MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Liberibacter asiaticus str. gxpsy

Total Repeats: 744

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020549	AAAAT	2	10	2149	2158	80 %	20 %	0 %	0 %	470204501
2	NC_020549	TCATT	2	10	2738	2747	20 %	60 %	0 %	20 %	470204501
3	NC_020549	AAAAC	2	10	3343	3352	80 %	0 %	0 %	20 %	470204502
4	NC_020549	CTAAT	2	10	3528	3537	40 %	40 %	0 %	20 %	470204502
5	NC_020549	CAATA	2	10	4872	4881	60 %	20 %	0 %	20 %	470204503
6	NC_020549	AACAT	2	10	4885	4894	60 %	20 %	0 %	20 %	470204503
7	NC_020549	TATTT	2	10	9001	9010	20 %	80 %	0 %	0 %	470204505
8	NC_020549	AAATC	2	10	11813	11822	60 %	20 %	0 %	20 %	470204506
9	NC_020549	AGGCG	2	10	12849	12858	20 %	0 %	60 %	20 %	470204506
10	NC_020549	AAAGA	2	10	13650	13659	80 %	0 %	20 %	0 %	470204506
11	NC_020549	TCATT	2	10	15009	15018	20 %	60 %	0 %	20 %	470204507
12	NC_020549	GACGA	2	10	15739	15748	40 %	0 %	40 %	20 %	470204508
13	NC_020549	TGGGA	2	10	17046	17055	20 %	20 %	60 %	0 %	470204510
14	NC_020549	AAAAT	2	10	17875	17884	80 %	20 %	0 %	0 %	470204512
15	NC_020549	AAACA	2	10	22961	22970	80 %	0 %	0 %	20 %	470204516
16	NC_020549	CCTTG	2	10	30702	30711	0 %	40 %	20 %	40 %	470204524
17	NC_020549	ATCCC	2	10	34413	34422	20 %	20 %	0 %	60 %	470204526
18	NC_020549	CTTTA	2	10	39818	39827	20 %	60 %	0 %	20 %	470204533
19	NC_020549	CTCTT	2	10	40170	40179	0 %	60 %	0 %	40 %	470204533
20	NC_020549	AACAG	2	10	40572	40581	60 %	0 %	20 %	20 %	470204534
21	NC_020549	TTGAA	2	10	48484	48493	40 %	40 %	20 %	0 %	470204543
22	NC_020549	ATCTC	2	10	49932	49941	20 %	40 %	0 %	40 %	470204544
23	NC_020549	TCCTG	2	10	53610	53619	0 %	40 %	20 %	40 %	470204546
24	NC_020549	TTGAA	2	10	58982	58991	40 %	40 %	20 %	0 %	470204548
25	NC_020549	AAGAA	2	10	59552	59561	80 %	0 %	20 %	0 %	470204549
26	NC_020549	AAAAG	2	10	66693	66702	80 %	0 %	20 %	0 %	470204555
27	NC_020549	ATTTT	2	10	67384	67393	20 %	80 %	0 %	0 %	470204556
28	NC_020549	CATCT	2	10	68583	68592	20 %	40 %	0 %	40 %	470204557
29	NC_020549	GCACC	2	10	68666	68675	20 %	0 %	20 %	60 %	470204557
30	NC_020549	TAGAA	2	10	69720	69729	60 %	20 %	20 %	0 %	470204557
31	NC_020549	CAAGA	2	10	74346	74355	60 %	0 %	20 %	20 %	470204561
32	NC_020549	ACTTC	2	10	78213	78222	20 %	40 %	0 %	40 %	470204564
33	NC_020549	CAAGG	2	10	78280	78289	40 %	0 %	40 %	20 %	470204564
34	NC_020549	AAATC	2	10	79302	79311	60 %	20 %	0 %	20 %	470204565
35	NC_020549	AATCA	2	10	79583	79592	60 %	20 %	0 %	20 %	470204565
36	NC_020549	ATATC	2	10	81353	81362	40 %	40 %	0 %	20 %	470204567
37	NC_020549	TCCAA	2	10	81986	81995	40 %	20 %	0 %	40 %	470204568
38	NC_020549	ATAAA	2	10	82057	82066	80 %	20 %	0 %	0 %	470204568
39	NC_020549	ACAAA	2	10	83355	83364	80 %	0 %	0 %	20 %	470204569
40	NC_020549	GAGAA	2	10	92834	92843	60 %	0 %	40 %	0 %	470204580
41	NC_020549	TAAAA	2	10	93141	93150	80 %	20 %	0 %	0 %	470204581
42	NC_020549	TTCAA	2	10	93215	93224	40 %	40 %	0 %	20 %	470204581
43	NC_020549	ATAAA	2	10	93302	93311	80 %	20 %	0 %	0 %	470204581
44	NC_020549	ATAAA	2	10	93449	93458	80 %	20 %	0 %	0 %	470204581
45	NC_020549	AAATC	2	10	93798	93807	60 %	20 %	0 %	20 %	470204582
46	NC_020549	AAAAC	2	10	94081	94090	80 %	0 %	0 %	20 %	470204583
47	NC_020549	CAATG	2	10	94836	94845	40 %	20 %	20 %	20 %	470204584
48	NC_020549	TACAT	2	10	94992	95001	40 %	40 %	0 %	20 %	470204584
49	NC_020549	AAAAC	2	10	95737	95746	80 %	0 %	0 %	20 %	470204584
50	NC_020549	CTACG	2	10	96184	96193	20 %	20 %	20 %	40 %	470204584
51	NC_020549	TCATT	2	10	99774	99783	20 %	60 %	0 %	20 %	470204587
52	NC_020549	CCATC	2	10	104734	104743	20 %	20 %	0 %	60 %	470204591
53	NC_020549	CAATA	2	10	106726	106735	60 %	20 %	0 %	20 %	470204591
54	NC_020549	CTTTT	2	10	107188	107197	0 %	80 %	0 %	20 %	470204591
55	NC_020549	CTTTT	2	10	109084	109093	0 %	80 %	0 %	20 %	470204591
56	NC_020549	CAATA	2	10	109258	109267	60 %	20 %	0 %	20 %	470204591
57	NC_020549	TCCTC	2	10	111619	111628	0 %	40 %	0 %	60 %	470204593
58	NC_020549	CTTTT	2	10	112412	112421	0 %	80 %	0 %	20 %	470204595
59	NC_020549	TCACA	2	10	117417	117426	40 %	20 %	0 %	40 %	470204600
60	NC_020549	CTTTA	2	10	120832	120841	20 %	60 %	0 %	20 %	470204604
61	NC_020549	CCACT	2	10	122392	122401	20 %	20 %	0 %	60 %	470204608
62	NC_020549	GCATC	2	10	123285	123294	20 %	20 %	20 %	40 %	470204610
63	NC_020549	AAATA	2	10	125371	125380	80 %	20 %	0 %	0 %	470204616
64	NC_020549	CCTTT	2	10	125421	125430	0 %	60 %	0 %	40 %	470204616
65	NC_020549	ACGCA	2	10	134185	134194	40 %	0 %	20 %	40 %	470204628
66	NC_020549	GCATA	2	10	136058	136067	40 %	20 %	20 %	20 %	470204630
67	NC_020549	ACCAT	2	10	136798	136807	40 %	20 %	0 %	40 %	470204630
68	NC_020549	AACAT	2	10	138618	138627	60 %	20 %	0 %	20 %	470204632
69	NC_020549	AGATC	2	10	138726	138735	40 %	20 %	20 %	20 %	470204632
70	NC_020549	ACAAA	2	10	138957	138966	80 %	0 %	0 %	20 %	470204632
71	NC_020549	AGGAG	2	10	143962	143971	40 %	0 %	60 %	0 %	470204635
72	NC_020549	ACTTC	2	10	146862	146871	20 %	40 %	0 %	40 %	470204637
73	NC_020549	ACCGC	2	10	147134	147143	20 %	0 %	20 %	60 %	470204638
74	NC_020549	TTCCA	2	10	149703	149712	20 %	40 %	0 %	40 %	470204639
75	NC_020549	TATTT	2	10	150392	150401	20 %	80 %	0 %	0 %	470204639
76	NC_020549	AATTG	2	10	150755	150764	40 %	40 %	20 %	0 %	470204639
77	NC_020549	ATCCA	2	10	152133	152142	40 %	20 %	0 %	40 %	470204641
78	NC_020549	CTGTA	2	10	153922	153931	20 %	40 %	20 %	20 %	470204642
79	NC_020549	ATCTA	2	10	155067	155076	40 %	40 %	0 %	20 %	470204643
80	NC_020549	AAAAT	2	10	155661	155670	80 %	20 %	0 %	0 %	470204644
81	NC_020549	CTGTT	2	10	156347	156356	0 %	60 %	20 %	20 %	470204644
82	NC_020549	TTCGA	2	10	157939	157948	20 %	40 %	20 %	20 %	470204646
83	NC_020549	CCAAG	2	10	158971	158980	40 %	0 %	20 %	40 %	470204646
84	NC_020549	TCATT	2	10	159866	159875	20 %	60 %	0 %	20 %	470204647
85	NC_020549	TAATA	2	10	161120	161129	60 %	40 %	0 %	0 %	470204647
86	NC_020549	TTTTC	2	10	161540	161549	0 %	80 %	0 %	20 %	470204647
87	NC_020549	AAATA	2	10	161713	161722	80 %	20 %	0 %	0 %	470204648
88	NC_020549	TCATC	2	10	161973	161982	20 %	40 %	0 %	40 %	470204648
89	NC_020549	TATAA	2	10	163799	163808	60 %	40 %	0 %	0 %	470204650
90	NC_020549	CCTTT	2	10	165865	165874	0 %	60 %	0 %	40 %	470204651
91	NC_020549	ATGTT	2	10	167068	167077	20 %	60 %	20 %	0 %	470204652
92	NC_020549	ATCCT	2	10	167203	167212	20 %	40 %	0 %	40 %	470204652
93	NC_020549	AAAAC	2	10	168187	168196	80 %	0 %	0 %	20 %	470204653
94	NC_020549	TATAA	2	10	169459	169468	60 %	40 %	0 %	0 %	470204653
95	NC_020549	CATTA	2	10	169513	169522	40 %	40 %	0 %	20 %	470204653
96	NC_020549	TCCAT	2	10	171142	171151	20 %	40 %	0 %	40 %	470204656
97	NC_020549	TTGAA	2	10	172682	172691	40 %	40 %	20 %	0 %	470204657
98	NC_020549	TATCA	2	10	173767	173776	40 %	40 %	0 %	20 %	470204659
99	NC_020549	GTCTT	2	10	174871	174880	0 %	60 %	20 %	20 %	470204660
100	NC_020549	CAATC	2	10	176394	176403	40 %	20 %	0 %	40 %	470204661
101	NC_020549	GCTAT	2	10	179497	179506	20 %	40 %	20 %	20 %	470204664
102	NC_020549	GAAGG	2	10	181208	181217	40 %	0 %	60 %	0 %	470204667
103	NC_020549	CTCTA	2	10	182233	182242	20 %	40 %	0 %	40 %	470204668
104	NC_020549	GAAAA	2	10	183734	183743	80 %	0 %	20 %	0 %	470204668
105	NC_020549	GATAC	2	10	186723	186732	40 %	20 %	20 %	20 %	470204670
106	NC_020549	ACATT	2	10	197064	197073	40 %	40 %	0 %	20 %	470204679
107	NC_020549	CTTTA	2	10	198228	198237	20 %	60 %	0 %	20 %	470204682
108	NC_020549	GATGG	2	10	202051	202060	20 %	20 %	60 %	0 %	470204684
109	NC_020549	TAAGG	2	10	203418	203427	40 %	20 %	40 %	0 %	470204685
110	NC_020549	CCAAA	2	10	205515	205524	60 %	0 %	0 %	40 %	470204688
111	NC_020549	CAAGC	2	10	206119	206128	40 %	0 %	20 %	40 %	470204688
112	NC_020549	CAACA	2	10	206573	206582	60 %	0 %	0 %	40 %	470204688
113	NC_020549	ACATA	2	10	207412	207421	60 %	20 %	0 %	20 %	470204689
114	NC_020549	ATGAA	2	10	211393	211402	60 %	20 %	20 %	0 %	470204691
115	NC_020549	CATTA	2	10	212692	212701	40 %	40 %	0 %	20 %	470204693
116	NC_020549	ACGAT	2	10	213502	213511	40 %	20 %	20 %	20 %	470204694
117	NC_020549	ATTCT	2	10	213793	213802	20 %	60 %	0 %	20 %	470204694
118	NC_020549	TGGGT	2	10	214669	214678	0 %	40 %	60 %	0 %	470204695
119	NC_020549	TTGGA	2	10	215781	215790	20 %	40 %	40 %	0 %	470204696
120	NC_020549	AGAAA	2	10	215839	215848	80 %	0 %	20 %	0 %	470204696
121	NC_020549	TTAAA	2	10	218905	218914	60 %	40 %	0 %	0 %	470204698
122	NC_020549	TAATG	2	10	219715	219724	40 %	40 %	20 %	0 %	470204699
123	NC_020549	ACCTC	2	10	223687	223696	20 %	20 %	0 %	60 %	470204702
124	NC_020549	ACCAT	2	10	223819	223828	40 %	20 %	0 %	40 %	470204702
125	NC_020549	TGGAA	2	10	224282	224291	40 %	20 %	40 %	0 %	470204703
126	NC_020549	TAATT	2	10	225481	225490	40 %	60 %	0 %	0 %	470204704
127	NC_020549	CAAAA	2	10	227339	227348	80 %	0 %	0 %	20 %	470204706
128	NC_020549	TTCAT	2	10	227512	227521	20 %	60 %	0 %	20 %	470204706
129	NC_020549	GTACC	2	10	229849	229858	20 %	20 %	20 %	40 %	470204710
130	NC_020549	CGATG	2	10	235268	235277	20 %	20 %	40 %	20 %	470204714
131	NC_020549	TCACC	2	10	237681	237690	20 %	20 %	0 %	60 %	470204715
132	NC_020549	TCCCT	2	10	240228	240237	0 %	40 %	0 %	60 %	470204718
133	NC_020549	AAAAG	2	10	241147	241156	80 %	0 %	20 %	0 %	470204718
134	NC_020549	TCTTG	2	10	248267	248276	0 %	60 %	20 %	20 %	470204724
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