MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Listeria monocytogenes N53-1 complete genome

Total Repeats: 39738

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020558	CAA	2	6	406	411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470208774
2	NC_020558	TAT	2	6	440	445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208774
3	NC_020558	AAT	2	6	456	461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470208774
4	NC_020558	GAA	2	6	567	572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208774
5	NC_020558	GCA	2	6	705	710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470208774
6	NC_020558	GGA	2	6	765	770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470208774
7	NC_020558	CAA	2	6	819	824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470208774
8	NC_020558	TTA	2	6	880	885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208774
9	NC_020558	ATA	2	6	898	903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470208774
10	NC_020558	GAA	2	6	909	914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208774
11	NC_020558	TGA	2	6	953	958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208774
12	NC_020558	AAG	2	6	979	984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208774
13	NC_020558	ATG	2	6	1024	1029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208774
14	NC_020558	ATT	3	9	1041	1049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208774
15	NC_020558	CCA	2	6	1137	1142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470208774
16	NC_020558	AGT	2	6	1277	1282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208774
17	NC_020558	TTC	2	6	1289	1294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470208774
18	NC_020558	TAA	2	6	1301	1306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470208774
19	NC_020558	GCA	2	6	1326	1331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470208774
20	NC_020558	TTA	2	6	1372	1377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208774
21	NC_020558	AAG	2	6	1393	1398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208774
22	NC_020558	AGA	2	6	1427	1432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208774
23	NC_020558	TGA	2	6	1532	1537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208774
24	NC_020558	TGG	2	6	1541	1546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470208774
25	NC_020558	ACA	2	6	1557	1562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470208774
26	NC_020558	ACT	2	6	1592	1597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470208774
27	NC_020558	GCA	2	6	1744	1749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_020558	AAC	2	6	1938	1943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470208775
29	NC_020558	ATG	2	6	1979	1984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208775
30	NC_020558	ATG	2	6	2051	2056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208775
31	NC_020558	TGG	2	6	2082	2087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470208775
32	NC_020558	TCG	2	6	2124	2129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470208775
33	NC_020558	AGA	2	6	2136	2141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208775
34	NC_020558	CCT	2	6	2198	2203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470208775
35	NC_020558	TGA	2	6	2451	2456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208775
36	NC_020558	ACA	2	6	2462	2467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470208775
37	NC_020558	CAA	2	6	2547	2552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470208775
38	NC_020558	TAT	2	6	2579	2584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208775
39	NC_020558	TAA	2	6	2724	2729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470208775
40	NC_020558	TTA	2	6	2732	2737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208775
41	NC_020558	TCC	2	6	2773	2778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470208775
42	NC_020558	GAA	2	6	2836	2841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208775
43	NC_020558	ATG	2	6	2869	2874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208775
44	NC_020558	TGA	2	6	2898	2903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208775
45	NC_020558	ATG	2	6	3121	3126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208776
46	NC_020558	ACA	2	6	3136	3141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470208776
47	NC_020558	GAT	2	6	3216	3221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208776
48	NC_020558	TTG	2	6	3233	3238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470208776
49	NC_020558	GCT	2	6	3265	3270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470208776
50	NC_020558	ATT	2	6	3313	3318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208776
51	NC_020558	GGT	2	6	3414	3419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470208776
52	NC_020558	ATT	2	6	3430	3435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208776
53	NC_020558	CTT	2	6	3469	3474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470208776
54	NC_020558	GAT	2	6	3505	3510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208776
55	NC_020558	CTA	2	6	3512	3517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470208776
56	NC_020558	ACC	2	6	3526	3531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470208776
57	NC_020558	TGT	2	6	3666	3671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470208776
58	NC_020558	GCT	2	6	3697	3702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470208776
59	NC_020558	TAA	2	6	3899	3904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470208776
60	NC_020558	CGG	2	6	3938	3943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470208776
61	NC_020558	AGC	2	6	3990	3995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470208776
62	NC_020558	TCC	2	6	3997	4002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470208776
63	NC_020558	TTA	2	6	4135	4140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208776
64	NC_020558	TTA	2	6	4169	4174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208776
65	NC_020558	TGT	2	6	4236	4241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470208776
66	NC_020558	TGG	2	6	4363	4368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470208776
67	NC_020558	CGA	2	6	4453	4458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470208776
68	NC_020558	TAT	2	6	4581	4586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208777
69	NC_020558	TGG	2	6	4721	4726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470208777
70	NC_020558	TAT	2	6	5048	5053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208778
71	NC_020558	AGA	2	6	5063	5068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208778
72	NC_020558	CAA	2	6	5340	5345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470208778
73	NC_020558	GCG	2	6	5487	5492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470208778
74	NC_020558	TCA	2	6	5498	5503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470208778
75	NC_020558	GTG	2	6	5638	5643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470208778
76	NC_020558	GAT	2	6	5667	5672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208778
77	NC_020558	GAA	2	6	5778	5783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208778
78	NC_020558	CTT	2	6	5802	5807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470208778
79	NC_020558	GAT	2	6	5811	5816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208778
80	NC_020558	CGA	2	6	5831	5836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470208778
81	NC_020558	ACA	2	6	5895	5900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470208778
82	NC_020558	CAA	2	6	5938	5943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470208778
83	NC_020558	TGA	2	6	5999	6004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020558	AAT	2	6	6022	6027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020558	AGA	2	6	6035	6040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208779
86	NC_020558	TTG	2	6	6187	6192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470208779
87	NC_020558	TGA	2	6	6203	6208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208779
88	NC_020558	GTC	2	6	6319	6324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470208779
89	NC_020558	TGG	2	6	6359	6364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470208779
90	NC_020558	GGC	3	9	6372	6380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470208779
91	NC_020558	GTG	2	6	6499	6504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470208779
92	NC_020558	GTA	2	6	6507	6512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208779
93	NC_020558	GAA	2	6	6522	6527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208779
94	NC_020558	AAC	2	6	6593	6598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470208779
95	NC_020558	GAA	2	6	6687	6692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208779
96	NC_020558	CCA	2	6	6780	6785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470208779
97	NC_020558	GAT	2	6	6807	6812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208779
98	NC_020558	ATA	2	6	6838	6843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470208779
99	NC_020558	CAT	2	6	6860	6865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470208779
100	NC_020558	TTA	2	6	6940	6945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208779
101	NC_020558	TAA	2	6	6962	6967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470208779
102	NC_020558	TGA	2	6	6983	6988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208779
103	NC_020558	ATT	2	6	7029	7034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208779
104	NC_020558	ATG	2	6	7146	7151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208779
105	NC_020558	GCT	2	6	7215	7220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470208779
106	NC_020558	TTC	2	6	7295	7300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470208779
107	NC_020558	TGG	2	6	7349	7354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470208779
108	NC_020558	GAA	2	6	7458	7463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208779
109	NC_020558	TGG	2	6	7499	7504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470208779
110	NC_020558	ACT	2	6	7586	7591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470208779
111	NC_020558	ACC	2	6	7655	7660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470208779
112	NC_020558	AGA	2	6	7718	7723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208779
113	NC_020558	AAC	2	6	7798	7803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470208779
114	NC_020558	ACA	2	6	7812	7817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470208779
115	NC_020558	ACT	2	6	7838	7843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470208779
116	NC_020558	TCG	2	6	7916	7921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470208779
117	NC_020558	TAA	2	6	7968	7973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470208779
118	NC_020558	TAA	2	6	7986	7991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020558	TTA	2	6	7997	8002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020558	CAT	2	6	8123	8128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470208780
121	NC_020558	TTG	2	6	8153	8158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470208780
122	NC_020558	CGT	2	6	8203	8208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470208780
123	NC_020558	GGC	2	6	8415	8420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470208780
124	NC_020558	ACT	2	6	8466	8471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470208780
125	NC_020558	TAA	2	6	8481	8486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470208780
126	NC_020558	TTA	2	6	8563	8568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208780
127	NC_020558	CAA	2	6	8603	8608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470208780
128	NC_020558	CCA	2	6	8619	8624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470208780
129	NC_020558	CTG	2	6	8723	8728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470208780
130	NC_020558	GAT	2	6	8730	8735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208780
131	NC_020558	GAA	2	6	8812	8817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208780
132	NC_020558	TTA	2	6	8843	8848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208780
133	NC_020558	GAA	2	6	8913	8918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208780
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257	NC_020558	TTC	2	6	17947	17952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470208789
258	NC_020558	ATG	2	6	17977	17982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208789
259	NC_020558	ATT	2	6	18061	18066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208789
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261	NC_020558	CTT	2	6	18198	18203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470208789
262	NC_020558	ATG	2	6	18217	18222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208789
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265	NC_020558	CTT	2	6	18402	18407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470208789
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289	NC_020558	ACA	2	6	19891	19896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470208791
290	NC_020558	TTA	2	6	19910	19915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208791
291	NC_020558	GCA	2	6	20017	20022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470208791
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293	NC_020558	CTG	2	6	20326	20331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470208792
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379	NC_020558	AGC	3	9	26332	26340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470208799
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