MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes La111 complete genome

Total Repeats: 6605

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020557	GCA	2	6	1744	1749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_020557	TGA	2	6	5999	6004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020557	AAT	2	6	6022	6027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020557	TAA	2	6	7986	7991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020557	TTA	2	6	7997	8002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020557	TAA	2	6	12668	12673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020557	TAT	2	6	12718	12723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020557	AGT	2	6	15713	15718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020557	CTT	2	6	15971	15976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_020557	TTG	2	6	16834	16839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020557	AGC	2	6	16844	16849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_020557	CTC	2	6	21237	21242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_020557	ATT	2	6	21379	21384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020557	GAG	2	6	21441	21446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020557	TCA	2	6	22911	22916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_020557	AAG	2	6	25650	25655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020557	GGA	2	6	27285	27290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020557	TCA	2	6	28767	28772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_020557	GTC	2	6	28896	28901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_020557	AGT	2	6	32392	32397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020557	CAT	2	6	32410	32415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_020557	AGT	2	6	32420	32425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020557	ATT	2	6	32618	32623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020557	GAA	2	6	32631	32636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020557	TCT	2	6	32697	32702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_020557	TCT	2	6	32802	32807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_020557	ATA	2	6	32819	32824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020557	TGG	2	6	32825	32830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020557	ATA	2	6	32893	32898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020557	TTG	2	6	32936	32941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020557	CCG	2	6	32970	32975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_020557	CTT	2	6	33070	33075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_020557	GTT	2	6	33082	33087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020557	CAA	2	6	34401	34406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_020557	AGG	2	6	40297	40302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020557	TCT	2	6	40313	40318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_020557	AAT	2	6	40405	40410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020557	ATG	2	6	40423	40428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020557	AGG	2	6	41538	41543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020557	AGA	2	6	41544	41549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020557	AGG	2	6	45105	45110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020557	TGA	2	6	47867	47872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020557	ATA	2	6	49233	49238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020557	ATT	2	6	49260	49265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020557	AGG	2	6	49362	49367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020557	GAG	2	6	49710	49715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020557	AGG	2	6	50293	50298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020557	AAG	2	6	50627	50632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020557	TAT	2	6	51407	51412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020557	TTA	2	6	51522	51527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020557	GGA	2	6	52412	52417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020557	GAT	2	6	52578	52583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020557	GTA	2	6	52633	52638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020557	TTA	2	6	52664	52669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020557	TAG	2	6	52694	52699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020557	ATG	2	6	52733	52738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020557	TTG	2	6	52795	52800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020557	TCT	2	6	52812	52817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_020557	TTG	2	6	52853	52858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020557	TAT	2	6	52878	52883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020557	GTT	2	6	53026	53031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020557	AGC	2	6	53075	53080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_020557	ATA	2	6	53179	53184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020557	TGA	2	6	54503	54508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020557	ATA	2	6	54529	54534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020557	TGA	2	6	54536	54541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020557	TGG	2	6	58585	58590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020557	AAT	2	6	59965	59970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020557	ATA	2	6	60256	60261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020557	CAA	2	6	60575	60580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_020557	AAC	2	6	64604	64609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_020557	GAT	2	6	64632	64637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020557	AGA	2	6	65116	65121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020557	CTA	2	6	65271	65276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_020557	AGA	2	6	65281	65286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020557	GCG	2	6	65306	65311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_020557	GAA	2	6	65338	65343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020557	TCG	2	6	65385	65390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_020557	GCG	2	6	68320	68325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_020557	GAA	2	6	73287	73292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020557	ATG	2	6	73306	73311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020557	GCG	2	6	73340	73345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_020557	AGA	2	6	73397	73402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020557	ATT	2	6	73429	73434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020557	CCA	2	6	73577	73582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_020557	AAG	2	6	73677	73682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020557	AGT	3	9	73683	73691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020557	GCC	2	6	73736	73741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_020557	ATT	2	6	73750	73755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020557	ATG	2	6	73759	73764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020557	AAG	2	6	73794	73799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020557	TAA	2	6	73826	73831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020557	GAG	2	6	76502	76507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020557	CAC	2	6	77410	77415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_020557	TTA	2	6	77426	77431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020557	TTA	2	6	77474	77479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020557	GTT	2	6	77522	77527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020557	AGC	2	6	77542	77547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_020557	TAA	2	6	77657	77662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020557	AAT	2	6	77667	77672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020557	ATT	2	6	77690	77695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020557	TAA	2	6	77735	77740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020557	TAC	2	6	77743	77748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_020557	GTT	2	6	77765	77770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020557	ATG	2	6	78550	78555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020557	GGC	2	6	78564	78569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_020557	TGT	2	6	78635	78640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020557	TGA	2	6	78773	78778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020557	AGA	2	6	78803	78808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020557	CAC	2	6	78930	78935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_020557	TAA	3	9	79058	79066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020557	TCC	2	6	79070	79075	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_020557	TAA	2	6	79499	79504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020557	TGT	2	6	80544	80549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020557	TAA	2	6	80621	80626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020557	GAT	2	6	80631	80636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020557	TAG	2	6	80675	80680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020557	TAG	2	6	80727	80732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020557	ATA	2	6	80842	80847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020557	AGT	2	6	83197	83202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020557	ACA	2	6	89858	89863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_020557	ACA	2	6	96699	96704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_020557	AAT	2	6	96721	96726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020557	AGG	2	6	96885	96890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020557	AGG	2	6	97875	97880	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020557	GGA	2	6	98702	98707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020557	TAA	2	6	99712	99717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020557	ATA	2	6	100200	100205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020557	AGG	2	6	100248	100253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020557	CCT	2	6	100626	100631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_020557	TGC	2	6	101015	101020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_020557	TAT	2	6	101028	101033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020557	AAT	2	6	101045	101050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020557	GTT	2	6	101073	101078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020557	AGG	2	6	102090	102095	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020557	AAG	2	6	102555	102560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020557	CCG	2	6	102571	102576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_020557	AAG	2	6	102764	102769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020557	GTT	2	6	107873	107878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020557	ATA	2	6	107895	107900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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