MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Streptomyces davawensis JCM 4913 plasmid pSDA1

Total Repeats: 75

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020545	CGGGC	2	10	79	88	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
2	NC_020545	GCGCA	2	10	311	320	20 %	0 %	40 %	40 %	471327981
3	NC_020545	GACGA	2	10	2293	2302	40 %	0 %	40 %	20 %	471327982
4	NC_020545	CCGCC	2	10	4319	4328	0 %	0 %	20 %	80 %	471327982
5	NC_020545	TCCGA	2	10	6605	6614	20 %	20 %	20 %	40 %	471327985
6	NC_020545	CTGGA	2	10	6713	6722	20 %	20 %	40 %	20 %	471327985
7	NC_020545	ACCGG	2	10	7019	7028	20 %	0 %	40 %	40 %	471327985
8	NC_020545	TGTTC	2	10	7703	7712	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_020545	GCCCG	2	10	13750	13759	0 %	0 %	40 %	60 %	471327996
10	NC_020545	CCGGT	2	10	13871	13880	0 %	20 %	40 %	40 %	471327996
11	NC_020545	GCCGC	2	10	17447	17456	0 %	0 %	40 %	60 %	471328000
12	NC_020545	CGAGC	2	10	18520	18529	20 %	0 %	40 %	40 %	471328001
13	NC_020545	CGGTG	2	10	20244	20253	0 %	20 %	60 %	20 %	471328004
14	NC_020545	CGCGC	2	10	21433	21442	0 %	0 %	40 %	60 %	471328006
15	NC_020545	CGGCA	2	10	24623	24632	20 %	0 %	40 %	40 %	471328010
16	NC_020545	TGAGC	2	10	25213	25222	20 %	20 %	40 %	20 %	471328010
17	NC_020545	TGCCC	2	10	26004	26013	0 %	20 %	20 %	60 %	471328012
18	NC_020545	TCGGG	2	10	26761	26770	0 %	20 %	60 %	20 %	471328014
19	NC_020545	GTCGC	2	10	27716	27725	0 %	20 %	40 %	40 %	471328015
20	NC_020545	TCGTG	2	10	27781	27790	0 %	40 %	40 %	20 %	471328015
21	NC_020545	CTCGT	2	10	29954	29963	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
22	NC_020545	GCCGG	2	10	30123	30132	0 %	0 %	60 %	40 %	471328020
23	NC_020545	CGGCC	2	10	30251	30260	0 %	0 %	40 %	60 %	471328020
24	NC_020545	CCCGG	2	10	30392	30401	0 %	0 %	40 %	60 %	471328020
25	NC_020545	ACCGC	2	10	31580	31589	20 %	0 %	20 %	60 %	471328022
26	NC_020545	GCTCG	2	10	31847	31856	0 %	20 %	40 %	40 %	471328023
27	NC_020545	CGGGG	2	10	32446	32455	0 %	0 %	80 %	20 %	471328025
28	NC_020545	CCAGG	2	10	33093	33102	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
29	NC_020545	CGGGG	2	10	33979	33988	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
30	NC_020545	GGGTG	2	10	34069	34078	0 %	20 %	80 %	0 %	471328027
31	NC_020545	TGCCG	2	10	34897	34906	0 %	20 %	40 %	40 %	471328028
32	NC_020545	AGGCC	2	10	35377	35386	20 %	0 %	40 %	40 %	471328029
33	NC_020545	GGTGG	2	10	35552	35561	0 %	20 %	80 %	0 %	471328029
34	NC_020545	CACCG	2	10	35832	35841	20 %	0 %	20 %	60 %	471328030
35	NC_020545	CGGGT	2	10	36257	36266	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
36	NC_020545	GCGGG	2	10	38078	38087	0 %	0 %	80 %	20 %	471328032
37	NC_020545	AGGCG	2	10	38414	38423	20 %	0 %	60 %	20 %	471328032
38	NC_020545	CCGGC	2	10	39740	39749	0 %	0 %	40 %	60 %	471328034
39	NC_020545	CCGGC	2	10	39782	39791	0 %	0 %	40 %	60 %	471328034
40	NC_020545	CGGCG	2	10	40053	40062	0 %	0 %	60 %	40 %	471328034
41	NC_020545	TGCCG	2	10	40154	40163	0 %	20 %	40 %	40 %	471328034
42	NC_020545	CGCGG	2	10	40753	40762	0 %	0 %	60 %	40 %	471328034
43	NC_020545	CCTCC	2	10	41223	41232	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
44	NC_020545	GCCTG	2	10	41935	41944	0 %	20 %	40 %	40 %	471328036
45	NC_020545	CAGGT	2	10	42244	42253	20 %	20 %	40 %	20 %	471328037
46	NC_020545	TGTGC	2	10	44435	44444	0 %	40 %	40 %	20 %	471328038
47	NC_020545	TGCGG	2	10	45425	45434	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
48	NC_020545	GGCAG	2	10	46281	46290	20 %	0 %	60 %	20 %	471328042
49	NC_020545	CAGGC	2	10	46325	46334	20 %	0 %	40 %	40 %	471328042
50	NC_020545	GCGGG	2	10	46383	46392	0 %	0 %	80 %	20 %	471328042
51	NC_020545	CTGCG	2	10	46904	46913	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
52	NC_020545	GCGCA	2	10	47283	47292	20 %	0 %	40 %	40 %	471328043
53	NC_020545	TGGGG	2	10	48247	48256	0 %	20 %	80 %	0 %	471328044
54	NC_020545	GTGCG	2	10	49046	49055	0 %	20 %	60 %	20 %	471328044
55	NC_020545	GTCGG	2	10	49366	49375	0 %	20 %	60 %	20 %	471328045
56	NC_020545	CCAGC	2	10	52777	52786	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
57	NC_020545	CGCTG	2	10	54726	54735	0 %	20 %	40 %	40 %	471328049
58	NC_020545	CGGGA	2	10	54796	54805	20 %	0 %	60 %	20 %	471328049
59	NC_020545	ACCGC	2	10	56809	56818	20 %	0 %	20 %	60 %	471328051
60	NC_020545	CGCCC	2	10	57147	57156	0 %	0 %	20 %	80 %	471328051
61	NC_020545	TGACA	2	10	59332	59341	40 %	20 %	20 %	20 %	471328056
62	NC_020545	CCCAG	2	10	67083	67092	20 %	0 %	20 %	60 %	471328066
63	NC_020545	CGGTG	2	10	67411	67420	0 %	20 %	60 %	20 %	471328066
64	NC_020545	AGCGC	2	10	70046	70055	20 %	0 %	40 %	40 %	471328068
65	NC_020545	CCGGG	2	10	72155	72164	0 %	0 %	60 %	40 %	471328069
66	NC_020545	GGAAA	2	10	75511	75520	60 %	0 %	40 %	0 %	471328072
67	NC_020545	CGGCA	2	10	75677	75686	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
68	NC_020545	GCTGG	2	10	75717	75726	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
69	NC_020545	GCCAT	2	10	77427	77436	20 %	20 %	20 %	40 %	471328074
70	NC_020545	CGGCC	2	10	79246	79255	0 %	0 %	40 %	60 %	471328076
71	NC_020545	AGCCC	2	10	81967	81976	20 %	0 %	20 %	60 %	471328081
72	NC_020545	GCGGA	2	10	82512	82521	20 %	0 %	60 %	20 %	471328082
73	NC_020545	CGGAA	2	10	85233	85242	40 %	0 %	40 %	20 %	471328086
74	NC_020545	GCAGC	2	10	87201	87210	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
75	NC_020545	GCCCG	2	10	89244	89253	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.