MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Corynebacterium callunae DSM 20147 plasmid pCC2

Total Repeats: 107

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020553	GC	3	6	1341	1346	0 %	0 %	50 %	50 %	470157238
2	NC_020553	TA	4	8	1384	1391	50 %	50 %	0 %	0 %	470157238
3	NC_020553	CG	3	6	1543	1548	0 %	0 %	50 %	50 %	470157238
4	NC_020553	GC	3	6	1837	1842	0 %	0 %	50 %	50 %	470157238
5	NC_020553	GT	3	6	2664	2669	0 %	50 %	50 %	0 %	470157239
6	NC_020553	GT	3	6	3277	3282	0 %	50 %	50 %	0 %	470157240
7	NC_020553	CA	3	6	3885	3890	50 %	0 %	0 %	50 %	470157240
8	NC_020553	GC	3	6	9324	9329	0 %	0 %	50 %	50 %	470157247
9	NC_020553	CA	3	6	9518	9523	50 %	0 %	0 %	50 %	470157247
10	NC_020553	CA	3	6	9585	9590	50 %	0 %	0 %	50 %	470157247
11	NC_020553	GA	3	6	9594	9599	50 %	0 %	50 %	0 %	470157247
12	NC_020553	CG	3	6	12154	12159	0 %	0 %	50 %	50 %	470157249
13	NC_020553	CG	4	8	13002	13009	0 %	0 %	50 %	50 %	470157250
14	NC_020553	GT	3	6	13102	13107	0 %	50 %	50 %	0 %	470157250
15	NC_020553	TC	3	6	16682	16687	0 %	50 %	0 %	50 %	470157252
16	NC_020553	TG	3	6	18366	18371	0 %	50 %	50 %	0 %	470157253
17	NC_020553	GA	3	6	21011	21016	50 %	0 %	50 %	0 %	470157257
18	NC_020553	CG	3	6	21094	21099	0 %	0 %	50 %	50 %	470157257
19	NC_020553	CG	3	6	21270	21275	0 %	0 %	50 %	50 %	470157257
20	NC_020553	AT	3	6	21428	21433	50 %	50 %	0 %	0 %	470157257
21	NC_020553	CG	3	6	21724	21729	0 %	0 %	50 %	50 %	470157258
22	NC_020553	CA	3	6	22172	22177	50 %	0 %	0 %	50 %	470157259
23	NC_020553	TG	3	6	22667	22672	0 %	50 %	50 %	0 %	470157259
24	NC_020553	TA	3	6	23532	23537	50 %	50 %	0 %	0 %	470157259
25	NC_020553	TC	3	6	23574	23579	0 %	50 %	0 %	50 %	470157259
26	NC_020553	AG	3	6	24828	24833	50 %	0 %	50 %	0 %	470157260
27	NC_020553	GT	3	6	24952	24957	0 %	50 %	50 %	0 %	470157260
28	NC_020553	GC	3	6	26210	26215	0 %	0 %	50 %	50 %	470157261
29	NC_020553	TG	3	6	26486	26491	0 %	50 %	50 %	0 %	470157262
30	NC_020553	AC	3	6	26533	26538	50 %	0 %	0 %	50 %	470157262
31	NC_020553	AT	3	6	27902	27907	50 %	50 %	0 %	0 %	470157264
32	NC_020553	GT	3	6	28378	28383	0 %	50 %	50 %	0 %	470157265
33	NC_020553	TG	3	6	28577	28582	0 %	50 %	50 %	0 %	470157265
34	NC_020553	AG	3	6	29924	29929	50 %	0 %	50 %	0 %	470157268
35	NC_020553	TC	3	6	30218	30223	0 %	50 %	0 %	50 %	470157268
36	NC_020553	TC	3	6	31118	31123	0 %	50 %	0 %	50 %	470157269
37	NC_020553	TC	3	6	31151	31156	0 %	50 %	0 %	50 %	470157269
38	NC_020553	AG	3	6	31643	31648	50 %	0 %	50 %	0 %	470157270
39	NC_020553	GC	3	6	32000	32005	0 %	0 %	50 %	50 %	470157270
40	NC_020553	TC	3	6	32826	32831	0 %	50 %	0 %	50 %	470157271
41	NC_020553	CG	3	6	32967	32972	0 %	0 %	50 %	50 %	470157271
42	NC_020553	GC	3	6	33255	33260	0 %	0 %	50 %	50 %	470157272
43	NC_020553	CA	3	6	33702	33707	50 %	0 %	0 %	50 %	470157273
44	NC_020553	TG	3	6	34972	34977	0 %	50 %	50 %	0 %	470157274
45	NC_020553	CA	3	6	36865	36870	50 %	0 %	0 %	50 %	470157277
46	NC_020553	CG	3	6	36897	36902	0 %	0 %	50 %	50 %	470157277
47	NC_020553	CA	3	6	37707	37712	50 %	0 %	0 %	50 %	470157277
48	NC_020553	CG	3	6	40220	40225	0 %	0 %	50 %	50 %	470157277
49	NC_020553	CG	3	6	40843	40848	0 %	0 %	50 %	50 %	470157277
50	NC_020553	CG	3	6	41217	41222	0 %	0 %	50 %	50 %	470157277
51	NC_020553	GT	3	6	41746	41751	0 %	50 %	50 %	0 %	470157277
52	NC_020553	AC	3	6	42882	42887	50 %	0 %	0 %	50 %	470157278
53	NC_020553	TC	4	8	42911	42918	0 %	50 %	0 %	50 %	470157278
54	NC_020553	GA	3	6	43470	43475	50 %	0 %	50 %	0 %	470157278
55	NC_020553	GA	3	6	44170	44175	50 %	0 %	50 %	0 %	470157278
56	NC_020553	TC	3	6	45785	45790	0 %	50 %	0 %	50 %	470157279
57	NC_020553	TG	3	6	45967	45972	0 %	50 %	50 %	0 %	470157279
58	NC_020553	GA	3	6	46995	47000	50 %	0 %	50 %	0 %	470157280
59	NC_020553	GT	3	6	48201	48206	0 %	50 %	50 %	0 %	470157280
60	NC_020553	TG	3	6	49745	49750	0 %	50 %	50 %	0 %	470157282
61	NC_020553	GT	3	6	49831	49836	0 %	50 %	50 %	0 %	470157282
62	NC_020553	GT	3	6	49858	49863	0 %	50 %	50 %	0 %	470157282
63	NC_020553	GT	4	8	50528	50535	0 %	50 %	50 %	0 %	470157283
64	NC_020553	GT	4	8	50681	50688	0 %	50 %	50 %	0 %	470157283
65	NC_020553	GC	3	6	50762	50767	0 %	0 %	50 %	50 %	470157283
66	NC_020553	GC	4	8	51277	51284	0 %	0 %	50 %	50 %	470157285
67	NC_020553	AT	3	6	51550	51555	50 %	50 %	0 %	0 %	470157285
68	NC_020553	CG	3	6	51602	51607	0 %	0 %	50 %	50 %	470157285
69	NC_020553	CA	3	6	53003	53008	50 %	0 %	0 %	50 %	470157286
70	NC_020553	CA	3	6	55390	55395	50 %	0 %	0 %	50 %	470157288
71	NC_020553	GA	3	6	56062	56067	50 %	0 %	50 %	0 %	470157289
72	NC_020553	CG	3	6	56143	56148	0 %	0 %	50 %	50 %	470157289
73	NC_020553	GT	3	6	56418	56423	0 %	50 %	50 %	0 %	470157290
74	NC_020553	GT	3	6	56665	56670	0 %	50 %	50 %	0 %	470157291
75	NC_020553	AC	3	6	56716	56721	50 %	0 %	0 %	50 %	470157291
76	NC_020553	CT	3	6	56920	56925	0 %	50 %	0 %	50 %	470157292
77	NC_020553	CA	3	6	59852	59857	50 %	0 %	0 %	50 %	470157294
78	NC_020553	CT	3	6	60272	60277	0 %	50 %	0 %	50 %	470157295
79	NC_020553	CT	3	6	60342	60347	0 %	50 %	0 %	50 %	470157295
80	NC_020553	CT	3	6	60501	60506	0 %	50 %	0 %	50 %	470157295
81	NC_020553	TG	4	8	60896	60903	0 %	50 %	50 %	0 %	470157295
82	NC_020553	CA	3	6	61990	61995	50 %	0 %	0 %	50 %	470157296
83	NC_020553	CG	3	6	63052	63057	0 %	0 %	50 %	50 %	470157297
84	NC_020553	CA	3	6	63725	63730	50 %	0 %	0 %	50 %	470157297
85	NC_020553	TC	3	6	65604	65609	0 %	50 %	0 %	50 %	470157299
86	NC_020553	TC	4	8	66261	66268	0 %	50 %	0 %	50 %	470157300
87	NC_020553	CA	3	6	66389	66394	50 %	0 %	0 %	50 %	470157300
88	NC_020553	CA	3	6	66745	66750	50 %	0 %	0 %	50 %	470157301
89	NC_020553	TG	3	6	67011	67016	0 %	50 %	50 %	0 %	470157301
90	NC_020553	TC	4	8	67376	67383	0 %	50 %	0 %	50 %	470157302
91	NC_020553	AC	3	6	69398	69403	50 %	0 %	0 %	50 %	470157303
92	NC_020553	AT	3	6	70119	70124	50 %	50 %	0 %	0 %	470157304
93	NC_020553	TG	3	6	71273	71278	0 %	50 %	50 %	0 %	470157305
94	NC_020553	TC	3	6	71288	71293	0 %	50 %	0 %	50 %	470157305
95	NC_020553	GC	3	6	71811	71816	0 %	0 %	50 %	50 %	470157305
96	NC_020553	CA	3	6	73029	73034	50 %	0 %	0 %	50 %	470157305
97	NC_020553	GT	3	6	73567	73572	0 %	50 %	50 %	0 %	470157305
98	NC_020553	TG	3	6	73883	73888	0 %	50 %	50 %	0 %	470157305
99	NC_020553	TG	4	8	75286	75293	0 %	50 %	50 %	0 %	470157307
100	NC_020553	GC	3	6	76044	76049	0 %	0 %	50 %	50 %	470157308
101	NC_020553	CA	3	6	78705	78710	50 %	0 %	0 %	50 %	470157313
102	NC_020553	AG	3	6	78752	78757	50 %	0 %	50 %	0 %	470157313
103	NC_020553	GT	3	6	78870	78875	0 %	50 %	50 %	0 %	470157313
104	NC_020553	GA	3	6	79914	79919	50 %	0 %	50 %	0 %	470157314
105	NC_020553	GT	3	6	80218	80223	0 %	50 %	50 %	0 %	470157314
106	NC_020553	AT	3	6	80483	80488	50 %	50 %	0 %	0 %	470157314
107	NC_020553	TC	3	6	82947	82952	0 %	50 %	0 %	50 %	470157316

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.