MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Listeria monocytogenes La111 complete genome

Total Repeats: 1586

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020557	ACCAA	2	10	2171	2180	60 %	0 %	0 %	40 %	470205643
2	NC_020557	TTAAA	2	10	2564	2573	60 %	40 %	0 %	0 %	470205643
3	NC_020557	TTTAT	2	10	4206	4215	20 %	80 %	0 %	0 %	470205644
4	NC_020557	TTTGT	2	10	4327	4336	0 %	80 %	20 %	0 %	470205644
5	NC_020557	CAAAA	2	10	7073	7082	80 %	0 %	0 %	20 %	470205647
6	NC_020557	TTGAT	2	10	11587	11596	20 %	60 %	20 %	0 %	470205649
7	NC_020557	TTTTA	2	10	12260	12269	20 %	80 %	0 %	0 %	470205650
8	NC_020557	GTATG	2	10	13203	13212	20 %	40 %	40 %	0 %	470205651
9	NC_020557	AAAGA	2	10	14218	14227	80 %	0 %	20 %	0 %	470205652
10	NC_020557	ATGAA	2	10	17059	17068	60 %	20 %	20 %	0 %	470205655
11	NC_020557	GAATG	2	10	18801	18810	40 %	20 %	40 %	0 %	470205656
12	NC_020557	TAATT	2	10	20179	20188	40 %	60 %	0 %	0 %	470205659
13	NC_020557	ATTAA	2	10	21691	21700	60 %	40 %	0 %	0 %	470205661
14	NC_020557	AAATC	2	10	22152	22161	60 %	20 %	0 %	20 %	470205661
15	NC_020557	AACAT	2	10	22313	22322	60 %	20 %	0 %	20 %	470205661
16	NC_020557	TTTTA	2	10	22930	22939	20 %	80 %	0 %	0 %	470205662
17	NC_020557	GACCA	2	10	23014	23023	40 %	0 %	20 %	40 %	470205662
18	NC_020557	TGGAT	2	10	23273	23282	20 %	40 %	40 %	0 %	470205662
19	NC_020557	CAAAA	2	10	24274	24283	80 %	0 %	0 %	20 %	470205663
20	NC_020557	ATTAT	2	10	24759	24768	40 %	60 %	0 %	0 %	470205664
21	NC_020557	TCAGG	2	10	25928	25937	20 %	20 %	40 %	20 %	470205666
22	NC_020557	TTTAC	2	10	26928	26937	20 %	60 %	0 %	20 %	470205667
23	NC_020557	TGAAA	2	10	34014	34023	60 %	20 %	20 %	0 %	470205673
24	NC_020557	GAATG	2	10	35885	35894	40 %	20 %	40 %	0 %	470205675
25	NC_020557	AAATT	2	10	36012	36021	60 %	40 %	0 %	0 %	470205675
26	NC_020557	ATGGA	2	10	38133	38142	40 %	20 %	40 %	0 %	470205676
27	NC_020557	AAAAC	2	10	40239	40248	80 %	0 %	0 %	20 %	470205677
28	NC_020557	TTATT	2	10	41728	41737	20 %	80 %	0 %	0 %	470205679
29	NC_020557	AAAAG	2	10	42942	42951	80 %	0 %	20 %	0 %	470205679
30	NC_020557	ATAAA	2	10	43766	43775	80 %	20 %	0 %	0 %	470205680
31	NC_020557	ATTTT	2	10	45571	45580	20 %	80 %	0 %	0 %	470205682
32	NC_020557	GAAAC	2	10	46829	46838	60 %	0 %	20 %	20 %	470205683
33	NC_020557	ATTTT	2	10	47155	47164	20 %	80 %	0 %	0 %	470205684
34	NC_020557	AAATG	2	10	48285	48294	60 %	20 %	20 %	0 %	470205685
35	NC_020557	GTAGA	2	10	49369	49378	40 %	20 %	40 %	0 %	470205686
36	NC_020557	TTACT	2	10	50351	50360	20 %	60 %	0 %	20 %	470205688
37	NC_020557	GAAAT	2	10	51009	51018	60 %	20 %	20 %	0 %	470205689
38	NC_020557	CTTAG	2	10	51108	51117	20 %	40 %	20 %	20 %	470205689
39	NC_020557	AGTTA	2	10	54007	54016	40 %	40 %	20 %	0 %	470205693
40	NC_020557	CGCAA	2	10	57520	57529	40 %	0 %	20 %	40 %	470205696
41	NC_020557	AAACG	2	10	62831	62840	60 %	0 %	20 %	20 %	470205702
42	NC_020557	CGAAA	2	10	64317	64326	60 %	0 %	20 %	20 %	470205703
43	NC_020557	AAAAC	2	10	64327	64336	80 %	0 %	0 %	20 %	470205703
44	NC_020557	AACAA	2	10	65711	65720	80 %	0 %	0 %	20 %	470205705
45	NC_020557	GAGAG	2	10	70760	70769	40 %	0 %	60 %	0 %	470205708
46	NC_020557	GCAAA	2	10	71942	71951	60 %	0 %	20 %	20 %	470205711
47	NC_020557	CAATA	2	10	72007	72016	60 %	20 %	0 %	20 %	470205711
48	NC_020557	GCCTT	2	10	72807	72816	0 %	40 %	20 %	40 %	470205712
49	NC_020557	CAAAA	2	10	73184	73193	80 %	0 %	0 %	20 %	470205712
50	NC_020557	GCTTG	2	10	75243	75252	0 %	40 %	40 %	20 %	470205715
51	NC_020557	AAACT	2	10	75253	75262	60 %	20 %	0 %	20 %	470205715
52	NC_020557	TCAAG	2	10	75918	75927	40 %	20 %	20 %	20 %	470205716
53	NC_020557	GCGCT	2	10	77278	77287	0 %	20 %	40 %	40 %	470205718
54	NC_020557	TCATT	2	10	80387	80396	20 %	60 %	0 %	20 %	470205721
55	NC_020557	CTAAA	2	10	82752	82761	60 %	20 %	0 %	20 %	470205723
56	NC_020557	GAAAA	2	10	84094	84103	80 %	0 %	20 %	0 %	470205724
57	NC_020557	TGAAA	2	10	84336	84345	60 %	20 %	20 %	0 %	470205724
58	NC_020557	AAATT	2	10	84680	84689	60 %	40 %	0 %	0 %	470205724
59	NC_020557	AGCGG	2	10	85264	85273	20 %	0 %	60 %	20 %	470205724
60	NC_020557	AGTTA	2	10	86673	86682	40 %	40 %	20 %	0 %	470205724
61	NC_020557	GAAAT	2	10	87760	87769	60 %	20 %	20 %	0 %	470205725
62	NC_020557	AAAAG	2	10	88072	88081	80 %	0 %	20 %	0 %	470205725
63	NC_020557	TGAAA	2	10	89069	89078	60 %	20 %	20 %	0 %	470205725
64	NC_020557	TGCAT	2	10	91729	91738	20 %	40 %	20 %	20 %	470205728
65	NC_020557	TTACT	2	10	91975	91984	20 %	60 %	0 %	20 %	470205728
66	NC_020557	GTTTT	2	10	93573	93582	0 %	80 %	20 %	0 %	470205730
67	NC_020557	GAAGT	2	10	93854	93863	40 %	20 %	40 %	0 %	470205730
68	NC_020557	AGCGG	2	10	95173	95182	20 %	0 %	60 %	20 %	470205731
69	NC_020557	TTCCA	2	10	101755	101764	20 %	40 %	0 %	40 %	470205741
70	NC_020557	AAAAG	2	10	103657	103666	80 %	0 %	20 %	0 %	470205743
71	NC_020557	ACGGT	2	10	105201	105210	20 %	20 %	40 %	20 %	470205744
72	NC_020557	GAAAT	2	10	106440	106449	60 %	20 %	20 %	0 %	470205745
73	NC_020557	GAATT	2	10	107081	107090	40 %	40 %	20 %	0 %	470205745
74	NC_020557	AACCA	2	10	110953	110962	60 %	0 %	0 %	40 %	470205748
75	NC_020557	CTCGA	2	10	112633	112642	20 %	20 %	20 %	40 %	470205750
76	NC_020557	TTCCA	2	10	112967	112976	20 %	40 %	0 %	40 %	470205750
77	NC_020557	TCTCT	2	10	113805	113814	0 %	60 %	0 %	40 %	470205751
78	NC_020557	TTTTA	2	10	114165	114174	20 %	80 %	0 %	0 %	470205752
79	NC_020557	AAAAG	2	10	114430	114439	80 %	0 %	20 %	0 %	470205753
80	NC_020557	TTAGT	2	10	116578	116587	20 %	60 %	20 %	0 %	470205757
81	NC_020557	TTTAT	2	10	119487	119496	20 %	80 %	0 %	0 %	470205762
82	NC_020557	AAGTG	2	10	121509	121518	40 %	20 %	40 %	0 %	470205765
83	NC_020557	GTCAG	2	10	121954	121963	20 %	20 %	40 %	20 %	470205766
84	NC_020557	TTGTT	2	10	125101	125110	0 %	80 %	20 %	0 %	470205769
85	NC_020557	ATTTT	2	10	126827	126836	20 %	80 %	0 %	0 %	470205771
86	NC_020557	GCCGT	2	10	127866	127875	0 %	20 %	40 %	40 %	470205774
87	NC_020557	AAAAT	2	10	128267	128276	80 %	20 %	0 %	0 %	470205774
88	NC_020557	AACTT	2	10	129409	129418	40 %	40 %	0 %	20 %	470205776
89	NC_020557	ACAAA	2	10	129511	129520	80 %	0 %	0 %	20 %	470205776
90	NC_020557	CTTGA	2	10	130306	130315	20 %	40 %	20 %	20 %	470205776
91	NC_020557	TTGGT	2	10	131101	131110	0 %	60 %	40 %	0 %	470205777
92	NC_020557	TATGA	2	10	133971	133980	40 %	40 %	20 %	0 %	470205782
93	NC_020557	AATTT	2	10	136947	136956	40 %	60 %	0 %	0 %	470205787
94	NC_020557	GAATA	2	10	140126	140135	60 %	20 %	20 %	0 %	470205792
95	NC_020557	TTTAC	2	10	141325	141334	20 %	60 %	0 %	20 %	470205793
96	NC_020557	AGATG	2	10	141374	141383	40 %	20 %	40 %	0 %	470205793
97	NC_020557	TCTAA	2	10	146671	146680	40 %	40 %	0 %	20 %	470205796
98	NC_020557	AAATC	2	10	147186	147195	60 %	20 %	0 %	20 %	470205796
99	NC_020557	GGCTG	2	10	147223	147232	0 %	20 %	60 %	20 %	470205796
100	NC_020557	CGAAA	2	10	147801	147810	60 %	0 %	20 %	20 %	470205796
101	NC_020557	AAGAT	2	10	150190	150199	60 %	20 %	20 %	0 %	470205798
102	NC_020557	TGCGC	2	10	150311	150320	0 %	20 %	40 %	40 %	470205798
103	NC_020557	GAATT	2	10	150561	150570	40 %	40 %	20 %	0 %	470205799
104	NC_020557	AAATA	2	10	153616	153625	80 %	20 %	0 %	0 %	470205803
105	NC_020557	TTCTT	2	10	154821	154830	0 %	80 %	0 %	20 %	470205805
106	NC_020557	TTCCA	2	10	155372	155381	20 %	40 %	0 %	40 %	470205806
107	NC_020557	AACCT	2	10	157143	157152	40 %	20 %	0 %	40 %	470205807
108	NC_020557	ACTTT	2	10	161135	161144	20 %	60 %	0 %	20 %	470205812
109	NC_020557	AAAAG	2	10	162564	162573	80 %	0 %	20 %	0 %	470205813
110	NC_020557	ATGAA	2	10	164338	164347	60 %	20 %	20 %	0 %	470205814
111	NC_020557	TACTT	2	10	167346	167355	20 %	60 %	0 %	20 %	470205818
112	NC_020557	AGTGA	2	10	169923	169932	40 %	20 %	40 %	0 %	470205820
113	NC_020557	CCGTA	2	10	171334	171343	20 %	20 %	20 %	40 %	470205821
114	NC_020557	TGGAA	2	10	172155	172164	40 %	20 %	40 %	0 %	470205822
115	NC_020557	ATGTA	2	10	172250	172259	40 %	40 %	20 %	0 %	470205822
116	NC_020557	GCGTT	2	10	174012	174021	0 %	40 %	40 %	20 %	470205823
117	NC_020557	AAGCG	2	10	174378	174387	40 %	0 %	40 %	20 %	470205823
118	NC_020557	CAAAA	2	10	174655	174664	80 %	0 %	0 %	20 %	470205823
119	NC_020557	ATCAA	2	10	176451	176460	60 %	20 %	0 %	20 %	470205824
120	NC_020557	AGAAA	2	10	178270	178279	80 %	0 %	20 %	0 %	470205826
121	NC_020557	GGACG	2	10	178996	179005	20 %	0 %	60 %	20 %	470205827
122	NC_020557	AATTT	2	10	181120	181129	40 %	60 %	0 %	0 %	470205830
123	NC_020557	ATTTG	2	10	181947	181956	20 %	60 %	20 %	0 %	470205831
124	NC_020557	AAAGT	2	10	189095	189104	60 %	20 %	20 %	0 %	470205839
125	NC_020557	CGAAA	2	10	189189	189198	60 %	0 %	20 %	20 %	470205839
126	NC_020557	CATTT	2	10	189232	189241	20 %	60 %	0 %	20 %	470205839
127	NC_020557	ATTTA	2	10	190567	190576	40 %	60 %	0 %	0 %	470205841
128	NC_020557	TGGTT	2	10	192258	192267	0 %	60 %	40 %	0 %	470205842
129	NC_020557	GGATT	2	10	192939	192948	20 %	40 %	40 %	0 %	470205843
130	NC_020557	TGAAA	2	10	194657	194666	60 %	20 %	20 %	0 %	470205844
131	NC_020557	TATAA	2	10	195156	195165	60 %	40 %	0 %	0 %	470205844
132	NC_020557	AAGTG	2	10	195512	195521	40 %	20 %	40 %	0 %	470205844
133	NC_020557	TTATT	2	10	195800	195809	20 %	80 %	0 %	0 %	470205844
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135	NC_020557	AACAG	2	10	196034	196043	60 %	0 %	20 %	20 %	470205844
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