MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Acinetobacter baumannii D1279779

Total Repeats: 224

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020547	AATTTA	2	12	293	304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020547	CAAAAA	2	12	12792	12803	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_020547	GAAATC	2	12	22745	22756	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_020547	AGAAAA	2	12	37795	37806	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020547	ATAAAA	2	12	40052	40063	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020547	AAAAAG	2	12	44546	44557	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020547	TATTTT	2	12	47681	47692	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020547	TCCTGT	2	12	95246	95257	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_020547	TCCTGT	2	12	96426	96437	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_020547	TCCTGT	2	12	96910	96921	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_020547	AATTTA	2	12	107433	107444	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020547	GATATG	2	12	133716	133727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020547	AATTTT	2	12	138845	138856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020547	ATTAAA	2	12	139914	139925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020547	TAATTA	2	12	140478	140489	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020547	ATAAAT	2	12	162200	162211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020547	TTCAAT	2	12	171163	171174	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_020547	ATTGAC	2	12	178430	178441	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_020547	AATTTT	2	12	199333	199344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020547	GAAATC	2	12	203892	203903	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_020547	TTTTTA	2	12	205790	205801	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020547	CAAGTT	2	12	208989	209000	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_020547	TGCTTT	2	12	297360	297371	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_020547	GAGTAG	2	12	307350	307361	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020547	TCAGAA	2	12	334534	334545	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_020547	ATTTTT	2	12	342997	343008	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020547	ACTCAA	2	12	371556	371567	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_020547	TATAAA	2	12	420507	420518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020547	ATTCAT	2	12	435725	435736	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_020547	GTTTTT	2	12	459236	459247	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020547	TCAAAA	2	12	496265	496276	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_020547	TGATAG	2	12	521960	521971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020547	ATATTG	2	12	583472	583483	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020547	ATAAAT	2	12	624203	624214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020547	AGCTTT	2	12	626613	626624	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_020547	ATATGA	2	12	628423	628434	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020547	ATATTT	2	12	677313	677324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020547	GAAATC	2	12	710211	710222	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_020547	TTTTTC	2	12	716022	716033	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_020547	TTAATT	2	12	767147	767158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020547	TTAAAA	2	12	782740	782751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020547	AATTTA	2	12	787984	787995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020547	AAAGAA	2	12	829359	829370	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020547	AATTTA	2	12	868908	868919	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020547	ACCTGT	2	12	875902	875913	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_020547	AACTAT	2	12	925048	925059	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_020547	TAAATA	2	12	994062	994073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020547	ATATTT	2	12	994080	994091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020547	AGAATT	2	12	1058251	1058262	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020547	TTTTAT	2	12	1067658	1067669	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020547	TATTTT	2	12	1072167	1072178	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020547	TTTTAA	2	12	1095795	1095806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020547	ATATTT	2	12	1095989	1096000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020547	CATTAG	2	12	1110358	1110369	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_020547	ATATTG	2	12	1143165	1143176	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020547	TGCCCA	2	12	1145694	1145705	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
57	NC_020547	CAATGT	2	12	1151051	1151062	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_020547	CAATAT	2	12	1214395	1214406	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_020547	CATTAA	2	12	1219883	1219894	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_020547	GTGATT	2	12	1220150	1220161	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020547	GTTTTT	2	12	1239619	1239630	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020547	TTCAGA	2	12	1252384	1252395	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_020547	TGAAAA	2	12	1263660	1263671	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020547	TGCCCA	2	12	1265049	1265060	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
65	NC_020547	TAAAAA	2	12	1285621	1285632	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020547	TAAATA	2	12	1287025	1287036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020547	AAAGTG	2	12	1305999	1306010	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020547	ATAAAA	2	12	1326233	1326244	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020547	AAATTG	2	12	1331522	1331533	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020547	AAAGCA	2	12	1336819	1336830	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_020547	CAATTA	2	12	1338170	1338181	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_020547	TAAAAA	2	12	1343176	1343187	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020547	TTTTAA	2	12	1345146	1345157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020547	TCAATA	2	12	1345172	1345183	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_020547	AAATGT	2	12	1351306	1351317	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020547	CAATTT	2	12	1373438	1373449	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_020547	CTATTC	2	12	1381209	1381220	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_020547	TAATCA	2	12	1381670	1381681	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_020547	ATTGAG	2	12	1381719	1381730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020547	ATTTTA	2	12	1395547	1395558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020547	ATATTG	2	12	1422031	1422042	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020547	ATATTG	2	12	1463905	1463916	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020547	AATTTG	2	12	1464802	1464813	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020547	ATATTG	2	12	1488337	1488348	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020547	TGTTTT	2	12	1494955	1494966	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020547	TGGTCG	2	12	1495558	1495569	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_020547	TAAAAT	2	12	1515384	1515395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020547	TAAGTG	2	12	1540435	1540446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020547	ATATTG	2	12	1544927	1544938	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020547	GATGTT	2	12	1546867	1546878	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020547	TAAAAA	2	12	1548196	1548207	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020547	AAAAAT	2	12	1548352	1548363	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020547	TAAAAA	2	12	1577753	1577764	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020547	AAATAA	2	12	1600109	1600120	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020547	TAATCA	2	12	1609183	1609194	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_020547	TGCTCA	2	12	1611821	1611832	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_020547	CTTGAG	2	12	1636319	1636330	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_020547	ATTTGT	2	12	1658520	1658531	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020547	TAATAT	2	12	1730751	1730762	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020547	ATTGTT	2	12	1741404	1741415	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020547	ATTTTA	2	12	1756890	1756901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020547	ATTATC	2	12	1759107	1759118	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_020547	GCTAGG	2	12	1774415	1774426	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_020547	AATTTA	2	12	1776388	1776399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020547	ATATTG	2	12	1787931	1787942	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020547	TGATTT	2	12	1849688	1849699	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020547	CAATAT	2	12	1891854	1891865	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_020547	ATAAAT	2	12	1928035	1928046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020547	ATATTG	2	12	1963948	1963959	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020547	ATTTTT	2	12	1982092	1982103	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020547	TAATTT	2	12	2078841	2078852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020547	CATAGC	2	12	2089885	2089896	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_020547	CAATAT	2	12	2095367	2095378	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_020547	TTTAAA	2	12	2103517	2103528	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020547	TTTAAT	2	12	2129916	2129927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020547	AATTAA	2	12	2133688	2133699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020547	TCATTA	2	12	2135920	2135931	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_020547	CTGAAA	2	12	2184555	2184566	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_020547	AATAAA	2	12	2184599	2184610	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020547	ATTAAT	2	12	2184765	2184776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020547	CAATAT	2	12	2195492	2195503	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_020547	TTTTTA	2	12	2229122	2229133	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020547	ATATTG	2	12	2233565	2233576	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020547	GTATAT	2	12	2239829	2239840	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020547	ATATTG	2	12	2256783	2256794	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020547	AATAAA	2	12	2257676	2257687	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020547	AATAAA	2	12	2260695	2260706	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020547	AAATTT	2	12	2291070	2291081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.