MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Listeria monocytogenes La111 complete genome

Total Repeats: 39710

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020557	CAA	2	6	406	411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470205642
2	NC_020557	TAT	2	6	440	445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470205642
3	NC_020557	AAT	2	6	456	461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470205642
4	NC_020557	GAA	2	6	567	572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470205642
5	NC_020557	GCA	2	6	705	710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470205642
6	NC_020557	GGA	2	6	765	770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470205642
7	NC_020557	CAA	2	6	819	824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470205642
8	NC_020557	TTA	2	6	880	885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470205642
9	NC_020557	ATA	2	6	898	903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470205642
10	NC_020557	GAA	2	6	909	914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470205642
11	NC_020557	TGA	2	6	953	958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470205642
12	NC_020557	AAG	2	6	979	984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470205642
13	NC_020557	ATG	2	6	1024	1029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470205642
14	NC_020557	ATT	3	9	1041	1049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470205642
15	NC_020557	CCA	2	6	1137	1142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470205642
16	NC_020557	AGT	2	6	1277	1282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470205642
17	NC_020557	TTC	2	6	1289	1294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470205642
18	NC_020557	TAA	2	6	1301	1306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470205642
19	NC_020557	GCA	2	6	1326	1331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470205642
20	NC_020557	TTA	2	6	1372	1377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470205642
21	NC_020557	AAG	2	6	1393	1398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470205642
22	NC_020557	AGA	2	6	1427	1432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470205642
23	NC_020557	TGA	2	6	1532	1537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470205642
24	NC_020557	TGG	2	6	1541	1546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470205642
25	NC_020557	ACA	2	6	1557	1562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470205642
26	NC_020557	ACT	2	6	1592	1597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470205642
27	NC_020557	GCA	2	6	1744	1749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_020557	AAC	2	6	1938	1943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470205643
29	NC_020557	ATG	2	6	1979	1984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470205643
30	NC_020557	ATG	2	6	2051	2056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470205643
31	NC_020557	TGG	2	6	2082	2087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470205643
32	NC_020557	TCG	2	6	2124	2129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470205643
33	NC_020557	AGA	2	6	2136	2141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470205643
34	NC_020557	CCT	2	6	2198	2203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470205643
35	NC_020557	TGA	2	6	2451	2456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470205643
36	NC_020557	ACA	2	6	2462	2467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470205643
37	NC_020557	CAA	2	6	2547	2552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470205643
38	NC_020557	TAT	2	6	2579	2584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470205643
39	NC_020557	TAA	2	6	2724	2729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470205643
40	NC_020557	TTA	2	6	2732	2737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470205643
41	NC_020557	TCC	2	6	2773	2778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470205643
42	NC_020557	GAA	2	6	2836	2841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470205643
43	NC_020557	ATG	2	6	2869	2874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470205643
44	NC_020557	TGA	2	6	2898	2903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470205643
45	NC_020557	ATG	2	6	3121	3126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470205644
46	NC_020557	ACA	2	6	3136	3141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470205644
47	NC_020557	GAT	2	6	3216	3221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470205644
48	NC_020557	TTG	2	6	3233	3238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470205644
49	NC_020557	GCT	2	6	3265	3270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470205644
50	NC_020557	ATT	2	6	3313	3318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470205644
51	NC_020557	GGT	2	6	3414	3419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470205644
52	NC_020557	ATT	2	6	3430	3435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470205644
53	NC_020557	CTT	2	6	3469	3474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470205644
54	NC_020557	GAT	2	6	3505	3510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470205644
55	NC_020557	CTA	2	6	3512	3517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470205644
56	NC_020557	ACC	2	6	3526	3531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470205644
57	NC_020557	TGT	2	6	3666	3671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470205644
58	NC_020557	GCT	2	6	3697	3702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470205644
59	NC_020557	TAA	2	6	3899	3904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470205644
60	NC_020557	CGG	2	6	3938	3943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470205644
61	NC_020557	AGC	2	6	3990	3995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470205644
62	NC_020557	TCC	2	6	3997	4002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470205644
63	NC_020557	TTA	2	6	4135	4140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470205644
64	NC_020557	TTA	2	6	4169	4174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470205644
65	NC_020557	TGT	2	6	4236	4241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470205644
66	NC_020557	TGG	2	6	4363	4368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470205644
67	NC_020557	CGA	2	6	4453	4458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470205644
68	NC_020557	TAT	2	6	4581	4586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470205645
69	NC_020557	TGG	2	6	4721	4726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470205645
70	NC_020557	TAT	2	6	5048	5053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470205646
71	NC_020557	AGA	2	6	5063	5068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470205646
72	NC_020557	CAA	2	6	5340	5345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470205646
73	NC_020557	GCG	2	6	5487	5492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470205646
74	NC_020557	TCA	2	6	5498	5503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470205646
75	NC_020557	GTG	2	6	5638	5643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470205646
76	NC_020557	GAT	2	6	5667	5672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470205646
77	NC_020557	GAA	2	6	5778	5783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470205646
78	NC_020557	CTT	2	6	5802	5807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470205646
79	NC_020557	GAT	2	6	5811	5816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470205646
80	NC_020557	CGA	2	6	5831	5836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470205646
81	NC_020557	ACA	2	6	5895	5900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470205646
82	NC_020557	CAA	2	6	5938	5943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470205646
83	NC_020557	TGA	2	6	5999	6004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020557	AAT	2	6	6022	6027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020557	AGA	2	6	6035	6040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470205647
86	NC_020557	TTG	2	6	6187	6192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470205647
87	NC_020557	TGA	2	6	6203	6208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470205647
88	NC_020557	GTC	2	6	6319	6324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470205647
89	NC_020557	TGG	2	6	6359	6364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470205647
90	NC_020557	GGC	3	9	6372	6380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470205647
91	NC_020557	GTG	2	6	6499	6504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470205647
92	NC_020557	GTA	2	6	6507	6512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470205647
93	NC_020557	GAA	2	6	6522	6527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470205647
94	NC_020557	AAC	2	6	6593	6598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470205647
95	NC_020557	GAA	2	6	6687	6692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470205647
96	NC_020557	CCA	2	6	6780	6785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470205647
97	NC_020557	GAT	2	6	6807	6812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470205647
98	NC_020557	ATA	2	6	6838	6843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470205647
99	NC_020557	CAT	2	6	6860	6865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470205647
100	NC_020557	TTA	2	6	6940	6945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470205647
101	NC_020557	TAA	2	6	6962	6967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470205647
102	NC_020557	TGA	2	6	6983	6988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470205647
103	NC_020557	ATT	2	6	7029	7034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470205647
104	NC_020557	ATG	2	6	7146	7151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470205647
105	NC_020557	GCT	2	6	7215	7220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470205647
106	NC_020557	TTC	2	6	7295	7300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470205647
107	NC_020557	TGG	2	6	7349	7354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470205647
108	NC_020557	GAA	2	6	7458	7463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470205647
109	NC_020557	TGG	2	6	7499	7504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470205647
110	NC_020557	ACT	2	6	7586	7591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470205647
111	NC_020557	ACC	2	6	7655	7660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470205647
112	NC_020557	AGA	2	6	7718	7723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470205647
113	NC_020557	AAC	2	6	7798	7803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470205647
114	NC_020557	ACA	2	6	7812	7817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470205647
115	NC_020557	ACT	2	6	7838	7843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470205647
116	NC_020557	TCG	2	6	7916	7921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470205647
117	NC_020557	TAA	2	6	7968	7973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470205647
118	NC_020557	TAA	2	6	7986	7991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020557	TTA	2	6	7997	8002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020557	CAT	2	6	8123	8128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470205648
121	NC_020557	TTG	2	6	8153	8158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470205648
122	NC_020557	CGT	2	6	8203	8208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470205648
123	NC_020557	GGC	2	6	8415	8420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470205648
124	NC_020557	ACT	2	6	8466	8471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470205648
125	NC_020557	TAA	2	6	8481	8486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470205648
126	NC_020557	TTA	2	6	8563	8568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470205648
127	NC_020557	CAA	2	6	8603	8608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470205648
128	NC_020557	CCA	2	6	8619	8624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470205648
129	NC_020557	CTG	2	6	8723	8728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470205648
130	NC_020557	GAT	2	6	8730	8735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470205648
131	NC_020557	GAA	2	6	8812	8817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470205648
132	NC_020557	TTA	2	6	8843	8848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470205648
133	NC_020557	GAA	2	6	8913	8918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470205648
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139	NC_020557	AGT	2	6	9141	9146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470205648
140	NC_020557	TCG	2	6	9150	9155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470205648
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256	NC_020557	TTC	2	6	17919	17924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470205656
257	NC_020557	ATG	2	6	17949	17954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470205656
258	NC_020557	ATT	2	6	18033	18038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470205656
259	NC_020557	CTT	2	6	18134	18139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470205656
260	NC_020557	CTT	2	6	18170	18175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470205656
261	NC_020557	ATG	2	6	18189	18194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470205656
262	NC_020557	TGT	2	6	18305	18310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470205656
263	NC_020557	TGG	2	6	18311	18316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470205656
264	NC_020557	CTT	2	6	18374	18379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470205656
265	NC_020557	TTC	2	6	18498	18503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470205656
266	NC_020557	GTT	2	6	18513	18518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470205656
267	NC_020557	CGT	2	6	18573	18578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470205656
268	NC_020557	ACA	2	6	18676	18681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470205656
269	NC_020557	CTA	2	6	18683	18688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470205656
270	NC_020557	TCC	2	6	18770	18775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470205656
271	NC_020557	GAT	2	6	18816	18821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470205656
272	NC_020557	TTC	3	9	18924	18932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470205656
273	NC_020557	TCT	2	6	18952	18957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470205656
274	NC_020557	ATT	2	6	18975	18980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470205656
275	NC_020557	AGA	2	6	19070	19075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470205656
276	NC_020557	AGG	2	6	19108	19113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470205656
277	NC_020557	CAG	2	6	19293	19298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470205657
278	NC_020557	TAA	2	6	19323	19328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470205657
279	NC_020557	AGT	2	6	19349	19354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470205657
280	NC_020557	TTG	2	6	19449	19454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470205657
281	NC_020557	TTC	2	6	19529	19534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470205657
282	NC_020557	CTA	2	6	19538	19543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470205657
283	NC_020557	TGT	2	6	19678	19683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470205657
284	NC_020557	ATA	2	6	19744	19749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470205658
285	NC_020557	GCA	2	6	19758	19763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470205658
286	NC_020557	TTG	2	6	19795	19800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470205658
287	NC_020557	GTT	2	6	19815	19820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470205658
288	NC_020557	ACA	2	6	19863	19868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470205658
289	NC_020557	TTA	2	6	19882	19887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470205658
290	NC_020557	GCA	2	6	19989	19994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470205658
291	NC_020557	AAT	2	6	20234	20239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470205659
292	NC_020557	CTG	2	6	20302	20307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470205659
293	NC_020557	CAA	2	6	20410	20415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470205659
294	NC_020557	ATC	2	6	20432	20437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470205659
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299	NC_020557	TTA	2	6	20801	20806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470205660
300	NC_020557	CAA	2	6	20928	20933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470205660
301	NC_020557	ATT	2	6	20968	20973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470205660
302	NC_020557	ATA	2	6	21029	21034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470205660
303	NC_020557	CAG	2	6	21099	21104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470205660
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306	NC_020557	TAA	2	6	21163	21168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470205660
307	NC_020557	CTC	2	6	21237	21242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
308	NC_020557	ATT	2	6	21379	21384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
309	NC_020557	GAG	2	6	21441	21446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
310	NC_020557	TGC	2	6	21504	21509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470205661
311	NC_020557	TTG	2	6	21557	21562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470205661
312	NC_020557	ATC	2	6	21671	21676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470205661
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316	NC_020557	TGA	2	6	21816	21821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470205661
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323	NC_020557	CTT	2	6	22251	22256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470205661
324	NC_020557	TAC	2	6	22279	22284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470205661
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327	NC_020557	TTC	2	6	22398	22403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470205661
328	NC_020557	GAA	2	6	22609	22614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470205661
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330	NC_020557	ACA	2	6	22796	22801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470205661
331	NC_020557	GAA	2	6	22827	22832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470205661
332	NC_020557	TCA	2	6	22911	22916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
333	NC_020557	GTA	2	6	23033	23038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470205662
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337	NC_020557	GTT	2	6	23525	23530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470205662
338	NC_020557	GTT	2	6	23628	23633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470205662
339	NC_020557	GCC	3	9	23664	23672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470205662
340	NC_020557	TAT	3	9	24019	24027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470205663
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342	NC_020557	AAG	2	6	24104	24109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470205663
343	NC_020557	TAC	2	6	24124	24129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470205663
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346	NC_020557	GAA	2	6	24221	24226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470205663
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360	NC_020557	TTG	2	6	25259	25264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470205665
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365	NC_020557	AAT	2	6	25372	25377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470205665
366	NC_020557	GCA	2	6	25392	25397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470205665
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368	NC_020557	AAG	2	6	25650	25655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
369	NC_020557	TAA	2	6	25764	25769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470205666
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378	NC_020557	AGC	3	9	26308	26316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470205666
379	NC_020557	ATC	2	6	26369	26374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470205666
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