MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter cinaedi ATCC BAA-847 DNA

Total Repeats: 21004

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020555	ATA	2	6	11	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471314538
2	NC_020555	ATG	2	6	83	88	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471314538
3	NC_020555	GGA	2	6	192	197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	471314538
4	NC_020555	CAA	2	6	397	402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471314538
5	NC_020555	TGT	2	6	422	427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471314538
6	NC_020555	TGT	2	6	480	485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471314538
7	NC_020555	GCT	2	6	528	533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471314538
8	NC_020555	ATG	2	6	617	622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471314538
9	NC_020555	AAG	2	6	653	658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471314538
10	NC_020555	TGA	2	6	707	712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471314538
11	NC_020555	AGA	2	6	747	752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471314538
12	NC_020555	ATT	2	6	826	831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471314538
13	NC_020555	ATA	2	6	1043	1048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471314538
14	NC_020555	TTG	2	6	1058	1063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471314538
15	NC_020555	GTG	2	6	1138	1143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471314538
16	NC_020555	GAT	2	6	1182	1187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471314538
17	NC_020555	GAG	2	6	1288	1293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	471314538
18	NC_020555	CAG	2	6	1309	1314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471314538
19	NC_020555	GAA	2	6	1580	1585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471314539
20	NC_020555	GTT	2	6	1645	1650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471314539
21	NC_020555	TAT	2	6	1651	1656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471314539
22	NC_020555	ATG	2	6	1826	1831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471314539
23	NC_020555	TGG	2	6	1848	1853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471314539
24	NC_020555	ATT	2	6	1857	1862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471314539
25	NC_020555	GCA	2	6	2316	2321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471314539
26	NC_020555	AAT	2	6	2420	2425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471314539
27	NC_020555	GCA	2	6	2471	2476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471314539
28	NC_020555	GGC	2	6	2549	2554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471314539
29	NC_020555	TAT	2	6	2581	2586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471314539
30	NC_020555	AAG	2	6	2630	2635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471314539
31	NC_020555	CTT	2	6	2678	2683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471314540
32	NC_020555	CTG	2	6	2764	2769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471314540
33	NC_020555	TGA	2	6	2908	2913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471314540
34	NC_020555	AAG	2	6	3003	3008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471314540
35	NC_020555	TCA	2	6	3031	3036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471314540
36	NC_020555	TCT	2	6	3148	3153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471314540
37	NC_020555	TAA	2	6	3213	3218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471314540
38	NC_020555	AAT	2	6	3240	3245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471314540
39	NC_020555	TAA	2	6	3296	3301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471314540
40	NC_020555	ATC	2	6	3313	3318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471314540
41	NC_020555	TGC	2	6	3535	3540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471314540
42	NC_020555	TCA	2	6	3541	3546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471314540
43	NC_020555	TCA	2	6	3548	3553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471314540
44	NC_020555	GAT	2	6	3606	3611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471314540
45	NC_020555	CTT	2	6	3629	3634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471314540
46	NC_020555	CTT	2	6	3701	3706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471314540
47	NC_020555	GCC	2	6	3827	3832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471314540
48	NC_020555	TGC	2	6	3883	3888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471314540
49	NC_020555	TCT	2	6	3968	3973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471314540
50	NC_020555	ATC	2	6	4168	4173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471314540
51	NC_020555	ATC	2	6	4231	4236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471314540
52	NC_020555	AGC	2	6	4348	4353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471314540
53	NC_020555	GTG	2	6	4489	4494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471314540
54	NC_020555	TGG	2	6	4516	4521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471314540
55	NC_020555	ATA	2	6	4522	4527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471314540
56	NC_020555	CAC	2	6	4669	4674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471314541
57	NC_020555	ACT	2	6	4758	4763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471314541
58	NC_020555	GTG	2	6	4846	4851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471314541
59	NC_020555	TAA	2	6	4884	4889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471314541
60	NC_020555	TTG	2	6	4982	4987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471314541
61	NC_020555	AAT	2	6	4989	4994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471314541
62	NC_020555	GCA	2	6	5005	5010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471314541
63	NC_020555	TCA	2	6	5090	5095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471314541
64	NC_020555	GTG	2	6	5292	5297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471314541
65	NC_020555	TTA	2	6	5374	5379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471314541
66	NC_020555	TAT	2	6	5885	5890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471314542
67	NC_020555	GTG	2	6	5955	5960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471314542
68	NC_020555	GCG	2	6	6169	6174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471314542
69	NC_020555	TTA	2	6	6293	6298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471314542
70	NC_020555	TCA	2	6	6377	6382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471314542
71	NC_020555	GAG	2	6	6390	6395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	471314542
72	NC_020555	TGG	2	6	6412	6417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471314542
73	NC_020555	GGC	2	6	6778	6783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471314543
74	NC_020555	TAT	2	6	6844	6849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471314543
75	NC_020555	CTG	3	9	6871	6879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471314543
76	NC_020555	ATA	2	6	6951	6956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471314543
77	NC_020555	TGA	2	6	7042	7047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471314543
78	NC_020555	ATA	2	6	7064	7069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471314543
79	NC_020555	TGA	2	6	7070	7075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471314543
80	NC_020555	CTT	2	6	7097	7102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471314543
81	NC_020555	TCA	2	6	7173	7178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471314543
82	NC_020555	AGC	2	6	7284	7289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471314543
83	NC_020555	CTT	2	6	7297	7302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471314543
84	NC_020555	TCA	2	6	7362	7367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471314543
85	NC_020555	ATT	2	6	7388	7393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471314543
86	NC_020555	TCA	2	6	7396	7401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471314543
87	NC_020555	CCA	2	6	7431	7436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471314543
88	NC_020555	ATT	2	6	7466	7471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471314543
89	NC_020555	TAG	2	6	7593	7598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471314543
90	NC_020555	TCA	2	6	7656	7661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471314543
91	NC_020555	CAG	2	6	7735	7740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471314543
92	NC_020555	TAT	2	6	7837	7842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471314543
93	NC_020555	ATA	2	6	7952	7957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471314543
94	NC_020555	CTG	2	6	8011	8016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471314543
95	NC_020555	CAA	3	9	8095	8103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471314543
96	NC_020555	CTT	2	6	8161	8166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471314543
97	NC_020555	TCT	2	6	8172	8177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471314543
98	NC_020555	GCA	2	6	8190	8195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471314543
99	NC_020555	TAA	2	6	8285	8290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471314543
100	NC_020555	AAG	2	6	8345	8350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471314543
101	NC_020555	TGC	2	6	8366	8371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471314543
102	NC_020555	TCC	2	6	8418	8423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	471314543
103	NC_020555	CCA	3	9	8855	8863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471314544
104	NC_020555	TTG	2	6	8871	8876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471314544
105	NC_020555	ATA	2	6	8971	8976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471314545
106	NC_020555	ATA	2	6	9229	9234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471314545
107	NC_020555	CAC	2	6	9255	9260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471314545
108	NC_020555	TGC	3	9	9309	9317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471314545
109	NC_020555	CCG	2	6	9349	9354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471314545
110	NC_020555	TGC	3	9	9513	9521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471314545
111	NC_020555	ACT	2	6	9610	9615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471314545
112	NC_020555	CCA	2	6	9617	9622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471314545
113	NC_020555	AAG	2	6	9633	9638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471314545
114	NC_020555	TAA	2	6	9677	9682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471314545
115	NC_020555	GAT	2	6	9749	9754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471314545
116	NC_020555	TGC	2	6	9791	9796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471314545
117	NC_020555	AAT	2	6	9810	9815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471314545
118	NC_020555	GGA	2	6	9843	9848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	471314545
119	NC_020555	AGC	2	6	9880	9885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471314545
120	NC_020555	TCA	2	6	9914	9919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471314545
121	NC_020555	TGA	2	6	10198	10203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471314546
122	NC_020555	TAG	2	6	10253	10258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471314546
123	NC_020555	TGA	2	6	10510	10515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471314547
124	NC_020555	TTA	2	6	10670	10675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471314547
125	NC_020555	TTA	2	6	10682	10687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471314547
126	NC_020555	ATG	2	6	10734	10739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471314547
127	NC_020555	AAG	2	6	10782	10787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471314547
128	NC_020555	ATT	2	6	10841	10846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471314547
129	NC_020555	ATT	2	6	10977	10982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471314547
130	NC_020555	TGC	2	6	11075	11080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471314547
131	NC_020555	ATG	2	6	11097	11102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471314547
132	NC_020555	AGT	2	6	11107	11112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471314547
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249	NC_020555	CAA	2	6	23795	23800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471314563
250	NC_020555	GAT	2	6	23844	23849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471314563
251	NC_020555	GGC	2	6	24198	24203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471314563
252	NC_020555	ATA	2	6	24211	24216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471314563
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254	NC_020555	AAG	2	6	24451	24456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471314563
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