MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori OK310 plasmid pHPOK310 DNA

Total Repeats: 45

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020556	ATT	2	6	73	78	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020556	ACA	2	6	102	107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_020556	GCG	2	6	111	116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_020556	CAA	2	6	277	282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_020556	CTT	2	6	306	311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_020556	AAT	2	6	821	826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020556	AGA	2	6	949	954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020556	TGA	2	6	1006	1011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020556	CAA	2	6	1072	1077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_020556	GAA	2	6	1198	1203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020556	TGA	2	6	1299	1304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469823625
12	NC_020556	CAC	2	6	1336	1341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	469823625
13	NC_020556	AAC	2	6	1360	1365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	469823625
14	NC_020556	AAT	2	6	1629	1634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469823625
15	NC_020556	AAT	2	6	1651	1656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469823625
16	NC_020556	GAA	2	6	1702	1707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469823625
17	NC_020556	CAT	2	6	1905	1910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469823625
18	NC_020556	CTA	2	6	2220	2225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_020556	TTA	2	6	2231	2236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020556	TTG	2	6	2927	2932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020556	GTT	2	6	3263	3268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020556	TTA	2	6	3270	3275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020556	AAC	2	6	3284	3289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_020556	TGT	2	6	3292	3297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020556	CTT	2	6	3408	3413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_020556	CTT	2	6	3430	3435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_020556	CTT	2	6	3452	3457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_020556	CTT	2	6	3474	3479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_020556	CTT	2	6	3496	3501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_020556	CTT	2	6	3518	3523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_020556	ATT	2	6	3539	3544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020556	AAC	2	6	3564	3569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_020556	CAA	2	6	3607	3612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_020556	TTG	2	6	3636	3641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020556	GGA	2	6	3654	3659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020556	TAT	2	6	3703	3708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020556	TTA	2	6	3758	3763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020556	TAT	2	6	3825	3830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020556	ATT	2	6	3922	3927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020556	AGA	2	6	3967	3972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020556	CAA	2	6	3981	3986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_020556	ACC	2	6	3998	4003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_020556	ACC	2	6	4055	4060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_020556	AAC	2	6	4067	4072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_020556	CAA	2	6	4075	4080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.