MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Streptomyces davawensis JCM 4913 plasmid pSDA1

Total Repeats: 181

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020545	GC	3	6	509	514	0 %	0 %	50 %	50 %	471327981
2	NC_020545	GC	3	6	1442	1447	0 %	0 %	50 %	50 %	471327982
3	NC_020545	CT	3	6	1677	1682	0 %	50 %	0 %	50 %	471327982
4	NC_020545	GC	4	8	3426	3433	0 %	0 %	50 %	50 %	471327982
5	NC_020545	CG	4	8	3704	3711	0 %	0 %	50 %	50 %	471327982
6	NC_020545	CG	3	6	3806	3811	0 %	0 %	50 %	50 %	471327982
7	NC_020545	CG	3	6	3889	3894	0 %	0 %	50 %	50 %	471327982
8	NC_020545	GC	3	6	4117	4122	0 %	0 %	50 %	50 %	471327982
9	NC_020545	AC	3	6	4486	4491	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_020545	AG	3	6	4500	4505	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020545	TC	3	6	4530	4535	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_020545	TG	3	6	4731	4736	0 %	50 %	50 %	0 %	471327983
13	NC_020545	CG	3	6	5401	5406	0 %	0 %	50 %	50 %	471327984
14	NC_020545	GT	3	6	5594	5599	0 %	50 %	50 %	0 %	471327984
15	NC_020545	CG	5	10	5935	5944	0 %	0 %	50 %	50 %	471327984
16	NC_020545	CG	4	8	5955	5962	0 %	0 %	50 %	50 %	471327984
17	NC_020545	CG	3	6	6271	6276	0 %	0 %	50 %	50 %	471327984
18	NC_020545	TG	3	6	6700	6705	0 %	50 %	50 %	0 %	471327985
19	NC_020545	GC	3	6	7057	7062	0 %	0 %	50 %	50 %	471327985
20	NC_020545	CG	3	6	7336	7341	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_020545	GC	3	6	8800	8805	0 %	0 %	50 %	50 %	471327989
22	NC_020545	CG	3	6	9478	9483	0 %	0 %	50 %	50 %	471327990
23	NC_020545	GC	3	6	9764	9769	0 %	0 %	50 %	50 %	471327991
24	NC_020545	GT	4	8	9909	9916	0 %	50 %	50 %	0 %	471327991
25	NC_020545	GC	3	6	10689	10694	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_020545	CG	3	6	11045	11050	0 %	0 %	50 %	50 %	471327992
27	NC_020545	GC	3	6	11371	11376	0 %	0 %	50 %	50 %	471327992
28	NC_020545	GC	3	6	11543	11548	0 %	0 %	50 %	50 %	471327993
29	NC_020545	GC	3	6	11625	11630	0 %	0 %	50 %	50 %	471327993
30	NC_020545	CG	4	8	12434	12441	0 %	0 %	50 %	50 %	471327994
31	NC_020545	CG	3	6	13607	13612	0 %	0 %	50 %	50 %	471327996
32	NC_020545	GC	3	6	13680	13685	0 %	0 %	50 %	50 %	471327996
33	NC_020545	CG	3	6	14127	14132	0 %	0 %	50 %	50 %	471327996
34	NC_020545	CG	4	8	15890	15897	0 %	0 %	50 %	50 %	471327997
35	NC_020545	GC	3	6	16143	16148	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_020545	CG	3	6	17095	17100	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_020545	CG	3	6	17306	17311	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_020545	CG	4	8	18180	18187	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_020545	GA	3	6	19055	19060	50 %	0 %	50 %	0 %	471328001
40	NC_020545	CG	3	6	20195	20200	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_020545	CG	4	8	20280	20287	0 %	0 %	50 %	50 %	471328004
42	NC_020545	GC	3	6	20549	20554	0 %	0 %	50 %	50 %	471328005
43	NC_020545	CG	3	6	20765	20770	0 %	0 %	50 %	50 %	471328005
44	NC_020545	CG	3	6	21105	21110	0 %	0 %	50 %	50 %	471328006
45	NC_020545	CG	3	6	21136	21141	0 %	0 %	50 %	50 %	471328006
46	NC_020545	CG	3	6	21255	21260	0 %	0 %	50 %	50 %	471328006
47	NC_020545	GC	3	6	21269	21274	0 %	0 %	50 %	50 %	471328006
48	NC_020545	CG	3	6	21843	21848	0 %	0 %	50 %	50 %	471328006
49	NC_020545	AG	3	6	21903	21908	50 %	0 %	50 %	0 %	471328006
50	NC_020545	GC	3	6	23738	23743	0 %	0 %	50 %	50 %	471328009
51	NC_020545	CG	3	6	23809	23814	0 %	0 %	50 %	50 %	471328009
52	NC_020545	CA	3	6	24785	24790	50 %	0 %	0 %	50 %	471328010
53	NC_020545	GC	4	8	24975	24982	0 %	0 %	50 %	50 %	471328010
54	NC_020545	GC	3	6	26555	26560	0 %	0 %	50 %	50 %	471328013
55	NC_020545	CG	3	6	27265	27270	0 %	0 %	50 %	50 %	471328014
56	NC_020545	GC	3	6	28893	28898	0 %	0 %	50 %	50 %	471328018
57	NC_020545	GC	3	6	28953	28958	0 %	0 %	50 %	50 %	471328018
58	NC_020545	CG	3	6	29301	29306	0 %	0 %	50 %	50 %	471328019
59	NC_020545	GC	3	6	29920	29925	0 %	0 %	50 %	50 %	471328019
60	NC_020545	CG	4	8	30188	30195	0 %	0 %	50 %	50 %	471328020
61	NC_020545	TC	3	6	30361	30366	0 %	50 %	0 %	50 %	471328020
62	NC_020545	GC	3	6	31311	31316	0 %	0 %	50 %	50 %	471328022
63	NC_020545	GC	3	6	32380	32385	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_020545	GC	4	8	33585	33592	0 %	0 %	50 %	50 %	471328026
65	NC_020545	GC	3	6	34974	34979	0 %	0 %	50 %	50 %	471328028
66	NC_020545	CG	3	6	34983	34988	0 %	0 %	50 %	50 %	471328028
67	NC_020545	CG	3	6	35206	35211	0 %	0 %	50 %	50 %	471328029
68	NC_020545	CG	3	6	35279	35284	0 %	0 %	50 %	50 %	471328029
69	NC_020545	GC	3	6	35691	35696	0 %	0 %	50 %	50 %	471328030
70	NC_020545	CG	3	6	35739	35744	0 %	0 %	50 %	50 %	471328030
71	NC_020545	GC	3	6	37547	37552	0 %	0 %	50 %	50 %	471328032
72	NC_020545	GC	3	6	37900	37905	0 %	0 %	50 %	50 %	471328032
73	NC_020545	CG	3	6	37999	38004	0 %	0 %	50 %	50 %	471328032
74	NC_020545	TG	3	6	38208	38213	0 %	50 %	50 %	0 %	471328032
75	NC_020545	GC	3	6	38597	38602	0 %	0 %	50 %	50 %	471328033
76	NC_020545	CG	3	6	39271	39276	0 %	0 %	50 %	50 %	471328034
77	NC_020545	GC	3	6	39548	39553	0 %	0 %	50 %	50 %	471328034
78	NC_020545	GC	3	6	40310	40315	0 %	0 %	50 %	50 %	471328034
79	NC_020545	CG	3	6	40572	40577	0 %	0 %	50 %	50 %	471328034
80	NC_020545	GC	3	6	40623	40628	0 %	0 %	50 %	50 %	471328034
81	NC_020545	CG	3	6	40716	40721	0 %	0 %	50 %	50 %	471328034
82	NC_020545	GA	3	6	40924	40929	50 %	0 %	50 %	0 %	471328034
83	NC_020545	TG	3	6	41259	41264	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020545	CG	3	6	41267	41272	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_020545	CG	4	8	41298	41305	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_020545	CG	3	6	41927	41932	0 %	0 %	50 %	50 %	471328036
87	NC_020545	TG	3	6	42224	42229	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020545	CG	3	6	42371	42376	0 %	0 %	50 %	50 %	471328037
89	NC_020545	CG	3	6	42802	42807	0 %	0 %	50 %	50 %	471328037
90	NC_020545	GC	3	6	44022	44027	0 %	0 %	50 %	50 %	471328037
91	NC_020545	GC	3	6	44109	44114	0 %	0 %	50 %	50 %	471328037
92	NC_020545	GC	3	6	44160	44165	0 %	0 %	50 %	50 %	471328037
93	NC_020545	CT	3	6	45325	45330	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_020545	CG	3	6	45571	45576	0 %	0 %	50 %	50 %	471328041
95	NC_020545	GA	3	6	46820	46825	50 %	0 %	50 %	0 %	471328042
96	NC_020545	CT	3	6	46843	46848	0 %	50 %	0 %	50 %	471328042
97	NC_020545	AC	3	6	48188	48193	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_020545	CG	3	6	48446	48451	0 %	0 %	50 %	50 %	471328044
99	NC_020545	GT	3	6	48691	48696	0 %	50 %	50 %	0 %	471328044
100	NC_020545	CG	3	6	50156	50161	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_020545	CG	3	6	50494	50499	0 %	0 %	50 %	50 %	471328046
102	NC_020545	CG	3	6	50576	50581	0 %	0 %	50 %	50 %	471328046
103	NC_020545	GC	3	6	50624	50629	0 %	0 %	50 %	50 %	471328046
104	NC_020545	CG	3	6	50670	50675	0 %	0 %	50 %	50 %	471328046
105	NC_020545	CG	3	6	51090	51095	0 %	0 %	50 %	50 %	471328046
106	NC_020545	GC	3	6	51552	51557	0 %	0 %	50 %	50 %	471328047
107	NC_020545	GC	3	6	51720	51725	0 %	0 %	50 %	50 %	471328047
108	NC_020545	AC	3	6	52392	52397	50 %	0 %	0 %	50 %	471328048
109	NC_020545	CG	3	6	52464	52469	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_020545	GT	3	6	52813	52818	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020545	GC	3	6	52981	52986	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_020545	GC	3	6	53538	53543	0 %	0 %	50 %	50 %	471328049
113	NC_020545	GC	3	6	53940	53945	0 %	0 %	50 %	50 %	471328049
114	NC_020545	CG	3	6	54055	54060	0 %	0 %	50 %	50 %	471328049
115	NC_020545	GC	3	6	54492	54497	0 %	0 %	50 %	50 %	471328049
116	NC_020545	CG	3	6	54635	54640	0 %	0 %	50 %	50 %	471328049
117	NC_020545	GC	3	6	54941	54946	0 %	0 %	50 %	50 %	471328050
118	NC_020545	AG	3	6	55395	55400	50 %	0 %	50 %	0 %	471328050
119	NC_020545	CG	3	6	55422	55427	0 %	0 %	50 %	50 %	471328050
120	NC_020545	CG	4	8	56526	56533	0 %	0 %	50 %	50 %	471328051
121	NC_020545	GC	3	6	56781	56786	0 %	0 %	50 %	50 %	471328051
122	NC_020545	CG	3	6	57109	57114	0 %	0 %	50 %	50 %	471328051
123	NC_020545	CG	3	6	57969	57974	0 %	0 %	50 %	50 %	471328053
124	NC_020545	GC	3	6	58028	58033	0 %	0 %	50 %	50 %	471328053
125	NC_020545	CG	3	6	58420	58425	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_020545	CA	3	6	60403	60408	50 %	0 %	0 %	50 %	471328057
127	NC_020545	CA	3	6	61018	61023	50 %	0 %	0 %	50 %	471328058
128	NC_020545	GC	3	6	62046	62051	0 %	0 %	50 %	50 %	471328059
129	NC_020545	CG	3	6	62158	62163	0 %	0 %	50 %	50 %	471328059
130	NC_020545	CG	3	6	62611	62616	0 %	0 %	50 %	50 %	471328060
131	NC_020545	TG	3	6	62828	62833	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020545	TC	3	6	62857	62862	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_020545	CG	3	6	63772	63777	0 %	0 %	50 %	50 %	471328061
134	NC_020545	GC	3	6	63880	63885	0 %	0 %	50 %	50 %	471328061
135	NC_020545	GC	4	8	66645	66652	0 %	0 %	50 %	50 %	471328066
136	NC_020545	GC	3	6	66938	66943	0 %	0 %	50 %	50 %	471328066
137	NC_020545	GC	3	6	67365	67370	0 %	0 %	50 %	50 %	471328066
138	NC_020545	CG	4	8	67791	67798	0 %	0 %	50 %	50 %	471328066
139	NC_020545	GC	3	6	68517	68522	0 %	0 %	50 %	50 %	471328066
140	NC_020545	GC	3	6	69971	69976	0 %	0 %	50 %	50 %	471328068
141	NC_020545	CG	3	6	69996	70001	0 %	0 %	50 %	50 %	471328068
142	NC_020545	GC	4	8	70526	70533	0 %	0 %	50 %	50 %	471328068
143	NC_020545	CG	3	6	70578	70583	0 %	0 %	50 %	50 %	471328068
144	NC_020545	AG	3	6	70781	70786	50 %	0 %	50 %	0 %	471328068
145	NC_020545	AG	3	6	71379	71384	50 %	0 %	50 %	0 %	471328068
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147	NC_020545	CG	3	6	72298	72303	0 %	0 %	50 %	50 %	471328069
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.