MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Liberibacter asiaticus str. gxpsy

Total Repeats: 14014

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020549	CGA	2	6	2019	2024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470204501
2	NC_020549	ATT	2	6	2187	2192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470204501
3	NC_020549	ATA	2	6	2258	2263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470204501
4	NC_020549	AAG	2	6	2293	2298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470204501
5	NC_020549	AGT	2	6	2454	2459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470204501
6	NC_020549	CAA	2	6	2497	2502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470204501
7	NC_020549	TGA	2	6	2552	2557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470204501
8	NC_020549	TCC	2	6	2561	2566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470204501
9	NC_020549	CAG	2	6	2594	2599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470204501
10	NC_020549	GAA	2	6	2662	2667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470204501
11	NC_020549	CAC	2	6	2717	2722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470204501
12	NC_020549	TAT	2	6	2781	2786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470204501
13	NC_020549	AAG	2	6	2936	2941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470204501
14	NC_020549	TTA	2	6	3017	3022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470204501
15	NC_020549	ATA	2	6	3108	3113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470204502
16	NC_020549	AAG	2	6	3123	3128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470204502
17	NC_020549	ATA	2	6	3168	3173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470204502
18	NC_020549	ATT	2	6	3397	3402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470204502
19	NC_020549	CAG	2	6	3462	3467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470204502
20	NC_020549	AGG	2	6	3553	3558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470204502
21	NC_020549	AGC	2	6	3649	3654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470204502
22	NC_020549	AGA	2	6	3655	3660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470204502
23	NC_020549	TAA	2	6	3730	3735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470204502
24	NC_020549	AAG	2	6	3789	3794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470204502
25	NC_020549	ATG	2	6	3874	3879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470204503
26	NC_020549	TAC	2	6	3892	3897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470204503
27	NC_020549	GCA	2	6	3965	3970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470204503
28	NC_020549	ATG	2	6	3977	3982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470204503
29	NC_020549	TCA	2	6	3998	4003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470204503
30	NC_020549	TTC	2	6	4041	4046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470204503
31	NC_020549	CAA	2	6	4172	4177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470204503
32	NC_020549	ATT	2	6	4310	4315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470204503
33	NC_020549	TAC	2	6	4404	4409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470204503
34	NC_020549	ATA	2	6	4451	4456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470204503
35	NC_020549	ATG	2	6	4474	4479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470204503
36	NC_020549	ACA	2	6	4483	4488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470204503
37	NC_020549	CTC	2	6	4496	4501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470204503
38	NC_020549	TAA	2	6	4626	4631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470204503
39	NC_020549	ATC	2	6	4641	4646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470204503
40	NC_020549	AAC	2	6	4683	4688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470204503
41	NC_020549	AAG	2	6	4700	4705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470204503
42	NC_020549	ATC	2	6	4721	4726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470204503
43	NC_020549	AGT	2	6	4813	4818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470204503
44	NC_020549	TTC	2	6	4908	4913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470204503
45	NC_020549	TAA	2	6	4944	4949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470204503
46	NC_020549	AAC	2	6	4969	4974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470204503
47	NC_020549	AAT	2	6	5059	5064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470204503
48	NC_020549	TGA	2	6	5142	5147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470204503
49	NC_020549	AAT	2	6	5155	5160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470204503
50	NC_020549	TAT	3	9	5318	5326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470204504
51	NC_020549	TCA	2	6	5338	5343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470204504
52	NC_020549	ATA	2	6	5354	5359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470204504
53	NC_020549	ATG	2	6	5399	5404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470204504
54	NC_020549	ATC	2	6	5431	5436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470204504
55	NC_020549	ATT	2	6	5476	5481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470204504
56	NC_020549	AAT	2	6	5581	5586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470204504
57	NC_020549	TGT	2	6	5601	5606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470204504
58	NC_020549	AAT	2	6	5640	5645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470204504
59	NC_020549	CAT	2	6	5691	5696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470204504
60	NC_020549	AAT	2	6	5712	5717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470204504
61	NC_020549	ATA	2	6	5729	5734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470204504
62	NC_020549	TAG	2	6	5738	5743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470204504
63	NC_020549	GAA	2	6	5764	5769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470204504
64	NC_020549	ATA	2	6	5783	5788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470204504
65	NC_020549	ATC	2	6	6509	6514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470204505
66	NC_020549	CGT	2	6	6536	6541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470204505
67	NC_020549	CAG	2	6	6567	6572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470204505
68	NC_020549	TAC	2	6	6576	6581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470204505
69	NC_020549	GCT	2	6	6638	6643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470204505
70	NC_020549	GTT	2	6	6659	6664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470204505
71	NC_020549	AAG	2	6	6672	6677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470204505
72	NC_020549	TTG	2	6	6760	6765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470204505
73	NC_020549	AAC	3	9	6874	6882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470204505
74	NC_020549	CTT	2	6	6927	6932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470204505
75	NC_020549	TAA	2	6	6942	6947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470204505
76	NC_020549	CAG	2	6	7086	7091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470204505
77	NC_020549	GAC	2	6	7200	7205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470204505
78	NC_020549	AAG	2	6	7327	7332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470204505
79	NC_020549	ACA	2	6	7385	7390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470204505
80	NC_020549	AAC	2	6	7405	7410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470204505
81	NC_020549	ACC	2	6	7615	7620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470204505
82	NC_020549	ATC	2	6	7621	7626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470204505
83	NC_020549	AAT	2	6	7631	7636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470204505
84	NC_020549	ATG	2	6	7649	7654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470204505
85	NC_020549	AGC	2	6	7879	7884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470204505
86	NC_020549	CTA	2	6	7964	7969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470204505
87	NC_020549	TAA	2	6	8091	8096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470204505
88	NC_020549	ATC	2	6	8098	8103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470204505
89	NC_020549	CTA	2	6	8160	8165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470204505
90	NC_020549	TCA	2	6	8274	8279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470204505
91	NC_020549	ACC	2	6	8302	8307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470204505
92	NC_020549	GAA	2	6	8320	8325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470204505
93	NC_020549	ACC	2	6	8341	8346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470204505
94	NC_020549	AAT	2	6	8374	8379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470204505
95	NC_020549	CCA	2	6	8414	8419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470204505
96	NC_020549	CAT	2	6	8464	8469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470204505
97	NC_020549	CAT	2	6	8536	8541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470204505
98	NC_020549	AGT	2	6	8560	8565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470204505
99	NC_020549	CAA	2	6	8580	8585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470204505
100	NC_020549	TAT	2	6	8589	8594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470204505
101	NC_020549	CAT	2	6	8619	8624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470204505
102	NC_020549	AAT	2	6	8668	8673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470204505
103	NC_020549	ATC	2	6	8701	8706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470204505
104	NC_020549	AGA	2	6	8725	8730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470204505
105	NC_020549	ATC	2	6	8761	8766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470204505
106	NC_020549	CCA	2	6	8814	8819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470204505
107	NC_020549	TTC	2	6	8831	8836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470204505
108	NC_020549	ATC	2	6	8840	8845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470204505
109	NC_020549	TGA	2	6	8876	8881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470204505
110	NC_020549	AGA	2	6	9152	9157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470204505
111	NC_020549	ACA	2	6	9168	9173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470204505
112	NC_020549	ACA	2	6	9362	9367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470204505
113	NC_020549	ACT	2	6	9377	9382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470204505
114	NC_020549	CAA	2	6	9420	9425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470204505
115	NC_020549	CTT	2	6	9427	9432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470204505
116	NC_020549	CAA	2	6	9555	9560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470204505
117	NC_020549	AAT	2	6	9576	9581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470204505
118	NC_020549	AGA	2	6	9596	9601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470204505
119	NC_020549	AAT	3	9	9748	9756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470204505
120	NC_020549	TCA	2	6	9783	9788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470204505
121	NC_020549	ATT	2	6	9793	9798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470204505
122	NC_020549	CGG	2	6	9812	9817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470204505
123	NC_020549	GGA	2	6	9884	9889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470204505
124	NC_020549	ATC	2	6	9911	9916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470204505
125	NC_020549	ATT	2	6	9925	9930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470204505
126	NC_020549	CAA	2	6	9951	9956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470204505
127	NC_020549	TAT	2	6	9970	9975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470204505
128	NC_020549	AGA	3	9	9994	10002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470204505
129	NC_020549	TAA	2	6	10057	10062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470204505
130	NC_020549	CAT	2	6	10084	10089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470204505
131	NC_020549	CTT	2	6	10137	10142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470204505
132	NC_020549	ACG	2	6	10187	10192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470204505
133	NC_020549	AAT	2	6	10375	10380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470204505
134	NC_020549	ATC	2	6	10585	10590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470204505
135	NC_020549	TTG	2	6	10621	10626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470204505
136	NC_020549	TTA	2	6	10689	10694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470204506
137	NC_020549	TTA	2	6	10708	10713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470204506
138	NC_020549	TTC	2	6	10725	10730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470204506
139	NC_020549	CAA	2	6	10853	10858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470204506
140	NC_020549	CAT	2	6	10889	10894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470204506
141	NC_020549	GCA	2	6	10930	10935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470204506
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143	NC_020549	TGT	2	6	11011	11016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470204506
144	NC_020549	CAT	2	6	11138	11143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470204506
145	NC_020549	CTT	2	6	11201	11206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470204506
146	NC_020549	ATC	3	9	11280	11288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470204506
147	NC_020549	TCT	2	6	11300	11305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470204506
148	NC_020549	TAA	2	6	11384	11389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470204506
149	NC_020549	TCT	2	6	11399	11404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470204506
150	NC_020549	TTA	2	6	11563	11568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470204506
151	NC_020549	CAA	2	6	11618	11623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470204506
152	NC_020549	AGG	2	6	11649	11654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470204506
153	NC_020549	ATC	2	6	11658	11663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470204506
154	NC_020549	TCT	2	6	11675	11680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470204506
155	NC_020549	CCA	2	6	11787	11792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470204506
156	NC_020549	TTC	2	6	12123	12128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470204506
157	NC_020549	CTA	2	6	12167	12172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470204506
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159	NC_020549	TCT	2	6	12274	12279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470204506
160	NC_020549	TTC	2	6	12315	12320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470204506
161	NC_020549	CGA	2	6	12413	12418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470204506
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163	NC_020549	TCA	2	6	12557	12562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470204506
164	NC_020549	CAA	2	6	12668	12673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470204506
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167	NC_020549	TCT	2	6	12895	12900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470204506
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199	NC_020549	TGA	2	6	15120	15125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470204507
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250	NC_020549	CTT	2	6	18729	18734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470204513
251	NC_020549	ACC	2	6	18735	18740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470204513
252	NC_020549	ATT	2	6	18748	18753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470204513
253	NC_020549	AAC	2	6	18801	18806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470204513
254	NC_020549	GAG	2	6	18875	18880	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470204513
255	NC_020549	TCA	2	6	18905	18910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470204513
256	NC_020549	TTA	2	6	18940	18945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470204513
257	NC_020549	AAT	2	6	18978	18983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470204513
258	NC_020549	ATC	2	6	18990	18995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470204513
259	NC_020549	AAT	2	6	19048	19053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470204513
260	NC_020549	TCA	2	6	19060	19065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470204513
261	NC_020549	AAC	2	6	19089	19094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470204513
262	NC_020549	CGA	2	6	19098	19103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470204513
263	NC_020549	GCA	2	6	19165	19170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470204513
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269	NC_020549	CTC	2	6	19805	19810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470204514
270	NC_020549	CCT	2	6	19848	19853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470204514
271	NC_020549	CAT	3	9	19948	19956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470204514
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273	NC_020549	CAA	2	6	20023	20028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470204514
274	NC_020549	CAA	2	6	20110	20115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470204514
275	NC_020549	TTG	2	6	20312	20317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470204514
276	NC_020549	AGT	2	6	20444	20449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470204514
277	NC_020549	TCA	2	6	20520	20525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470204514
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279	NC_020549	TTC	2	6	20705	20710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470204514
280	NC_020549	CAA	2	6	20784	20789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470204514
281	NC_020549	CTA	2	6	20814	20819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470204514
282	NC_020549	CAT	2	6	20848	20853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470204514
283	NC_020549	CGA	2	6	20878	20883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470204514
284	NC_020549	AGA	2	6	20885	20890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470204514
285	NC_020549	CAA	2	6	20911	20916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470204514
286	NC_020549	CAG	2	6	22294	22299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470204515
287	NC_020549	ACC	2	6	22356	22361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470204515
288	NC_020549	CAA	2	6	22703	22708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470204516
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290	NC_020549	TCT	2	6	22794	22799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470204516
291	NC_020549	CAA	2	6	22873	22878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470204516
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293	NC_020549	TCA	2	6	22914	22919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470204516
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