MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Helicobacter cinaedi ATCC BAA-847 DNA

Total Repeats: 2058

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020555	TTTAA	2	10	1363	1372	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020555	GTAGT	2	10	1410	1419	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020555	AAAGC	2	10	3587	3596	60 %	0 %	20 %	20 %	471314540
4	NC_020555	TGGCG	2	10	6072	6081	0 %	20 %	60 %	20 %	471314542
5	NC_020555	ATTGT	2	10	7053	7062	20 %	60 %	20 %	0 %	471314543
6	NC_020555	CGTGT	2	10	7641	7650	0 %	40 %	40 %	20 %	471314543
7	NC_020555	TGATT	2	10	7906	7915	20 %	60 %	20 %	0 %	471314543
8	NC_020555	AGATA	2	10	9215	9224	60 %	20 %	20 %	0 %	471314545
9	NC_020555	CACAA	2	10	12563	12572	60 %	0 %	0 %	40 %	471314548
10	NC_020555	GCAAG	2	10	13437	13446	40 %	0 %	40 %	20 %	471314550
11	NC_020555	CATTT	2	10	16040	16049	20 %	60 %	0 %	20 %	471314554
12	NC_020555	TGTGG	2	10	16484	16493	0 %	40 %	60 %	0 %	471314555
13	NC_020555	AGGCA	2	10	16705	16714	40 %	0 %	40 %	20 %	471314555
14	NC_020555	AGCAT	2	10	16911	16920	40 %	20 %	20 %	20 %	471314555
15	NC_020555	ACAAT	2	10	17078	17087	60 %	20 %	0 %	20 %	471314555
16	NC_020555	TATCA	2	10	17180	17189	40 %	40 %	0 %	20 %	471314556
17	NC_020555	GATAG	2	10	17469	17478	40 %	20 %	40 %	0 %	471314557
18	NC_020555	TACTC	2	10	18772	18781	20 %	40 %	0 %	40 %	471314557
19	NC_020555	ATGGT	2	10	19811	19820	20 %	40 %	40 %	0 %	471314558
20	NC_020555	TAGCA	2	10	19914	19923	40 %	20 %	20 %	20 %	471314558
21	NC_020555	AATAG	2	10	20387	20396	60 %	20 %	20 %	0 %	471314559
22	NC_020555	GATAT	2	10	21303	21312	40 %	40 %	20 %	0 %	471314559
23	NC_020555	ACTTC	2	10	21940	21949	20 %	40 %	0 %	40 %	471314560
24	NC_020555	CCCCA	2	10	28681	28690	20 %	0 %	0 %	80 %	471314566
25	NC_020555	AGCAT	2	10	29278	29287	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_020555	TCAAA	2	10	29433	29442	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_020555	TTCTT	2	10	31665	31674	0 %	80 %	0 %	20 %	471314569
28	NC_020555	AGCCA	2	10	32014	32023	40 %	0 %	20 %	40 %	471314569
29	NC_020555	ATTTG	2	10	32660	32669	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020555	TACAA	2	10	34354	34363	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_020555	CAAAA	2	10	34841	34850	80 %	0 %	0 %	20 %	471314571
32	NC_020555	AAAAC	2	10	35911	35920	80 %	0 %	0 %	20 %	471314571
33	NC_020555	TTTGA	2	10	36771	36780	20 %	60 %	20 %	0 %	471314573
34	NC_020555	CGCAC	2	10	37200	37209	20 %	0 %	20 %	60 %	471314575
35	NC_020555	TAAGC	2	10	37310	37319	40 %	20 %	20 %	20 %	471314575
36	NC_020555	TAAAA	2	10	37897	37906	80 %	20 %	0 %	0 %	471314576
37	NC_020555	GAGCG	2	10	37970	37979	20 %	0 %	60 %	20 %	471314576
38	NC_020555	ACAAA	2	10	38061	38070	80 %	0 %	0 %	20 %	471314576
39	NC_020555	TTTGT	2	10	39231	39240	0 %	80 %	20 %	0 %	471314578
40	NC_020555	GCACA	2	10	41823	41832	40 %	0 %	20 %	40 %	471314579
41	NC_020555	AGAAA	2	10	41916	41925	80 %	0 %	20 %	0 %	471314579
42	NC_020555	GGAGA	2	10	43526	43535	40 %	0 %	60 %	0 %	471314580
43	NC_020555	TTACA	2	10	43854	43863	40 %	40 %	0 %	20 %	471314580
44	NC_020555	ATAGC	2	10	47886	47895	40 %	20 %	20 %	20 %	471314585
45	NC_020555	CTTAT	2	10	48766	48775	20 %	60 %	0 %	20 %	471314587
46	NC_020555	CGCTT	2	10	48825	48834	0 %	40 %	20 %	40 %	471314587
47	NC_020555	GACAA	2	10	50622	50631	60 %	0 %	20 %	20 %	471314588
48	NC_020555	TTGCT	2	10	51835	51844	0 %	60 %	20 %	20 %	471314589
49	NC_020555	TTAGC	2	10	53057	53066	20 %	40 %	20 %	20 %	471314589
50	NC_020555	TTTGC	2	10	53086	53095	0 %	60 %	20 %	20 %	471314590
51	NC_020555	TAAAA	2	10	54269	54278	80 %	20 %	0 %	0 %	471314590
52	NC_020555	ATTTG	2	10	55390	55399	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020555	TAAAA	2	10	55426	55435	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020555	GAAAT	2	10	56375	56384	60 %	20 %	20 %	0 %	471314592
55	NC_020555	CTTTG	2	10	57338	57347	0 %	60 %	20 %	20 %	471314592
56	NC_020555	ATTTT	2	10	57717	57726	20 %	80 %	0 %	0 %	471314593
57	NC_020555	GCAAG	2	10	57913	57922	40 %	0 %	40 %	20 %	471314593
58	NC_020555	CTTGT	2	10	58614	58623	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_020555	TTGCT	2	10	58741	58750	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_020555	ATTTG	2	10	59413	59422	20 %	60 %	20 %	0 %	471314594
61	NC_020555	GCGTG	2	10	60284	60293	0 %	20 %	60 %	20 %	471314595
62	NC_020555	AAGAG	2	10	61100	61109	60 %	0 %	40 %	0 %	471314595
63	NC_020555	TTTGA	2	10	64367	64376	20 %	60 %	20 %	0 %	471314597
64	NC_020555	TCTCA	2	10	64482	64491	20 %	40 %	0 %	40 %	471314597
65	NC_020555	TCAAA	2	10	64579	64588	60 %	20 %	0 %	20 %	471314597
66	NC_020555	CAAGG	2	10	65009	65018	40 %	0 %	40 %	20 %	471314597
67	NC_020555	ATTTA	2	10	65022	65031	40 %	60 %	0 %	0 %	471314597
68	NC_020555	GGGAA	2	10	65226	65235	40 %	0 %	60 %	0 %	471314597
69	NC_020555	AAGTG	2	10	65620	65629	40 %	20 %	40 %	0 %	471314597
70	NC_020555	ATGCA	2	10	66572	66581	40 %	20 %	20 %	20 %	471314598
71	NC_020555	CATAT	2	10	67098	67107	40 %	40 %	0 %	20 %	471314598
72	NC_020555	AAAGC	2	10	67969	67978	60 %	0 %	20 %	20 %	471314598
73	NC_020555	CTACA	2	10	68285	68294	40 %	20 %	0 %	40 %	471314599
74	NC_020555	GCTAT	2	10	69451	69460	20 %	40 %	20 %	20 %	471314600
75	NC_020555	CTTCT	2	10	75067	75076	0 %	60 %	0 %	40 %	471314602
76	NC_020555	AATGG	2	10	77658	77667	40 %	20 %	40 %	0 %	471314603
77	NC_020555	TCTAT	2	10	78393	78402	20 %	60 %	0 %	20 %	471314604
78	NC_020555	GGGCA	2	10	79731	79740	20 %	0 %	60 %	20 %	471314605
79	NC_020555	GCAAA	2	10	80393	80402	60 %	0 %	20 %	20 %	471314606
80	NC_020555	TAAAT	2	10	80797	80806	60 %	40 %	0 %	0 %	471314606
81	NC_020555	GGAGA	2	10	83844	83853	40 %	0 %	60 %	0 %	471314609
82	NC_020555	TGAAG	2	10	85320	85329	40 %	20 %	40 %	0 %	471314611
83	NC_020555	CATAT	2	10	85937	85946	40 %	40 %	0 %	20 %	471314612
84	NC_020555	CAAGC	2	10	86593	86602	40 %	0 %	20 %	40 %	471314613
85	NC_020555	GTGGG	2	10	88370	88379	0 %	20 %	80 %	0 %	471314614
86	NC_020555	CAAAG	2	10	89066	89075	60 %	0 %	20 %	20 %	471314614
87	NC_020555	TGGTG	2	10	89303	89312	0 %	40 %	60 %	0 %	471314614
88	NC_020555	TTGGA	2	10	89496	89505	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020555	GCTAG	2	10	89741	89750	20 %	20 %	40 %	20 %	471314615
90	NC_020555	AAGAA	2	10	91965	91974	80 %	0 %	20 %	0 %	471314618
91	NC_020555	TTTGA	2	10	92915	92924	20 %	60 %	20 %	0 %	471314619
92	NC_020555	AAACA	2	10	93270	93279	80 %	0 %	0 %	20 %	471314619
93	NC_020555	ATTGC	2	10	93911	93920	20 %	40 %	20 %	20 %	471314620
94	NC_020555	CATTG	2	10	95895	95904	20 %	40 %	20 %	20 %	471314622
95	NC_020555	GCTCT	2	10	97861	97870	0 %	40 %	20 %	40 %	471314624
96	NC_020555	TGCAA	2	10	98054	98063	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
97	NC_020555	TTGAT	2	10	98862	98871	20 %	60 %	20 %	0 %	471314625
98	NC_020555	TTACC	2	10	99075	99084	20 %	40 %	0 %	40 %	471314625
99	NC_020555	ACGCA	2	10	99566	99575	40 %	0 %	20 %	40 %	471314625
100	NC_020555	ACGCA	2	10	100696	100705	40 %	0 %	20 %	40 %	471314626
101	NC_020555	GATAA	2	10	100792	100801	60 %	20 %	20 %	0 %	471314626
102	NC_020555	AAAAT	2	10	102282	102291	80 %	20 %	0 %	0 %	471314627
103	NC_020555	GCTTG	2	10	102537	102546	0 %	40 %	40 %	20 %	471314628
104	NC_020555	TCTTT	2	10	108165	108174	0 %	80 %	0 %	20 %	471314635
105	NC_020555	TTGCG	2	10	108583	108592	0 %	40 %	40 %	20 %	471314635
106	NC_020555	TTGGC	2	10	111189	111198	0 %	40 %	40 %	20 %	471314639
107	NC_020555	AGGGC	2	10	111572	111581	20 %	0 %	60 %	20 %	471314639
108	NC_020555	AGCAA	2	10	111911	111920	60 %	0 %	20 %	20 %	471314640
109	NC_020555	AAAAG	2	10	112333	112342	80 %	0 %	20 %	0 %	471314640
110	NC_020555	ATAAA	2	10	113156	113165	80 %	20 %	0 %	0 %	471314641
111	NC_020555	CTTAT	2	10	114456	114465	20 %	60 %	0 %	20 %	471314642
112	NC_020555	GGCAG	2	10	114672	114681	20 %	0 %	60 %	20 %	471314642
113	NC_020555	AGGCA	2	10	115208	115217	40 %	0 %	40 %	20 %	471314642
114	NC_020555	TGTTT	2	10	116174	116183	0 %	80 %	20 %	0 %	471314643
115	NC_020555	GATAG	2	10	117621	117630	40 %	20 %	40 %	0 %	471314644
116	NC_020555	ACCAC	2	10	118047	118056	40 %	0 %	0 %	60 %	471314645
117	NC_020555	CAGCA	2	10	118379	118388	40 %	0 %	20 %	40 %	471314645
118	NC_020555	AATCT	2	10	118482	118491	40 %	40 %	0 %	20 %	471314645
119	NC_020555	GCTTT	2	10	119708	119717	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_020555	TTTGG	2	10	120916	120925	0 %	60 %	40 %	0 %	471314647
121	NC_020555	CTTTG	2	10	122891	122900	0 %	60 %	20 %	20 %	471314649
122	NC_020555	TGAGA	2	10	124088	124097	40 %	20 %	40 %	0 %	471314650
123	NC_020555	CCATA	2	10	124406	124415	40 %	20 %	0 %	40 %	471314650
124	NC_020555	CAGCA	2	10	125009	125018	40 %	0 %	20 %	40 %	471314651
125	NC_020555	TGAGA	2	10	125657	125666	40 %	20 %	40 %	0 %	471314651
126	NC_020555	AATCA	2	10	126082	126091	60 %	20 %	0 %	20 %	471314652
127	NC_020555	GGCGA	2	10	126113	126122	20 %	0 %	60 %	20 %	471314652
128	NC_020555	AAGCA	2	10	127915	127924	60 %	0 %	20 %	20 %	471314652
129	NC_020555	CATTT	2	10	128497	128506	20 %	60 %	0 %	20 %	471314653
130	NC_020555	TTTGC	2	10	131062	131071	0 %	60 %	20 %	20 %	471314654
131	NC_020555	GCTGT	2	10	133066	133075	0 %	40 %	40 %	20 %	471314656
132	NC_020555	AAGGC	2	10	133170	133179	40 %	0 %	40 %	20 %	471314657
133	NC_020555	ATGTG	2	10	134035	134044	20 %	40 %	40 %	0 %	471314658
134	NC_020555	TCATA	2	10	134413	134422	40 %	40 %	0 %	20 %	471314658
135	NC_020555	TTTTA	2	10	135007	135016	20 %	80 %	0 %	0 %	471314659
136	NC_020555	GGTAA	2	10	135943	135952	40 %	20 %	40 %	0 %	471314659
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150	NC_020555	TATTG	2	10	151230	151239	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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155	NC_020555	GTTTG	2	10	155654	155663	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
156	NC_020555	TTTTA	2	10	155682	155691	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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261	NC_020555	GAAAA	2	10	259315	259324	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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264	NC_020555	CTTGC	2	10	260116	260125	0 %	40 %	20 %	40 %	471314794
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