MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Corynebacterium callunae DSM 20147 plasmid pCC2

Total Repeats: 41

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020553	CTGGCC	2	12	2435	2446	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	470157239
2	NC_020553	CTCACC	2	12	2534	2545	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	470157239
3	NC_020553	CCCGGT	2	12	3425	3436	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	470157240
4	NC_020553	GGCCAC	2	12	8290	8301	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	470157246
5	NC_020553	CGTGGT	2	12	10159	10170	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	470157247
6	NC_020553	CACCGC	2	12	13721	13732	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	470157250
7	NC_020553	GCCGGG	2	12	13990	14001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470157250
8	NC_020553	GTCATC	2	12	14118	14129	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	470157250
9	NC_020553	GTTCGC	2	12	16381	16392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470157252
10	NC_020553	TCGACG	2	12	19510	19521	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	470157255
11	NC_020553	TCTCAT	2	12	22445	22456	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	470157259
12	NC_020553	AGTCCG	2	12	23435	23446	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	470157259
13	NC_020553	ATTGCG	2	12	24610	24621	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	470157260
14	NC_020553	GCGCAC	2	12	24626	24637	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	470157260
15	NC_020553	TTTCCT	2	12	30336	30347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470157268
16	NC_020553	GACAAC	2	12	32539	32550	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	470157271
17	NC_020553	GTTCTT	2	12	32591	32602	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	470157271
18	NC_020553	TCTTCC	2	12	36328	36339	0 %	50 %	0 %	50 %	470157276
19	NC_020553	TCCGTG	2	12	37286	37297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470157277
20	NC_020553	ATGGAC	2	12	39769	39780	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	470157277
21	NC_020553	GGTGAT	2	12	41818	41829	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	470157277
22	NC_020553	GCCGAA	2	12	49184	49195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470157281
23	NC_020553	ATCGGT	2	12	53304	53315	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	470157287
24	NC_020553	GTCGAT	2	12	53691	53702	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	470157287
25	NC_020553	GCATCA	2	12	54978	54989	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470157288
26	NC_020553	CACCAA	2	12	55638	55649	50 %	0 %	0 %	50 %	470157289
27	NC_020553	TGTCGC	2	12	56437	56448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470157290
28	NC_020553	TCGTGG	2	12	58160	58171	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	470157293
29	NC_020553	CTTGCA	2	12	59082	59093	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	470157294
30	NC_020553	CGGTGG	2	12	59423	59434	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	470157294
31	NC_020553	CAGGTG	2	12	59917	59928	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	470157294
32	NC_020553	GTCACC	2	12	61347	61358	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	470157295
33	NC_020553	ATGAGG	2	12	61363	61374	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	470157295
34	NC_020553	CTGCGT	2	12	61425	61436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470157295
35	NC_020553	TCTCAT	2	12	64443	64454	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	470157299
36	NC_020553	CATTGT	2	12	67523	67534	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470157302
37	NC_020553	GTTGAG	2	12	70282	70293	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	470157304
38	NC_020553	CTGGAT	2	12	75119	75130	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	470157307
39	NC_020553	GTCCAT	2	12	81683	81694	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	470157315
40	NC_020553	GCTTCT	2	12	82395	82406	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	470157316
41	NC_020553	CCAGGG	2	12	84616	84627	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	470157318

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.