MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Sphingomonas sp. MM-1 plasmid pISP3

Total Repeats: 46

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020544	CGAGC	2	10	3	12	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2	NC_020544	TGGCG	2	10	35	44	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3	NC_020544	GTCGC	2	10	412	421	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4	NC_020544	AGCGC	2	10	878	887	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5	NC_020544	TGTCG	2	10	1837	1846	0 %	40 %	40 %	20 %	472433926
6	NC_020544	GGCGC	2	10	4364	4373	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
7	NC_020544	GGCCA	2	10	6516	6525	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
8	NC_020544	AGCCG	2	10	6552	6561	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
9	NC_020544	CGGCC	2	10	6968	6977	0 %	0 %	40 %	60 %	472433929
10	NC_020544	CGATC	2	10	13642	13651	20 %	20 %	20 %	40 %	472433934
11	NC_020544	TAATG	2	10	13940	13949	40 %	40 %	20 %	0 %	472433935
12	NC_020544	GTGAT	2	10	17383	17392	20 %	40 %	40 %	0 %	472433940
13	NC_020544	GCCTG	2	10	21418	21427	0 %	20 %	40 %	40 %	472433944
14	NC_020544	TTCGG	2	10	22462	22471	0 %	40 %	40 %	20 %	472433946
15	NC_020544	GCGCC	2	10	22976	22985	0 %	0 %	40 %	60 %	472433947
16	NC_020544	CCGCG	2	10	24152	24161	0 %	0 %	40 %	60 %	472433948
17	NC_020544	TCGCC	2	10	24183	24192	0 %	20 %	20 %	60 %	472433948
18	NC_020544	CCATG	2	10	24975	24984	20 %	20 %	20 %	40 %	472433948
19	NC_020544	TCGCC	2	10	25002	25011	0 %	20 %	20 %	60 %	472433948
20	NC_020544	TCCCA	2	10	25554	25563	20 %	20 %	0 %	60 %	472433949
21	NC_020544	CAGCG	2	10	25833	25842	20 %	0 %	40 %	40 %	472433949
22	NC_020544	TCGCC	2	10	26233	26242	0 %	20 %	20 %	60 %	472433949
23	NC_020544	AACCA	2	10	26410	26419	60 %	0 %	0 %	40 %	472433949
24	NC_020544	GCGCG	2	10	26464	26473	0 %	0 %	60 %	40 %	472433949
25	NC_020544	CATCG	2	10	27164	27173	20 %	20 %	20 %	40 %	472433949
26	NC_020544	CCGGC	2	10	27189	27198	0 %	0 %	40 %	60 %	472433949
27	NC_020544	CGGTG	2	10	27285	27294	0 %	20 %	60 %	20 %	472433949
28	NC_020544	CGGGC	2	10	27591	27600	0 %	0 %	60 %	40 %	472433949
29	NC_020544	AAGCG	2	10	27740	27749	40 %	0 %	40 %	20 %	472433949
30	NC_020544	GCGCC	2	10	28608	28617	0 %	0 %	40 %	60 %	472433950
31	NC_020544	GATCG	2	10	29562	29571	20 %	20 %	40 %	20 %	472433951
32	NC_020544	GCCCG	2	10	30931	30940	0 %	0 %	40 %	60 %	472433952
33	NC_020544	CCCCT	2	10	32829	32838	0 %	20 %	0 %	80 %	472433955
34	NC_020544	CCGAC	2	10	32880	32889	20 %	0 %	20 %	60 %	472433955
35	NC_020544	ACGCC	2	10	33396	33405	20 %	0 %	20 %	60 %	472433956
36	NC_020544	CTGGC	2	10	33742	33751	0 %	20 %	40 %	40 %	472433956
37	NC_020544	GCGCC	2	10	35515	35524	0 %	0 %	40 %	60 %	472433958
38	NC_020544	AGGAT	2	10	35906	35915	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020544	CCTGC	2	10	36524	36533	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
40	NC_020544	CCCCT	2	10	37228	37237	0 %	20 %	0 %	80 %	472433960
41	NC_020544	GCTCG	2	10	38797	38806	0 %	20 %	40 %	40 %	472433962
42	NC_020544	GCGCG	2	10	38926	38935	0 %	0 %	60 %	40 %	472433962
43	NC_020544	GGGGA	2	10	39467	39476	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020544	AGCGA	2	10	40429	40438	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
45	NC_020544	GGCGC	2	10	41719	41728	0 %	0 %	60 %	40 %	472433967
46	NC_020544	TGCGT	2	10	42641	42650	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.