776
5	NC_020558	CAAAA	2	10	7073	7082	80 %	0 %	0 %	20 %	470208779
6	NC_020558	TTGAT	2	10	11615	11624	20 %	60 %	20 %	0 %	470208782
7	NC_020558	TTTTA	2	10	12288	12297	20 %	80 %	0 %	0 %	470208783
8	NC_020558	GTATG	2	10	13231	13240	20 %	40 %	40 %	0 %	470208784
9	NC_020558	AAAGA	2	10	14246	14255	80 %	0 %	20 %	0 %	470208785
10	NC_020558	ATGAA	2	10	17087	17096	60 %	20 %	20 %	0 %	470208788
11	NC_020558	GAATG	2	10	18829	18838	40 %	20 %	40 %	0 %	470208789
12	NC_020558	ATTAA	2	10	21715	21724	60 %	40 %	0 %	0 %	470208794
13	NC_020558	AAATC	2	10	22176	22185	60 %	20 %	0 %	20 %	470208794
14	NC_020558	AACAT	2	10	22337	22346	60 %	20 %	0 %	20 %	470208794
15	NC_020558	TTTTA	2	10	22954	22963	20 %	80 %	0 %	0 %	470208795
16	NC_020558	GACCA	2	10	23038	23047	40 %	0 %	20 %	40 %	470208795
17	NC_020558	TGGAT	2	10	23297	23306	20 %	40 %	40 %	0 %	470208795
18	NC_020558	CAAAA	2	10	24298	24307	80 %	0 %	0 %	20 %	470208796
19	NC_020558	ATTAT	2	10	24783	24792	40 %	60 %	0 %	0 %	470208797
20	NC_020558	TCAGG	2	10	25952	25961	20 %	20 %	40 %	20 %	470208799
21	NC_020558	TTTAC	2	10	26952	26961	20 %	60 %	0 %	20 %	470208800
22	NC_020558	TGAAA	2	10	34038	34047	60 %	20 %	20 %	0 %	470208806
23	NC_020558	GAATG	2	10	35909	35918	40 %	20 %	40 %	0 %	470208808
24	NC_020558	AAATT	2	10	36036	36045	60 %	40 %	0 %	0 %	470208808
25	NC_020558	ATGGA	2	10	38157	38166	40 %	20 %	40 %	0 %	470208809
26	NC_020558	AAAAC	2	10	40263	40272	80 %	0 %	0 %	20 %	470208810
27	NC_020558	TTATT	2	10	41752	41761	20 %	80 %	0 %	0 %	470208812
28	NC_020558	AAAAG	2	10	42966	42975	80 %	0 %	20 %	0 %	470208812
29	NC_020558	ATAAA	2	10	43790	43799	80 %	20 %	0 %	0 %	470208813
30	NC_020558	ATTTT	2	10	45595	45604	20 %	80 %	0 %	0 %	470208815
31	NC_020558	GAAAC	2	10	46853	46862	60 %	0 %	20 %	20 %	470208816
32	NC_020558	ATTTT	2	10	47179	47188	20 %	80 %	0 %	0 %	470208817
33	NC_020558	AAATG	2	10	48309	48318	60 %	20 %	20 %	0 %	470208818
34	NC_020558	GTAGA	2	10	49393	49402	40 %	20 %	40 %	0 %	470208819
35	NC_020558	TTACT	2	10	50375	50384	20 %	60 %	0 %	20 %	470208821
36	NC_020558	GAAAT	2	10	51033	51042	60 %	20 %	20 %	0 %	470208822
37	NC_020558	CTTAG	2	10	51132	51141	20 %	40 %	20 %	20 %	470208822
38	NC_020558	AGTTA	2	10	54031	54040	40 %	40 %	20 %	0 %	470208826
39	NC_020558	CGCAA	2	10	57544	57553	40 %	0 %	20 %	40 %	470208829
40	NC_020558	AAACG	2	10	62852	62861	60 %	0 %	20 %	20 %	470208835
41	NC_020558	CGAAA	2	10	64338	64347	60 %	0 %	20 %	20 %	470208836
42	NC_020558	AAAAC	2	10	64348	64357	80 %	0 %	0 %	20 %	470208836
43	NC_020558	AACAA	2	10	65732	65741	80 %	0 %	0 %	20 %	470208838
44	NC_020558	GAGAG	2	10	70781	70790	40 %	0 %	60 %	0 %	470208841
45	NC_020558	GCAAA	2	10	71963	71972	60 %	0 %	20 %	20 %	470208844
46	NC_020558	CAATA	2	10	72028	72037	60 %	20 %	0 %	20 %	470208844
47	NC_020558	GCCTT	2	10	72828	72837	0 %	40 %	20 %	40 %	470208845
48	NC_020558	CAAAA	2	10	73205	73214	80 %	0 %	0 %	20 %	470208845
49	NC_020558	GCTTG	2	10	75227	75236	0 %	40 %	40 %	20 %	470208849
50	NC_020558	AAACT	2	10	75237	75246	60 %	20 %	0 %	20 %	470208849
51	NC_020558	TCAAG	2	10	75902	75911	40 %	20 %	20 %	20 %	470208850
52	NC_020558	TCATT	2	10	80366	80375	20 %	60 %	0 %	20 %	470208855
53	NC_020558	CTAAA	2	10	82731	82740	60 %	20 %	0 %	20 %	470208857
54	NC_020558	GAAAA	2	10	84064	84073	80 %	0 %	20 %	0 %	470208858
55	NC_020558	TGAAA	2	10	84306	84315	60 %	20 %	20 %	0 %	470208858
56	NC_020558	AAATT	2	10	84650	84659	60 %	40 %	0 %	0 %	470208858
57	NC_020558	AGCGG	2	10	85234	85243	20 %	0 %	60 %	20 %	470208858
58	NC_020558	AGTTA	2	10	86643	86652	40 %	40 %	20 %	0 %	470208858
59	NC_020558	GAAAT	2	10	87730	87739	60 %	20 %	20 %	0 %	470208859
60	NC_020558	AAAAG	2	10	88042	88051	80 %	0 %	20 %	0 %	470208859
61	NC_020558	TGAAA	2	10	89039	89048	60 %	20 %	20 %	0 %	470208859
62	NC_020558	TGCAT	2	10	91699	91708	20 %	40 %	20 %	20 %	470208862
63	NC_020558	TTACT	2	10	91945	91954	20 %	60 %	0 %	20 %	470208862
64	NC_020558	GTTTT	2	10	93543	93552	0 %	80 %	20 %	0 %	470208864
65	NC_020558	GAAGT	2	10	93824	93833	40 %	20 %	40 %	0 %	470208864
66	NC_020558	AGCGG	2	10	95143	95152	20 %	0 %	60 %	20 %	470208865
67	NC_020558	TTCCA	2	10	101725	101734	20 %	40 %	0 %	40 %	470208875
68	NC_020558	AAAAG	2	10	103627	103636	80 %	0 %	20 %	0 %	470208877
69	NC_020558	ACGGT	2	10	105171	105180	20 %	20 %	40 %	20 %	470208878
70	NC_020558	GAAAT	2	10	106410	106419	60 %	20 %	20 %	0 %	470208879
71	NC_020558	GAATT	2	10	107050	107059	40 %	40 %	20 %	0 %	470208880
72	NC_020558	AACCA	2	10	110926	110935	60 %	0 %	0 %	40 %	470208883
73	NC_020558	CTCGA	2	10	112606	112615	20 %	20 %	20 %	40 %	470208885
74	NC_020558	TTCCA	2	10	112940	112949	20 %	40 %	0 %	40 %	470208885
75	NC_020558	TCTCT	2	10	113778	113787	0 %	60 %	0 %	40 %	470208886
76	NC_020558	TTTTA	2	10	114138	114147	20 %	80 %	0 %	0 %	470208887
77	NC_020558	AAAAG	2	10	114403	114412	80 %	0 %	20 %	0 %	470208888
78	NC_020558	TTAGT	2	10	116551	116560	20 %	60 %	20 %	0 %	470208892
79	NC_020558	TTTAT	2	10	119487	119496	20 %	80 %	0 %	0 %	470208897
80	NC_020558	AAGTG	2	10	121509	121518	40 %	20 %	40 %	0 %	470208900
81	NC_020558	GTCAG	2	10	121954	121963	20 %	20 %	40 %	20 %	470208901
82	NC_020558	TTGTT	2	10	125087	125096	0 %	80 %	20 %	0 %	470208905
83	NC_020558	ATTTT	2	10	126823	126832	20 %	80 %	0 %	0 %	470208908
84	NC_020558	GCCGT	2	10	127876	127885	0 %	20 %	40 %	40 %	470208910
85	NC_020558	AAAAT	2	10	128277	128286	80 %	20 %	0 %	0 %	470208910
86	NC_020558	AACTT	2	10	129427	129436	40 %	40 %	0 %	20 %	470208912
87	NC_020558	ACAAA	2	10	129529	129538	80 %	0 %	0 %	20 %	470208912
88	NC_020558	CTTGA	2	10	130324	130333	20 %	40 %	20 %	20 %	470208912
89	NC_020558	TTGGT	2	10	131119	131128	0 %	60 %	40 %	0 %	470208913
90	NC_020558	TATGA	2	10	134015	134024	40 %	40 %	20 %	0 %	470208919
91	NC_020558	AATTT	2	10	136986	136995	40 %	60 %	0 %	0 %	470208924
92	NC_020558	GAATA	2	10	140159	140168	60 %	20 %	20 %	0 %	470208929
93	NC_020558	TTTAC	2	10	141358	141367	20 %	60 %	0 %	20 %	470208930
94	NC_020558	AGATG	2	10	141407	141416	40 %	20 %	40 %	0 %	470208930
95	NC_020558	TCTAA	2	10	146704	146713	40 %	40 %	0 %	20 %	470208933
96	NC_020558	AAATC	2	10	147219	147228	60 %	20 %	0 %	20 %	470208933
97	NC_020558	GGCTG	2	10	147256	147265	0 %	20 %	60 %	20 %	470208933
98	NC_020558	CGAAA	2	10	147834	147843	60 %	0 %	20 %	20 %	470208933
99	NC_020558	AAGAT	2	10	150223	150232	60 %	20 %	20 %	0 %	470208935
100	NC_020558	TGCGC	2	10	150344	150353	0 %	20 %	40 %	40 %	470208935
101	NC_020558	GAATT	2	10	150594	150603	40 %	40 %	20 %	0 %	470208936
102	NC_020558	AAATA	2	10	153649	153658	80 %	20 %	0 %	0 %	470208940
103	NC_020558	TTCTT	2	10	154854	154863	0 %	80 %	0 %	20 %	470208942
104	NC_020558	TTCCA	2	10	155405	155414	20 %	40 %	0 %	40 %	470208943
105	NC_020558	AACCT	2	10	157176	157185	40 %	20 %	0 %	40 %	470208944
106	NC_020558	AAAAG	2	10	162596	162605	80 %	0 %	20 %	0 %	470208949
107	NC_020558	ATGAA	2	10	164370	164379	60 %	20 %	20 %	0 %	470208950
108	NC_020558	TACTT	2	10	167370	167379	20 %	60 %	0 %	20 %	470208954
109	NC_020558	AGTGA	2	10	169944	169953	40 %	20 %	40 %	0 %	470208956
110	NC_020558	CCGTA	2	10	171354	171363	20 %	20 %	20 %	40 %	470208956
111	NC_020558	TGGAA	2	10	172175	172184	40 %	20 %	40 %	0 %	470208957
112	NC_020558	ATGTA	2	10	172270	172279	40 %	40 %	20 %	0 %	470208957
113	NC_020558	GCGTT	2	10	174032	174041	0 %	40 %	40 %	20 %	470208958
114	NC_020558	AAGCG	2	10	174398	174407	40 %	0 %	40 %	20 %	470208958
115	NC_020558	CAAAA	2	10	174675	174684	80 %	0 %	0 %	20 %	470208958
116	NC_020558	ATCAA	2	10	176471	176480	60 %	20 %	0 %	20 %	470208959
117	NC_020558	AGAAA	2	10	178290	178299	80 %	0 %	20 %	0 %	470208961
118	NC_020558	GGACG	2	10	179016	179025	20 %	0 %	60 %	20 %	470208962
119	NC_020558	AATTT	2	10	181140	181149	40 %	60 %	0 %	0 %	470208965
120	NC_020558	ATTTG	2	10	181967	181976	20 %	60 %	20 %	0 %	470208966
121	NC_020558	AAAGT	2	10	189115	189124	60 %	20 %	20 %	0 %	470208974
122	NC_020558	CGAAA	2	10	189209	189218	60 %	0 %	20 %	20 %	470208974
123	NC_020558	CATTT	2	10	189252	189261	20 %	60 %	0 %	20 %	470208974
124	NC_020558	ATTTA	2	10	190587	190596	40 %	60 %	0 %	0 %	470208976
125	NC_020558	TGGTT	2	10	192278	192287	0 %	60 %	40 %	0 %	470208977
126	NC_020558	GGATT	2	10	192959	192968	20 %	40 %	40 %	0 %	470208978
127	NC_020558	TGAAA	2	10	194677	194686	60 %	20 %	20 %	0 %	470208979
128	NC_020558	TATAA	2	10	195176	195185	60 %	40 %	0 %	0 %	470208979
129	NC_020558	AAGTG	2	10	195532	195541	40 %	20 %	40 %	0 %	470208979
130	NC_020558	TTATT	2	10	195820	195829	20 %	80 %	0 %	0 %	470208979
131	NC_020558	GAAAA	2	10	196044	196053	80 %	0 %	20 %	0 %	470208979
132	NC_020558	AACAG	2	10	196054	196063	60 %	0 %	20 %	20 %	470208979
133	NC_020558	AAAAG	2	10	197172	197181	80 %	0 %	20 %	0 %	470208980
134	NC_020558	CATTT	2	10	199345	199354	20 %	60 %	0 %	20 %	470208984
135	NC_020558	AAAAG	2	10	199969	199978	80 %	0 %	20 %	0 %	470208985
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253	NC_020558	CTTAC	2	10	458976	458985	20 %	40 %	0 %	40 %	470209273
254	NC_020558	TTCTT	2	10	460596	460605	0 %	80 %	0 %	20 %	470209275
255	NC_020558	TGACA	2	10	465659	465668	40 %	20 %	20 %	20 %	470209285
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263	NC_020558	AAGTA	2	10	476721	476730	60 %	20 %	20 %	0 %	470209301
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