MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Listeria monocytogenes N53-1 complete genome

Total Repeats: 8487

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020558	CAAT	2	8	321	328	50 %	25 %	0 %	25 %	470208774
2	NC_020558	CTTA	2	8	944	951	25 %	50 %	0 %	25 %	470208774
3	NC_020558	GACC	2	8	1056	1063	25 %	0 %	25 %	50 %	470208774
4	NC_020558	CGTT	2	8	1418	1425	0 %	50 %	25 %	25 %	470208774
5	NC_020558	ATTA	3	12	1810	1821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020558	TACT	2	8	2348	2355	25 %	50 %	0 %	25 %	470208775
7	NC_020558	TAAA	2	8	2498	2505	75 %	25 %	0 %	0 %	470208775
8	NC_020558	AATA	2	8	4512	4519	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020558	TGAT	2	8	4702	4709	25 %	50 %	25 %	0 %	470208777
10	NC_020558	AACC	2	8	4976	4983	50 %	0 %	0 %	50 %	470208778
11	NC_020558	TGCT	2	8	5002	5009	0 %	50 %	25 %	25 %	470208778
12	NC_020558	ATTT	2	8	5301	5308	25 %	75 %	0 %	0 %	470208778
13	NC_020558	TTCA	2	8	5463	5470	25 %	50 %	0 %	25 %	470208778
14	NC_020558	AATC	2	8	5611	5618	50 %	25 %	0 %	25 %	470208778
15	NC_020558	AAAG	2	8	6006	6013	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020558	TAAA	2	8	6751	6758	75 %	25 %	0 %	0 %	470208779
17	NC_020558	ATTT	2	8	6786	6793	25 %	75 %	0 %	0 %	470208779
18	NC_020558	TAAA	2	8	7135	7142	75 %	25 %	0 %	0 %	470208779
19	NC_020558	ATTA	2	8	7538	7545	50 %	50 %	0 %	0 %	470208779
20	NC_020558	TAAA	2	8	8105	8112	75 %	25 %	0 %	0 %	470208780
21	NC_020558	ATGA	2	8	8221	8228	50 %	25 %	25 %	0 %	470208780
22	NC_020558	AATT	2	8	9248	9255	50 %	50 %	0 %	0 %	470208780
23	NC_020558	ACAA	2	8	9317	9324	75 %	0 %	0 %	25 %	470208780
24	NC_020558	ATTA	2	8	9411	9418	50 %	50 %	0 %	0 %	470208780
25	NC_020558	CTAA	2	8	9592	9599	50 %	25 %	0 %	25 %	470208780
26	NC_020558	ACTT	2	8	9827	9834	25 %	50 %	0 %	25 %	470208780
27	NC_020558	ATCT	2	8	10071	10078	25 %	50 %	0 %	25 %	470208780
28	NC_020558	AAAC	2	8	10225	10232	75 %	0 %	0 %	25 %	470208780
29	NC_020558	AATC	2	8	10790	10797	50 %	25 %	0 %	25 %	470208781
30	NC_020558	ATTA	2	8	11021	11028	50 %	50 %	0 %	0 %	470208781
31	NC_020558	ATTA	2	8	13527	13534	50 %	50 %	0 %	0 %	470208784
32	NC_020558	ATTT	2	8	13867	13874	25 %	75 %	0 %	0 %	470208785
33	NC_020558	ATGC	2	8	14417	14424	25 %	25 %	25 %	25 %	470208785
34	NC_020558	TGTA	2	8	15156	15163	25 %	50 %	25 %	0 %	470208786
35	NC_020558	ACCG	2	8	16544	16551	25 %	0 %	25 %	50 %	470208787
36	NC_020558	TACA	2	8	16678	16685	50 %	25 %	0 %	25 %	470208787
37	NC_020558	AGCT	2	8	16789	16796	25 %	25 %	25 %	25 %	470208787
38	NC_020558	CAAA	2	8	17116	17123	75 %	0 %	0 %	25 %	470208788
39	NC_020558	CTTG	2	8	17355	17362	0 %	50 %	25 %	25 %	470208789
40	NC_020558	TTTA	2	8	17496	17503	25 %	75 %	0 %	0 %	470208789
41	NC_020558	ATTA	2	8	17856	17863	50 %	50 %	0 %	0 %	470208789
42	NC_020558	GCTT	2	8	17907	17914	0 %	50 %	25 %	25 %	470208789
43	NC_020558	ACCG	2	8	18231	18238	25 %	0 %	25 %	50 %	470208789
44	NC_020558	GTTT	2	8	18556	18563	0 %	75 %	25 %	0 %	470208789
45	NC_020558	TGTC	2	8	18944	18951	0 %	50 %	25 %	25 %	470208789
46	NC_020558	ACTT	2	8	19275	19282	25 %	50 %	0 %	25 %	470208790
47	NC_020558	GGCT	2	8	19295	19302	0 %	25 %	50 %	25 %	470208790
48	NC_020558	TATT	2	8	19672	19679	25 %	75 %	0 %	0 %	470208790
49	NC_020558	TTCA	2	8	19930	19937	25 %	50 %	0 %	25 %	470208791
50	NC_020558	GGAC	2	8	21606	21613	25 %	0 %	50 %	25 %	470208794
51	NC_020558	AATC	2	8	22164	22171	50 %	25 %	0 %	25 %	470208794
52	NC_020558	AAGC	2	8	22508	22515	50 %	0 %	25 %	25 %	470208794
53	NC_020558	AGCC	2	8	23595	23602	25 %	0 %	25 %	50 %	470208795
54	NC_020558	GAAC	2	8	23631	23638	50 %	0 %	25 %	25 %	470208795
55	NC_020558	ATTA	2	8	24067	24074	50 %	50 %	0 %	0 %	470208796
56	NC_020558	GTAA	2	8	24224	24231	50 %	25 %	25 %	0 %	470208796
57	NC_020558	GTTA	2	8	25720	25727	25 %	50 %	25 %	0 %	470208799
58	NC_020558	CAAA	2	8	26404	26411	75 %	0 %	0 %	25 %	470208799
59	NC_020558	GTTG	2	8	26548	26555	0 %	50 %	50 %	0 %	470208800
60	NC_020558	AAAG	2	8	26756	26763	75 %	0 %	25 %	0 %	470208800
61	NC_020558	GTTA	2	8	28194	28201	25 %	50 %	25 %	0 %	470208802
62	NC_020558	GTCC	2	8	28263	28270	0 %	25 %	25 %	50 %	470208802
63	NC_020558	TGAT	2	8	28315	28322	25 %	50 %	25 %	0 %	470208802
64	NC_020558	AAAT	2	8	28733	28740	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020558	AGGA	2	8	28911	28918	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020558	GAAA	2	8	29054	29061	75 %	0 %	25 %	0 %	470208803
67	NC_020558	GAAG	2	8	29190	29197	50 %	0 %	50 %	0 %	470208803
68	NC_020558	TTGG	2	8	29326	29333	0 %	50 %	50 %	0 %	470208803
69	NC_020558	GTAC	2	8	29350	29357	25 %	25 %	25 %	25 %	470208803
70	NC_020558	ATTT	2	8	30038	30045	25 %	75 %	0 %	0 %	470208803
71	NC_020558	CAAT	2	8	30755	30762	50 %	25 %	0 %	25 %	470208803
72	NC_020558	TAAA	2	8	30840	30847	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020558	ATTA	2	8	31371	31378	50 %	50 %	0 %	0 %	470208804
74	NC_020558	GAAA	2	8	31982	31989	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020558	CCTT	2	8	33205	33212	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_020558	ACTA	2	8	33711	33718	50 %	25 %	0 %	25 %	470208806
77	NC_020558	AATA	2	8	33750	33757	75 %	25 %	0 %	0 %	470208806
78	NC_020558	AAAC	2	8	34665	34672	75 %	0 %	0 %	25 %	470208807
79	NC_020558	TTGT	2	8	34816	34823	0 %	75 %	25 %	0 %	470208807
80	NC_020558	TTGG	2	8	34846	34853	0 %	50 %	50 %	0 %	470208807
81	NC_020558	AAAC	2	8	34861	34868	75 %	0 %	0 %	25 %	470208807
82	NC_020558	TATT	2	8	34874	34881	25 %	75 %	0 %	0 %	470208807
83	NC_020558	AACT	2	8	35119	35126	50 %	25 %	0 %	25 %	470208807
84	NC_020558	GGCT	2	8	36077	36084	0 %	25 %	50 %	25 %	470208808
85	NC_020558	GATG	2	8	36727	36734	25 %	25 %	50 %	0 %	470208808
86	NC_020558	AACA	2	8	37000	37007	75 %	0 %	0 %	25 %	470208808
87	NC_020558	TTTA	2	8	37176	37183	25 %	75 %	0 %	0 %	470208808
88	NC_020558	AAAC	2	8	37229	37236	75 %	0 %	0 %	25 %	470208808
89	NC_020558	GAAT	2	8	37596	37603	50 %	25 %	25 %	0 %	470208808
90	NC_020558	CAAT	2	8	37613	37620	50 %	25 %	0 %	25 %	470208808
91	NC_020558	GCGG	2	8	38261	38268	0 %	0 %	75 %	25 %	470208809
92	NC_020558	TTAG	2	8	38327	38334	25 %	50 %	25 %	0 %	470208809
93	NC_020558	TACC	2	8	39110	39117	25 %	25 %	0 %	50 %	470208809
94	NC_020558	CAAA	2	8	39273	39280	75 %	0 %	0 %	25 %	470208810
95	NC_020558	CAAC	2	8	39763	39770	50 %	0 %	0 %	50 %	470208810
96	NC_020558	AAAT	2	8	40211	40218	75 %	25 %	0 %	0 %	470208810
97	NC_020558	AAAT	2	8	40500	40507	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020558	TTCT	2	8	40804	40811	0 %	75 %	0 %	25 %	470208811
99	NC_020558	ATTA	2	8	41889	41896	50 %	50 %	0 %	0 %	470208812
100	NC_020558	TTGT	2	8	41925	41932	0 %	75 %	25 %	0 %	470208812
101	NC_020558	ATTT	2	8	42114	42121	25 %	75 %	0 %	0 %	470208812
102	NC_020558	ATTT	2	8	42197	42204	25 %	75 %	0 %	0 %	470208812
103	NC_020558	ACGT	2	8	43310	43317	25 %	25 %	25 %	25 %	470208813
104	NC_020558	ATTT	2	8	43615	43622	25 %	75 %	0 %	0 %	470208813
105	NC_020558	GGAA	2	8	43854	43861	50 %	0 %	50 %	0 %	470208813
106	NC_020558	CGAC	2	8	43881	43888	25 %	0 %	25 %	50 %	470208813
107	NC_020558	ATTA	2	8	43903	43910	50 %	50 %	0 %	0 %	470208813
108	NC_020558	TGGT	2	8	44009	44016	0 %	50 %	50 %	0 %	470208813
109	NC_020558	ATTA	2	8	44427	44434	50 %	50 %	0 %	0 %	470208814
110	NC_020558	ACCA	2	8	44475	44482	50 %	0 %	0 %	50 %	470208814
111	NC_020558	TCTT	2	8	44546	44553	0 %	75 %	0 %	25 %	470208814
112	NC_020558	AAAG	2	8	44947	44954	75 %	0 %	25 %	0 %	470208814
113	NC_020558	GAAG	2	8	45672	45679	50 %	0 %	50 %	0 %	470208815
114	NC_020558	AAAC	2	8	45778	45785	75 %	0 %	0 %	25 %	470208815
115	NC_020558	TTAA	2	8	46360	46367	50 %	50 %	0 %	0 %	470208816
116	NC_020558	AAAC	2	8	46629	46636	75 %	0 %	0 %	25 %	470208816
117	NC_020558	ATTT	2	8	46642	46649	25 %	75 %	0 %	0 %	470208816
118	NC_020558	TACG	2	8	46797	46804	25 %	25 %	25 %	25 %	470208816
119	NC_020558	ATAA	2	8	47063	47070	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020558	TAAA	2	8	47125	47132	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020558	AGTG	2	8	47142	47149	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020558	TTAG	2	8	47876	47883	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020558	CCAG	2	8	48423	48430	25 %	0 %	25 %	50 %	470208818
124	NC_020558	TGAA	2	8	48560	48567	50 %	25 %	25 %	0 %	470208818
125	NC_020558	GAAC	2	8	48592	48599	50 %	0 %	25 %	25 %	470208818
126	NC_020558	TTTA	2	8	48633	48640	25 %	75 %	0 %	0 %	470208818
127	NC_020558	GCTC	2	8	49294	49301	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_020558	GGCG	2	8	49960	49967	0 %	0 %	75 %	25 %	470208820
129	NC_020558	AAAT	2	8	50565	50572	75 %	25 %	0 %	0 %	470208821
130	NC_020558	TATT	2	8	50668	50675	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020558	TAAA	2	8	51400	51407	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020558	AGAA	2	8	51624	51631	75 %	0 %	25 %	0 %	470208823
133	NC_020558	TAAT	2	8	51716	51723	50 %	50 %	0 %	0 %	470208823
134	NC_020558	ACTT	2	8	52152	52159	25 %	50 %	0 %	25 %	470208823
135	NC_020558	GCTT	2	8	52280	52287	0 %	50 %	25 %	25 %	470208824
136	NC_020558	ATAA	2	8	52344	52351	75 %	25 %	0 %	0 %	470208824
137	NC_020558	AACA	2	8	52509	52516	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_020558	TTTA	2	8	52575	52582	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020558	ATTG	2	8	52614	52621	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020558	TACT	2	8	52697	52704	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_020558	ATTG	2	8	52848	52855	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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