MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Streptomyces davawensis JCM 4913 plasmid pSDA1

Total Repeats: 68

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020545	GCCCTG	2	12	740	751	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	471327981
2	NC_020545	CACCGA	2	12	2280	2291	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	471327982
3	NC_020545	GGGCGA	2	12	3333	3344	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	471327982
4	NC_020545	GGACTG	2	12	3456	3467	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	471327982
5	NC_020545	GGGGGC	2	12	4704	4715	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	471327983
6	NC_020545	CCGACT	2	12	5120	5131	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	471327983
7	NC_020545	TGACCG	2	12	6645	6656	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	471327985
8	NC_020545	GGGCCG	2	12	8287	8298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471327988
9	NC_020545	GGGGGC	2	12	10222	10233	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	471327991
10	NC_020545	CCGGGG	2	12	10374	10385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471327991
11	NC_020545	GTCGGC	2	12	13046	13057	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	471327995
12	NC_020545	ACACCG	2	12	15976	15987	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	471327997
13	NC_020545	CCGGGA	2	12	19802	19813	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	471328002
14	NC_020545	ACGGCG	2	12	21095	21106	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	471328006
15	NC_020545	CCGCAC	2	12	21499	21510	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	471328006
16	NC_020545	CGAGCC	2	12	23780	23791	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	471328009
17	NC_020545	GGTCGG	2	12	25365	25376	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	471328011
18	NC_020545	GCTGGG	2	12	26634	26645	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	471328013
19	NC_020545	GGATGC	2	12	26999	27010	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	471328014
20	NC_020545	GGGCCG	2	12	27580	27591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471328015
21	NC_020545	GCCCGG	2	12	27645	27656	0 %	0 %	50 %	50 %	471328015
22	NC_020545	CTTCGG	2	12	27688	27699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471328015
23	NC_020545	GGCGTT	2	12	28049	28060	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	471328015
24	NC_020545	CGGGCA	2	12	28905	28916	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	471328018
25	NC_020545	CCGGGC	2	12	29757	29768	0 %	0 %	50 %	50 %	471328019
26	NC_020545	CCTCGC	2	12	30936	30947	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	471328022
27	NC_020545	CCGGAT	2	12	31186	31197	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	471328022
28	NC_020545	GACGTC	2	12	33715	33726	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	471328026
29	NC_020545	CTTCAT	2	12	34259	34270	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	471328027
30	NC_020545	TGCCGA	2	12	34564	34575	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	471328028
31	NC_020545	TGCGGG	2	12	35182	35193	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	471328029
32	NC_020545	TGGCGG	2	12	35308	35319	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	471328029
33	NC_020545	GCCCTC	2	12	36447	36458	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	471328032
34	NC_020545	TCCGGC	2	12	39593	39604	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	471328034
35	NC_020545	GCGCCG	2	12	39805	39816	0 %	0 %	50 %	50 %	471328034
36	NC_020545	CCTTGG	2	12	39966	39977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471328034
37	NC_020545	GTCGGC	2	12	40699	40710	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	471328034
38	NC_020545	TCAGCG	2	12	43049	43060	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	471328037
39	NC_020545	GGCGCG	2	12	44598	44609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471328038
40	NC_020545	CTGGGG	2	12	44787	44798	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	471328038
41	NC_020545	CTTCGG	2	12	46426	46437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471328042
42	NC_020545	GTGAGC	2	12	50435	50446	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	471328046
43	NC_020545	GATGGC	2	12	51269	51280	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	471328047
44	NC_020545	GTACCC	2	12	52372	52383	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	471328048
45	NC_020545	GTGAAG	2	12	53260	53271	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	471328049
46	NC_020545	GGCACG	2	12	53434	53445	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	471328049
47	NC_020545	CCGGGC	2	12	55637	55648	0 %	0 %	50 %	50 %	471328050
48	NC_020545	AGGCCG	2	12	60227	60238	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	471328057
49	NC_020545	GGGCGC	2	12	66774	66785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471328066
50	NC_020545	CGACGT	2	12	71918	71929	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	471328069
51	NC_020545	GAAGGT	2	12	72942	72953	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	471328069
52	NC_020545	GAGTAG	2	12	73726	73737	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	471328069
53	NC_020545	CGCCCG	2	12	74040	74051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471328070
54	NC_020545	CCTACG	2	12	75992	76003	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	471328073
55	NC_020545	CGGCTC	2	12	76373	76384	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	471328073
56	NC_020545	TTGAGT	2	12	76391	76402	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	471328073
57	NC_020545	CGGTGG	2	12	78501	78512	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	471328076
58	NC_020545	CCGGGC	2	12	78941	78952	0 %	0 %	50 %	50 %	471328076
59	NC_020545	TCACGC	2	12	80290	80301	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	471328078
60	NC_020545	GACGCC	2	12	83271	83282	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	471328083
61	NC_020545	CGGGTG	2	12	83999	84010	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	471328084
62	NC_020545	CGAGGC	2	12	84308	84319	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	471328085
63	NC_020545	GGCTGG	2	12	84438	84449	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	471328085
64	NC_020545	CACGGT	2	12	85981	85992	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	471328087
65	NC_020545	GCCGAG	2	12	86327	86338	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	471328088
66	NC_020545	CCAGCT	2	12	87533	87544	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	471328091
67	NC_020545	CAGGTC	2	12	87678	87689	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	471328091
68	NC_020545	GCTTGC	2	12	88264	88275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471328092

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.