MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes N53-1 complete genome

Total Repeats: 6637

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020558	GCA	2	6	1744	1749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_020558	TGA	2	6	5999	6004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020558	AAT	2	6	6022	6027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020558	TAA	2	6	7986	7991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020558	TTA	2	6	7997	8002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020558	TGA	2	6	11547	11552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020558	TAA	2	6	12696	12701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020558	TAT	2	6	12746	12751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020558	AGT	2	6	15741	15746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020558	CTT	2	6	15999	16004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_020558	TTG	2	6	16862	16867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020558	AGC	2	6	16872	16877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_020558	AAT	2	6	20259	20264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020558	CTC	2	6	21261	21266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_020558	ATT	2	6	21403	21408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020558	GAG	2	6	21465	21470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020558	TCA	2	6	22935	22940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_020558	AAG	2	6	25674	25679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020558	GGA	2	6	27309	27314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020558	TCA	2	6	28791	28796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_020558	GTC	2	6	28920	28925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_020558	AGT	2	6	32416	32421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020558	CAT	2	6	32434	32439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_020558	AGT	2	6	32444	32449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020558	ATT	2	6	32642	32647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020558	GAA	2	6	32655	32660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020558	TCT	2	6	32721	32726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_020558	TCT	2	6	32826	32831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_020558	ATA	2	6	32843	32848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020558	TGG	2	6	32849	32854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020558	ATA	2	6	32917	32922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020558	TTG	2	6	32960	32965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020558	CCG	2	6	32994	32999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_020558	CTT	2	6	33094	33099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_020558	GTT	2	6	33106	33111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020558	CAA	2	6	34425	34430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_020558	AGG	2	6	40321	40326	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020558	TCT	2	6	40337	40342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_020558	AAT	2	6	40429	40434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020558	ATG	2	6	40447	40452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020558	AGG	2	6	41562	41567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020558	AGA	2	6	41568	41573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020558	AGG	2	6	45129	45134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020558	TGA	2	6	47891	47896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020558	ATA	2	6	49257	49262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020558	ATT	2	6	49284	49289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020558	AGG	2	6	49386	49391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020558	GAG	2	6	49734	49739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020558	AGG	2	6	50317	50322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020558	AAG	2	6	50651	50656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020558	TAT	2	6	51431	51436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020558	TTA	2	6	51546	51551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020558	GGA	2	6	52436	52441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020558	GAT	2	6	52602	52607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020558	GTA	2	6	52657	52662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020558	TTA	2	6	52688	52693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020558	TAG	2	6	52718	52723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020558	ATG	2	6	52757	52762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020558	TTG	2	6	52819	52824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020558	TCT	2	6	52836	52841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_020558	TTG	2	6	52877	52882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020558	TAT	2	6	52902	52907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020558	GTT	2	6	53050	53055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020558	AGC	2	6	53099	53104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_020558	ATA	2	6	53203	53208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020558	TGA	2	6	54527	54532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020558	ATA	2	6	54553	54558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020558	TGA	2	6	54560	54565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020558	TGG	2	6	58616	58621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020558	AAT	2	6	59993	59998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020558	ATA	2	6	60284	60289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020558	CAA	2	6	60603	60608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_020558	AGA	2	6	61271	61276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020558	ACA	2	6	61297	61302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_020558	AAT	2	6	61311	61316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020558	AAC	2	6	64625	64630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_020558	GAT	2	6	64653	64658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020558	AGA	2	6	65137	65142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020558	CTA	2	6	65292	65297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_020558	AGA	2	6	65302	65307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020558	GCG	2	6	65327	65332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_020558	GAA	2	6	65359	65364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020558	TCG	2	6	65406	65411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_020558	GCG	2	6	68341	68346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_020558	ATT	2	6	73427	73432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020558	CCA	2	6	73575	73580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_020558	AAC	2	6	75763	75768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_020558	GAG	2	6	76491	76496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020558	GAA	2	6	77086	77091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020558	TGT	2	6	77109	77114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020558	CTG	2	6	77152	77157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_020558	ACA	2	6	77164	77169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_020558	TGC	2	6	77205	77210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_020558	TGT	2	6	77220	77225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020558	GGA	2	6	77226	77231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020558	CAC	2	6	77398	77403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_020558	TTA	2	6	77414	77419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020558	TTA	2	6	77462	77467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020558	GTT	2	6	77510	77515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020558	AGC	2	6	77530	77535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_020558	TAA	2	6	77645	77650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020558	AAT	2	6	77655	77660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020558	ATT	2	6	77678	77683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020558	TAA	2	6	77723	77728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020558	TAC	2	6	77731	77736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_020558	GTT	2	6	77753	77758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020558	ATG	2	6	78538	78543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020558	GGC	2	6	78552	78557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_020558	TGT	2	6	78623	78628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020558	TGA	2	6	78761	78766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020558	AGA	2	6	78791	78796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020558	CAC	2	6	78918	78923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_020558	TAA	3	9	79046	79054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020558	TCC	2	6	79058	79063	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_020558	TAA	2	6	79478	79483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020558	TGT	2	6	80523	80528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020558	TAA	2	6	80600	80605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020558	GAT	2	6	80610	80615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020558	TAG	2	6	80654	80659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020558	TAG	2	6	80706	80711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020558	ATA	2	6	80821	80826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020558	AGT	2	6	83167	83172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020558	ACA	2	6	89828	89833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_020558	ACA	2	6	96669	96674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_020558	AAT	2	6	96691	96696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020558	AGG	2	6	96855	96860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020558	AGG	2	6	97845	97850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020558	GGA	2	6	98672	98677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020558	TAA	2	6	99682	99687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020558	ATA	2	6	100170	100175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020558	AGG	2	6	100218	100223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020558	CCT	2	6	100596	100601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_020558	TGC	2	6	100985	100990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_020558	TAT	2	6	100998	101003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020558	AAT	2	6	101015	101020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020558	GTT	2	6	101043	101048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020558	AGG	2	6	102060	102065	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020558	AAG	2	6	102525	102530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020558	CCG	2	6	102541	102546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_020558	AAG	2	6	102734	102739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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