MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Streptomyces davawensis JCM 4913 plasmid pSDA1

Total Repeats: 289

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020545	TCGT	2	8	112	119	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_020545	CGGG	2	8	199	206	0 %	0 %	75 %	25 %	471327981
3	NC_020545	CGGT	2	8	371	378	0 %	25 %	50 %	25 %	471327981
4	NC_020545	TCGT	2	8	1148	1155	0 %	50 %	25 %	25 %	471327981
5	NC_020545	GATG	2	8	1277	1284	25 %	25 %	50 %	0 %	471327981
6	NC_020545	GGCG	2	8	1523	1530	0 %	0 %	75 %	25 %	471327982
7	NC_020545	GGCG	2	8	1752	1759	0 %	0 %	75 %	25 %	471327982
8	NC_020545	TCGC	2	8	1795	1802	0 %	25 %	25 %	50 %	471327982
9	NC_020545	TGGC	2	8	2011	2018	0 %	25 %	50 %	25 %	471327982
10	NC_020545	GGCC	2	8	2364	2371	0 %	0 %	50 %	50 %	471327982
11	NC_020545	AGCG	2	8	2428	2435	25 %	0 %	50 %	25 %	471327982
12	NC_020545	ACCG	2	8	3002	3009	25 %	0 %	25 %	50 %	471327982
13	NC_020545	GGCG	2	8	3053	3060	0 %	0 %	75 %	25 %	471327982
14	NC_020545	GGTG	2	8	3143	3150	0 %	25 %	75 %	0 %	471327982
15	NC_020545	GCGG	2	8	4619	4626	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16	NC_020545	GGCG	2	8	4844	4851	0 %	0 %	75 %	25 %	471327983
17	NC_020545	GCGT	2	8	4914	4921	0 %	25 %	50 %	25 %	471327983
18	NC_020545	CTGC	2	8	5644	5651	0 %	25 %	25 %	50 %	471327984
19	NC_020545	CCCA	3	12	6010	6021	25 %	0 %	0 %	75 %	471327984
20	NC_020545	CGGG	2	8	6120	6127	0 %	0 %	75 %	25 %	471327984
21	NC_020545	GCGG	2	8	6141	6148	0 %	0 %	75 %	25 %	471327984
22	NC_020545	AGCG	2	8	6310	6317	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_020545	CGGA	2	8	6511	6518	25 %	0 %	50 %	25 %	471327985
24	NC_020545	GGCC	2	8	6631	6638	0 %	0 %	50 %	50 %	471327985
25	NC_020545	CGCC	2	8	6682	6689	0 %	0 %	25 %	75 %	471327985
26	NC_020545	CCGA	2	8	6934	6941	25 %	0 %	25 %	50 %	471327985
27	NC_020545	GCAG	2	8	8180	8187	25 %	0 %	50 %	25 %	471327988
28	NC_020545	ATCG	2	8	8258	8265	25 %	25 %	25 %	25 %	471327988
29	NC_020545	CGTC	2	8	8323	8330	0 %	25 %	25 %	50 %	471327988
30	NC_020545	CGTT	2	8	8453	8460	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_020545	CGTT	2	8	8547	8554	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_020545	CCGG	2	8	8587	8594	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_020545	GGCG	2	8	9072	9079	0 %	0 %	75 %	25 %	471327989
34	NC_020545	GGGT	2	8	9611	9618	0 %	25 %	75 %	0 %	471327990
35	NC_020545	GGCG	2	8	9798	9805	0 %	0 %	75 %	25 %	471327991
36	NC_020545	GAGG	2	8	9940	9947	25 %	0 %	75 %	0 %	471327991
37	NC_020545	CGGC	2	8	10140	10147	0 %	0 %	50 %	50 %	471327991
38	NC_020545	GGCG	2	8	10575	10582	0 %	0 %	75 %	25 %	471327991
39	NC_020545	GTCC	2	8	11089	11096	0 %	25 %	25 %	50 %	471327992
40	NC_020545	TGCG	2	8	11223	11230	0 %	25 %	50 %	25 %	471327992
41	NC_020545	GGCG	2	8	11646	11653	0 %	0 %	75 %	25 %	471327993
42	NC_020545	GCGG	2	8	11677	11684	0 %	0 %	75 %	25 %	471327993
43	NC_020545	TCCT	2	8	12608	12615	0 %	50 %	0 %	50 %	471327995
44	NC_020545	CCGG	2	8	12785	12792	0 %	0 %	50 %	50 %	471327995
45	NC_020545	GGGC	2	8	13288	13295	0 %	0 %	75 %	25 %	471327995
46	NC_020545	GCCG	2	8	13443	13450	0 %	0 %	50 %	50 %	471327995
47	NC_020545	GGGC	2	8	13554	13561	0 %	0 %	75 %	25 %	471327996
48	NC_020545	GCCG	2	8	13934	13941	0 %	0 %	50 %	50 %	471327996
49	NC_020545	CGCC	2	8	14569	14576	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
50	NC_020545	CCCG	2	8	14840	14847	0 %	0 %	25 %	75 %	471327997
51	NC_020545	GCTG	2	8	14875	14882	0 %	25 %	50 %	25 %	471327997
52	NC_020545	CAGC	2	8	15349	15356	25 %	0 %	25 %	50 %	471327997
53	NC_020545	CGTG	2	8	15622	15629	0 %	25 %	50 %	25 %	471327997
54	NC_020545	CGCC	2	8	15932	15939	0 %	0 %	25 %	75 %	471327997
55	NC_020545	GTCC	2	8	16792	16799	0 %	25 %	25 %	50 %	471327999
56	NC_020545	GGGC	2	8	17205	17212	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
57	NC_020545	TCGC	2	8	18050	18057	0 %	25 %	25 %	50 %	471328000
58	NC_020545	CGCA	2	8	18966	18973	25 %	0 %	25 %	50 %	471328001
59	NC_020545	GGCG	2	8	19087	19094	0 %	0 %	75 %	25 %	471328001
60	NC_020545	CGTC	2	8	19237	19244	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_020545	TGGC	2	8	19433	19440	0 %	25 %	50 %	25 %	471328002
62	NC_020545	CGTG	2	8	19451	19458	0 %	25 %	50 %	25 %	471328002
63	NC_020545	GCCC	2	8	20030	20037	0 %	0 %	25 %	75 %	471328003
64	NC_020545	CGCT	2	8	20057	20064	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_020545	CGGG	2	8	20086	20093	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
66	NC_020545	GTCG	2	8	20223	20230	0 %	25 %	50 %	25 %	471328004
67	NC_020545	TTGC	2	8	20648	20655	0 %	50 %	25 %	25 %	471328005
68	NC_020545	GGCC	2	8	21368	21375	0 %	0 %	50 %	50 %	471328006
69	NC_020545	AGCG	2	8	21617	21624	25 %	0 %	50 %	25 %	471328006
70	NC_020545	GGGC	2	8	21640	21647	0 %	0 %	75 %	25 %	471328006
71	NC_020545	GCCA	2	8	22265	22272	25 %	0 %	25 %	50 %	471328006
72	NC_020545	CGGG	2	8	22509	22516	0 %	0 %	75 %	25 %	471328006
73	NC_020545	CGGG	2	8	22700	22707	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
74	NC_020545	CCAT	2	8	23033	23040	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_020545	GACA	2	8	23175	23182	50 %	0 %	25 %	25 %	471328008
76	NC_020545	CGTG	2	8	23289	23296	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_020545	GAGG	2	8	24718	24725	25 %	0 %	75 %	0 %	471328010
78	NC_020545	AGCC	2	8	24888	24895	25 %	0 %	25 %	50 %	471328010
79	NC_020545	CTGC	2	8	25130	25137	0 %	25 %	25 %	50 %	471328010
80	NC_020545	CGGA	2	8	25175	25182	25 %	0 %	50 %	25 %	471328010
81	NC_020545	GCGT	2	8	25529	25536	0 %	25 %	50 %	25 %	471328011
82	NC_020545	CCGG	2	8	26441	26448	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_020545	TCGT	2	8	27121	27128	0 %	50 %	25 %	25 %	471328014
84	NC_020545	GCCT	2	8	27630	27637	0 %	25 %	25 %	50 %	471328015
85	NC_020545	CCGC	2	8	27940	27947	0 %	0 %	25 %	75 %	471328015
86	NC_020545	TGCG	2	8	28195	28202	0 %	25 %	50 %	25 %	471328015
87	NC_020545	GCGG	2	8	28249	28256	0 %	0 %	75 %	25 %	471328015
88	NC_020545	GGCG	2	8	28468	28475	0 %	0 %	75 %	25 %	471328016
89	NC_020545	GCTG	2	8	28738	28745	0 %	25 %	50 %	25 %	471328017
90	NC_020545	GGCG	2	8	29019	29026	0 %	0 %	75 %	25 %	471328018
91	NC_020545	CAGG	2	8	29244	29251	25 %	0 %	50 %	25 %	471328018
92	NC_020545	CCGA	2	8	29452	29459	25 %	0 %	25 %	50 %	471328019
93	NC_020545	GACG	2	8	29598	29605	25 %	0 %	50 %	25 %	471328019
94	NC_020545	TGGG	2	8	29970	29977	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020545	CGGC	2	8	30088	30095	0 %	0 %	50 %	50 %	471328020
96	NC_020545	CCGG	2	8	30155	30162	0 %	0 %	50 %	50 %	471328020
97	NC_020545	GTCC	2	8	30179	30186	0 %	25 %	25 %	50 %	471328020
98	NC_020545	TGCG	2	8	30480	30487	0 %	25 %	50 %	25 %	471328021
99	NC_020545	CGGG	2	8	31904	31911	0 %	0 %	75 %	25 %	471328023
100	NC_020545	GGCC	2	8	32264	32271	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_020545	GCAG	2	8	33387	33394	25 %	0 %	50 %	25 %	471328026
102	NC_020545	GCGG	2	8	34019	34026	0 %	0 %	75 %	25 %	471328027
103	NC_020545	AGGA	2	8	34119	34126	50 %	0 %	50 %	0 %	471328027
104	NC_020545	CGGG	2	8	35503	35510	0 %	0 %	75 %	25 %	471328029
105	NC_020545	GGGT	2	8	35821	35828	0 %	25 %	75 %	0 %	471328030
106	NC_020545	GCGA	2	8	36072	36079	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_020545	GCCG	2	8	36270	36277	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_020545	CGGG	2	8	36282	36289	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
109	NC_020545	CGCC	2	8	36403	36410	0 %	0 %	25 %	75 %	471328032
110	NC_020545	GCCG	2	8	36419	36426	0 %	0 %	50 %	50 %	471328032
111	NC_020545	AGCG	2	8	36619	36626	25 %	0 %	50 %	25 %	471328032
112	NC_020545	CCGG	2	8	36913	36920	0 %	0 %	50 %	50 %	471328032
113	NC_020545	AGCG	2	8	37147	37154	25 %	0 %	50 %	25 %	471328032
114	NC_020545	GTCC	2	8	37250	37257	0 %	25 %	25 %	50 %	471328032
115	NC_020545	GTCC	2	8	37695	37702	0 %	25 %	25 %	50 %	471328032
116	NC_020545	TCCA	2	8	37765	37772	25 %	25 %	0 %	50 %	471328032
117	NC_020545	TGCG	2	8	37960	37967	0 %	25 %	50 %	25 %	471328032
118	NC_020545	GCCG	2	8	38148	38155	0 %	0 %	50 %	50 %	471328032
119	NC_020545	CCAG	2	8	38183	38190	25 %	0 %	25 %	50 %	471328032
120	NC_020545	GTGG	2	8	38517	38524	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020545	GAGG	2	8	38829	38836	25 %	0 %	75 %	0 %	471328033
122	NC_020545	TGCG	2	8	39004	39011	0 %	25 %	50 %	25 %	471328034
123	NC_020545	GGTC	2	8	39427	39434	0 %	25 %	50 %	25 %	471328034
124	NC_020545	GCCC	2	8	39709	39716	0 %	0 %	25 %	75 %	471328034
125	NC_020545	GCCT	2	8	39886	39893	0 %	25 %	25 %	50 %	471328034
126	NC_020545	CCGT	2	8	39947	39954	0 %	25 %	25 %	50 %	471328034
127	NC_020545	GCCG	2	8	40012	40019	0 %	0 %	50 %	50 %	471328034
128	NC_020545	GTCC	2	8	40663	40670	0 %	25 %	25 %	50 %	471328034
129	NC_020545	CCAG	2	8	40899	40906	25 %	0 %	25 %	50 %	471328034
130	NC_020545	GACA	2	8	41242	41249	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_020545	CGCC	2	8	41417	41424	0 %	0 %	25 %	75 %	471328035
132	NC_020545	CAGC	2	8	41598	41605	25 %	0 %	25 %	50 %	471328035
133	NC_020545	TCCT	2	8	41796	41803	0 %	50 %	0 %	50 %	471328036
134	NC_020545	GGGT	2	8	42236	42243	0 %	25 %	75 %	0 %	471328037
135	NC_020545	GACG	2	8	42268	42275	25 %	0 %	50 %	25 %	471328037
136	NC_020545	GCGG	2	8	42748	42755	0 %	0 %	75 %	25 %	471328037
137	NC_020545	CCGG	2	8	42787	42794	0 %	0 %	50 %	50 %	471328037
138	NC_020545	CCGT	2	8	42826	42833	0 %	25 %	25 %	50 %	471328037
139	NC_020545	CGTC	2	8	42853	42860	0 %	25 %	25 %	50 %	471328037
140	NC_020545	CCGT	2	8	42892	42899	0 %	25 %	25 %	50 %	471328037
141	NC_020545	CCCG	2	8	42987	42994	0 %	0 %	25 %	75 %	471328037
142	NC_020545	GCTC	2	8	44519	44526	0 %	25 %	25 %	50 %	471328038
143	NC_020545	GCGT	2	8	44656	44663	0 %	25 %	50 %	25 %	471328038
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282	NC_020545	CGCC	2	8	86627	86634	0 %	0 %	25 %	75 %	471328089
283	NC_020545	CGCC	2	8	87085	87092	0 %	0 %	25 %	75 %	471328090
284	NC_020545	CGCT	2	8	87330	87337	0 %	25 %	25 %	50 %	471328091
285	NC_020545	GGCC	2	8	87473	87480	0 %	0 %	50 %	50 %	471328091
286	NC_020545	CCGG	2	8	88333	88340	0 %	0 %	50 %	50 %	471328092
287	NC_020545	TGGC	2	8	88930	88937	0 %	25 %	50 %	25 %	471328093
288	NC_020545	ATGC	2	8	89188	89195	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
289	NC_020545	ACGA	2	8	89213	89220	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.