MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Azoarcus sp. KH32C plasmid pAZKH DNA

Total Repeats: 220

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020548	CCTG	2	8	1072	1079	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_020548	TCCG	2	8	2579	2586	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_020548	TATT	2	8	7246	7253	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020548	TTTA	2	8	7299	7306	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020548	CTGC	2	8	8901	8908	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_020548	CATT	2	8	10246	10253	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_020548	GCCG	2	8	11559	11566	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_020548	GTTG	2	8	12552	12559	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020548	GGAC	2	8	26170	26177	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_020548	TCGC	2	8	28586	28593	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_020548	ACCC	2	8	29433	29440	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
12	NC_020548	AGGG	2	8	32943	32950	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020548	GCGA	2	8	37213	37220	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_020548	AGCG	2	8	37265	37272	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_020548	ACCG	2	8	37478	37485	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_020548	GACC	2	8	44126	44133	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_020548	GCGT	2	8	59861	59868	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_020548	TGGC	2	8	80789	80796	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_020548	GCTT	2	8	80865	80872	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_020548	AATT	2	8	80941	80948	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020548	TCGT	2	8	82555	82562	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_020548	ACAG	2	8	83565	83572	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_020548	AATA	2	8	100168	100175	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020548	AAGC	2	8	106885	106892	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_020548	CATA	2	8	108443	108450	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_020548	GCCG	2	8	111683	111690	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_020548	GGCA	2	8	111828	111835	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_020548	CAAA	2	8	120926	120933	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_020548	CGGA	2	8	121117	121124	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_020548	ACCG	2	8	122554	122561	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_020548	AAGC	2	8	127132	127139	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_020548	CGGC	2	8	128410	128417	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_020548	AGCA	2	8	143049	143056	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_020548	CGAC	2	8	145843	145850	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_020548	GCGG	2	8	147018	147025	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
36	NC_020548	CCAA	2	8	151465	151472	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_020548	CCTG	2	8	151475	151482	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_020548	ACTT	2	8	161095	161102	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_020548	CAAG	2	8	165080	165087	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_020548	CTTC	2	8	165149	165156	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_020548	GCAT	2	8	173966	173973	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_020548	GCCG	2	8	173989	173996	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_020548	CGGG	2	8	174064	174071	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
44	NC_020548	GGGA	2	8	176125	176132	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020548	TTCG	2	8	176236	176243	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_020548	AGGA	2	8	182986	182993	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020548	CCGC	2	8	184848	184855	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
48	NC_020548	GCAT	2	8	185095	185102	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_020548	CAGG	2	8	194410	194417	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_020548	AAGG	2	8	206632	206639	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020548	CAAA	2	8	211592	211599	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_020548	CCAC	2	8	211735	211742	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
53	NC_020548	ATGA	2	8	212864	212871	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020548	AGCC	2	8	213377	213384	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_020548	AAAC	2	8	213474	213481	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_020548	GGCA	2	8	217817	217824	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_020548	CTCG	2	8	217870	217877	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_020548	CAGC	2	8	221210	221217	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_020548	TGCC	2	8	222421	222428	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_020548	TCGA	2	8	227880	227887	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_020548	TCGA	2	8	227923	227930	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_020548	GCCG	2	8	235793	235800	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_020548	TATC	2	8	243796	243803	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_020548	GAAT	2	8	243940	243947	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020548	TCCG	2	8	245351	245358	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_020548	GTCC	2	8	245460	245467	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_020548	CACC	2	8	245569	245576	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
68	NC_020548	CCGC	2	8	245939	245946	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
69	NC_020548	GTGG	2	8	254614	254621	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020548	TGGA	2	8	256623	256630	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020548	CCCT	2	8	268230	268237	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
72	NC_020548	TCGC	2	8	269396	269403	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_020548	GCCC	2	8	269468	269475	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
74	NC_020548	GATT	2	8	276555	276562	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020548	CTGC	2	8	282157	282164	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_020548	CGGG	2	8	284125	284132	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
77	NC_020548	GGGC	2	8	287818	287825	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
78	NC_020548	CAAC	2	8	293370	293377	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_020548	CCTC	2	8	294694	294701	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
80	NC_020548	TCCG	2	8	299707	299714	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
81	NC_020548	GAAG	2	8	299720	299727	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020548	GGCG	2	8	301011	301018	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
83	NC_020548	CCCT	3	12	301061	301072	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
84	NC_020548	TCCC	2	8	307177	307184	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
85	NC_020548	CCCG	2	8	307222	307229	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
86	NC_020548	CGGC	2	8	309078	309085	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_020548	CGGG	2	8	310043	310050	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
88	NC_020548	TCCG	2	8	314094	314101	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
89	NC_020548	GCCT	2	8	314261	314268	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_020548	AATG	2	8	328681	328688	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020548	GTTA	2	8	339930	339937	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020548	GTGA	2	8	343856	343863	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020548	GGAT	2	8	347267	347274	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020548	AACG	2	8	347298	347305	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_020548	AGGC	2	8	348955	348962	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_020548	CAGG	2	8	348998	349005	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_020548	TTCC	2	8	350297	350304	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_020548	ACGG	2	8	355695	355702	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
99	NC_020548	CATC	2	8	355926	355933	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_020548	GCAG	2	8	357177	357184	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_020548	GTAT	2	8	357636	357643	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020548	CCCG	2	8	358204	358211	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
103	NC_020548	TCGC	2	8	362618	362625	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
104	NC_020548	CGGC	2	8	362675	362682	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_020548	ACAT	2	8	366478	366485	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_020548	GACT	2	8	366572	366579	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_020548	GCCC	2	8	368998	369005	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
108	NC_020548	GCAG	2	8	369696	369703	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
109	NC_020548	CGGT	2	8	373284	373291	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
110	NC_020548	TCCT	2	8	376558	376565	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_020548	CCGT	2	8	376722	376729	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
112	NC_020548	CAAG	2	8	376794	376801	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_020548	AAAG	2	8	376816	376823	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020548	CGGC	2	8	384538	384545	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_020548	TGCC	2	8	384613	384620	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_020548	CTCC	2	8	389197	389204	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
117	NC_020548	ATCA	2	8	390330	390337	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_020548	GATG	2	8	393769	393776	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020548	CCGT	2	8	396097	396104	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_020548	CCGA	2	8	396231	396238	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
121	NC_020548	TACT	2	8	400987	400994	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_020548	TCCT	2	8	401408	401415	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_020548	TCTT	2	8	401420	401427	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_020548	CCCT	2	8	401535	401542	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
125	NC_020548	GAGC	2	8	405138	405145	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
126	NC_020548	GGAA	2	8	405192	405199	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020548	GGCC	2	8	405232	405239	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_020548	GCCC	2	8	410700	410707	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
129	NC_020548	TCCG	2	8	411899	411906	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_020548	ACAG	2	8	413768	413775	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_020548	AAAG	2	8	419337	419344	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020548	AGCG	2	8	423485	423492	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_020548	AGCG	2	8	423494	423501	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_020548	AAGG	2	8	443391	443398	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020548	CCGC	2	8	447307	447314	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
136	NC_020548	CCGA	2	8	453177	453184	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
137	NC_020548	AACT	3	12	456370	456381	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_020548	AGTG	2	8	456426	456433	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020548	CGGG	2	8	456716	456723	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
140	NC_020548	CACC	2	8	457366	457373	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
141	NC_020548	TGCC	2	8	457580	457587	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
142	NC_020548	TCGG	2	8	458110	458117	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
143	NC_020548	GCGT	2	8	461506	461513	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
144	NC_020548	TTGG	2	8	466098	466105	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020548	CGAG	2	8	467035	467042	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
146	NC_020548	TGTT	2	8	467235	467242	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_020548	ATCG	2	8	471290	471297	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_020548	CTCG	2	8	474166	474173	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
149	NC_020548	TGTA	2	8	482655	482662	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_020548	CAGC	2	8	482737	482744	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
151	NC_020548	CGAG	2	8	483080	483087	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
152	NC_020548	GCCC	2	8	493581	493588	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
153	NC_020548	AGTG	2	8	495467	495474	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
154	NC_020548	AAGA	2	8	502657	502664	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
155	NC_020548	CCCG	2	8	502707	502714	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
156	NC_020548	TCCC	2	8	502833	502840	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
157	NC_020548	GAAC	2	8	502844	502851	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
158	NC_020548	CATG	2	8	503441	503448	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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160	NC_020548	CAAC	2	8	505148	505155	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
161	NC_020548	CGAA	2	8	515272	515279	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
162	NC_020548	GAAA	2	8	515330	515337	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
163	NC_020548	TTCA	2	8	529231	529238	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
164	NC_020548	AGCG	2	8	529317	529324	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
165	NC_020548	CATC	2	8	529421	529428	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
166	NC_020548	TCCC	2	8	532265	532272	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
167	NC_020548	TTCA	2	8	546028	546035	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
168	NC_020548	CTCG	2	8	553650	553657	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
169	NC_020548	CTGA	2	8	553934	553941	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
170	NC_020548	GCAA	2	8	555128	555135	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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172	NC_020548	CCGT	2	8	559161	559168	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
173	NC_020548	TGGC	2	8	563681	563688	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
174	NC_020548	TCTT	2	8	564404	564411	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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176	NC_020548	CGTC	2	8	564911	564918	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
177	NC_020548	GACT	2	8	565077	565084	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
178	NC_020548	CAGC	2	8	565551	565558	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
179	NC_020548	CCCG	2	8	567314	567321	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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181	NC_020548	GATA	2	8	569482	569489	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
182	NC_020548	TGCT	2	8	591034	591041	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
183	NC_020548	TTGA	2	8	592325	592332	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
184	NC_020548	CATA	2	8	592551	592558	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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186	NC_020548	ATTA	2	8	592686	592693	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_020548	GGGC	2	8	593187	593194	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
188	NC_020548	CAAA	2	8	600194	600201	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
189	NC_020548	GAAG	2	8	600430	600437	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
190	NC_020548	CTTC	2	8	603052	603059	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
191	NC_020548	CTGT	2	8	603082	603089	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
192	NC_020548	TTGG	2	8	618315	618322	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
193	NC_020548	GGAT	2	8	618358	618365	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
194	NC_020548	CGGG	2	8	619503	619510	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
195	NC_020548	TGCG	2	8	619564	619571	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
196	NC_020548	TCCT	2	8	619674	619681	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
197	NC_020548	TGGG	2	8	649182	649189	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
198	NC_020548	GTCT	2	8	656243	656250	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
199	NC_020548	CTTC	2	8	665481	665488	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
200	NC_020548	GACA	2	8	667613	667620	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
201	NC_020548	ACCC	2	8	668613	668620	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
202	NC_020548	GATG	4	16	671713	671728	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
203	NC_020548	ACCG	2	8	671749	671756	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
204	NC_020548	CGAG	2	8	671763	671770	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
205	NC_020548	CCGA	2	8	673075	673082	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
206	NC_020548	CTGG	2	8	673139	673146	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
207	NC_020548	GGAT	2	8	675923	675930	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
208	NC_020548	GACG	2	8	687974	687981	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
209	NC_020548	GTGA	2	8	695286	695293	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
210	NC_020548	CCGG	2	8	695376	695383	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
211	NC_020548	TCGG	2	8	695478	695485	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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213	NC_020548	GCGT	2	8	700820	700827	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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215	NC_020548	TCAA	2	8	704892	704899	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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217	NC_020548	CGAG	2	8	705129	705136	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
218	NC_020548	GTTC	2	8	721161	721168	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
219	NC_020548	ACCG	2	8	725790	725797	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
220	NC_020548	CGAT	2	8	729717	729724	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.