MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Sphingomonas sp. MM-1 plasmid pISP3

Total Repeats: 100

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020544	CGAC	2	8	1608	1615	25 %	0 %	25 %	50 %	472433926
2	NC_020544	TCGC	2	8	1762	1769	0 %	25 %	25 %	50 %	472433926
3	NC_020544	GAGC	2	8	1918	1925	25 %	0 %	50 %	25 %	472433926
4	NC_020544	GAGC	2	8	2732	2739	25 %	0 %	50 %	25 %	472433927
5	NC_020544	CGCT	2	8	7106	7113	0 %	25 %	25 %	50 %	472433929
6	NC_020544	CGGG	2	8	7140	7147	0 %	0 %	75 %	25 %	472433929
7	NC_020544	CGAG	2	8	7237	7244	25 %	0 %	50 %	25 %	472433929
8	NC_020544	GGAC	2	8	8395	8402	25 %	0 %	50 %	25 %	472433931
9	NC_020544	TCCA	2	8	8490	8497	25 %	25 %	0 %	50 %	472433931
10	NC_020544	CATC	2	8	8555	8562	25 %	25 %	0 %	50 %	472433931
11	NC_020544	CTGG	2	8	8697	8704	0 %	25 %	50 %	25 %	472433931
12	NC_020544	GCGA	2	8	8778	8785	25 %	0 %	50 %	25 %	472433931
13	NC_020544	CAGT	2	8	8793	8800	25 %	25 %	25 %	25 %	472433931
14	NC_020544	CGAT	2	8	9861	9868	25 %	25 %	25 %	25 %	472433932
15	NC_020544	CCGG	2	8	9953	9960	0 %	0 %	50 %	50 %	472433932
16	NC_020544	CGGA	2	8	9975	9982	25 %	0 %	50 %	25 %	472433932
17	NC_020544	GGCC	2	8	10006	10013	0 %	0 %	50 %	50 %	472433932
18	NC_020544	GCGG	2	8	10088	10095	0 %	0 %	75 %	25 %	472433932
19	NC_020544	CGAT	2	8	10152	10159	25 %	25 %	25 %	25 %	472433932
20	NC_020544	CCGA	2	8	10790	10797	25 %	0 %	25 %	50 %	472433932
21	NC_020544	TCGA	2	8	10968	10975	25 %	25 %	25 %	25 %	472433932
22	NC_020544	GCGG	2	8	11293	11300	0 %	0 %	75 %	25 %	472433932
23	NC_020544	AAGC	2	8	11851	11858	50 %	0 %	25 %	25 %	472433933
24	NC_020544	GGAT	2	8	11905	11912	25 %	25 %	50 %	0 %	472433933
25	NC_020544	CCTT	2	8	12031	12038	0 %	50 %	0 %	50 %	472433933
26	NC_020544	TGGC	2	8	12448	12455	0 %	25 %	50 %	25 %	472433933
27	NC_020544	GGCT	2	8	12910	12917	0 %	25 %	50 %	25 %	472433934
28	NC_020544	ACGG	2	8	13112	13119	25 %	0 %	50 %	25 %	472433934
29	NC_020544	GTCG	2	8	13988	13995	0 %	25 %	50 %	25 %	472433935
30	NC_020544	TGCC	2	8	14821	14828	0 %	25 %	25 %	50 %	472433936
31	NC_020544	AAGG	2	8	15555	15562	50 %	0 %	50 %	0 %	472433937
32	NC_020544	CCGG	2	8	16302	16309	0 %	0 %	50 %	50 %	472433938
33	NC_020544	TCGT	2	8	16622	16629	0 %	50 %	25 %	25 %	472433938
34	NC_020544	CATC	2	8	16924	16931	25 %	25 %	0 %	50 %	472433938
35	NC_020544	GGAC	2	8	17338	17345	25 %	0 %	50 %	25 %	472433940
36	NC_020544	ACCT	2	8	17613	17620	25 %	25 %	0 %	50 %	472433940
37	NC_020544	CGAT	2	8	17650	17657	25 %	25 %	25 %	25 %	472433940
38	NC_020544	GCTC	2	8	18306	18313	0 %	25 %	25 %	50 %	472433941
39	NC_020544	CGCC	2	8	18377	18384	0 %	0 %	25 %	75 %	472433941
40	NC_020544	CGAT	2	8	18446	18453	25 %	25 %	25 %	25 %	472433941
41	NC_020544	CCGC	2	8	18840	18847	0 %	0 %	25 %	75 %	472433942
42	NC_020544	AATG	2	8	19281	19288	50 %	25 %	25 %	0 %	472433942
43	NC_020544	GGCG	2	8	19470	19477	0 %	0 %	75 %	25 %	472433943
44	NC_020544	GGCC	2	8	19556	19563	0 %	0 %	50 %	50 %	472433943
45	NC_020544	GCCC	2	8	19720	19727	0 %	0 %	25 %	75 %	472433943
46	NC_020544	GGCG	2	8	20207	20214	0 %	0 %	75 %	25 %	472433944
47	NC_020544	GCTG	2	8	20489	20496	0 %	25 %	50 %	25 %	472433944
48	NC_020544	CGAT	2	8	20551	20558	25 %	25 %	25 %	25 %	472433944
49	NC_020544	AGCG	2	8	20583	20590	25 %	0 %	50 %	25 %	472433944
50	NC_020544	GGCG	2	8	20870	20877	0 %	0 %	75 %	25 %	472433944
51	NC_020544	CATC	2	8	20920	20927	25 %	25 %	0 %	50 %	472433944
52	NC_020544	GTGC	2	8	20946	20953	0 %	25 %	50 %	25 %	472433944
53	NC_020544	GGAA	2	8	21170	21177	50 %	0 %	50 %	0 %	472433944
54	NC_020544	GGGT	2	8	21275	21282	0 %	25 %	75 %	0 %	472433944
55	NC_020544	GACA	2	8	21598	21605	50 %	0 %	25 %	25 %	472433945
56	NC_020544	ACGC	2	8	21663	21670	25 %	0 %	25 %	50 %	472433945
57	NC_020544	CGGG	2	8	22233	22240	0 %	0 %	75 %	25 %	472433946
58	NC_020544	CGCC	2	8	22893	22900	0 %	0 %	25 %	75 %	472433947
59	NC_020544	CAGC	2	8	23004	23011	25 %	0 %	25 %	50 %	472433947
60	NC_020544	CGCC	2	8	23147	23154	0 %	0 %	25 %	75 %	472433947
61	NC_020544	GCCC	2	8	23898	23905	0 %	0 %	25 %	75 %	472433948
62	NC_020544	GCCC	2	8	25393	25400	0 %	0 %	25 %	75 %	472433948
63	NC_020544	TCCG	2	8	25861	25868	0 %	25 %	25 %	50 %	472433949
64	NC_020544	ATCG	2	8	26281	26288	25 %	25 %	25 %	25 %	472433949
65	NC_020544	GGCA	2	8	26702	26709	25 %	0 %	50 %	25 %	472433949
66	NC_020544	CGAG	2	8	26899	26906	25 %	0 %	50 %	25 %	472433949
67	NC_020544	CGAT	2	8	27048	27055	25 %	25 %	25 %	25 %	472433949
68	NC_020544	ACGA	2	8	27219	27226	50 %	0 %	25 %	25 %	472433949
69	NC_020544	GCCC	2	8	27498	27505	0 %	0 %	25 %	75 %	472433949
70	NC_020544	ATCG	2	8	27524	27531	25 %	25 %	25 %	25 %	472433949
71	NC_020544	ATCG	2	8	27863	27870	25 %	25 %	25 %	25 %	472433949
72	NC_020544	GCCG	2	8	27976	27983	0 %	0 %	50 %	50 %	472433949
73	NC_020544	GCGG	2	8	28051	28058	0 %	0 %	75 %	25 %	472433949
74	NC_020544	GCGT	2	8	28117	28124	0 %	25 %	50 %	25 %	472433949
75	NC_020544	GCAG	2	8	28191	28198	25 %	0 %	50 %	25 %	472433949
76	NC_020544	GGCG	2	8	28271	28278	0 %	0 %	75 %	25 %	472433949
77	NC_020544	GGCG	2	8	28663	28670	0 %	0 %	75 %	25 %	472433950
78	NC_020544	CGCT	2	8	28816	28823	0 %	25 %	25 %	50 %	472433950
79	NC_020544	GGCC	2	8	29393	29400	0 %	0 %	50 %	50 %	472433951
80	NC_020544	GCCC	2	8	29909	29916	0 %	0 %	25 %	75 %	472433951
81	NC_020544	AGGA	2	8	30190	30197	50 %	0 %	50 %	0 %	472433951
82	NC_020544	GTCC	2	8	31021	31028	0 %	25 %	25 %	50 %	472433952
83	NC_020544	CGCC	2	8	31678	31685	0 %	0 %	25 %	75 %	472433952
84	NC_020544	ACGC	2	8	32742	32749	25 %	0 %	25 %	50 %	472433955
85	NC_020544	ACGC	2	8	33080	33087	25 %	0 %	25 %	50 %	472433956
86	NC_020544	GCTC	2	8	33599	33606	0 %	25 %	25 %	50 %	472433956
87	NC_020544	ATGA	2	8	33845	33852	50 %	25 %	25 %	0 %	472433956
88	NC_020544	CGAT	2	8	33894	33901	25 %	25 %	25 %	25 %	472433957
89	NC_020544	GCTC	2	8	34015	34022	0 %	25 %	25 %	50 %	472433957
90	NC_020544	CACG	2	8	34489	34496	25 %	0 %	25 %	50 %	472433958
91	NC_020544	CCGC	2	8	34734	34741	0 %	0 %	25 %	75 %	472433958
92	NC_020544	GCTG	2	8	35307	35314	0 %	25 %	50 %	25 %	472433958
93	NC_020544	GCCC	2	8	35369	35376	0 %	0 %	25 %	75 %	472433958
94	NC_020544	GATG	2	8	38062	38069	25 %	25 %	50 %	0 %	472433960
95	NC_020544	GCGG	2	8	38480	38487	0 %	0 %	75 %	25 %	472433961
96	NC_020544	CGTG	2	8	40557	40564	0 %	25 %	50 %	25 %	472433964
97	NC_020544	GCTG	2	8	42795	42802	0 %	25 %	50 %	25 %	472433968
98	NC_020544	GCGG	2	8	43134	43141	0 %	0 %	75 %	25 %	472433968
99	NC_020544	GCCC	2	8	43462	43469	0 %	0 %	25 %	75 %	472433968
100	NC_020544	CGGG	2	8	43624	43631	0 %	0 %	75 %	25 %	472433968

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.