MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptomyces davawensis JCM 4913 plasmid pSDA1

Total Repeats: 52

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020545	TCGT	2	8	112	119	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_020545	GCGG	2	8	4619	4626	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3	NC_020545	AGCG	2	8	6310	6317	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_020545	CGTT	2	8	8453	8460	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_020545	CGTT	2	8	8547	8554	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_020545	CCGG	2	8	8587	8594	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_020545	CGCC	2	8	14569	14576	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8	NC_020545	GGGC	2	8	17205	17212	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
9	NC_020545	CGTC	2	8	19237	19244	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_020545	CGCT	2	8	20057	20064	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_020545	CGGG	2	8	20086	20093	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12	NC_020545	CGGG	2	8	22700	22707	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13	NC_020545	CCAT	2	8	23033	23040	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_020545	CGTG	2	8	23289	23296	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_020545	CCGG	2	8	26441	26448	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_020545	TGGG	2	8	29970	29977	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020545	GGCC	2	8	32264	32271	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_020545	GCGA	2	8	36072	36079	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_020545	GCCG	2	8	36270	36277	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_020545	CGGG	2	8	36282	36289	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
21	NC_020545	GTGG	2	8	38517	38524	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020545	GACA	2	8	41242	41249	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_020545	GGCC	2	8	45351	45358	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_020545	GACG	2	8	46886	46893	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_020545	CCAG	2	8	46935	46942	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_020545	AGCA	2	8	47225	47232	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_020545	GGGC	2	8	49979	49986	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
28	NC_020545	GTCG	2	8	50100	50107	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_020545	GGGC	2	8	51976	51983	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
30	NC_020545	GCCC	2	8	52640	52647	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
31	NC_020545	ACGA	2	8	52940	52947	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_020545	CGGG	2	8	53027	53034	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
33	NC_020545	CGAG	2	8	57632	57639	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_020545	ACGG	2	8	59165	59172	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_020545	CGGC	2	8	59543	59550	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_020545	GCCG	2	8	59560	59567	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_020545	GGCA	2	8	61741	61748	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_020545	TGCC	2	8	65043	65050	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_020545	GCCT	2	8	69249	69256	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_020545	CGAT	2	8	71469	71476	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_020545	TGAT	2	8	71504	71511	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020545	GGGT	2	8	71515	71522	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020545	TGCC	2	8	76413	76420	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_020545	CAGC	2	8	77731	77738	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_020545	AGGG	2	8	77911	77918	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020545	GCTC	2	8	80568	80575	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_020545	GGCG	2	8	80635	80642	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
48	NC_020545	CAGG	2	8	81045	81052	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_020545	CGGG	2	8	86126	86133	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
50	NC_020545	TCCC	2	8	86225	86232	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
51	NC_020545	ATGC	2	8	89188	89195	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_020545	ACGA	2	8	89213	89220	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.