MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Sphingomonas sp. MM-1 plasmid pISP3

Total Repeats: 19

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020544	CTGCGC	2	12	2377	2388	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	472433927
2	NC_020544	GTCGCG	2	12	2671	2682	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	472433927
3	NC_020544	CGGTGC	2	12	4208	4219	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_020544	ATCCAG	3	18	11021	11038	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	472433932
5	NC_020544	ATGGGC	2	12	11943	11954	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	472433933
6	NC_020544	CAGAGC	2	12	18164	18175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_020544	CTCCAC	2	12	22440	22451	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	472433946
8	NC_020544	ATCTCT	2	12	22535	22546	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	472433946
9	NC_020544	CGGCGT	2	12	24019	24030	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	472433948
10	NC_020544	TCGAGG	2	12	25503	25514	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	472433949
11	NC_020544	TGCCGG	2	12	30784	30795	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	472433952
12	NC_020544	CTCGAT	2	12	32201	32212	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	472433953
13	NC_020544	CGGAAG	2	12	32614	32625	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	472433954
14	NC_020544	CGCAAG	2	12	34980	34991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433958
15	NC_020544	GGACCG	2	12	36194	36205	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	472433959
16	NC_020544	GGCGCT	2	12	38652	38663	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	472433961
17	NC_020544	GCCCCA	2	12	39789	39800	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	472433963
18	NC_020544	GGCCGA	2	12	42519	42530	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_020544	GGCGAC	2	12	43447	43458	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	472433968

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.