MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Azoarcus sp. KH32C plasmid pAZKH DNA

Total Repeats: 27

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020548	CATTGA	2	12	69	80	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_020548	CGGAAG	2	12	37253	37264	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_020548	GGGCGG	2	12	49504	49515	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_020548	AACGAT	2	12	122642	122653	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_020548	CTCACT	2	12	180256	180267	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_020548	GCGTCG	2	12	184739	184750	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_020548	CAGGCT	2	12	218596	218607	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_020548	CCCTCT	2	12	269415	269426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_020548	CTTCCG	2	12	293290	293301	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
10	NC_020548	GGGCGC	2	12	367532	367543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_020548	CAAGGA	2	12	368753	368764	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_020548	GAAGGT	2	12	457527	457538	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020548	TCGCGG	2	12	458014	458025	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_020548	TTGAAA	2	12	472517	472528	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020548	GATGCG	2	12	493560	493571	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_020548	GCGCCG	3	18	495445	495462	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_020548	TCTCCT	2	12	519627	519638	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_020548	GCAGGC	2	12	524653	524664	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_020548	TCGTTG	2	12	534288	534299	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_020548	GCCATC	2	12	549942	549953	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
21	NC_020548	ATACGA	2	12	598884	598895	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_020548	AAAAGC	2	12	601301	601312	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_020548	GCGGGT	2	12	662364	662375	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_020548	CCCCCT	2	12	665268	665279	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
25	NC_020548	ATCGGG	2	12	665445	665456	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_020548	CGCATG	2	12	688596	688607	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_020548	TTCCGT	2	12	714360	714371	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.