MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Azoarcus sp. KH32C plasmid pAZKH DNA

Total Repeats: 66

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020548	TGAAA	2	10	94	103	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020548	CCCGA	2	10	2589	2598	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3	NC_020548	CGATC	2	10	49833	49842	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4	NC_020548	AATAC	2	10	50967	50976	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_020548	CATGG	2	10	59609	59618	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_020548	CTTTT	2	10	73758	73767	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_020548	GTCTG	2	10	81115	81124	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_020548	TCGCG	2	10	116924	116933	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
9	NC_020548	GCAAA	2	10	121838	121847	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_020548	AAAAG	2	10	145799	145808	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020548	CCGAC	2	10	145819	145828	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
12	NC_020548	TGTGG	2	10	160582	160591	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020548	CTTGG	2	10	167529	167538	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_020548	GCGGG	2	10	167588	167597	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
15	NC_020548	CGCAA	2	10	183000	183009	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
16	NC_020548	CGTTT	2	10	209981	209990	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_020548	ACGCA	2	10	245328	245337	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
18	NC_020548	GCGAT	2	10	249525	249534	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_020548	GTTCG	2	10	256599	256608	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_020548	CCTTC	2	10	257620	257629	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
21	NC_020548	GTTGA	2	10	262649	262658	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020548	GTCGC	2	10	284256	284265	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
23	NC_020548	GCTGC	2	10	287845	287854	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
24	NC_020548	GATTC	2	10	326636	326645	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_020548	TCGGA	2	10	326916	326925	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_020548	CGCTC	2	10	329361	329370	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
27	NC_020548	GGCCT	2	10	343174	343183	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
28	NC_020548	CTCCG	2	10	346000	346009	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
29	NC_020548	AATAT	2	10	359164	359173	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020548	CGTAT	2	10	359179	359188	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_020548	GAAAC	2	10	367581	367590	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_020548	ATGCG	2	10	376769	376778	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_020548	TTGCT	2	10	394619	394628	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_020548	GGTTC	2	10	399559	399568	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
35	NC_020548	TCCAG	2	10	401275	401284	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
36	NC_020548	TTCAA	2	10	419169	419178	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_020548	TACGA	2	10	419311	419320	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_020548	ACCCG	2	10	444689	444698	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
39	NC_020548	TCAAA	2	10	456139	456148	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_020548	CGAGC	2	10	460601	460610	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
41	NC_020548	AGTTG	2	10	461572	461581	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020548	CGCAC	2	10	467448	467457	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
43	NC_020548	GCAAG	2	10	471214	471223	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
44	NC_020548	TGCCG	2	10	474329	474338	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
45	NC_020548	CGCGG	2	10	499604	499613	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
46	NC_020548	GAACC	2	10	504187	504196	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
47	NC_020548	TGCTG	2	10	518577	518586	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
48	NC_020548	TGCAC	2	10	524753	524762	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
49	NC_020548	TGGAC	2	10	529220	529229	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
50	NC_020548	GGGCC	2	10	553848	553857	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
51	NC_020548	CTGAG	2	10	553905	553914	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
52	NC_020548	GCGGG	2	10	562169	562178	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
53	NC_020548	CGAGC	2	10	565700	565709	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
54	NC_020548	AGCAC	2	10	567183	567192	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
55	NC_020548	TGCGA	2	10	577873	577882	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_020548	ATTGC	2	10	581051	581060	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_020548	CCGCG	2	10	583316	583325	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
58	NC_020548	AATTC	2	10	588725	588734	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_020548	TTGAA	2	10	588846	588855	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020548	CTGCA	2	10	592346	592355	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
61	NC_020548	TCGTT	2	10	598352	598361	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_020548	ACGCG	2	10	618448	618457	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
63	NC_020548	GAACC	2	10	619486	619495	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
64	NC_020548	CTGCC	2	10	644989	644998	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
65	NC_020548	GCCGT	2	10	652739	652748	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
66	NC_020548	CCCTG	2	10	729286	729295	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.