MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Sphingomonas sp. MM-1 plasmid pISP3

Total Repeats: 26

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020544	AACG	2	8	1079	1086	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_020544	GCGG	2	8	1233	1240	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3	NC_020544	GATC	2	8	1496	1503	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_020544	GCAA	2	8	4300	4307	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_020544	CCCG	2	8	4422	4429	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6	NC_020544	GGCG	2	8	5007	5014	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7	NC_020544	GCGG	2	8	5368	5375	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8	NC_020544	GCGG	2	8	6485	6492	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
9	NC_020544	GCCC	2	8	7536	7543	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10	NC_020544	AAGG	2	8	7558	7565	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020544	GCAA	2	8	8031	8038	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_020544	CAGC	3	12	8956	8967	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_020544	AGGG	2	8	8983	8990	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020544	CTTT	2	8	11623	11630	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_020544	CCTG	2	8	21790	21797	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_020544	TCCG	2	8	28396	28403	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_020544	GGCC	2	8	30639	30646	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_020544	GGGA	2	8	34146	34153	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020544	GCCG	2	8	36441	36448	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_020544	TTAC	2	8	38361	38368	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_020544	CGGG	2	8	40239	40246	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
22	NC_020544	CGAA	2	8	40318	40325	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_020544	TCGT	2	8	40514	40521	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_020544	GAGC	2	8	42069	42076	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_020544	AGAA	2	8	42442	42449	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020544	CGAT	2	8	42551	42558	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.